Nukleotidi Flashcards
sestavine nukleotidov
- dušikova baza
- sladkor: riboza ali deoksiriboza
- fosfat
povezava med dušikovo bazo in sladkorjem
N-glikozidna vez med mestom 3 na bazi in C1 sladkorja
povezava med sladkorjem in fosfatom
fosfoestrska vez med fosfatom in C5 sladkorja
delitev dušikovih baz
1) piramidini
2) purini
zgradba in primeri purinskih baz
dva obroča
adenin in gvanin
zgradba in primer pirimidinskih baz
en obroč
citozin, timin, uracil
tavtomerije dušikovih baz
1) laktam/laktim tavtomerija
2) imin/enamin tavtomerija
prekurzor pirimidinskih baz
orotinska kislina
gradniki orotinske kisline
amonijak, 2 ATP, hidrogenkarbonat, asparaginska kislina
pretvorba UTP v CTP
NH3 nadomesti fosfat na laktim obliki UTP
pretvorba CTP v UTP
hidroliza iminske oblike, kjer se amino skupina nadomesti s karbonilno
petvorba dUMP v dTMP
metilacija preko metilen-tetrahidrofolata
prekurzor purisnkih baz
5-fosforibozilamin
pogoj za tvorbo N-glikozidne vezi med N-bazo in sladkorjem
aktivacija sladkorja (fosforilacija), nastane riboza-5-fosfat
potek nastanka purinskih baz
v nizu reakcij nastane inozin-5-fosfat, ta se aminira do AMP, ta lahko oksidira do GMP
razlika med nukleozidom in nukleotidom
nukleozid = dušikova baza + sladkor nuklaotid = dušikova baza + sladkor + pirofosfat
Kaj omogoča več konformacij nukleozidov?
rotacija okrog N-glikozidne vezi
najpogostejši konformaciji nukleozidov
syn in anti
mesta fosfoestrske vezi na nukleozidih
2, 3, ali 5 (na deoksinukleozidih brez 2)
vrsta vezi med nukleotidi in fosfati
fosfoanhidridna vez
