Encimi

Question 1

lastnosti encimov

Answer 1

• proteini ali ribocimi z veliko katalitično močjo
• substratno specifični
• ne spremenijo ravnotežja reakcije, ampak jo samo pospešijo
• imajo aktivno mesto
• zmanjšajo energijo predhodnega stanja z vezavo substrata na A
• običajno del organizirane metabolne poti - delujejo s kofaktorji

Question 2

mesto poteka encimske katalize

Answer 2

različne funkcionalne skupine aminokislinskih radikalov

Question 3

primeri kofaktorjev

Answer 3

1) metalni ioni
2) koencimi
3) prostetične skupine

Question 4

drugo poimenovanje neaktivnih in aktivnih encimov

Answer 4

aloencimi in holoencimi

Question 5

sestava holoencima

Answer 5

apoencim + kofaktor/koencim (proteinski del in neproteinski del)

Question 6

vezavna energija

Answer 6

energija, potrebna, da se substrat v predhodnem stanju veže na encim

Question 7

znižanje aktivacijske proste entalpije za X kJ/mol zadošča za Y povečanje hitrosti

Answer 7

X… 5.7 kJ/mol

Y… 10x

Question 8

razredi encimov

Answer 8

1) oksidoreduktaze
2) transferaze
3) hidrolaze
4) liaze (sintaze)
5) izomeraze
6) ligaze (sintetaze)

Question 9

podrazredi oksidoreduktaz

Answer 9

1) dehidrogenaze
2) oksidaze
3) peroksidaze
4) oksigenaze

Question 10

koencimi dehidrogenaz in mehanizem delovanja

Answer 10

oksidirane oblike koencimov (NAD+, NADP+, FAD, FMN) sprejemajo elektrone v obliki vodikovih protonov ali hidridnih anionov

Question 11

primer reakcij z dehidrogenazami

Answer 11

oksidacija malata v oksaloacetat/sukcinata v fumarat

Question 12

kofaktorji oksidaz in peroksidaz

Answer 12

kisik oziroma vodikov peroksid kot končna prejemnika elektronov
Hem in Fe-S klatrati delujejo kot prostetične skupine

Question 13

mehanizem delovanja oksigenaz in kofaktorji

Answer 13

v reakcijo neposredno vnesejo kisik

pogosti so Fe kompleksi

Question 14

namen transferaz

Answer 14

prenos funkcionalne skupine iz ene molekule na drugo

BISUBSTRATNI encimi

Question 15

kofaktor transaminaz in njihov mehanizem delovanja

Answer 15

potreben je PLP (piridoksal-fosfat), ki se pretvori v piridoksamin-fosfat in regenerira z alfa keto kislino
prenašajo aminske skupine

Question 16

kofaktor transketolaz

Answer 16

TPP (tiaminpirofosfat)

Question 17

kofaktor kinaz

Answer 17

ATP

Question 18

kofaktor aciltransferaz

Answer 18

koencim A s tiolno skupino

Question 19

kofaktor metil transferaz

Answer 19

S-adenozilmetionin

Question 20

razredi transferaz

Answer 20

1) C1 transferaze
2) aminotransferaze
3) gikoziltransferaze
4) fosfotransferaze

Question 21

razredi hidrolaz

Answer 21

1) esteraze
2) glikozidaze
3) peptidaze
4) amidaze

Question 22

naloga hidrolaz

Answer 22

prenos funkcionalne skupine na vodo

Question 23

posebnost delovanja hidrolaz

Answer 23

za svoje delovanje ne potrebujejo koencimov ali prostetičnih skupin

Question 24

naloga liaz

Answer 24

tvorba vezi, brez dodatne enrgije ATP

Question 25

reakcija glutaminaze

Answer 25

pretvorba L-glutamina v L-glutamat

Question 26

reakcija karboanhidraze + kofaktor

Answer 26

katalizira tvorbo C-O vezi med OH- in CO2

kofaktor je cinkov (II) ion

Question 27

naloga aldolaze

Answer 27

katalizira aldolno kondenzacijo in retroaldolno reakcijo

Question 28

tipi aldolaz po mehanizmu katalize

Answer 28

1) kovalentna

2) s kovinskim ionom

Question 29

V katero skupino encimov uvrščamo citrat sintazo?

Answer 29

transferaze

Question 30

reakcija citrat sintaze

Answer 30

pretvorba oksaloacetata v citrat

Question 31

V katero skupino encimov uvrščamo ATP sintazo?

Answer 31

hidrolaze

Question 32

naloga izomeraz

Answer 32

intramolekularne oksidoreduktaze -> kataliza tavtomerij…

Question 33

primeri izomeraz

Answer 33

1) UDP-glukoze-4-epimeraza
2) fosfotriozna izomeraza
3) fosfoheksozna izomeraza

Question 34

reakcija UDP-glukoza-4-epimeraze

Answer 34

pretvorba UDP-glukoze v UDP-galaktozo

Question 35

reakcija fosfotrioze izomeraze

Answer 35

pretvorba aldoze v ketozo

Question 36

reakcija fosfoheksoze izomeraze

Answer 36

pretvorba glukoze-6-fosfat v galaktozo-6-fosfat

Question 37

kofaktor fosfoheksoze izomeraze

Answer 37

Mg2+

Question 38

naloga ligaz/sintetaz

Answer 38

tvorba vezi ob porabi ATP energije

Question 39

reakcija glutamin sintetaze

Answer 39

katalizira sklopljeno endergonsko reakcijo kondenzacije karboksilne skupine z NH3 –> pretvorba glutamata v glutamin

Question 40

reakcija karbamoil fosfat sintetaze

Answer 40

pretvorba bikarbonata v karbamoilni fosfat

Question 41

reakcija piruvat karboksilaze

Answer 41

pretvorba piruvata v oksaloacetat

Question 42

kofaktor piruvat karboksilaze

Answer 42

ATP in biotin

Question 43

pomeni biotina v reakciji piruvat karboksilaze

Answer 43

ATP se najprej veže na biotin in nato na piruvat