Genes codificantes 1.1 Flashcards

1
Q

Estructura del ADN

A
  • doble hélice
  • semiconservadora
  • antiparalela
  • esqueleto pentosas fosfato
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2
Q

Formas del ADN

A

B = 10pb (giro a la derecha)
A = 11pb (giro a la derecha) → baja humedad
Z = 12pb (giro a la izquierda)

la + comun es la B

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3
Q

¿En qué sentido va la transcripción?

A

5’ – 3’

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4
Q

Fun fact

A

la hebra nueva de ARN es igual a la hebra sentido de ADN (5’-3’) susitituyendo T por U

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Q

Fun fact

A

el primer nucleotido de la hebra de ARN es trifosfatado y a partir de ahí se pierden pirofosfatos y quedan monofosfatados

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6
Q

¿Qué característica tienen los sitios de inicio de transcripcion?

con respecto a su transcripcion

A

no se pueden transcribir → llaman a una polimerasa

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7
Q

Modificaciones postranscripcionales del ARNm

A
  1. splicing (remover intrones)
  2. se pone cola de poli A
  3. se pone caperuza (antes del primer exon)
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8
Q

Función de la adicion de 5’cap

A
  • protege ARN de degradacion
  • transporta ARN al citoplasma (sale del núcleo)
  • sitio de union proteico (ribosoma) para la traduccion
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9
Q

Cola de poli A
* Medida
* Función

A
  • 100-250 A
  • protege de degradacion y facilita la traduccion en ribosomas

Mientras + corta + inestable

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10
Q

Funcion del splicing

A
  • eliminacion de intrones (no codificantes)
  • union de exones (codificantes)
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11
Q

Regiones promotoras/reguladoras
* Función
* ¿Río arriba/abajo?

A
  • regulan si se transcribe o no el gen llamando a los FT para unirse
  • rio arriba

FT: factores de transcripcion

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12
Q

¿Qué es río arriba y río abajo?

A
  • arriba: en la dirección del -1 (regiones reguladoras)
  • abajo: en la direccion del +1 (donde inicia transcripcion “1er exon”)
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13
Q

¿Qué es la caja TATA?

A

secuencias promotora de T y A de 25pb rio arriba

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14
Q

Polimerasa que transcribe el ARNm

A

polimerasa II

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15
Q

Características de la caja GC (3)

A
  • secuencia promotora con GGGCGG
  • palindromica
  • se unen FT SP1, SP3 y SP4
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16
Q

¿En qué ocasiones se usa la caja GC?

A

en genes que no tienen la caja TATA (la mayoria de veces)

17
Q

¿Qué son genes constitutivos (house keeping)?

A

se transcriben todo el tiempo y en todos los tejidos

18
Q

Islas CpG (4)
* Características
* Nt
* ¿Rio arriba/abajo?

P = enlace fosfodiester

A
  • regiones con muchas C y G (sitios de metilacion) que indican inicio transcripción
  • 20-50 nt
  • están 100pb rio arriba
19
Q

Características de las islas CpG con respecto a la metilación

A
  • metiladas (hiper) → inhibe transcripcion
  • desmetiladas (hipo) → promueve transcripcion

normalmente: metiladas

20
Q

Características de la caja CAAT (3)

A
  • está río arriba (posición -80)
  • secuencia reguladora
  • palindromica
21
Q

Características de los potenciadores (enhancers) (4)

A
  • 50kb rio arriba
  • rio abajo en algun exon o intron
  • especificos según el tipo celular
  • reguladores tipo CIS

primer enhancer descubierto: simio

22
Q

¿Los potenciadores (enhancers) son distantes o cercanos al sitio de transcripcion?

A

distantes

23
Q

Pasos de la transcripción

A
  • iniciación
  • elongación
  • terminación
24
Q

Proceso de transcripcion

A
  • RNA polimerasa se une a la hebra de ADN
  • se abre la cadena de ADN
  • polimerasa une nucleotidos (5’ – 3’) hasta el sitio de terminacion
  • suelta el ARNm inmaduro
25
Q

ARN recién sintetizado se le llama:

A
  • transcrito primario
  • RNA inmaduro
  • RNA heterogeneo
  • RNA precursor
26
Q

Conformacion del ARN transcrito primario

A
  • UTR
  • M7Gppp Cap o 5’cap
  • intrones
  • exones
  • cola de poli A
27
Q

Si el ARN solo tiene cola de poli A y 5’cap se le llama…

A

ARN inmaduro

28
Q

Enzimas que cortan y ponen la cola de poli A en el ARN primario

A

endonucleasa corta ARN y la PAP (polimerasa) pone cola

29
Q

¿Qué pasa si hay una mutación en exones e intrones?

A
  • exon → mutación que + afecta función de protes
  • intron → en región promotora no se da proceso y en region de terminacion no se da señal de fin