Pseudogenes Flashcards
¿Qué son?
Secuencias de DNA derevidas de la duplicación o de la retroposición de genes funcionales que han sido sometidos a selección natural, y por lo tanto, retienen gran parte de la secuencia y estructura original.
¿De dónde se originan?
Repeticiones tandem
¿Por qué se da la capacidad de perder una proteína?
Acumulación de mutaciones → codones de paro prematuros, mutaciones que alteran el marco de lectura, adiciones o deleciones
Psudogenes vs Genes
90% de concordancia con homólogo
* **Gen ferroquetalasa **→ exones 2-11 82-93%, región 5´63%
* Gen lactato deshidrogenasa → Región 5´y 3´con el doble de diferencias
Tipos de pseudogenes
Según su tipo de duplicación
Nonprocessed pseudogenes
- Remanentes de genes duplicados en tándem
- Mantiene la estructura de intrones y exones
- No estricta → flexibilidad mutacional
- Pseudogenes dentro → no produce proteína
Processed pseudogenes
CARECEN DE INTRONES Y DE ELEMENTOS REGULADORES
Transcripción y procesamiento → mRNA → retrotranscripción → cDNA → integración cromosómica → mutación o transcribe (RETROGEN → no intrones
Unitary pseudogenes
Genes que no tienen un gen parental funcional en el genóma (pudieran estar en otras espcies → marsupiale)
Posible función
- Reguladores postranscripcionales de genes funcionales al codificar miRNA
- Pueden transcribirse aunque no tengan la estructura completa → enfermedad
- Diversidad de Ac
- Variación genética
The GENCODE
Proyecto del consorcio de ENCODE que ha indentificado 12,000 pseudogenes
Funciones
siRNA o miRNA
* Regulación
* Generación Ac y Ag
* Recombinación de genes funcionales
* Recombinación con genes funcionales → enfermedad