Análisis genómicos y proteomicos Flashcards

1
Q

Proyecto encargado de descubrir los elementos funcionales de la secuencia

A

ENCODE

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Q

El análisis bidimensional (SDS-PAGE) se analiza mediante:

A
  • Punto isoeléctrico
  • Masa molecular
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Q

El análisis monodimensional (SDS-PAGE) se analiza mediante:

A

Solo masa (tamaño)

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4
Q

Proceso que permite que 22,000 genes podrían originar en una sola célula 500,000 proteínas diferentes

A

Splicing alternativo

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5
Q

El principal objetivo de la proteómica es…

A

Entender:
* Expresión
* Función
* Regulación

Del conjunto completo de proteínas codificadas por un organismo

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6
Q

Las modificaciones post-traduccionales sirven para…

A

Regular:
* Actividad
* Estabilidad
* Localización subcelular

De una proteína, así como sus interacciones con otras proteínas

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7
Q

Las proteínas son efectoras del…

A

Trabajo celular

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8
Q

Técnicas para realizar estudios de las proteínas

A
  • Electroforesis mono y bidimensional
  • Espectrometria de masas (secuenciar protes)
  • Tecnicas in silico (análisis de bases de datos)
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9
Q

Fun fact

A

La proteína de estudio se aísla por la afinidad que tiene con un anticuerpo y las proteínas que están pegadas a ellas se analizan por espectrometría de masas.

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10
Q

Las interacciones proteína-proteína se analizan mediante la purificación por…

A

Afinidad-MS

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11
Q

¿Qué buscan las estrategias de separacion de proteinas?

A

Reducir complejidad y tiempo de analisis

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12
Q

La purificación se monitoriza mediante

A

SDS-PAGE (gel bidimensional)

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13
Q

El proceso de purificación de una proteína supone una secuencia de etapas en las que las proteínas contaminantes se eliminan a partir de…

A

Diferencias de tamaño, carga e hidrofobicidad.

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14
Q

Proceso de espectrometría de masas

A
  • Extracción
  • Tripsina
  • Espectrometría
  • In silico
  • Identificación
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15
Q

Una vez que la proteína llega a su carga neutra se realiza una separación mediante…

A

Iones

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16
Q

Espectrometría de masa

¿Qué peptidasa se utiliza?

A

Tripsina → a.a (específicos)

17
Q

Espectrometría de masa

¿Qué se utiliza para determinar c/u de las masas de los a.a?

A

Espectofotrómetro

18
Q

Espectrometría de masa

¿Qué hace?

A

Usa la relación masa/carga para calcular componentes de una proteína

Ensayo in silico → identificar prote

19
Q

¿Qué es la huella peptídica?

A
  • Capacidad de identificar una proteina
  • Usa espectometria de masas (MS)
20
Q

¿Qué es un MALDI-TOF?

Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight

A

Desorción/ionización laser asistido por matriz a tiempo de vuelo

Está acoplado a la espectrometría de masas

21
Q

PASO 1

MALDI-TOF (La matriz se ⎽⎽⎽⎽)

Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight

A

Co-cristaliza

22
Q

PASO 2

MALDI-TOF (Características del láser)

Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight

A

Láser de 337nm → analito se vuelve en forma gaseosa

23
Q

PASO 3

MALDI-TOF ¿Qué se transfieren las moléculas de la matriz?

Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight

A

Protones ionizando la muestra

24
Q

PASO 4

MALDI-TOF ¿Qué pasa con los residuos de la matriz?

Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight

A

Se eliminan (desolvatación)

25
Q

PASO 5

MALDI-TOF ¿Qué es el tiempo de vuelo?

Matrix Assited Laser Desorption Ionization Time Of Flight

A

Tiempo que pasan las moleculas dentro del analizador

Todas son aceleradas con un campo eléctrico

26
Q

MALDI-TOF

¿Qué se va a evaluar en las moléculas finalmente?

A

Masa y carga

⏱️ que tarda en llegar desde donde se le aplicó la fuerza al detector

27
Q

MALDI-TOF

¿Qué es desorción e ionización?

A
  • Desorción: moléculas separadas cuando se transforman en estado gaseoso
  • Ionización: eliminación de protones
28
Q

Uso del MALDI-TOF

A
  • Identificación de cepas bacterianas y fúngicas (masa y carga)
  • Diagnóstico
  • Valorar la carga de las pts y el tiempo de vuelo