cours 6 mcb2991 Flashcards
différence entre BCR et TCR
- BCR plus grand (pour reach) vs TCR plus petit (contact intime avec cellule)
- BCR: hétérotétramère vs TCR hétérodimère
- BCR: 2 chaines légères, 2 lourdes vs TCR: 1 alpha 1 beta
- seul TCR a charge + transmembranaire
similarité BCR et TCR
- composé motifs conservés
- queue cytoplasmique courte
- région variable et région constante
quelle est la particularité du loci delta
se trouve dans le loci alpha
le réarrangement de l’un empêche l’expression de l’autre
de quoi sont fait les loci
tous: alpha, beta, delta, gamma
- région variable qui fait la majorité du loci
- région constante
- gènes conservés entre espèces
où se trouve la plus grande et la plus petite quantité ADN répétitif
plus grande: loci du TCR
plus petite: région DJC des loci
comment y a-t-il autant de diversité dans les immunorécepteurs
- diversité germinale: polymorphisme
- diversité combinatoire: différentes combinaisons possibles pcq fait d’hétérodimères
- modification somatiques: régions CDR (hypervariables)
quelles sont les types de modifications somatiques
- réarrangement génique (VDJ)
- commutation de classe (seul Ig)
- hypermutations somatiques (seul Ig)
- conversion génique (Ig de poulet)
quelles sont les 5 phases de la recombinaison somatique
- initiation
- synapse
- clivage
- protection et apprêtement
- résolution
caractéristiques de RAG-1 et RAG-2
- interagissent avec RSS
- interaction très spécifique
- RAG-1 interagit surtout avec espaceur (12-23) et nanomère
- RAG-1: machine alors que RAG-2: stabilise en liant plutôt heptamère
caractéristiques protéine HMG
plie ADN, important pour clivage, lie aux RSS avec complex RAG
de quoi sont fait les épingles à cheveux
100% ADN
caractéristiques de Ku
- interagit manière non-spécifique
- protège ADN
- dimérise avec autre Ku (Ku80 avec Ku70)
- ciblase (recrute autres protéines)
- ADN et Ku sont collés: interactions très proximal
caractéristiques DNA-PKcs
- orchestre la protection et apprêtement
- phosphoryle les substrats
caractéristiques Artemis
- hydrolase
- ouvre épingle à cheveu n’importe où pour que épingle se déplie
caractéristiques de TdT
- ajout base aléatoires
- contribue à diversité
caractéristiques XRCC4 et DNA ligase IV
- réparation double brin
- interaction non-spécifique
- Ku permet ciblé complex
- XRCC4 qui positionne la ligase
caractéristiques XLF/Cernunnos
- formation filament permet adapter structures de bris doubles-brins
- interagit avec complex XRCC4 et ligase IV
caractéristiques de PAXX
stabilise tout complex Ku, DNA-PKcs, XRCC4/LIG4, XLF
différence entre espace ADN-complex synaptique et ADN-Ku
ADN-Ku: collés
ADN-complex synaptique: bcp espace dans cavité, besoin pour appariement, pairage, ligation dans atrium
que contient le complex synaptique NHEJ
LIG4, XRCC4, XLF, Ku, DNA-PKcs, PAXX
détails de la recombinaison somatique
pour trouver les deux bon RSS: ADN lui même passe à travers le nexus (complex de recombinaison avec RAG2)
1. RAG-2 interagit avec histone pour rendre accessible des RSS
2. RAG1 et RAG2 lient RSS
3. HMG lie les deux extrémités et plient ADN
4. clivage: relargue ADN entre les deux RSS et extrémités libres, épingle à cheveu pour protégé
5. pleins de Ku pour protéger ADN
6. DNA-PKcs pour passer aux prochaines étapes
7. Artemis ouvre épingle à cheveu (pas toujours même endroit)
8. exonucléase gruge aléatoirement
9. TdT ajoute nt aléatoirement, mais de façon complémentaire
10. XRCC4 et LIG4 lient jonctions à l’aide XLF/Cernunnos, PAXX
