Problème 2 - Organismes causant diarrhée infectieuse

Question 1

Dans les organismes causant des diarrhées infectieuses, il y a des virus. Parle-moi de leur épidémio, des organismes fréquents, de la clinique, de la durée et du traitement pour ces organismes.

Answer 1

• Épidémio : forme la plus fréquente, incubation courte (1-4 jours)
• Organismes fréquents : norovirus (adultes), rotavirus (enfants)
• Clinique : diarrhée aqueuse sécrétoire, nausées et vomissements, fièvre légère (parfois), crampes.
• Durée : 2-6 jours, autorésolutif.
• Traitement : hydratation, anti-diarrhéique.

Question 2

Dans les organismes causant des diarrhées infectieuses, il y a des bactéries. Parle-moi de leur épidémio, des organismes fréquents, de la clinique, de la durée et du traitement pour ces organismes.

Answer 2

• Épidémio : incubation variable (1-8 jours), transmission fécale-orale, eau contaminée, nourriture contaminée, personne à personne (parfois)
• Organismes fréquents : E. Coli (entérotoxigénique, entéroagrégatif, entéropathogénique), vibrio cholerae.
• Clinique : Diarrhée sécrétoire aqueuse,
• Durée : 3-7 jours, auto-résolutif pour la plupart.
• Traitement : hydratation, anti-diarrhéique (pas si fièvre ou sang), antibio au besoin.
• Épidémio : idem.
• Organismes fréquents : E. Coli (entérohémorragique, entéro-invasif), Salmonella, Shigella, C. difficile, Yersinia enterolytica, Campylobacter jejuni
• Clinique : dysenterie / diarrhée, inflammatoire, fièvre.
• Durée : idem.
• Traitement : idem.

Question 3

Dans les organismes causant des diarrhées infectieuses, il y a des parasites. Parle-moi de leur épidémio, des organismes fréquents, de la clinique, de la durée et du traitement pour ces organismes.

Answer 3

• Épidémio : incubation longue (1-4 semaines)
• Organismes fréquents : Giardia Lamblia, Entamoeba Histolytica
• Clinique : diarrhées chroniques, diarrhée aigue inflammatoire possible pour E. histolytica
• Durée : plusieurs semaines, non auto-résolutif.
• Traitement : hydratation, métronidazole.

Question 4

Quels organismes causent une diarrhée sanglante ?

Answer 4

CHESS :

• Campylobacter
• Hémorragique E. Coli (0157:H7 surtout)
• Entamoeba histolytica
• Salmonella
• Shigella

Question 5

Bactéries causant diarrhée : E. Coli.

Classification et aspect au Gram, principales infections reliées à E. Coli.

Answer 5

Classification et aspect au Gram :

• Bâtonnets Gram négatif.
• Anaérone facultatif oxydase - (entérobactérie) fermenteur de lactose
• Fait partie de la flore normale du tractus GI

Principales infections reliées :

• Gastro-entérites (5 types)
• Infections urinaires
• Infection intra-abdominale (flore mixte)
• Méningite chez le nouveau-né (contamination durant accouchement)

Question 6

Qu’est-ce que le E. coli entéro-toxigénique ?

Answer 6

• Colonise petit intestin
• Produit toxine cholera-like
• Entraîne diarrhée sécrétoire aqueuse (pas de fière ou de sang dans selles)
• Incubation 1-3 jours et durée 3 jours
• Transmis par eaux contaminées avec matières fécales
• Pays en développement (cause #1 de la diarrhée du voyageur)

Question 7

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-pathogénique ?

Answer 7

• Adhère aux cellules épithéliales du petit intestin
• Entraîne inflammation légère avec destruction microvillosités et malabsorption
• Diarrhée aqueuse
• Surtout < 3 ans dans pays en développement
• Transmission par eau/nourriture contaminée ET personne à personne

Question 8

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-agrégatif ?

Answer 8

• Adhère sous forme d’agrégats (auto-agglutination) à la muqueuse du colon
• Produit entérotoxine qui induit sécrétion de fluides
• Diarrhée aqueuse souvent prolongée (chronique) + retard de croissance chez les enfants
• Transmission par ingestion de nourriture ou eau contaminée
• Pays en développement (cause #2 de diarrhée du voyageur)

Question 9

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-hémorragique ?

Answer 9

• Production de toxine shiga qui inhibe la synthèse des protéines (mort cellulaire) et dont certaines souches causent des dommages endothéliaux.
• Transmission par nourriture contaminée (été ++) surtout boeuf mal cuit, lait non pasteurisé, légumes crus, eau contaminée.
• Peut avoir transmission personne à personne (garderies)
• Entraîne colite inflammatoire : incubation 4 jours, diarrhée hémorragique, douleurs abdo sévères, pas de fièvre.
• Risque de SHU avec souche 0157:H7 surtout (MADO) : anémie hémolytique microangiopathique, thrombocytopénie, IRA. Peut être précipité par traitement aux antibio.

Question 10

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-invasif ?

Answer 10

• Envahissement de la muqueuse du colon (comme Shigella), nécessite gros inuculum.
• Entraîne colite inflammatoire (comme Shigella) : diarrhée hémorragique.
• Associée à nourriture contaminée dans les pays en développement (assez rare)

Question 11

Comment diagnostique-t-on une diarrhée causée par E. Coli ?

Answer 11

• Culture de selles
• gélose MacConkey sorbitol pour le 0157:H7
• Sérotyping pour antigènes O et H

Question 12

Bactéries causant diarrhée : Salmonella spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Answer 12

Classification et aspect au Gram :

• Bâtonnet gram négatif
• Anaérobe facultative oxydase négative (entérobactérie), lactose négative, motile.

Types :

• Sérotypes typhoïdes (S. typhi et S. paratyphi) causent fièvre entérique.
• Sérotypes non typhoïdes (S. enteritidis, S. choleraesuis, etc.) : cause gastroentérite.

Épidémio :

• Aliments contaminés (été ++) : poulet pas assez cuit, oeufs, nourriture transformée contaminée (produits laitiers)
• Eau contaminée (pour S. typhi seulement)
• Animaux infectés (tortue, rongeurs, iguanes, oiseaux)
• Facteurs de risques spécifiques :
• achlorydrie (car salmonella est sensible à acidité)
• anémie falciforme
• prise d’antibio, immunosuppression

Question 13

Bactéries causant diarrhée : Salmonella spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Answer 13

Pathologie :

• Nécessite ingestion d’un grand inoculum.
• Attachement des bactéries à épithélium intestinal.
• Injection de protéines dans les cellules favorisant internalisation des bactéries.
• Invasion des cellules puis lyse.

Manifestations cliniques :

• Gastro-entérite inflammatoire (Salmonella non typhoïdes) : après consommation de nourriture louche, diarrhée importante sanglante ou non, incubation 8-24h.
• Septicémie : S. Typhi, S. Paratyphi, S. Choleraesuis.
• Fièvre entérique (typhoïde et paratyphoïde)
• incubation 8-14 jours
• SAG (fièvre, céphalées, myalgie, malaise, toux)
• sx GI (inconfort abdo, constipation, diarrhée sanglante)
• leucopénie et splénomégalie
• progression à forte fièvre et choc septique
• spot roses (macules roses sur la peau)

Méthode diagnostique : culture de selles.

Question 14

Bactéries causant diarrhée : Campylobacter spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Answer 14

Classification et aspect au Gram :

• Bâtonnet Gram négatif en forme de virgule.
• Oxydase positive (N’EST PAS UNE ENTÉROBACTÉRIE) non fermenteur de glucose
• Micoaérophilique

Types :

• C. jejuni est la souche causant le plus souvent des diarrhées
• C. fetus cause souvent bactériémie car transporté par monocytes

Épidémio :

• Infection zoonotique acquise par nourriture contaminée
• viande pas assez cuite (volaille ++)
• eau contaminée
• lait non pasteurisé
• Une des causes majeures de diarrhée du voyageur
• Surtout été/automne

Question 15

Bactéries causant diarrhée : Campylobacter spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Answer 15

Pathologie :

• Nécessite ingestion d’un inoculum important (car Campy est sensible à acidité gastrique)
• Internalisation par cellules épithéliales intestinales : invasion de la muqueuse.
• Lyse et nécrose tissulaire, induction inflammation avec muqueuse ulcérée, oedémateuse (production d’une cytotoxine)

Manifestations cliniques :

• Gastroentérite
• fièvre et douleur abdo sévère
• diarrhée inflammatoire hémorragique
• Associé à complications tardives reliées à réaction immune croisée des anticorps développés contre la bactéries
• syndrome de G-B (2-3 semaines après diarrhée)
• associé à arthrite réactive (syndrome de Reiter : 6-8 semaines après diarrhée)

Méthodes diagnostiques :

• Identification de BGN en forme de virgule/S dans les selles (insensible mais spécifique)
• Culture de selles
• milieu spécial en microaérobie + température élevée
• gélose camp-BAC sélective
• croissance lente (2-3 jours)
• Détection d’un antigène par méthode immuno-enzymatique

Question 16

Bactéries causant diarrhée : Shigella spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Answer 16

Classification et aspect au Gram :

• Bâtonnets Gram négatif
• Anaérobes facultatifs oxydase négatif (entérobactéries), lactose négatif et non mobiles

Types :

• S. sonnei (responsables de la majorité des infections dans pays développés)
• S. flexneri (infections dans pays en développement)
• S. dysenteriae (infections les plus sévères)

Épidémio :

• Humains sont le seul réservoir
• Transmission personne à personne (fécale orale) : par contamination fécale de l’eau, nourriture, sièges toilette
• Facteurs de risques spécifiques : enfants dans garderie, personnes dans institutions.

Question 17

Bactéries causant diarrhée : Shigella spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Answer 17

Pathologie :

• Inoculum très petit peut causer maladie (car résistant à acide)
• Attachement des bactéries à épithélium intestinal et injection de protéines dans les cellules favorisant internalisation des bactéries = invasion des cellules.
• Transmission cellule à cellule ET production cytotoxine (shiga) induisant mort cellulaire
• ulcères superficiels dans muqueuse intestinale
• induit inflammation aigue extensive
• Ne cause pas de bctériémie
• Initiation croissance dans petit intestin puis s’étend au colon
• premières manifestations sont dues à entérotoxines
• après invasionde muqueuse du côlon avec dysenterie et inflammation

Manifestations cliniques :

• Gastro-entérite invasive (shigellose) -> surtout DX pédiatrique
• incubation 36-72h
• crampes abdo et ténesme = SIGNE CARDINAL
• diarrhée hémorragique et purulente (inflammatoire avec ++ leucocytes et mucus)
• Peut être associé au SHU

Méthodes diagnostiques : culture de selles.

Question 18

Bactéries causant diarrhées : Yersinia spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Answer 18

Classification et aspect au Gram :

• Bâtonnet Gram négatif
• Oxydase négative (entérobactérie), lactose négative, anaérobe facultatif.

Types :

• Yersinia enterocolitica : cause gastroentérites.
• Yersinia pestis : cause peste bubonique et peste pulmonaire.

Épidémiologie :

• Transmission par nourriture contaminée
• viandes (porc ++) (croissance à 4°C)
• lait
• Europe, Amérique du Sud, Afrique, Asie
• Enfants 1-4 ans
• Hiver

Question 19

Bactéries causant diarrhée : Yersinia spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Answer 19

Pathologie :

• Nécessite ingestion d’un grand inoculum.
• Invasion de la muqueuse de l’iléon terminal.
• Résistant à phagocytose.
• Entraîne inflammation des ganglions mésentériques (douleurs QID ++)

Manifestations cliniques :

• Gastroentérite :
• incubation 4-6 jours
• fièvre et douleur aigue au QID
• diarrhée inflammatoire hémorragique
• 2 semaines (durée)
• Fièvre entérique :
• incubation 8-14 jours
• SAG + sx GI (inconfort abdominal, diarrhée hémorragique)
• Progression au choc septique

Méthodes diagnostiques :

• Culture de selles
• croissance sur la majorité des milieux de culture
• incubation à 4°C peut isoler bactérie

Question 20

Bactéries causant diarrhée : Vibrio cholerae.

Classification et aspect au Gram, épidémio, pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Answer 20

Classification et aspect au Gram :

• Bâtonnet Gram négatif courbé avec flagelle simple
• Anaérobe facultatif oxydase positif (n’est pas une entérobactérie), fermenteur de glucose

Épidémio :

• Transmission par eau ou nourriture contaminée
• crustacés, algues, milieux estuaires, marins, eau salée
• zones avec hygiène déficiente

Pathologie :

• Nécessite inoculum élevé car sensible à acidité gastrique
• Adhère à muqueuse du petit intestin
• Produit exotoxine choléra qui promeut sécrétion massive d’eau et sodium (diarrhée aqueuse sécrétoire massive)

Manifestations cliniques :

• Gastroentérite :
• début brutal et diarrhée aqueuse massive et vomissements
• peut entraîner déshydratation avec choc hypovolémique

Méthodes diagnostiques :

• Culture de selles
• nécessite milieu spécial (TCBS)
• a besoin de sel pour croître

Question 21

Bactéries causant diarrhée : Clostridium difficile.

Microbiologie, épidémiologie.

Answer 21

Microbiologie :

• Bâtonnet Gram positif
• Anaérobe strict
• Forme des spores (résistants à chaleur, acidité, désinfectants, antibiotiques)

Épidémio :

• Facteurs de risque pour infection à C. difficile
• utilisation d’antibio dans les 3 derniers mois (surtout clindamycine, ampicilline, céphalosporine, fluoroquinolones et larges spectres)
• hospitalisation (transmission patient à patient via spores transportées par personnel)
• achlorydrie favorise survie des formes végétatives de C. difficile dans estomac.
• âge avancé, comorbidités, chirurgie gastro-intestinale récente
• polymorphismes génétiques
• Statistiques :
• chez 10% des patients hospitalisés pour > 2 jours
• incidence en augmentation

Question 22

Bactéries causant diarrhée : Clostridium difficile.

Pathophysio, manifestations cliniques.

Answer 22

Pathophysio :

• Ingestion de spores de C. difficile toxigénique.
• Croissance de ces pathogènes, colonisation du colon et libération d’exotoxine :
• toxine A (entérotoxine)
• toxine B (cytotoxine)
• Toxines se lient aux cellules intestinales et les tuent.
• desquamation cellulaire, formation d’ulcères et inflammation
• formation de pseudomembranes visibles à colonoscopie (colite pseudomembraneuse)

Manifestations cliniques :
- Porteur asymptomatique :
* 20% des patients hospitalisés
* favorise formation d’anticorps contre toxine
- Diarrhée +/- colite
* diarrhée aqueuse légère à grave
* selles malodorantes
* douleur abdominale crampiforme dans les QI sévère
* fièvre légère
* leucocytose légère
* +/- pseudomembrane à colonoscopie / épaississement paroi colique au CT Scan
- Colite fulminante (2-3%)
* diarrhée ou constipation possibles
* leucocytose marquée
* douleur abdo diffuse et s.vère
* peut se compliquer en mégacolon toxique (traitement urgent par colectomie et iléostomie)
* mortalité élevée
* traitement médical difficile car souvent iléus empêche de traiter PO
> on essaye vancomycine via tube NG + métronidazole IV
> colectomie d’urgence si pas de réponse au traitement médical

Question 23

Bactéries causant diarrhée : Clostridium difficile.

DDX, méthodes diagnostiques, traitement.

Answer 23

Diagnostic différentiel :

• Diarrhée osmotique reliée aux antibiotiques.
• absence de fièvre et leucocytose
• absence de leucocytes dans selles
• amélioration lors de l’arrêt de prise orale d’antibiotiques

Méthodes diagnostiques :

• ELISA pour toxine A et B
• peu sensible, mais rapide
• Recherche de cytotoxine sur lignée cellulaire
• on dépose échantillon de selles dans petits puits contenant culture cellulaire
• on observe cytotoxicité (destruction du tapis cellulaire par toxine B)
• très sensible et spécifique
• long (2-3 jours) et coûteux
• Recherche de l’antigène glutamate déshydrogénase (GDH) dans les selles
• très sensible
• résultats rapides
• moins spécifique
• confirmer avec ELISA ou recherche de cytotoxine sur lignée cellulaire
• PCR
• on recherche génome des toxines
• très sensible et spécifique
• rapide (1h)
• pas très disponible
• Endoscopie pour voir pseudomembrane si DX urgent nécessaire
• Culture pas utilisée en clinique car beaucoup trop long.

Traitement :

• Si présentation classique, on n’attend pas les résultats pour traiter.
• Arrêter antibio causaux si possible.
• Traitement de support symptomatique (hydratation)
• Éviter agents antipéristaltiques
• Traitement antibio :
• métronidazole PO pour premier ou deuxième épisode pas trop sévère
• vancomycine PO dans cas sévères ou multi-récidivant
• vancomycine via tube naso-gastrique + métronidazole IV si fulminant
• Taux élevé de récurrence (15-35%)
• Si échec des traitements à répétition : greffe de selles pour rétablir flore intestinale.

Question 24

Virus causant diarrhée : norovirus.

Answer 24

Microbiologie :

• Virus ARN à simple brin de la famille des calicivirus.
• Non enveloppé : moins sensible aux désinfectants.

Transmission :

• Eau et aliments contaminés (piscine, lacts, crustacés ++)
• Personne à personne

Épidémio : touche surtout adultes.

Clinique : diarrhée aqueuse, nausées, vomissements.

Prise en charge : pas de test rapide. Traitement de support avec hydratation.

Diagnostic : ELISA sur selles, RT-PCR.

Question 25

Virus causant diarrhée : rotavirus.

Answer 25

Microbiologie :
- Virus ARN à double brin de la famille de réovirus.

Épidémio :

• Enfants (90% en font au moins une foie avant 3 ans), atteint aussi adultes en contact avec enfants atteints.
• Hiver
• Transmission fécale-orale

Pathogenèse :

• Résistant au lavage de mains et désinfectants + acidité gastrique
• Réplication du virus dans les cellules épithéliales intestinales
• Perte d’absorption par villi épithéliaux et déficience en lactase et autres disaccharidases.

Clinique : diarrhée aqueuse.

Diagnostic : ELISA sur selles, RT-PCR

Question 26

Parasites causant diarrhée : Giardia lamblia.

Microbiologie, épidémiologie.

Answer 26

Microbiologie :

• Protozoaire de la famille des flagellés.
• Existe sous deux formes :
• trophozoïtes
• kystes : forme dormante lorsque l’environnement est sous-optimal
• peuvent survivre plusieurs mois dans eau fraîche
• peuvent être éradiqués en filtrant l’eau ou en la faisant bouillir

Épidémio :

• Transmission du kyste par :
• eau contaminée
• aliments contaminés
• personne à personne : fécal-oral (garderie, HARSAH)
• Giardiase plus commune chez enfants
• Patients avec agammaglobulinémie sont vulnérables à forme sévère et prolongée de la maladie

Question 27

Parasites causant diarrhée : Giardia lamblia.

Cycle biologique, pathophysio.

Answer 27

Cycle :

• Ingestion du kyste (petit inoculum)
• Dékystement dans le petit intestin : libération de trophozoïtes flagellés.
• Division par fission binaire dans le petit intestin
• Excrétion par les fèces : kystes contaminent environnement.

Pathophysio :

• Adhèrent aux cellules intestinales et altèrent bordure en brosse.
• entraîne déficience en disaccharidase
• entraîne légère inflammation
• ne cause pas d’altérations invasives ou destruction locale

Question 28

Parasites causant diarrhée : Giardia lamblia.

Manifestations cliniques, diagnostic, traitement.

Answer 28

Manifestations cliniques :

• Asymptomatique
• Giardiase : forme subaigue
• incubation 5-7 jours
• dure 4-6 semaines
• diarrhée aqueuse
• douleur abdo, crampes, gonflement, ballonnements, malaises
• nausées, vomissements
• Giardiase : forme chronique (plus rare)
• malabsorption
• diarrhée chronique
• perte de poids

Diagnostic :

• Examen direct des selles : absence de PMN, recherche de parasites (trophozoïtes) + kystes dans les selles (sensibilité 90%)
• Recherche de l’antigène (ELISA ou immunofluorescence) : test de choix.
• Si persistance de tests négatifs chez patient avec haute suspicion de giardiase : aspiration duodénale, entéro-test, biopsie du petit intestin supérieur.

Traitement :
- Métronidazole PO

Question 29

Parasites causant diarrhée : entamoeba histolytica.

Microbiologie, épidémio, cycle biologique.

Answer 29

Microbio :

• Protozoaire, famille des amibes
• 2 formes : trophozoïtes, kystes (forme dormante, peuvent survivre plusieurs mois dans environnement chaud et humide)

Épidémio :

• Transmission des kystes par voie fécale-orale : personne à personne, eau ou nourriture contaminée.
• Prévalence élevée dans pays en voie de développement, risque d’acquisition élevé si voyage < 1 mois en zone endémique

Cycle :

• Ingestion de kystes résistant à acidité de l’estomac (vs trophozoïtes)
• Dékystement dans petit intestin
• Multiplication (division binaire) dans côlon
• Trophozoïtes adhèrent à récepteurs à galactose sur entérocytes et les tuent par mécanisme calcium-dépendant = ulcération muqueuse et pénétration dans sang.
• Trophozoïtes peuvent envahir foie et poumons (abcès hépatiques et pulmonaires)
• Trophozoïtes et kystes sont évacués dans selles et contaminent environnement.

Question 30

Parasites causant diarrhée : Entamoeba histolytica.

Manifestations cliniques, diagnostic, traitement.

Answer 30

Manifestations cliniques :

• Infection superficielle : diarrhée aqueuse, plaintes GI non spécifiques
• Infection invasive : diarrhée hémorragique, douleur abdo, ténesme, parfois fièvre
• Abcès hépatiques : douleur QSD, douleur à l’épaule droite, hépatomégalie. Si atteinte chronique = phosphatase alkaline augmente.
• • attention, peut se présenter comme colite ulcéreuse, mais si on donne des corticostéroïdes la maladie s’aggrave et on peut entraîner un mégacolon toxique.

Diagnostic :

• Examen direct au microscope :
• différencier de E. dispar, qui est un parasite non pathogénique
• ELISA : recherche de l’antigène fécal
• PCR : pour différencier E. histolytica de E. dispar
• Sérologie : anticorps anti-amibiaise (positif chez majorité des patients après 1 semaine)

Traitement :

• Métronidazole ou tinidazole pour traiter maladie active
• Paromomycine pour parasites intraluminaux pour assurer éradication de l’infection.