DNA Reparatur 1 Flashcards
Welches sind die beiden häufigsten DNA Schäden,
wodurch werden sie verursacht und wie werden sie repariert? Welche anderen DNA-Schäden sind unvermeidbar, da die auslösenden Agenzien durch
unverzichtbare metabolische Vorgänge generiert werden?
Die beiden häufigsten DNA-Schäden sind der single-strand-break (aufgrund der Hydrolyse der Phosphordiesterbindung) und die Depurination (aufgrund der Spaltung der N-glykosidischen Bindung), beide entstehen aufgrund von Wasser.
Der single-strand-break wird durch eine Ligase Repariert die das Rückgrat durch eine Kondensationsreaktion wieder repariert.
Die Depurination wird durch Basenextinktionsreparatur mithilfe einer AP-Endonuklease repariert.
Andere Schäden sind:
-Depyrimidination
-Oxidative Schäden durch reaktive Sauerstoffspezies
-Hydrolytische Schäden z.B. Cytosin Desaminierung
-Alkylierung bzw. Methylierung durch z.B. Metabolite
Warum werden die Basen bei der Erkennung durch Glykosylasen aus der Duplex geflippt? Wie muss dann die Glykosylase nach einer geschädigten Basen suchen? Warum könnte dies besonders in Eukaryoten schwierig sein?
So können alle Seiten der Base überprüft werden, was wichtig für eine spezifische Erkennung ist. Glykosylasen suchen den gesamten Strang ab und flippen jede Base.
Es gibt spezifische Glykosylasen mit schadenspezifischer Bindungstasche. Wenn eine falsche (für die Glykoslyase spezifische) Basenpaarung vorliegt ist die Bindungsenergie hoch genug um einen Komplex mit der Glykosylase zu bilden und den Schaden zu beheben.
Eukaryoten verfügen über ein großes Genom welches gepaart mit Histonen als Chromatinstruktur vorliegt, vor allem wenn es als dichtes Heterochromatin vorliegt. Außerdem kann ‘Konkurrenz’ zwischen Glykolyasen vorkommen.
