Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Kemija - 2. delni izpit > Proteini > Flashcards

Proteini Flashcards

1
Q

definicija proteoma

A

nabor vseh proteinov posameznega organizma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

sestavni gradniki proteinov

A

20 standardnih AK, od katerih so lahko nekatere modificirane

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

primer posttranslacijsko spremenjenih AK v proteinih

A

hidroksiprolin in hidroksilizin v kolagenu
selenocisein (stop kodon UGA)
prisotne tudi v miozinu in pro-trombinu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

V katerih proteinih najdemo ornitin in citrulin?

A

nobenih

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

vezi med AK v proteinih

A

peptidne vezi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

mesto nastanka peptidnih vezi in molekule, ki pri tem sodelujejo

A

ribosomi

mRNA, rRNA, tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

mehanizem nastanka peptidne vezi

A

povežeta se -COOH in -NH2 skupina, odcepi se voda in nastane amidna oziroma peptidna vez

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Kaj daje rigidnost peptidni vezi?

A

prost elektronski par na dušiku, ki se razporedi so celi vezi - peptidna vez je na pol dvojna vez

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

konfiguracija večine peptidnih vezi

A

trans-konfiguracija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

število AK v peptidu

A

2-10

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

število AK v polipeptidu

A

10-100

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

število AK v proteinu

A

> 100

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

definicija enote Dalton

A

1 DA = 1/12 mase atoma C12

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

povprečna molekulska masa AK in proteina

A 
M(AK) = 128 g/mol 
M(P) = n*110 g/mol
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

vloga proteinov

A

opora, transport, skladiščenje, uravnavanje izražanja genov, obramba, kataliza, signalizacija, gibanje…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

primarna struktura proteinov

A

zaporedje AK poezanih s kovalentnimi vezmi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

vezi med AK v proteinih

A

peptidne in disulfidni mostički

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

bolezenska stanja pri zamenjavi AK v zaporedju za protein

A

1) anemija srpastih celic (GLU — VAL)
2) hemolitična anemija
3) cistična fibroza

19
Q

metode za določanje zaporedja AK

A

1) Sangerjeva metoda (fluorodinitrobenzen)
2) Edmanova metoda (fenilizotiocianat)
3) masna spektrometrija

20
Q

pomen zaporedja AK

A
  • nosi informacijo o sekundarni in terciarni zgradbi (prostorska struktura)
  • določa vlogo in lokacijo proteina
  • evolucijska vloga (primerjava med sorodnimi organizmi)
21
Q

bolezenska stanja povezana z napakami v sekundarni strukturi

A

1) prionske bolezni
2) Alzheimer
3) Parkinson

22
Q

sekundarna struktura proteina

A

stabilni strukturni elementi

23
Q

pogosti sekundarni strukturi proteina

A

alfa vijačnica in beta struktura

24
Q

stabilizacija alfa vijačnice proteinov

A

vodikove vezi znotraj vijačnice med C=O n-te aminokisline in NH n+4-te aminokisline v vijačnici

25
Q

AK ostanki, ki destabilizirajo vijačnico

A

prolin, glicin, valin, tirozin, izolevcin in zaporedja nabitih AK

26
Q

pozicija nasprotno nabitih stranskih verig v alfa vijačnici

A
  1. na n mestu, nasprotno nabita na n+3/4 mestu
27
Q

Kaj se zgodi na koncu zaporedja AK v vijačnicah?

A

ustvari se delni naboj, ki se stabilizira s C- (negativen) ali N-terminalnim (pozitiven) koncem

28
Q

stabilizacija beta strukture

A

vodikove vezi med C=O in NH druge AK, a so te vezi lahko vzpostavljene znotraj istega zaporedja ali med različnimi polipeptidnimi verigami

29
Q

položaj stranskih verig v beta strukturi

A

izmenično pod in nad strukturo

30
Q

primer v beta strukturo povezanih AK

A

glicin in alanin v keratinih - vsebujeta tudi beta zavoje

31
Q

Kaj tvori cca 1/3 AK ostankov?

A

zavoje ali zanke

32
Q

definicija beta zavoja

A

pogost zavoj, ki povezuje antiparalelne beta strukture in vključuje 4 AK, vodikova vez pa nastane med C=O in NH tretje

33
Q

možne rotacije okoli vezi v peptidih

A

peptidna vez je rigidna in ni sposobna rotacije

mogoča je rotacija okrog N-C(alfa) in C-C(alfa) vezi, ki jo opišeta dihedralna kota psi (CC) in fi (NC)

34
Q

Kaj določata/omogočata kota fi in psi?

A

sekundarno strukturo proteina in cis-konformacijo

35
Q

terciarna struktura proteina

A

njegova prostorska struktura, v kateri protein zavzame določeno konformacijo, ki predstavlja razporeditev atomov v prostoru

36
Q

nativna konformacija proteina

A

konformacija proteina, v kateri ima najnižjo energijo/najnižjo prosto entalpijo

37
Q

stabilizacija tercialrne strukture

A

šibke interakcije (hidrofobne, vodikove vezi, ionske interakcije)
pri nekaterih proteinih (inzulin) tudi disulfidni mostički

38
Q

metode določanja terciarne strukture

A 
rentgenska kristalografija 
NMR spektroskopija (manjši P)
39
Q

nastanek proteinskega motiva

A

posamezni elementi sekundarnih struktur se povezujejo v stabilne, geometrijsko urejene strukture, ki jim pravimo motivi

40
Q

proteinske domene

A

več združenih motivov

41
Q

kvartarna struktura proteina

A

nastane s povezovanjem različnih podenot v prostoru

42
Q

vezi med podenotami kvartarne strukture

A

hidrofobne in ionske interakcije (identične podenote)

43
Q

vloge kvartarne strukture in primeri

A

1) regulatorna vloga (konformacijske spremembe)

2) strukturna vloga (povezovanje fibrilarnih proteinov)

Kemija - 2. delni izpit (37 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions