DNA Reparatur 2 Flashcards
Gehen Sie die einzelnen Schritte der NER durch und machen Sie sich klar, wozu die jeweiligen Schritte dienen. Legen Sie dabei besonderes Gewicht auf die
folgenden zwei Teilaspekte:
a: Welche Funktion hat die Ubiquitylierung von XPC und XPE bei der Erkennung von CPDs?
b: Auf Grund Ihrer Spezifität müssten XPG und ERCC1-XPF jeweils Doppelstrangbrüche erzeugen.
Warum? Wie könnte dies verhindert werden?
- Schneidet ein Oligonukleotid mit dem Schaden aus der DNA
- Als Substrate (hier die Angriffsstelle) dienen z.B. Pyrimidindimere und 6,4 Photoprodukte, welche durch UV-Strahlung erzeugt werden
- Erkennt Verzerrungen in der Helix
Eukaryoten verfügen über zwei Wege zur NER: zum einen die Global Genome Repair (GGR), welche Schäden in transkriptionsinaktiven Bereichen der DNA behebt und zum anderen die sogenannte Transcription Coupled Repair (TCR), welche Schäden an der aktuell zu transkribierenden DNA behebt.
zu a): Die ubiquitinilierung von XPC erhöht sich seine Affinität zum CPD-Dimer der sich aufgrund von UV-Schäden gebildet hat. XPE hat die Aufgabe den Schaden zu erkennen und die Ubiquitinligasen zu rekrutieren. Es wird nach der Ubiquitinilierung abgebaut.
zu b): XPG und ERCC1-XPF erkennen nur Einzelstrang-Doppelstrang Übergänge. Darum sind die Stränge asymmetrisch von Proteinen besetzt wodurch nur ein Einzelstrang geschnitten werden kann.
Welche Gründe könnte es geben, dass sich bei der NER neben der Globalgenomreparatur (GGR) noch die Transkriptions-gekoppelte Reparatur entwickelt hat?
- GGR ist sehr langsam, mache Schäden werden erst nach Tagen repariert
- Schäden behindern die Transkription weshalb ein Reparaturmechanismus notwendig ist der bei der Transkription anwendbar ist
- verhindert das Gene über eine längere Zeit inaktiv bleiben bis die GGR den Schaden behebt.
