Bakteriegenetik och mobila element Flashcards
Vad heter den plats i bakterien där dess arvsmassa finns?
Nukleoid
Har nukleoiden hos en bakterie ett cellmembran?
Nej
Vad är den molekylärbiologiska (centrala) dogmen?
Jämför DNA replikationen för en E. coli-bakterie och en människa. Vad är störst/minst hos följande i respektive organism?
- Kromosomstorlek (baspar)
- DNA synteshastighet
- Okazakifragment
- Antal replikationsorigin
- Tid för fullständig replikation
- Kromosomstorlek (baspar) - betydligt större för människa (bakterie har dessutom bara 1 cirkulär kromosom, människor 46)
- DNA synteshastighet - betydligt snabbare för bakterie
- Okazakifragment - Fler för bakterier
- Antal replikationsorigin - Endast 1 för bakterie, 30.000 för männska
- Tid för fullständig replikation - Nästan samma (0,64 vs 1 h)
Nämn tre fundamentala skillnader i trankriptionen hos en prokaryot, jämfört med en eukaryot?
- Ingen processing av mRNA, prokaryoter saknar intron.
- Prokaryoter har polycistroniskt mRNA.
- Hos prokaryoter kan transkription och translation av en och samma mRNA sträng ske samtidigt.
Vad är en intron för något?
Junk DNA/RNA, skräp i sekvensen
Vad är polycistroniskt mRNA?
mRNA som kan koda för flera olika gener. På samma transkript ryms kod för flera olika proteiner.
Vems ribosom är störst, din ribosom eller en bakteries?
Din ribosom
Den mänskliga ribosomen är 80S (60S + 40S)
En bakteries är 70S (50S + 30S)
I bakteriers ribosom finns en välkänd gen som kan utnyttjas för att identifiera och typa bakterier. Vilken?
16S-genen
Förklara hur 16S typning funkar?
16S typning innebär att man tittar på likheter och skillnader mellan din bakterie du analyserar och information i databaser där andra bakteriers 16S-gen. Likheter och skillnader i genens innehåll används för att göra jämförelser och typa din bakterie.
Vad är topoisomeraser?
Enzymer som ändrar DNA molekylers topologi, hur molekylerna är tvinnade/konfigurerade)
Vad heter enzymen som iniberar transkription (inhiberar bakteriellt polymeras)?
Rifamyciner
Vad innebär pangenom och core genom? Skillnader?
- Pangenom: alla gener som hittats i t.ex. olika E. coli varianter (gener som kan förekomma)
- Core genom: gener som är gemensamma för alla E.coli varianter (gener som alltid förekommer hos alla varianter av E. coli)
Vilken process i bakterien angriper många antibiotika?
Translationsprocessen
Vad innebär det att bakteriella genom har en hög gendensitet?
- Inga introner
- Kodade gener sitter tät ihop