Lastnosti in reakcije nukleinskih kislin Flashcards
naboj in pKa nukleinskih kislin
negativen naboj s pKa okrog 2
H kateri elektrodi potujejo NK v elektroforezi?
anodi (pozitivni)
Zakaj lahko NK absorbirajo UV svetlobo?
zaradi purinskih in pirimidinskih baz, ki vsebujejo aromatske obroče
Kaj merimo s hipokromnim učinkom?
T tališča dvojne vijačnice
razdelitev reakcij na NK
1) reakcije, ki potekajo na ogrodju
2) reakcije, ki potekajo na bazah
hidrolizo fosfoestrskih vezi katalizirajo X (podrazred encimov)
X… nukleaze
delitev nukleaz
1) eksonukleaze (cepijo na koncu verige)
2) endonukleaze (cepijo na sredini verige)
kondenzacijo fosfoestrskih vezi katalizirajo X (podrazred encimov)
X… ligaze
sintezo DNA katalizira X (podrazred encimov)
polimeraza
tipi reakcij na dušikovih bazah
metilacije, acetilacije, fosforilacije, deaminacije, depurinacije…
Z reakcijami na dušikovih bazah dobimo X
X… derivate
Zakaj je genom nagnjen k spremembam?
DNA je termodinamsko zelo neugodna zaradi svoje urejenosti in s tem nizke entropije
metilacija gvanina: popravljanje, problem
metiliran gvanin je mogoče popraviti z metiltransferazo, ki prenese metilno skupino na cistein (tiolna skupina), dokler se DNA še ni podvojila
pri drugem podvajanju se izgubi vsaka informacija vezave gvanina, saj metiliran gvanin tvori vezi s timinom
povezava dveh timinov: pogoj
pod vplivom UV svetlobe tvorita timinski dimer (napaka v DNA)