Identificación in silico de secuencias de bases de datos Flashcards
1
Q
¿Cuáles son las bases de datos públicas que se utilizan para identificar secuencias genómicas?
A
- NCBI (pubmed, gene, dbSNP, ClinVar)
- Ensembl
- Universidad de Sta Cruz (UCSC)
2
Q
¿Cuáles son las bases de datos públicas que se utilizan para identificar proteínas?
A
Uniprot
3
Q
Fun fact
A
- rs → SNP
- A1278 → cambio de a.a
- C-T → base
4
Q
Variación
A
Predice el efecto que tiene una variante en una secuencia dada (ej. enfermedades)
5
Q
¿En qué está basado el genome browser?
A
En el proyecto de mil genomas (Análisis de las enfermedades y poblaciones)
6
Q
Para ver la secuencia original y las diferentes variantes
A
NCBI
7
Q
Para ver la frecuencia de la variante en poblaciones
A
Ensembl
7
Q
Para rutas metabólicas
A
Kegg
8
Q
Te da información sobre la variante de la proteína y te da una imagen detallada de el cambio estructural
A
ProtVar
