Rearreglos genómicos

Question 1

• ¿Qué son los rearreglos genómicos?
• ¿Longitud?

Answer 1

• Cambios en el ADN
• Van de miles de pb a segmentos completos de los chr

Rearreglos → Regiones enormes / InDel → Pequeñas

Question 2

¿Cómo pueden ser los rearreglos genómicos?

Answer 2

Duplicaciones, inversiones, inserciones y deleciones

Son + grandes que los INDELS

Question 3

Las enfermedades generadas por estos rearreglos genómicos se conocen como…

Answer 3

Desorden genético

Question 4

3 mecanismos por los cuales ocurren los rearreglos genómicos

Answer 4

1. NAHR → mediada por LCRs
2. NHEJ (non-homologous joining)
3. FoSTeS (fork stalling and template switching)

Question 5

Diferencias entre mutaciones y rearreglos

Answer 5

• Mutaciones: por errores durante replicación/reparación
• Rearreglos: por características genéticas estructurales

Question 6

NAHR

¿Qué son los LCR?

Answer 6

Fragmentos de ADN (10-300kb) con una similitud entre el 95% y 97%

Question 7

NAHR

¿En qué regiones se encuentran los LCR?

Answer 7

• Pericentroméricas
• Subteloméricas
• Intersticiales

Question 8

NAHR

Diferencia entre los rearreglos recurrentes y no recurrentes que se dan por NAHR

Answer 8

• Recurrentes: + comunes, delimitados por LCR
• No recurrentes: al azar, por SRO
• No recurrentes (with grouping): por reg. palindrómicas

Question 9

NAHR

¿Qué son regiones cortas de sobrelapamiento (SRO)?

Answer 9

Regiones que coinciden para que se haga un NAHR

Question 10

NAHR

Cuando los LCR están en el mismo cromosoma y misma orientacion (transcripcion) se generan…

Answer 10

Duplicación y deleciones

Question 11

NAHR

Cuando los LCR están en diferentes cromosomas se generan…

Answer 11

Traslocaciones

Question 12

NAHR

Cuando los LCR están en el mismo cromosoma pero orientacion contraria (transcripcion) se generan….

Answer 12

Inversiones

Question 13

NAHR

¿Dónde ocurren los NAHR?

Answer 13

• Hot spots
• Mitosis y meiosis

Question 14

NAHR

AHR puede tener los ⎽⎽⎽⎽ adyacentes a los de NAHR

Answer 14

Hot spots

Question 15

NAHR

¿Dónde ocurren los NAHR en mitosis y meiosis y cúal es la consecuencia?

Answer 15

• Meiosis: en cx germinales → desorden genético
• Mitosis: poblaciones (tejido específico) → cáncer

Si el rearreglo no está en cx germinal NO se hereda

Question 16

NAHR

La eficiencia de NAHR depende de:

Answer 16

・ Longitud del LCR → rearreglo (10-400kb) a > longitud es + probable que se recombine
・ Cercanía del LCR
・ Identidad 96% (se parecen entre sí)

Question 17

NAHR

En la meiosis los NAHR pueden llevarse a cabo en:

Answer 17

• La misma cromátida (intracromátida) → deleción
• Cromátidas hermanas (intercromátida) → deleción y duplicación
• Cromosoma homólogo (intercromosomal) → deleción y duplicación

Question 18

NAHR

Aplicación de los NAHR

Answer 18

Predictor de desórdenes genómicos
(+ LCR + inestable)

Question 19

NHEJ

• ¿Para qué se usan los NHEJ?
• ¿En cuántos pasos consiste?

Answer 19

• Para la reparación DSB (doble strand breaks)
• Consiste en 4 pasos

Question 20

NHEJ

¿Por qué son provocados los DSB?

Answer 20

Errores de recombinación por radiación o ROS

Question 21

NHEJ

4 pasos

Answer 21

1. Detección de DSB
2. Puente de los extremos dañados (Ku)
3. Modificación de los extremos para compatibilidad (Artemis/polimerasa μ y λ)
4. Ligación de extremos (XRCC y ligasa IV)

Question 22

¿La formación de rearreglos por medio de NHEJ es igual de específica como los NAHR?

Answer 22

Falso
(NHEJ no es tan específica como los NAHR pero si se ve estimulada y regulada por la arquitectura genómica)

Question 23

Rearreglo + común en traslocaciones cromosómicas vistas en el cáncer

Answer 23

NHEJ

Question 24

FoSTeS

¿Qué son los FoSTeS?

Answer 24

Mecanismo derivado de la replicación

Question 25

FoSTeS

¿Cuáles son las estructuras que pueden favorecer los FoSTeS?

Answer 25

• ADN palindrómico
• Estructuras de stemloop
• Estructuras cruciformes