Membranski proteini

Question 1

funkcije membranskih proteiniov

Answer 1

1) transport organskih molekul
2) komunikacija
3) celični stiki
4) kataliza reakcij
5) dihalna veriga

Question 2

vrste vstavljanja proteinov v membrano

Answer 2

integralni, periferni in amfitropični

Question 3

povezave integralnih proteinov z membrano

Answer 3

močne hidrofobne interakcije

Question 4

povezave perifernih proteinov z membrano

Answer 4

šibke interakcije - elektrostatske in H-vezi

Question 5

amfitropični proteini

Answer 5

so vezani na membrano, lahko pa se sprostijo v citosolu

Question 6

tipi integralnih proteinov

Answer 6

1) tip I in II prečkata membrano enkrat
2) tip III membrano prečka večkrat
3) tip IV je na membrano pripet preko nekega sidra
4) tip V sestavlja več polipeptidnih verig, ki prečkajo membrano
5) tip VI prečka membrano in se hkrati pripenja nanjo preko sidra

Question 7

razlika med integranimi proteini I in II

Answer 7

pri integralni proteinih I v notranjost celice štrli COO- konec, pri tipu II pa NH3+

Question 8

primer IP I in njegova naloga

Answer 8

glikoforin

to je protein v membrani eritrocitov, ki suži za medcelično prepoznavanje

Question 9

zgradba glikoforina

Answer 9

v membrani se nahaja 19 aminokislin verige, ki so organizirane v alfa vijačnice
zunanji del je glikoziliran s tetrasaharidom iz dveh saličnih kislin, galaktoze in N-acetilglukozamina, tetrasaharid pa se povezuje preko O-glikozidnih vezi na serin in treonin

Question 10

primer IP III

Answer 10

protonska črpalka bakteriorodopsin in vidni pigment rodopsin

Question 11

struktura protonske črpalke bakteriorodopsin in rodospina

Answer 11

7 hidrofobnih transmembranskih alfa vijačnic

Question 12

Kako lahko napovemo topologijo membranskih proteinov?

Answer 12

Če pogledamo na indeks hidrofobnosti AK radikalov, lahko vidimo kje so polarne in kje nepolarne aminokisline
po tem lahko sklepamo, da so nepolarne aminokisline v notranjosti membrane, polarne pa gledajo not/ven

Question 13

AK na meji med membrano in vodnim okoljem

Answer 13

na meji med membrano in zunanjostjo/notranjostjo oziroma vodo se pogosto nahajata triptofan in tirozin, ki vstopata v interakcije z vodnim okoljem in membrano

Question 14

AK na citoplazmeski strani membrane

Answer 14

bazične AK - arginin, lizin, histidin

Question 15

struktura in vloga beta sodčkov v membranskih proteinih

Answer 15

vsebujejo 20 ali več transmembranskih segmentov z beta verigami v obliki cilindra, kar omogoča maksimalno število vodikovih vezi med C=O in NH v peptidnih vezeh

Question 16

vrste lipidnih sider

Answer 16

1) acilna sidra
2) izoprenoidna sidra
3) glikozil fosfatidil inozitolna sidra

Question 17

povezave, ki se tvorijo a acilnimi sidri

Answer 17

• palmitoilacija: vezava s cisteinom znotraj proteina

- miristoilacija: vezava z amino skupino na amino terminalnem glicinu

Question 18

primer vezave z izoprenoidnim sidrom

Answer 18

farnezil, ki se veže s karboksilno skupino karboksi terminalnega cisteina: geranil geranilna sidra

Question 19

sestava GPI sidra

Answer 19

dva repka v mebrani sta vezana na fosfatidil inozitol, ki je vezan na oligosaharidno jedro