Interacciones proteína-proteína y modificaciones postraduccionales Flashcards
V/F
¿El conocimiento de la secuencia nucleotídica y transcriptómica de una proteína es suficiente para conocer su función?
Falso
(Se requiere saber cómo interactúa con otras proteínas)
Clasificación de la interacción de las proteínas
- Dominios de la misma cadena polipeptídica
- Dominios de diferentes cadenas polipeptídicas
- Complejos entre proteínas independientes
・
Metodologías para evaluar las interacciones proteína-proteína (7)
- Rayo X
- ELISA
- Doble híbrido Y2H
- Microarreglo de proteínas
- Microscopía electrónica
- Inmunofluorescencia
- FRET
Doble híbrido Y2H
¿Qué detecta?
Interacción entre 2 proteínas por medio de 2 dominios
Doble híbrido Y2H
Factor de transcripción es separado en 2 partes (dominios):
- Dominio de unión a ADN
- Dominio de activación (AD)
Ambos tienen que estar para que se inicie la transcripción
Doble híbrido Y2H
¿Qué proteínas se les unen a los dominios de unión a ADN y a los dominios de activación (AD)?
Proteínas cuya interacción se quiere analizar
Doble híbrido Y2H
Explicación de la fc 6
- 1 proteina para el dominio de unión a ADN
- 1 proteína para el dominio de activación (AD)
Si las 2 protes interactúan = activan al FT → transcripción del gen reportero
FRET (fluorescence resonance energy transfer)
¿Cómo se van a marcar las proteínas?
Con fluoróforo aceptores (prote 2) y donadores (prote 1)
FRET (fluorescence resonance energy transfer)
Relación de la interacción de las proteínas y la luz emitida (YFP)
Yellow fluorescence protein
Interacción de 2 proteínas → YFP se excita a 480 → emite luz 💛 en 530
Solo se da cuando hay interacción
FRET (fluorescence resonance energy transfer)
Relación de la interacción de las proteínas y la luz emitida (CFP)
Cian fluorescence protein
Interacción de 2 proteínas → CFP se excita a 436 → emite luz 🩵 en 480
Solo se da cuando hay interacción
¿Qué pueden incluir las modificaciones postraduccionales?
- Adición de grupos químicos
- Cortes de cadena polipeptídica
- Plegamiento
Las modificaciones postraduccionales determinan…
- Actividad
- Localización
- Interacciones con otras proteínas
Ej. cascada de cinasas se regula mediante fosforilaciones
Técnicas para identificar modificaciones postraduccionales
Western blot
Características (3)
Western blot
- Separa protes por gel de electroforesis
- Ac de por medio
- Unión Ac-prote se detecta usando marcador radioactivo
Ac se une al a.a P → Anti Ac se une al Ac (radioactividad ✨)