Problème 2 - Organismes causant diarrhée infectieuse Flashcards by Geneviève Leblanc

Dans les organismes causant des diarrhées infectieuses, il y a des virus. Parle-moi de leur épidémio, des organismes fréquents, de la clinique, de la durée et du traitement pour ces organismes.

Épidémio : forme la plus fréquente, incubation courte (1-4 jours)
Organismes fréquents : norovirus (adultes), rotavirus (enfants)
Clinique : diarrhée aqueuse sécrétoire, nausées et vomissements, fièvre légère (parfois), crampes.
Durée : 2-6 jours, autorésolutif.
Traitement : hydratation, anti-diarrhéique.

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Dans les organismes causant des diarrhées infectieuses, il y a des bactéries. Parle-moi de leur épidémio, des organismes fréquents, de la clinique, de la durée et du traitement pour ces organismes.

Épidémio : incubation variable (1-8 jours), transmission fécale-orale, eau contaminée, nourriture contaminée, personne à personne (parfois)
Organismes fréquents : E. Coli (entérotoxigénique, entéroagrégatif, entéropathogénique), vibrio cholerae.
Clinique : Diarrhée sécrétoire aqueuse,
Durée : 3-7 jours, auto-résolutif pour la plupart.
Traitement : hydratation, anti-diarrhéique (pas si fièvre ou sang), antibio au besoin.
Épidémio : idem.
Organismes fréquents : E. Coli (entérohémorragique, entéro-invasif), Salmonella, Shigella, C. difficile, Yersinia enterolytica, Campylobacter jejuni
Clinique : dysenterie / diarrhée, inflammatoire, fièvre.
Durée : idem.
Traitement : idem.

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Dans les organismes causant des diarrhées infectieuses, il y a des parasites. Parle-moi de leur épidémio, des organismes fréquents, de la clinique, de la durée et du traitement pour ces organismes.

Épidémio : incubation longue (1-4 semaines)
Organismes fréquents : Giardia Lamblia, Entamoeba Histolytica
Clinique : diarrhées chroniques, diarrhée aigue inflammatoire possible pour E. histolytica
Durée : plusieurs semaines, non auto-résolutif.
Traitement : hydratation, métronidazole.

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Quels organismes causent une diarrhée sanglante ?

CHESS :

Campylobacter
Hémorragique E. Coli (0157:H7 surtout)
Entamoeba histolytica
Salmonella
Shigella

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Bactéries causant diarrhée : E. Coli.

Classification et aspect au Gram, principales infections reliées à E. Coli.

Classification et aspect au Gram :

Bâtonnets Gram négatif.
Anaérone facultatif oxydase - (entérobactérie) fermenteur de lactose
Fait partie de la flore normale du tractus GI

Principales infections reliées :

Gastro-entérites (5 types)
Infections urinaires
Infection intra-abdominale (flore mixte)
Méningite chez le nouveau-né (contamination durant accouchement)

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Qu’est-ce que le E. coli entéro-toxigénique ?

Colonise petit intestin
Produit toxine cholera-like
Entraîne diarrhée sécrétoire aqueuse (pas de fière ou de sang dans selles)
Incubation 1-3 jours et durée 3 jours
Transmis par eaux contaminées avec matières fécales
Pays en développement (cause #1 de la diarrhée du voyageur)

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-pathogénique ?

Adhère aux cellules épithéliales du petit intestin
Entraîne inflammation légère avec destruction microvillosités et malabsorption
Diarrhée aqueuse
Surtout < 3 ans dans pays en développement
Transmission par eau/nourriture contaminée ET personne à personne

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-agrégatif ?

Adhère sous forme d’agrégats (auto-agglutination) à la muqueuse du colon
Produit entérotoxine qui induit sécrétion de fluides
Diarrhée aqueuse souvent prolongée (chronique) + retard de croissance chez les enfants
Transmission par ingestion de nourriture ou eau contaminée
Pays en développement (cause #2 de diarrhée du voyageur)

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-hémorragique ?

Production de toxine shiga qui inhibe la synthèse des protéines (mort cellulaire) et dont certaines souches causent des dommages endothéliaux.
Transmission par nourriture contaminée (été ++) surtout boeuf mal cuit, lait non pasteurisé, légumes crus, eau contaminée.
Peut avoir transmission personne à personne (garderies)
Entraîne colite inflammatoire : incubation 4 jours, diarrhée hémorragique, douleurs abdo sévères, pas de fièvre.
Risque de SHU avec souche 0157:H7 surtout (MADO) : anémie hémolytique microangiopathique, thrombocytopénie, IRA. Peut être précipité par traitement aux antibio.

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Qu’est-ce que le E. Coli entéro-invasif ?

Envahissement de la muqueuse du colon (comme Shigella), nécessite gros inuculum.
Entraîne colite inflammatoire (comme Shigella) : diarrhée hémorragique.
Associée à nourriture contaminée dans les pays en développement (assez rare)

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Comment diagnostique-t-on une diarrhée causée par E. Coli ?

Culture de selles
gélose MacConkey sorbitol pour le 0157:H7
Sérotyping pour antigènes O et H

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Bactéries causant diarrhée : Salmonella spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Classification et aspect au Gram :

Bâtonnet gram négatif
Anaérobe facultative oxydase négative (entérobactérie), lactose négative, motile.

Types :

Sérotypes typhoïdes (S. typhi et S. paratyphi) causent fièvre entérique.
Sérotypes non typhoïdes (S. enteritidis, S. choleraesuis, etc.) : cause gastroentérite.

Épidémio :

Aliments contaminés (été ++) : poulet pas assez cuit, oeufs, nourriture transformée contaminée (produits laitiers)
Eau contaminée (pour S. typhi seulement)
Animaux infectés (tortue, rongeurs, iguanes, oiseaux)
Facteurs de risques spécifiques :
achlorydrie (car salmonella est sensible à acidité)
anémie falciforme
prise d’antibio, immunosuppression

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Bactéries causant diarrhée : Salmonella spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Pathologie :

Nécessite ingestion d’un grand inoculum.
Attachement des bactéries à épithélium intestinal.
Injection de protéines dans les cellules favorisant internalisation des bactéries.
Invasion des cellules puis lyse.

Manifestations cliniques :

Gastro-entérite inflammatoire (Salmonella non typhoïdes) : après consommation de nourriture louche, diarrhée importante sanglante ou non, incubation 8-24h.
Septicémie : S. Typhi, S. Paratyphi, S. Choleraesuis.
Fièvre entérique (typhoïde et paratyphoïde)
incubation 8-14 jours
SAG (fièvre, céphalées, myalgie, malaise, toux)
sx GI (inconfort abdo, constipation, diarrhée sanglante)
leucopénie et splénomégalie
progression à forte fièvre et choc septique
spot roses (macules roses sur la peau)

Méthode diagnostique : culture de selles.

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Bactéries causant diarrhée : Campylobacter spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Classification et aspect au Gram :

Bâtonnet Gram négatif en forme de virgule.
Oxydase positive (N’EST PAS UNE ENTÉROBACTÉRIE) non fermenteur de glucose
Micoaérophilique

Types :

C. jejuni est la souche causant le plus souvent des diarrhées
C. fetus cause souvent bactériémie car transporté par monocytes

Épidémio :

Infection zoonotique acquise par nourriture contaminée
viande pas assez cuite (volaille ++)
eau contaminée
lait non pasteurisé
Une des causes majeures de diarrhée du voyageur
Surtout été/automne

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Bactéries causant diarrhée : Campylobacter spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Pathologie :

Nécessite ingestion d’un inoculum important (car Campy est sensible à acidité gastrique)
Internalisation par cellules épithéliales intestinales : invasion de la muqueuse.
Lyse et nécrose tissulaire, induction inflammation avec muqueuse ulcérée, oedémateuse (production d’une cytotoxine)

Manifestations cliniques :

Gastroentérite
fièvre et douleur abdo sévère
diarrhée inflammatoire hémorragique
Associé à complications tardives reliées à réaction immune croisée des anticorps développés contre la bactéries
syndrome de G-B (2-3 semaines après diarrhée)
associé à arthrite réactive (syndrome de Reiter : 6-8 semaines après diarrhée)

Méthodes diagnostiques :

Identification de BGN en forme de virgule/S dans les selles (insensible mais spécifique)
Culture de selles
milieu spécial en microaérobie + température élevée
gélose camp-BAC sélective
croissance lente (2-3 jours)
Détection d’un antigène par méthode immuno-enzymatique

How well did you know this?

Not at all

Perfectly

Bactéries causant diarrhée : Shigella spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Classification et aspect au Gram :

Bâtonnets Gram négatif
Anaérobes facultatifs oxydase négatif (entérobactéries), lactose négatif et non mobiles

Types :

S. sonnei (responsables de la majorité des infections dans pays développés)
S. flexneri (infections dans pays en développement)
S. dysenteriae (infections les plus sévères)

Épidémio :

Humains sont le seul réservoir
Transmission personne à personne (fécale orale) : par contamination fécale de l’eau, nourriture, sièges toilette
Facteurs de risques spécifiques : enfants dans garderie, personnes dans institutions.

Bactéries causant diarrhée : Shigella spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Pathologie :

Inoculum très petit peut causer maladie (car résistant à acide)
Attachement des bactéries à épithélium intestinal et injection de protéines dans les cellules favorisant internalisation des bactéries = invasion des cellules.
Transmission cellule à cellule ET production cytotoxine (shiga) induisant mort cellulaire
ulcères superficiels dans muqueuse intestinale
induit inflammation aigue extensive
Ne cause pas de bctériémie
Initiation croissance dans petit intestin puis s’étend au colon
premières manifestations sont dues à entérotoxines
après invasionde muqueuse du côlon avec dysenterie et inflammation

Manifestations cliniques :

Gastro-entérite invasive (shigellose) -> surtout DX pédiatrique
incubation 36-72h
crampes abdo et ténesme = SIGNE CARDINAL
diarrhée hémorragique et purulente (inflammatoire avec ++ leucocytes et mucus)
Peut être associé au SHU

Méthodes diagnostiques : culture de selles.

Bactéries causant diarrhées : Yersinia spp.

Classification et aspect au Gram, types, épidémiologie.

Classification et aspect au Gram :

Bâtonnet Gram négatif
Oxydase négative (entérobactérie), lactose négative, anaérobe facultatif.

Types :

Yersinia enterocolitica : cause gastroentérites.
Yersinia pestis : cause peste bubonique et peste pulmonaire.

Épidémiologie :

Transmission par nourriture contaminée
viandes (porc ++) (croissance à 4°C)
lait
Europe, Amérique du Sud, Afrique, Asie
Enfants 1-4 ans
Hiver

Bactéries causant diarrhée : Yersinia spp.

Pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Pathologie :

Nécessite ingestion d’un grand inoculum.
Invasion de la muqueuse de l’iléon terminal.
Résistant à phagocytose.
Entraîne inflammation des ganglions mésentériques (douleurs QID ++)

Manifestations cliniques :

Gastroentérite :
incubation 4-6 jours
fièvre et douleur aigue au QID
diarrhée inflammatoire hémorragique
2 semaines (durée)
Fièvre entérique :
incubation 8-14 jours
SAG + sx GI (inconfort abdominal, diarrhée hémorragique)
Progression au choc septique

Méthodes diagnostiques :

Culture de selles
croissance sur la majorité des milieux de culture
incubation à 4°C peut isoler bactérie

Bactéries causant diarrhée : Vibrio cholerae.

Classification et aspect au Gram, épidémio, pathologie, manifestations cliniques, méthodes diagnostiques.

Classification et aspect au Gram :

Bâtonnet Gram négatif courbé avec flagelle simple
Anaérobe facultatif oxydase positif (n’est pas une entérobactérie), fermenteur de glucose

Épidémio :

Transmission par eau ou nourriture contaminée
crustacés, algues, milieux estuaires, marins, eau salée
zones avec hygiène déficiente

Pathologie :

Nécessite inoculum élevé car sensible à acidité gastrique
Adhère à muqueuse du petit intestin
Produit exotoxine choléra qui promeut sécrétion massive d’eau et sodium (diarrhée aqueuse sécrétoire massive)

Manifestations cliniques :

Gastroentérite :
début brutal et diarrhée aqueuse massive et vomissements
peut entraîner déshydratation avec choc hypovolémique

Méthodes diagnostiques :

Culture de selles
nécessite milieu spécial (TCBS)
a besoin de sel pour croître

Bactéries causant diarrhée : Clostridium difficile.

Microbiologie, épidémiologie.

Microbiologie :

Bâtonnet Gram positif
Anaérobe strict
Forme des spores (résistants à chaleur, acidité, désinfectants, antibiotiques)

Épidémio :

Facteurs de risque pour infection à C. difficile
utilisation d’antibio dans les 3 derniers mois (surtout clindamycine, ampicilline, céphalosporine, fluoroquinolones et larges spectres)
hospitalisation (transmission patient à patient via spores transportées par personnel)
achlorydrie favorise survie des formes végétatives de C. difficile dans estomac.
âge avancé, comorbidités, chirurgie gastro-intestinale récente
polymorphismes génétiques
Statistiques :
chez 10% des patients hospitalisés pour > 2 jours
incidence en augmentation

Bactéries causant diarrhée : Clostridium difficile.

Pathophysio, manifestations cliniques.

Pathophysio :

Ingestion de spores de C. difficile toxigénique.
Croissance de ces pathogènes, colonisation du colon et libération d’exotoxine :
toxine A (entérotoxine)
toxine B (cytotoxine)
Toxines se lient aux cellules intestinales et les tuent.
desquamation cellulaire, formation d’ulcères et inflammation
formation de pseudomembranes visibles à colonoscopie (colite pseudomembraneuse)

Manifestations cliniques :
- Porteur asymptomatique :
* 20% des patients hospitalisés
* favorise formation d’anticorps contre toxine
- Diarrhée +/- colite
* diarrhée aqueuse légère à grave
* selles malodorantes
* douleur abdominale crampiforme dans les QI sévère
* fièvre légère
* leucocytose légère
* +/- pseudomembrane à colonoscopie / épaississement paroi colique au CT Scan
- Colite fulminante (2-3%)
* diarrhée ou constipation possibles
* leucocytose marquée
* douleur abdo diffuse et s.vère
* peut se compliquer en mégacolon toxique (traitement urgent par colectomie et iléostomie)
* mortalité élevée
* traitement médical difficile car souvent iléus empêche de traiter PO
> on essaye vancomycine via tube NG + métronidazole IV
> colectomie d’urgence si pas de réponse au traitement médical

Bactéries causant diarrhée : Clostridium difficile.

DDX, méthodes diagnostiques, traitement.

Diagnostic différentiel :

Diarrhée osmotique reliée aux antibiotiques.
absence de fièvre et leucocytose
absence de leucocytes dans selles
amélioration lors de l’arrêt de prise orale d’antibiotiques

Méthodes diagnostiques :

ELISA pour toxine A et B
peu sensible, mais rapide
Recherche de cytotoxine sur lignée cellulaire
on dépose échantillon de selles dans petits puits contenant culture cellulaire
on observe cytotoxicité (destruction du tapis cellulaire par toxine B)
très sensible et spécifique
long (2-3 jours) et coûteux
Recherche de l’antigène glutamate déshydrogénase (GDH) dans les selles
très sensible
résultats rapides
moins spécifique
confirmer avec ELISA ou recherche de cytotoxine sur lignée cellulaire
PCR
on recherche génome des toxines
très sensible et spécifique
rapide (1h)
pas très disponible
Endoscopie pour voir pseudomembrane si DX urgent nécessaire
Culture pas utilisée en clinique car beaucoup trop long.

Traitement :

Si présentation classique, on n’attend pas les résultats pour traiter.
Arrêter antibio causaux si possible.
Traitement de support symptomatique (hydratation)
Éviter agents antipéristaltiques
Traitement antibio :
métronidazole PO pour premier ou deuxième épisode pas trop sévère
vancomycine PO dans cas sévères ou multi-récidivant
vancomycine via tube naso-gastrique + métronidazole IV si fulminant
Taux élevé de récurrence (15-35%)
Si échec des traitements à répétition : greffe de selles pour rétablir flore intestinale.

Virus causant diarrhée : norovirus.

Microbiologie :

Virus ARN à simple brin de la famille des calicivirus.
Non enveloppé : moins sensible aux désinfectants.

Transmission :

Eau et aliments contaminés (piscine, lacts, crustacés ++)
Personne à personne

Épidémio : touche surtout adultes.

Clinique : diarrhée aqueuse, nausées, vomissements.

Prise en charge : pas de test rapide. Traitement de support avec hydratation.

Diagnostic : ELISA sur selles, RT-PCR.

Virus causant diarrhée : rotavirus.

Microbiologie : - Virus ARN à double brin de la famille de réovirus. Épidémio : - Enfants (90% en font au moins une foie avant 3 ans), atteint aussi adultes en contact avec enfants atteints. - Hiver - Transmission fécale-orale Pathogenèse : - Résistant au lavage de mains et désinfectants + acidité gastrique - Réplication du virus dans les cellules épithéliales intestinales - Perte d'absorption par villi épithéliaux et déficience en lactase et autres disaccharidases. Clinique : diarrhée aqueuse. Diagnostic : ELISA sur selles, RT-PCR

Parasites causant diarrhée : Giardia lamblia. | Microbiologie, épidémiologie.

Microbiologie : - Protozoaire de la famille des flagellés. - Existe sous deux formes : * trophozoïtes * kystes : forme dormante lorsque l'environnement est sous-optimal * peuvent survivre plusieurs mois dans eau fraîche * peuvent être éradiqués en filtrant l'eau ou en la faisant bouillir Épidémio : - Transmission du kyste par : * eau contaminée * aliments contaminés * personne à personne : fécal-oral (garderie, HARSAH) - Giardiase plus commune chez enfants - Patients avec agammaglobulinémie sont vulnérables à forme sévère et prolongée de la maladie

Parasites causant diarrhée : Giardia lamblia. | Cycle biologique, pathophysio.

Cycle : - Ingestion du kyste (petit inoculum) - Dékystement dans le petit intestin : libération de trophozoïtes flagellés. - Division par fission binaire dans le petit intestin - Excrétion par les fèces : kystes contaminent environnement. Pathophysio : - Adhèrent aux cellules intestinales et altèrent bordure en brosse. * entraîne déficience en disaccharidase * entraîne légère inflammation * ne cause pas d'altérations invasives ou destruction locale

Parasites causant diarrhée : Giardia lamblia. | Manifestations cliniques, diagnostic, traitement.

Manifestations cliniques : - Asymptomatique - Giardiase : forme subaigue * incubation 5-7 jours * dure 4-6 semaines * diarrhée aqueuse * douleur abdo, crampes, gonflement, ballonnements, malaises * nausées, vomissements - Giardiase : forme chronique (plus rare) * malabsorption * diarrhée chronique * perte de poids Diagnostic : - Examen direct des selles : absence de PMN, recherche de parasites (trophozoïtes) + kystes dans les selles (sensibilité 90%) - Recherche de l'antigène (ELISA ou immunofluorescence) : test de choix. - Si persistance de tests négatifs chez patient avec haute suspicion de giardiase : aspiration duodénale, entéro-test, biopsie du petit intestin supérieur. Traitement : - Métronidazole PO

Parasites causant diarrhée : entamoeba histolytica. | Microbiologie, épidémio, cycle biologique.

Microbio : - Protozoaire, famille des amibes - 2 formes : trophozoïtes, kystes (forme dormante, peuvent survivre plusieurs mois dans environnement chaud et humide) Épidémio : - Transmission des kystes par voie fécale-orale : personne à personne, eau ou nourriture contaminée. - Prévalence élevée dans pays en voie de développement, risque d'acquisition élevé si voyage < 1 mois en zone endémique Cycle : - Ingestion de kystes résistant à acidité de l'estomac (vs trophozoïtes) - Dékystement dans petit intestin - Multiplication (division binaire) dans côlon - Trophozoïtes adhèrent à récepteurs à galactose sur entérocytes et les tuent par mécanisme calcium-dépendant = ulcération muqueuse et pénétration dans sang. - Trophozoïtes peuvent envahir foie et poumons (abcès hépatiques et pulmonaires) - Trophozoïtes et kystes sont évacués dans selles et contaminent environnement.

Parasites causant diarrhée : Entamoeba histolytica. | Manifestations cliniques, diagnostic, traitement.

Manifestations cliniques : - Infection superficielle : diarrhée aqueuse, plaintes GI non spécifiques - Infection invasive : diarrhée hémorragique, douleur abdo, ténesme, parfois fièvre - Abcès hépatiques : douleur QSD, douleur à l'épaule droite, hépatomégalie. Si atteinte chronique = phosphatase alkaline augmente. * * attention, peut se présenter comme colite ulcéreuse, mais si on donne des corticostéroïdes la maladie s'aggrave et on peut entraîner un mégacolon toxique. Diagnostic : - Examen direct au microscope : * différencier de E. dispar, qui est un parasite non pathogénique - ELISA : recherche de l'antigène fécal - PCR : pour différencier E. histolytica de E. dispar - Sérologie : anticorps anti-amibiaise (positif chez majorité des patients après 1 semaine) Traitement : - Métronidazole ou tinidazole pour traiter maladie active - Paromomycine pour parasites intraluminaux pour assurer éradication de l'infection.