Rearreglos genómicos Flashcards
- ¿Qué son los rearreglos genómicos?
- ¿Longitud?
- Cambios en el ADN
- Van de miles de pb a segmentos completos de los chr
DIP → INDEL → REARREGLO
¿Cómo pueden ser los rearreglos genómicos?
Duplicaciones, inversiones, inserciones y deleciones
Son + grandes que los INDELS
Las enfermedades generadas por estos rearreglos genómicos se conocen como…
Desorden genético
3 mecanismos por los cuales ocurren los rearreglos genómicos
- NAHR → mediada por LCRs
- NHEJ (non-homologous joining)
- FoSTeS (fork stalling and template switching)
Diferencias entre mutaciones y rearreglos
- Mutaciones: por errores durante replicación/reparación
- Rearreglos: por características genéticas estructurales
NAHR
¿Qué son los LCR?
Fragmentos de ADN (10-300kb) con una similitud entre el 95% y 97%
NAHR
¿En qué regiones se encuentran los LCR?
- Pericentroméricas
- Subteloméricas
- Intersticiales
NAHR
Diferencia entre los rearreglos recurrentes y no recurrentes que se dan por NAHR
- Recurrentes: + comunes, delimitados por LCR
- No recurrentes: al azar, por SRO
- No recurrentes (with grouping): por reg. palindrómicas
NAHR
¿Qué son regiones cortas de sobrelapamiento (SRO)?
Regiones que coinciden para que se haga un NAHR
NAHR
Cuando los LCR están en el mismo cromosoma y misma orientacion (transcripcion) se generan…
Duplicación y deleciones
NAHR
Cuando los LCR están en diferentes cromosomas se generan…
Traslocaciones
NAHR
Cuando los LCR están en el mismo cromosoma pero orientacion contraria (transcripcion) se generan….
Inversiones
NAHR
¿Dónde ocurren los NAHR?
- Hot spots
- Mitosis y meiosis
NAHR
AHR puede tener los ⎽⎽⎽⎽ adyacentes a los de NAHR
Hot spots
NAHR
¿Dónde ocurren los NAHR en mitosis y meiosis y cúal es la consecuencia?
- Meiosis: en cx germinales → desorden genético
- Mitosis: poblaciones (tejido específico) → cáncer
Si el rearreglo no está en cx germinal NO se hereda
NAHR
La eficiencia de NAHR depende de:
・ Longitud del LCR → rearreglo (10-400kb) a > longitud es + probable que se recombine
・ Cercanía del LCR
・ Identidad 96% (se parecen entre sí)
NAHR
En la meiosis los NAHR pueden llevarse a cabo en:
- La misma cromátida (intracromátida) → deleción
- Cromátidas hermanas (intercromátida) → deleción y duplicación
- Cromosoma homólogo (intercromosomal) → deleción y duplicación
NAHR
Aplicación de los NAHR
Predictor de desórdenes genómicos
(+ LCR + inestable)
NHEJ
- ¿Para qué se usan los NHEJ?
- ¿En cuántos pasos consiste?
- Para la reparación DSB (doble strand breaks)
- Consiste en 4 pasos
NHEJ
¿Por qué son provocados los DSB?
Errores de recombinación por radiación o ROS
NHEJ
4 pasos
- Detección de DSB
- Puente de los extremos dañados (Ku)
- Modificación de los extremos para compatibilidad (Artemis/polimerasa μ y λ)
- Ligación de extremos (XRCC y ligasa IV)
¿La formación de rearreglos por medio de NHEJ es igual de específica como los NAHR?
Falso
(NHEJ no es tan específica como los NAHR pero si se ve estimulada y regulada por la arquitectura genómica)
Rearreglo + común en traslocaciones cromosómicas vistas en el cáncer
NHEJ
FoSTeS
¿Qué son los FoSTeS?
Mecanismo derivado de la replicación
FoSTeS
¿Cuáles son las estructuras que pueden favorecer los FoSTeS?
- ADN palindrómico
- Estructuras de stemloop
- Estructuras cruciformes
