Virusmorfologi Flashcards
Vad är ett virus?
En obligat intracellulär parasit
Paketerat genetiskt material
Den minska fenotyp som behövs för genotypens fortlevnad
Vad heter de två “faser” som virus kan förekomma i?
- Viruspartikel
- Virusinfekterad cell
Vilka två “komponenter”, gällande virusinfektion, gör att vi blir sjuka?
- Virusförökningen
- Immunförsvaret, som kan förstöra infekterade celler, tappar kraft
Orsakar alla virus sjukdom?
Nej
Vad är specifikt för virus?
- Storlek: 20 - 300 nm
- Obligat intracellulär parasit - specifika för celltyp, ex. växtvirus, bakterievirus (fager) och animalievirus
- DNA- eller RNA-genom (inte båda)
- Saknar subcellulära organeller
- Saknar metabolism - lever inte av sig själv
- Ej binär delning (replikation) - ej som bakterie, ingen exponentiell delning
- Okänsliga för antibiotika
Vilka beståndsdelar ingår i en viruspartikel?
- Virion - en hel infektiös viruspartikel
- Hölje - lipidmembran med proteiner
- Virala glykoproteiner / spikes - virusproteiner med eller utan glykaner i höljet
- Martix - mellan hölje och kapsid
- Kapsid - symmetriskt proteinlager runt genomet
- Kärna - genomet med associerade proteiner
- Nukleokapsid - kapsid + kärna
Vilka två typer av virusgenom finns?
- DNA
- RNA
Vilka typer av DNA-genom finns?
- Enkelsträngad (ss)
- Dubbelsträngad (ds) - vanligare
- Cirkulärt - enkelsträngad eller dubbelsträngad
Vilka typer av RNA-genom finns?
- Enkelsträngad
- (+) mRNA kopia (härifrån bildas protein direkt)
- (-) inventerat mRNA (komplementär sekvens)
- Dubbelsträngad
- Segmenterad - flera olika arvsmassor (ex. influensavirus)
Ge exempel på virus som har segmenterat genom?
Influensavirus
Vilka är egenskaperna för DNA-virus?
- Oftast dubbelsträngat
- Generellt större genom
- Genetiskt mer stabila - DNA är mer stabild än RNA
- Lägre mutationsfrekvens
- Replikationen sker i cellkärnan
Vilka är egenskaperna för RNA-virus?
- Oftast enkelsträngat
- Generellt mindre genom
- (+)RNA eller (-)RNA
- (+)RNA fungerar direkt som mRNA
- Genetiskt mer instabila
- Högre mutationsfrekvens
- Replikationen sker oftast i cytoplasman - kan därför upptäckas lättare
Vart sker replikationen av DNA-virus respektive RNA-virus?
- DNA - oftast i cellkärnan
- RNA - oftast i cytoplasman
Vad kallas proteinstrukturen som innesluter genomet?
Kapsid
Vilka typer av kapsider finns?
- Helikal - protein snurras runt arvsmassan
- Ikosahedral eller kubisk
- Komplex - ex. makrofag
Virus med vilket genom har oftast en helikal symmetri?
Vanligen virus med ss (-)RNA
Ge exempel på virus med helikal symmetri?
- Influensavirus
- Rabiesvirus
- Mässlingvirus
I ett virus med helikal symmetri, vad styrs kapsidens längd av?
Längden på genomet (RNA-längden)
Ge exempel på virus med en ikosagedral symmetri?
- Poliovirus
- Adenovirus
- Herpesvirus
- Parvovirus
Ge exempel på virus med en komplex symmetri?
- Bakteriofager
- Poxvirus - humanpatogen, med yttre/intre membran
Vad är kapsiden uppbyggd av?
- Proteiner - kapsomerer
- Många kopior av ett eller några enstaka protein
Vilka egenskaper har kapsiden?
- Uppbyggd av proteiner (kapsomerer)
- Många kopior av ett eller några enstaka protein
- Rigid struktur - tålig mot variationer i pH, temperatur och kemisk sammansättning
- Skyddar nukleinsyran
- Vissa icke-höljebärande virus har glykoproteiner eller “spikes” i kapsiden
Vad är icke-höljebärande virus tåliga mot?
- Uttorkning
- Syra
- Detergenter
Vilken typ av smitta utgörs av icke-höljebärande virus?
- Fekal-oral smitta
- Eftersom höljet gör att viruset blir känsligare och skulle ej klara av miljön i magtarmkanalen
Vilka egenskaper har höljet hos höljebärande virus?
- Höljet tas från cellulära membran och omger kapsidstrukturen
- Höljet har inga cellulära proteiner från värdcellen
- Ett intakt hölje är viktigt för virus-cell interaktioner och därmed infektionen
- Glykoproteiner i höljet binder till ny cell
Vad är höljebärande virus känsliga mot, och vilken miljö klarar de inte av?
- Uttorkning
- Syror
- Klarar inte av gastrointestinal miljö
Hur sprids höljebärande virus oftast?
- Droppsmitta
- Kroppsvätskor
- Blodtransfusioner
- Vilket slags genom har detta virus?
- Var finns kapsiden?
- Vad kan det vara för virus?
- Segmenterat genom med kapsid runt varje genomsegment
- Runt varje genomsegment
- Influensavirus
Vilken typ av proteiner är glykoproteinerna i höljet?
Transmembrana proteiner
Vad är ektodomänen och den interna domänen i glykoproteiner, och vilken roll spelar respektive domän?
- Ektodomän (yttre delen) - inbindning, antigena site (antikroppsinbindning), fusion med cellmembran, enzymatisk aktivitet
- Intre domän (inre delen) - ihopsättning av virion
Var finns matrix-proteiner och vad är deras roll?
- Täcker insidan av höljet
- Underlättar uppbyggnad av nukleokapsiden och stabiliserar höljet
Varför behöver virus enzymer?
För att viruset ska kunna använda sig av cellens replikationsmaskineri
Var finns de enzymer som viruset behöver?
- Nukleokapsiden
- Matrixen
Ge exempel på enzymer som virus behöver för att kunna använda sig av cellens replikationsmaskieri?
- Polymeraser
- Proteaser
- Poly(A) polymeras
- Capping enzymer
- t-RNA
I vilka “steg” kan virus klassificieras efter dess strukturella egenskaper?
- Nukleinsyra DNA/RNA, enkel- eller dubbelsträngad och polaritet (+/-)
- Kapsidsymmetri (helikal, kubisk, ilpsaedrisk)
- Höljebärande / icke-höljebärande
Vad är Baltimore-klassificering av virus?
- Klassificering som baseras på de olika genetiska systemen hos virus
Ge exempel på virus som tillhör varje av de 7 klasserna utifrån Baltimore-klassificeringen?
- Adenoviridae, Baculov., Herpesv. (herpes, CMV, EBV), Papilloma, Polio, Pox
- Parvoviridae (AAV)
- Reoviridae (rotavirus, blåtunga)
- Flaviviridae (hepatitis C, denguefeber, gula febern), Picornav. (mul- och klövsjukevirus, förkylning), Togav. (rubella), Tombusv. (tobacco necrosis), Bromov. (alfalfa mosaic), TMV
- Orthomyxoviridae (infulenza), Paramyxov. (mässling), Rhabdov. (rabies), Filov. (Ebola)
- Retroviridae (leukemi, tumörer, immunodeficiencies)
- Hepadnaviridae (hepatitis B), Caulimov.
Vilka “delar” ingår i en virusklassifikation?
- Familj
- Genus
- Typ (ex. 1, 2, 3, 4)
- Stam - vart de hittas (ex. de novo)
Vad slutar familjenamnet, respektive genusnamnet för virus med?
- Familjenamnet slutar med -viridae
- Genusnamnet slutar med -virus
