Fuentes de variación entre individuos Flashcards
¿A qué se deben las variaciones en el genoma humano?
Diferente ordenamiento de las bases nitrogenedas en el ADN.
Variabilidad genética entre individuos de una misma especie
0.1%
Variabilidad genética interespecies
- Cerdos → 90%
- Vaca → 80%
- Abeja → 61-75%
- Gorila → 95-99%
Secuencias propensa a la variabilidad dentro del genoma humano
No codificantes → polimorfismos
Gen
“Sección de ADN con una secuencia determinada para la creción de una proteína específica”.
* Se presentan dobles → padre y madre
Locus
Posición física en donde se encuentra un gen en el genoma.
loci → plural
Polimorfismos génicos
- En regiones codificantes
- Puden tener efecto o no en el fenotipo.
- Variablidad de proteínas o grupo sanguíneo (p. bioquímico)
- No dañinas→ responsables de la diversidad genética
Polimorfismos genéticos
En regiones no codificantes → reguladoras e intrones.
* Pueden dar origen a una alteración funcional
Origen de los polimorfismos
- Recombinación homóloga
- Segregación de los cromosomas
- Mutaciones
- Duplicaciones
- Transposiciones
Motor de la evolución
Transposiciones
Polimorfismo
- Alelo en un locus en la población que presenta una frecuencia de más de 1%.
- Comunes y no se dan al azar.
Divergencia genética
Las mutaciones se acumulan y se vuelven comunes.
Tipos de polimorfismos en el DNA
SNPs → Cambio de un solo nucelotido
InDels → Cambio en el tamaño de la secuencia
STRs, VNTRs y satélites → Cambio por el número de repeticiones
SNPs
- Deleción, inserción o sustitución de una bn.
- Frecuente en secuencias codificantes → 1000-3000pb
- En secuencias no codificantes → 500-1000pb
DIPS
Polimorfismos producidos por deleciones o inverciones
Ventaja de los SNP
- Biomarcadores → en todo el genoma
- Estabilidad
- Frecuencia
Tipos de SNPs
- Cambio C → T
- Inserción o deleción
- RFLP
rs → reference polymorfism + número de serie específico
Secuencias repetitivas de tamaño variable
- Sátelites
- Microsatélites
- Minisatélites
Microsatélites
STR
* Secuencias de 2 a 4 repetidos
* Extensión menor a 10pb
¿Cómo se identifican los microsatélites?
PCR
Iniciadores específicos que flanquean el sitio de la secuencia donde están localizados los mini o microsatélites.
Tipos de STR
- Perfectos → sin ser interrumpidos y de forma ordenada.
- Interrumpidas
- Combinadas
STR
- Pruebas de paternidad
- Genética forense
- No están distribuidos por todo el genoma
D12S391
D → DNA segement
Número de Chr
S → Single copy sequence
Número de serie
¿Cómo se comparan los STRs?
Número de repeticiones
¿Cómo se forman los satélites?
- Recombinación meiótica
- Entrecruzamiento disparejo →
En cromosomas homólogos → UEC (unequal crossover)
En cromátidas hermanas → UESCE (Unequal sister chromatid exchange)
Tartamudeo de la polimerasa
- Provoca la adición de unidades repetidas en tándem
- Deslizamiento en la polimeraas puede causar inserciones o deleciones
- En la replicación en la hebra transcrito
VNTR
- Loci de secuencias cortas
- 10-50pb
- Repetidas en bloque o tándem un número específico de veces
- Teloméricas
- Cantidad de repeticiones será la variabilidad de alelos distintos en un mismo locus.
Medio de identificación de los VNTR y STR
Distribución en gel
Satélites
- 100-200 repeticiones
- Centrómeros, regiones cercanas a los telómeros o regiones intracromómicas
Árbol genealógico
Polimorfismos del cromosoma Y
- Microsatélites → AC
- Indice de mutación bajo → no implicaciones en reproducción
- Identificación de parentescos por línea paterna
Polimorfismos mitocondriales
- Herencia materna
- Identificación de parentesco por línea materna → DNA mitocondrial
RFLP
- Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción
- Técnica útilizada para la identificación de polimorfismos
- Al modificar uno de los nucleotidos modifican la longitud de los fragmentos de restricción
- Uso de enzimas de restricción → si reconoce noo corta
Enzimas de restricción
- Proteínas aisladas de bacterias que realizan cortes a la molécula de ADN de manera muy específica
- Corte romo y corte cohesivo → fragmentos de restricción → hidridan con sondas → reconocimiento
Ejemplo RFLP
Homocigoto silvestre AA → El sitio de restricción se reconoce en ambas cadenas
Homocigoto sin corte variante CC → No presenta sitio de restricción, corta una sola banda
Heterocigoto AC → Tienen alelos diferentes en un mismo locus. Se observa uno con corte y uno sin corte.
PCR+digestión con R+electroforésis
Clasificación por efecto de los polimorfismos
Neutro → No altera la expresión, en regiones no codificantes.
Sinónimos o silientes → Variación en la lectura del código genético, que no cambia la traducción → mismo aminácido, difrente codon.
** No sinónimos** → Variación en el código genético, cambia el sentido de la traducción de un aminoácido por otro.
Útilidad del análisis de polimorfísmos
- Huella genética → patrón
- Ciencias forenses → comparación de sospechosos.
- Identificación de restos humanos.
- Estudios evolutivos → polimorfismos en “y” o mitocondriales.
Polimorfismo usado en ciencias forenses
STRS
Ejemplo 2 RFLP
