MIKROBIOLOGI(BAKTERIOLOGISKT DIAGNOSTIK) Flashcards
Vad är SYFTET med BAKTERIOLOGISKT DIAGNOSTIK?
SKILJA bakterier från annan agens
RIKTA behandling beroende på svar
EMPIRISK behandling(vi behöver statistik)
KONTROLL efter behandling(STI, H-pylori)
SMITTSPÅRNING asymptomatisk bärare(salmonella eller MRSA)
Vad kan GYNNA en BRA MIKROBIOLOGISK DIAGNOSTIK?
En BRA DIALOG mellan KLINIKERN och KLINISKA MIKROBIOLOGER!
Vad har KLINIKERN och MIKROBIOLOGEN för ROLL vid MIKROBIOLOGISKT DIAGNOSTIK?
KLINIKERN: KÄNNEDOM om METODERNA och hur man använder dem
MIKROBIOLOGEN:
TOLKA ev ge RÅD vb
Vad kan ge fel i SLUTRESULTATET av den MIKROBIOLOGISKA DIAGNOSTIKEN?
PRE-ANALYTISKA FAKTORER
ANALYTISKA FAKTORER
POST-ANALYTISKA FAKTORER
Nämn några EGENSKAPER av PROV med GOD KVALITE?
PRE-ANALYTISKA:
TID: när provet tas
ex: innan ab börjas
PLATS: var tar man prover
MINIMAL KONTAMINATION
RÄTT PROV MATERIAL:
ex: mitt stråle, första portion
PROVINMÄRKNING(d,v,s pat rätt pat id)
BRA REMISS
FÖRVARAS RÄTT före TRANSPORT:
- osterila områden->kallt
- blododlingsflaskor->rumstemp
KORT TRANSPORTTID
Vad menas med en BRA REMISS?
ANAMNES
-datum för insjuknande
INFEKTIONSANAMNES:
typ+allvarlighetsgrad
PROV:
- datum(TID)för provtagning
- prov MATERIALoch lokal(PLATS)
BEHANDLING:
ab behandling?
ANALYS:
Önskad analys
Nämn några METODER inom BAKTEROLOGISK DIAGNOSTIK?
DIREKTMIKROSKOPI
ODLING(INKL BLOD)
ANTIGENPÅVISNING
SEROLOGI!
DIREKTMIKROSKOPI
Vad är GRUNDEN till DIREKTMIKROSKOPI?
FÄRGNING(FFA GRAMFÄRGNING):
- påvisar om bakterier är G+ eller G-
- påvisar hur bakterier ARRANGERAS!(diplokocker, kedjor m.m)
Vad är FÖRDEL respektive NACKDEL med DIREKTMIKROSKOP?
FÖRDEL: snabbt, billigt och enkelt
NACKDEL:
- krävs ERFARENHET
- låg SENSITIVITET: -(normalt prov) utesluter inget
Hur kan man använda DREKTMIKROSKOPI för KOMPLETTERING av ANNAN DIAGNOSTIK?
t.ex Vid TBC kan man hitta SYREFAST-STAVAR sputum->smittFARA!
Var tas PROVET vid DIREKTMIKROSKOPI?
OFTA från STERILA OMRÅDEN!
BAKTERIEODLING
Vad är VIKTIGASTE METODEN i BAKTERIOLOGISKT DIAGNOSTIK?
BAKTERIEODLING!
Vad är FÖRDEL respektive NACKDEL med BAKTERIEODLING?
FÖRDEL:
BILLIGT
-HÖG SPECIFICITET: om vi har patologisk bild så kan man lita på det
-RESISTENSBESTÄMMNING
-ÖPPEN FRÅGESTÄLLNING: man behöver på förhand inte VETA vad man är ute efter
-man kan IDENTIFIERING av ISOLAT och ev BEVARA DET
PÅVISNING av VIABLA BAKTERIER
NACKDEL:
Alla bakterier kan inte ODLAS
KRÄVANDE: kräver god tid, transport, temp, atmosfär
TID:
- flesta AEROBA växer inom 24 h
- ANAEROBA är LÅNGSAMMA
MYKOBAKTERIER tar veckor för att påvisas
Vilka TYPER av SUBSTRAT finns?
FLYTANDE:
för ANRIKNING
FASTA:
-icke-selektiva: många bakterier kan fasta på det(bra för öppen frågeställning)
-selektiva: när man vill leta efter en PATOGEN bland många
-diagnostiska: de är DESIGNADE för en specifik BAKTERIE(d.v.s att om plattan blir grön så är det t.ex pseudomonas)
Vilken TEMPRATUR är OPTIMALT för BAKTERIER?
35-37
Hur kan man IDENTIFIERA BAKTERIEISOLAT?
När BAKTERIEN väl VÄXER så kan man identifiera den till ARTNIVÅ med olika metoder!
Vilka METODER kan IDENTIFIERA BAKTERIEISOLAT?
DIREKTMIKROSKOPI
ENZYMREAKTIONER
MALDI-TOFF
DNA-BASERAD
PCR: för att påvisa TOXINGENER
SEROTYPNING, GENOTYPNING
Vad är MALDI-TOFF?
Man kan påvisa PROTEINPROFILER:
Man SKJUTER bakterier med LASER: deras proteiner JONISERAS och F_LYGER genom en TOF-TUB_(ju tyngre joner, desto längre tid för dem att flyga)->man får PROTEINPROFILER som man jämför med DATABASEN(d.v.s att varje bakterie får sin egna FINGERPRINT)
BLODODLINGAR
Vad är VIKTIGASTE MIKROBIOLOGISKA METODEN för SVÅRA-MEDELSVÅRA INFEKTIONER?
BLODODLING!
Vad är ENDA SÄTTET att RESISTENSBESTÄMMA BLODISOLATET?
BLODODLING!
Vad är GRUNDEN till BLODODLINGSRESULTATAET?
GRAMFÄRGNING+DIREKTMIKROSKOPI(RESULTATET tolkas i relation till KLINIKEN)
Vad BESTÅR BLODODLINGSFLASKOR av?
1 aerob och 1 anaerob flaska(båda rymmer 8-10 ml blod)
*många bakterier är FAKULTATIVA(växer i både aerob och anaerob flaska)
*vissa växer bara i anaerob flaskan(OBLIGAT ANAEROB)
*vissa växer bara i aeroba flaskan(OBLIGAT AEROB): Pseudomonas, H-influensa och Neisseria meningitidis
Hur många BLODODLINGAR bör tas?
X2 d.v.s 2+2: anledningen till detta är att STÖRRE VOLYM ökar KÄNSLIGHETEN!
När ska man TA BLODODLING?
ffa SVÅR-MEDELSVÅR INFEKTION ev INFEKTIONER som kräver SJUKHUSVÅRD: HÖGRE sannolikhet att den visar något
INNAN AB: HÖGRE sannolikhet att den visar något
Vad vill man UNDVIKA vid BLODODLING?
HUDKONTAMINATION; kan göras via
- HUD-DESINFEKTION
- VENPUNKTION(d,v.s inte från kateter)
Kan NYA METODER ERSÄTTA BLODODLING?
NOPE, men kan komplettera och snabba på IDNTIFIERING av ISOLATET!
Vad beror SANNOLIKHETEN för att en BLODODLING ska visa en PATOGEN på? Hur många % av ALLA BLODODLINGAR är +?
SVÅRIGHET: d.v.s att ju mildare infektion så finns sannolikheten lägre att den ska vara +
KÄNSLIGHET
AB beh
8-12% av alla BLODODLINGAR är +
Hur SNABBT får man BLODODLINGSSVARET?
1-BLODODLINGEN blir + inom 1 dygn->då GRAMFÄRGAR man och ger PREL-RESULTAT
2-BAKTERIENS NAMN och RESISTENSBESTÄMNING: ges dagen efter GRAM-FÄRGNING!
OBS att PCR och MULDI-TOF kan ge svar samma dygn som GRAM-FÄRGNING!
3-SLUTLIGA - SVARET ges efter 5 dygn!
Hur kan man TOLKA det PRELIMINÄRA SVARET på en BLODODLING?
Bolla med KLINIKEN om vad detta kan vara!
Se om AB behandlingen har gett svar: om prel-resultat visar s-aureus så bör ab mot s-aureus förbättra patientens tillstånd)
PRELIMINÄRA SVARET: G+ KOCKER I HOPAR, vad innebär detta?
Kan antingen vara
S-aureus: ger MÅNGA typer av infektioner(VRI och sammhällsförvärvad)
KNS:
- dessa är MER RESISTENTA och ger inte svåra infektioner hos GRUNDFRISKA(förutsatt att de inte har infektion orsakad av främmande kropp)
- om det växer KNS i alla flaskor->hud-kontamination
PRELIMINÄRA SVARET: G+ KOCKER I KEDJOR, vad innebär detta?
TYDER på STREPTOKOCKER:
STREPTOKOCKUS PNEUMONIA: DIPLOKOCKER
ALFA-HEMOLYTISKA: dessa ger ENDOKARDIT!
BETA-HEMOLYTISKA(GAS): LÄNGRE KEDJOR
_ENTEROKOCKER(_LITE KORTARE KEDJOR)->låg-virulenta(ger inte svåra infektioner hos GRUNDFRISKA(förutsatt att de inte har infektion orsakad av främmande kropp)
PRELIMINÄRA SVARET: G-STAVAR, vad innebär detta?
PSEUDOMONAS: ger inte svåra infektioner hos GRUNDFRISKA(förutsatt att de inte har infektion orsakad av främmande kropp, cancer)
ENTEROBACTER:
e-coli
Klebsiella
SALMONELLA
B-FRAGILIS(ANAEROB)
PRELIMINÄRA SVARET: G+STAVAR, vad innebär detta?
LISTERIA
CLOSTRIDIER(ANAEROBA)
KONTAMINANTER
PRELIMINÄRA SVARET: G-KOCKER, vad innebär detta?
MENINGOKOCKER!
Vilka JÄSTSVAMPAR kan förekomma i BLODODLINGAR?
JÄSTSVAMPAR:
Är OVANLIGA, men om man tar STÖRRE VOLYM så kan man se dem
ex: CANDIDA
När kan man MISSTÄNKA KONTAMINATION i BLODODLINGAR?
-HUD-DESINFEKTION ÄR DÅLIGT
_-VENPUNKTION(_d,v.s inte från kateter) HAR HAFT DÅLIG TEKNINK
-Om man hittar KNS, DIFFTEROIDER och MIKROKOCCUS i flaskan
-PREL-SVARET blir + efter>1 dygn
-VÄXT i enbart 1 flaska
ANTIGENPÅVISNING
Vad är FÖRDEL respektive NACKDEL vid ANTIGENPOVISNING?
Metoden går ut på att påvisa ANTIGNER på BAKTERIER
FÖRDEL:
SNABBARE
Kräver ingen LEVANDE BAKTERIE
PATIENTNÄRA som t.ex STREP-A test(kan dock användas på labb->antigen i urin eller LIKVOR)
NACKDEL:
Krävs ERFARENHET!
SEROLOGI
Metoden går ut på att påvisa Ig M och Ig G AK
När kan man ANVÄNDA SEROLOGI?
Om ODLING inte kan göras
KOMPLEMENT till andra metoder
KONTROLL av IMMUNITET
Vad menas med EIA?
ENZYME IMMUNOLOGISK ASSAY(en metod för SEROLOGI)
1-BAKTERIEN bildar ANTIGENER
2-KROPPEN bildar AK mot ANTIGENET(PRIMÄRA)
3-Man tillsätter ANTIKROPP+ENZYM(SEKUNDÄR) som angriper den PRIMÄRA AK!
4-Därefter adderar man ett SUBSTRAT som BRYTES ned av ENZYMET->genom ändring i FÄRGINTENSITET så kan man SKATTA MÄNGDEN av KROPPENS AK(d.v.s PRIMÄRA)
Vad menas med IMMUNOBLOT?
1-Man delar upp PROTEINER i bakterier eller virus(d.v.s att man separerar dem)
2-ADDERAR SEPARATA MATERILAET till NITROCELLULOSMEMBRAN
3-ADDERAR patientSERUM
4-AK i SERUM reagerar med ANTIGENET
5-Därefter ADDERARA man en SEKUNDÄR AK(+enzym)->BRYTER ner SUBSTRAT->FÄRGÄNDRING!
OBS!
Hur kan man den RELATIVA KVANTITIVA ANTIKROPPSBESTÄMMNINGEN?
KVANTITATIV EIA: man analyserar PROVETS OPTICAL DENSYTY(d.v.s något inom FYSIK som skattar ABSORBANS av LJUS genom VÄTSKA) för att sedan jämföra med en STANDARDKURVA!
SERUMSPÄDNING: man SPÄDER ut SERUM(1/160, 1/320, 1/680 oh 1/1280) till den HÖGSTA SPÄDNINGSGRAD som ger + REAKTION->därefter ger man titern som INVERTERADE VÄRDET av SPÄDNINGEN i enheter/ml
Vad kan man påvisa med SEROLOGI vid en AKUT INFEKTION?
TITERÄNDRINGEN:
Om man har tagit ett prov lite tidigare så kan man se HÖGA titreringar av AK; när man tar provet senare så kan man se LÅGA titreringar av AK(ju högre TITERFÖRÄNDRING, desto större SANNOLIKHET att man har haft en INFEKTION)
Ig KLASSER:
Ig M
Ig G
AVIDITET:
AK har lägre AVIDITET vid färsk infektion(d.v.s att de inte vill visa sig) och deras aviditet STIGER med TIDEN!
Vad är FÖRDEL respektive NACKDEL med SEROLOGI?
FÖRDEL:
Om agens inte kan ODLAS
AUTOMATISERING: på labb
NACKDEL:
IMMUNSUPPRESSION
BRIST
NYFÖDDA och små barn har dålig AK utveckling
KORSREAKTION mellan AK(naturliga)
Nämn två TILLSTÅND där MIKROBIOLOGISKA DIAGNOSTIKEN är SEROLOGIBASERAD?
SYFYLIS:
Det går inte att odla TREPONEMA PALLIDUM
BORRELIA:
Det är en KLINISK diagnos, men man gör SEROLOGI som komplement!
Vilka AK kan påvisas vid SYFYLIS?
*SPECIFIKA: Ig M och Ig G AK mot TREPONEMA PALLIDUM s.k SYFYLIS TP->Om detta är + så går man vidare med TPPA(Treponema Plllidum Particle Agglutination) som också är en SPECIFIK AK
*kvarstår hela LIVET
OSPECIFIKA:
Om TPPA är+ så tar man RPR(Rapid Plasma Reaginin Test) som är en AK mot CARDIOLIPIN!
Vad är PROBLEMET vid OSPECIFIKA SYFYLIS AK?
Kan bli falskt +
Kan vara - vid sen fas
*dock SJUNKER dessa vid lyckad BEHANDLING!
Vad menas med SENSITIVITET, SPECIFICITET, POSITIV PREDIKATIVT VÄRDE(PPV) och NEGATIVT PREDIKATIVT VÄRDE(NPV)?
SENSITIVITET: + resultat/T-sjuka+F-sjuka
SPECIFICITET: -resultat/T friska+F-friska
PPV: T friska/+ resultat
NPV: T-sjuka/-resultat
Hur ska man tolka om vi har + TP och - OSPECIFIKA?
Kan vara:
TIDIG infektion
SEN tertiär SYFYLIS
Genomgången BEHANDLAD INFEKTION
Fråga om PAT har haft infektion tidigare och gör en undersökning:
Ta om OSPECIFIKA provet efter 4 månader och om det är - så har TP varit faskt +, men om det är +->:(
Vid misstanke om TERTIÄR SYFYLIS: ta om SPECIFIKA PROVET igen, om det är - så har TP varit falskt +, men om det är +->:(
Hur ska man tolka om vi har -TP och + OSPECIFIKA?
Sannolikt FASKT +