Proteómica del cáncer Flashcards
¿Qué es necesario para poder evaluar un proceso de enfermedad?
- Perfil de expresión
- Modificaciones postraduccionales
- Interacciones proteína-proteína
- Estructura de la proteína
- Función de la proteína
¿Qué ha permitido estudiar la identificación de biomarcadores y patrones de expresión en el caso del cáncer?
- Prognosis del tumor →Expresión diferencial en cada etapa
- Predicción
- Clasificación del tumor
- Identificación de potenciales respuestas
Análisis llevado a cabo en la proteómica del cáncer
- Recolección de muestras → tejido, sangre y células
- Extracción de proteínas
- Preparación de péptidos → digestión por proteasas, solución o gel y fraccionamientoo de péptidos
- LC-M análisis → solo SM
- Búsqueda en la base de datos
- Análisis e identificación y quantificación
- Datos → AA presentes
Heat maps
En microarreglos → Hay o no hay expresión de una proteína
Puntos relevantes del estudio del cáncer
- Crecimiento celular descontrolado → rutas metabólicas y expresión diferencial.
- Metástasis → Casacada de inicio de la metástasis, modificación de la expresión del receptor de glucocorticoides, identificación de moléculas para frenarla.
- Resistencia a fármacos → patrón de expresión específico en la resistensia, fármacos dirigidos a las proteína resistentes, INMUNOTERPIA (cáncer específico)
CPTAC
- 2011
- Metabolómica, proteómica y genómica del cáncer
- Microarreglos → Evolución de transcriptómica
- Base de datos
Programas cerados a partir de CPTAC
APOLLO
* The applied proteogenomics organizational lerning and outcomes.
* Unión del conocimiento de la innvestigación oncológica con el sistema de salud.
ICPC
* International cancer proteogenome cansortium
* Permite la coperación de más de 10 países para estudiar dx de cánceren varias poblaciones para intercambiar datos de dx efectivos.