Fall 1 - Thomas Lundin Flashcards
Hur är mässlingviruset uppbyggd?
Paradise Hotel har tappat sitt rykte
Paramyxo, helikal, hölje, (-), single stranded, RNA
Mässlingviruset är ett…
Paramyxovirus
Vad beror utslagen vid mässling på?
Utslagen beror på immunrespons på infekterar kapillärendotel och cellinfiltrat.
Börjar först i ansikte, ner till bplen och sen till extremiteter
Vad karaktäriseras prodromalfasen av?
- Diffusa symptom
- Koplik spots i munnen (vita, små prickar)
- Mest smittsamma tiden
Mässlings patofysiologi?
Steg 1: Viruset går in i respiratoriska trakten och binder till DC i epitel eller alveoler. Dessa vandrar till lymfoid vävnad
Steg 2: Systemisk dissemination när inflammatoriska celler visar för B-celler och T-celler. Dessa går ut i cirkulationen och migrerar -> infektionen amplifieras. T-celler infiltrerar huden och rensar infekterade celler vilket ger utslag.
Immuncellerna i lymfoida organ dör efter ett par dagar vilket ger tillfällig immunsuppression.
Steg 3: Epitelcellerna i luftvägarna producerar nya viruspartiklar och skada på epitelet ger hosta -> viruset sprid via aerosoler
Vad orskar många av mässlingsdödsfallen?
Efter infektion kan immunsuprressionern vara så illa att hela immunflrvsaret är dåligt 1 mån till 2 år efter vilket gör att man blir extra känslig.
Vanligt är allvarliga diarréer och pneumoni.
Vilka är de vanliga virusen vid virala luftvägsinfektioner?
- Influensa
- Respiratoriskt syncytiecirus
- Parainfluensa
- Coronavirus
Vad är en kapsid?
Kapsid är proteinstrukturen som omger kärnan. Kan vara i ikosaidal struktur, som en fotboll, eller helikal struktur, som en tub.
Kapsiden hos influensa består av höljeproteiner med HA och NA som ”spikes”. NP finns inuti cellen i arvsmassan.
Hur är influensa uppbyggt?
Influensa är ett orthomyxovirus. Dess egenskaper är:
- RNA-virus
- Helical
- Enveloped, har ett yttre hölje
- (-) segmenterat RNA -> måste byta till + genom RNA-beroende RNApolymeras
Orvar har hår till salu, sossigt rån
Orthomyxo, helikal, hölje, (-), single stranded, RNA
Virusreplikationens olika steg
Virusreplikationen sker i 8 steg:
- Absoption vid passande receptor
- Penetration via en endosom
- Avklädning frigör arvsmassa
- Transkription ger mer RNA
- Translation av virusproteiner
- Proliferation av arvsmassa
- Uppbyggnad och sammansättning
- Frisättning
Mässlings uppbyggnad
Paradise Hotel har tappat sitt rykte
Paramyxo, helikal, hölje, (-), single stranded, RNA
Vad är definitionen av virion?
Den fysiska viruspartikeln
Vad är definitionen av kapsid?
Protienstrukturen som omger nukleinsyra
Vad är definitionen av kapsomer?
Subenhet i kapsiden
Vad är definitionen av nukleokapsid?
Kärnan plus kapsid
Vad är definitionen av matrixprotein?
Stödjande höljde under det yttre hökjet
Vad är definitionen av hölje?
Lipidmembran som finns hos vissa
Vilka är influensavirusets spikes?
hemagglutinin (HA) och neuraminidas (NA)
Var finns NP i influensaviruset?
NP finns i kapsiden
Vad är definitionen av peplomer/spikes?
Morfologiska proteinenheter som sticker ut
Har ikosaedrala virus hölje eller inte?
Ikosaedrala virus kan ha hölje eller vara naket
Varför är influensaspridning säsongsberoende?
Spridning gynnas i kall, torr luft och är därför säsongsbetonad.
- Hög fuktighet och hög temp gör att droppar vid smitta sjunker direkt
Hur se influensas infektionsprocess ut?
- Receptormedierad endocytos via sialinsyra som HA binder vilket gör att häljet försvinner
- M2 protein pumpar in väte i viruspartikeln vilket gör att den faller samman
- 8 st fria -RNA finns i cytoplasman
- -RNA transkriberas till -RNA mha RNA-beroende RNA-polymeras
- RNAt används för att translera nya prtoeiner, syntetisera glykoproteiner som används vid budding och nya -RNA
- Ny virion skapas
- Anvknoppning från värdcellen sker mha NA som klyver syalinsyrareceptorn
Vilka är influensas virulensfaktorer?
Hemaglutinin, HA - hjälper till vid inbindning
Neuroamidas, NA - hjälper till med avknoppning
M2-protein typ 2 - jonpump som får in H+ in i viruset vilket gör att det faller samman och ger fritt RNA i cytoplasman
Vad har en virusinfektion för effekt på luftvägarna?
- Slem - hypersekretion
- Luftvägshyperaktivtte
- Plasmaläckage
- Nervaktivering
- Inflammation som rekryterar celler
- “Avklädning” av luftvägsepitelet -> inga cilier
Beskriv de patofysiologiska mekanismer som leder till luftvägssymtom i form av hosta, smärta och ökad slembildning vid infektion med influensa A eller B
Influensavirus infekterar mucus-bildande och cilierade epitelceller i luftvägarna vilket leder till en försämrad barriär och mucociliär transport. Förekomst av virus samt cellskada ger upphov till interferonsekretion och en inflammatorisk reaktion i luftvägarna med frisättning av cytokiner, plasmaläckage, hypersekretion etc.
Förklara den metodologiska principen för detektion av virusantigen
Virusisolering genom odling: Odling av virus i cellkultur, virusen får reproducera sig intracellulärt, är resurskrävande och utförs inte på alla lab.
Direktpåvisning av virusantigen (protein) i olika kroppsvätskor med immunfluorescens-teknik
Förklara den metodologiska principen för serologisk diagnostik av virusinfektion
Antikroppspåvisning/serologi: Identifiering av antikroppar mot virus i främst serum med ELISA, fungerar bäst med akutserum i kombination med konvalescentserum.
Förklara den metodologiska principen för nukleinsyratestning av virusinfektion.
Påvisande av virusförekomst i kroppsvätska med PCR-teknik.
För att fastställa och typa eventuell förekomst av influensavirus vill du ta ett prov för påvisning av virus-RNA i nasofaynxsekret, med PCR-teknik. Hur går själva provtagningen till?
Kan antingen göras genom provtagningspinne som förs in genom näsborren tills man kommer bak till nasofarynx, så att sekret fastnar på pinnen, eller genom aspiration av sekret med slang och sug. Överförs sedan till provrör med transportmedium (vätska)
Ange den cellpopulation inom det adaptiva immunförsvaret som är viktigast för utläkningen av influensainfektionen.
(CD8+) T-cellspopulationen
T-cellspopulationen utgörs av CD4+ hjälpar T-celler och CD8+ cytotoxiska T-celler. Beskriv varför CD4+ T-celler är viktiga för det humorala och det cellulära immunsvaret vid en influensainfektion.
Polariserar immunsvar mot TH1 vilket leder till aktivering av CD8+ T-celler som kan avdöda infekterade epitelceller. Inducerar isotypswitch hos antikroppsproducerande, virusspecifika B- celler som mognar ut till minnes Bceller/plasmaceller
Vilken grupp av antivirala medel tillhör Tamiflu?
Neuraminidashämmare
Beskriv hur Tamiflu eller annan neuraminidashämmare kan begränsa en influensainfektion
De inhiberar i regel virus förmåga att lämna den cell som virus har replikerat sig i (inhiberad viral egress) samt förhindrar fria influensaviruspartiklar ifrån att passera genom mucus-rika miljöer främst i respiratoriska vävnader
Vilken specifik aktivitet hos influensavirusets virulensfaktor neuraminidas inhiberar neuraminidashämmande läkemedel?
Neuraminidashömmarna inhiberar både Influensa A och influensa B:s enzymatiska höljeprotein genom att blockera detta virala proteins sialinsyra-klyvande aktiva centra/region
Vad står H respektive N för i nomenklaturen av influensavirus?
Hemagglutinin respektive neuraminidas
Vilken betydelse har hemagglutinin och neuraminidas för uppkomsten av nya influensa A typer, vid antigenic drift respektive antigenic shift samt beskriv skillnaden mellan båda dessa begrepp?
Vid antigenic Shift blir betydelsen mer dramatisk, eftersom hela genen som kodar för HA och/eller NA byts ut. Exempelvis blir en influensa A/H1N1 omvandlad till en influensa A/H3N2 i ett omedelbart skede. Därmed har två av de viktigaste virulensfaktorerna på ytan av influensaviruset bytt skepnad, och den humorala immuniteten mot influensa A/H1N1 i den infekterade personen blir i ett slag verkningslös mot den nya influensavirustypen (H3N2).
Vid antigenic Drift blir betydelsen av förändringen mindre dramatisk, eftersom det i regel då bara sker någon eller några få aminosyra-förändringar i B- eller T cell epitoperna hos det förändrade (“driftade”) viruset.
Exempelvis, om det sker en drift i HA antigener utanför B-cell epitoperna eller utanför de sialinsyra-bindande regioner, så påverkas i regel viruset eller immuniteten inte alls. Om det däremot sker en drift i en B-cell epitop som utgör en virus-neutraliserande epitop (exempelvis i HA) så kan den infekterade personens neutraliserande serum IgG mot denna HAepitop förlora mycket av sin virus-neutraliserande förmåga !! Då har man via en B-cell epitopdrift i HA-proteinet utvecklat en mutation, som gör det svårare för patientens serum IgG att neutralisera viruset. I regel går den neutraliserande förmågan inte helt förlorad (även om även detta ibland kan inträffa), den blir bara gradvis sämre.
Vilket är det första försvaret mot virus?
IFN-gamma/beta
Vad har IFN för funktion vid virusinfektion?
IFN binder till IFN-receptor vilket ger:
- I en infekterad cell blockerar detta proteinsyntesen och virusförkning
- I en icke-infekterad cell aktievras antivirusproteiner
När uppkommer influensapandemier?
Uppkommer när virus med en nu HA-suntyp uppstår som resultat av antigenic shift. Gör att det blir helt okänt för immunförsvaret
Influensa binder … på våra celler
Influensa binder sialinsyra alfa-2,6 på våra celler
Hur är RSV uppbyggt?
Respiratorisk syncytievirus = paramyxo, ss-RNA, hölje, helikal
Vad gör glykoproteinerna som omger RSV?
- F-glykoprotein fuserar
- G-glykoprotein fäster
Hur smittas RSV?
Droppsmitta
Hur induceras feber?
Monocyter, endotelceller och andra utsöndrar pyrogena cytokiner: Il-1, Il-6, TNF och IFN. Dessa når cirkulationen och påverkar hypotalamus endotel. PGE2 ökar och binder till EP3R vilket hämmar neuronen i preoptiska talamus och detta ändrar sensitiviteten i termosensitiva neuron och ger snabb utsöndring av cAMP från gliaceller -> neurotransmittor släpps fri och ökar termoregulatoriska centrats setpoint
Hur sker mognaden av enterocyter?
I kryptorna finns det omogna celler som efter 2 dagars vandring kommer ut till vili och lever ett moget liv där i 2 dagar
Var i slemhinnan sker näringsupptag?
Upptag sker apikalt i de mogna cellerna av fett, salt, aa, vatten etc. Viktigaste här är Na/K-kotransprten basalt som skapar en Na-gradient vilket driver Na/glukos symport. Denna kräver glukos vilket gör att en vattenblandning med glukos och salt är mycket effektivt för näringsupptag.
Vad är osmotisk diarré?
Vatten hålls kvar i tarmen med hjälp av omsotiskt aktiva agens i lumen samt att vatten utsöndras mot denna osmotiska gradient
Vad är sekretorisk diarré?
Sekretorisk diarré orsakas av kloridsekretion pga aktivering av ENS som aktiverar kryptceller. Aktivering av ENS utsöndrar VIP som binder in till receptorer på kryptceller. Detta ökar cAMP och öppnar cloridkanalen CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator)
Hur orsakar rotavirus diarré?
- Infekterar mogna enterocyter i tunntarmen genom att binda till receptorn, replikera och frisätta virustoxinet NSP4. NSP4 retar enteroendokrina celler vilket ökar intracellulärt Ca och släpper ut vesiklar med seratonin. Detta ger en sjukdomskänsla då seratonin stimulerar ENS -> signalerar mot vagus och hjärnans kräkcentra (area postrema)
Seratoninet som stimulerar ENS kommer även ge en utsöndring av VIP till kryptcellerna. Detta ökar cAMP och öppnar kloridkanalen CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) -> diarré
Vilket virus orsakar vinterkräksjukan?
Norovirus
Varför är vissa individer immun mot vinterkräksjukan?
- FUT2 kodar för alfa(1,2) fucosyltransferas som adderar fukos till H-antigen prekursor och aktiverar till H-antigen. Detta finns på saliv och slemhinnor och ingår i norovirusets tropism. Om man är homozygot är genen ”död” (G har bytts ut mot A vilket ger TAG (stoppkodon)), vilket ca 20% är. Utan fukos på receptorn kan ej viruset attackera.
Vad har luftvägarna för ospecifikt skydd?
- Låg temp
- Slem från bägarceller
- Cilierörelse
- AMP
- Hostningar
Vilka virus är det som primärt orsakar övre luftvägsinfektion?
- Influenza
- RSV
- Parainfluensa
- Coronavirus
Vad har NS1 för funktion hos influensa?
NS1 blockerar singalvägen som inducerar IFN genom att:
- binda dsDNA vilket blockerar siganlvägar och IFN-syntes
- blockera PKR vilket stoppar proteinsyntes
- blockera IRF som transporterar TF in i kärnan
Influensaepidemier uppstår efter…
antigenic drift
Influensapandemier uppstår efter…
antigenic shift
Vad är antigenic shift?
Antigenic shift är när en helt ny HA-subtyp uppstår pga rekombienring av 2 virus i samma cell
Vad är antigenic drift? Hur uppkomer det?
Antigenic drift är när ett litet fragment byts ut och beror alltid på punktmutation.
Mutationer uppkommer pga slarvig delning vilket förändrar epitoperna och gör att det ej känns igen lika bra
Hur diagnostiserar influensa?
Pinnprov i nasopharynx och svlag som sedan analyseras med PCR
Varför är små extra utsatta för RSV?
- Små barn har endast 30% av alveolblåsorna
- Små barn har dåliga hostningar
G-glykoproteiner fäster på…
CX3CR1-receptor
Hur undviker RSV immunförsvaret?
- Producerar IL-10-analoger vilket hämmar Th1-svar
- NS1 och NS2 blockerar IFN
- Cell-cellöverföring
Vilket virus ger falsk krupp?
Parainfluensa
En epidemi som är begränsad till ett område, land eller delar av ett land kallas…
Endemi
