Genes codificantes 1.1 Flashcards
Estructura del ADN
- doble hélice
- semiconservadora
- antiparalela
- esqueleto pentosas fosfato
Formas del ADN
B = 10pb (giro a la derecha)
A = 11pb (giro a la derecha) → baja humedad
Z = 12pb (giro a la izquierda)
la + comun es la B
¿En qué sentido va la transcripción?
5’ – 3’
Fun fact
la hebra nueva de ARN es igual a la hebra sentido de ADN (5’-3’) susitituyendo T por U
¿Qué característica tienen los sitios de inicio de transcripcion?
con respecto a su transcripcion
no se pueden transcribir → llaman a una polimerasa
Modificaciones postranscripcionales del ARNm
- splicing (remover intrones)
- se pone cola de poli A
- se pone caperuza (antes del primer exon)
Función de la adicion de 5’cap
- protege ARN de degradacion
- transporta ARN al citoplasma (sale del núcleo)
- sitio de union proteico (ribosoma) para la traduccion
Cola de poli A
* Medida
* Función
- 100-250 A
- protege de degradacion y facilita la traduccion en ribosomas
Mientras + corta + inestable
Funcion del splicing
- eliminacion de intrones (no codificantes)
- union de exones (codificantes)
Regiones promotoras/reguladoras
* Función
* ¿Río arriba/abajo?
- regulan si se transcribe o no el gen llamando a los FT para unirse
- rio arriba
FT: factores de transcripcion
¿Qué es río arriba y río abajo?
- arriba: en la dirección del -1 (regiones reguladoras)
- abajo: en la direccion del +1 (donde inicia transcripcion “1er exon”)
¿Qué es la caja TATA?
secuencias promotora de T y A de 25pb rio arriba
Polimerasa que transcribe el ARNm
polimerasa II
Características de la caja GC (3)
- secuencia promotora con GGGCGG
- palindromica
- se unen FT SP1, SP3 y SP4
¿En qué ocasiones se usa la caja GC?
en genes que no tienen la caja TATA (la mayoria de veces)
¿Qué son genes constitutivos (house keeping)?
se transcriben todo el tiempo y en todos los tejidos
Islas CpG (4)
* Características
* Nt
* ¿Rio arriba/abajo?
P = enlace fosfodiester
- regiones con muchas C y G (sitios de metilacion) que indican inicio transcripción
- 20-50 nt
- están 100pb rio arriba
Características de las islas CpG con respecto a la metilación
- metiladas (hiper) → inhibe transcripcion
- desmetiladas (hipo) → promueve transcripcion
normalmente: metiladas
Características de la caja CAAT (3)
- está río arriba (posición -80)
- secuencia reguladora
- palindromica
Características de los potenciadores (enhancers) (4)
- especificos según el tipo celular
- reguladores tipo CIS
primer enhancer descubierto: simio
¿Los potenciadores (enhancers) son distantes o cercanos al sitio de transcripcion?
distantes
ARN recién sintetizado se le llama:
- transcrito primario
- RNA inmaduro
- RNA heterogeneo
- RNA precursor
Conformacion del ARN transcrito primario
- UTR
- M7Gppp Cap o 5’cap
- intrones
- exones
- cola de poli A
Si el ARN solo tiene cola de poli A y 5’cap se le llama…
ARN inmaduro
Enzimas que cortan y ponen la cola de poli A en el ARN primario
endonucleasa corta ARN y la PAP (polimerasa) pone cola
¿Qué pasa si hay una mutación en exones e intrones?
- exon → mutación que + afecta función de protes
- intron → en región promotora no se da proceso y en region de terminacion no se da señal de fin
