Modelaje molecular y estructuras 3D Flashcards
Importancia de la estructura terciaria
Realizar de manera adecuada su función.
AA
Unidad de construcción de las proteínas.
Estructura de un AA
- C central
- Amino → NH2
- Carboxilo → COOH
- H
- Cadena lateral o grupo R → variable
Importancia de la cadena R
- Le da su característica química a cada AA.
- Varia: tamaño, forma, hidrofobicidad, carga y reactividad.
Tipo de enlace entre AA
Covalente
Estructura primaria
- Arreglo lineal simple
- Polemerización de aa
- Péptido o polipéptidos
- Tamaño → Da
Péptido
Cadena corta de aa unidos por enlaces peptídicos.
* 20-30.
Polipéptido
Cadena larga de aa unidos por enlaces peptídicos.
>100-4000
Estructura secundaria
- Espacios que se generan después del plegamiento.
¿Qué produce la estructura espiral y qué tipo de estructura es?
No hay interacción de enlaces no covalentes estabilizadores.
Estructura secundaria.
¿Cuándo se adquieren las estructuras de la estructura secundaria?
Cuando se estabilizan los puentes de H en los residuos.
* Hélices alfa
* Hojas beta
Hélices alfa
- C-O → Puente de hidrógeno → amino-H
- Todos los puentes de hidrógeno donadores están dirigidos a la misma dirección.
- Grupos R en los extremos.
¿Qué determinan los grupos R?
La hidrofobicidad o la hidrosolubilidad.
Hojas Beta
Láminas beta
* Hebras paralelas de dos cadenas de aa formadas por puentes de hidrógeno.
* Hebras cortas (5-8 residuos)
* Paralela o antiparalela
¿Qué determina la direccionalidad de la lámina beta?
El enlace peptídico
