cours 4 mcb2991 Flashcards
comment se fait-il qu’un virus inactivé soit présenté sur CMH II mais pas CMH I
virus inactivé ne produit pas de protéines virales, donc pas possible de faire présentation CMH I
qu’est-ce que l’autophagie
présentation virus endogène par CMH II
à partir Ag libre: formation phagophore puis autophagosome pour présenter CMH II
(inverse de cross-presentation)
comment ecq virus infectieux/protéines virales peut être présenté sur CMH II
- par autophagie: protéine produite par virus peut se retrouver dans un compartiment phagophore puis autophagosome
- cellules dendritiques micropinocytose et présente comme Ag exogène
2 types de cross-presentation
- vacuolaire: RE aide à la phagocytose donc dans phagosome se trouve plusieurs protéines du RE: maintenant possible de présenter par CMH I: tout se déroule à la vacuole
- vacuole vers cytosol: Ag pris par phagosome, mais protéine échappe de la vésicule: devient protéine endogène qui peut se rendre au RE pour présenter CHM I
que fait emetine et que cause-t-il sur présentation au CHM I et II
bloque synthèse protéique, donc inhibe activité virale, pas activité protéasome, pas peptide au RE donc pas présentation CMH I
comme voie CMH II ne dépend pas de synthèse proétique: présentation possible au CMH II
que fait la chloroquine et que cause-t-elle sur la présentation au CHM I et II
fait en sorte que les compartiments ne seront pas acide, empêche présentation au CHM II
comment se fait le processus d’ubiquitination
- Ub + ATP
- E1lié Ub
- E1 remplacé par E2
- E2 remplacé par protéine à l’aide de E3
- refait processus pour avoir plusieurs Ub sur protéine
- protéine marquée pour protéasome
- protéasome besoin ATP pour dégrader protéine
différents types d’ubiquitination
- mono-Ub
- multi-Ub (1 Ub/lysine)
- poly-Ub sur K63
- poly-Ub sur K48 (reconnu par protéasome)
comment est formé le protéasome
7 alpha type pour extrémités
7 beta type: 3 sous-unités beta avec activité protéolytique spécifique (chaque beta coupe des a.a. spécifiques)
qu’est-ce qu’un immuno protéasome
- augmente abondance et diversité peptides du CMH I
- nettoi cellules suite inflammation
que se passe-t-il avec les peptides une fois dégradé par le protéasome
- dégradé par aminopeptidase
- TAP pour entrer
- ERAP qui continue à couper peptides
que fait ERAP
prend peptides avec extension N-terminal pour les former en peptides plus petits
comment les peptides sont chargé sur CMH I
- chaine naissante class I glycosylé
- Gsl I/II clive glucose pour en laisser 1 seul
- ajout calnexine
- échange CNX pour beta 2 microglobuline
- lie calréticuline pour former peptide loading complex
- calréticuline recrute ERp57 et tapasin
- comme tapasin et TAP sont rapproché: plus efficace pour lier peptides sur CMH I
- lie peptide: Gls II enlève glucose
si lie pas peptide recommence: reglycosylé
comment empêcher CMH II lie peptide du RE
chaine invariante
comment se fait le processus de dégradation de la chaine invariante et de CLIP
- non-cystéine protéase dégrade partie de la chaine invariante
- cystéine protéase coupe complètement chaine invariante
- cathepsin S coupe CLIP
- protéase coupe de façon transmembranaire
- peut lier DM
que fait HLA-DM
lie DR (CMH II classique) et modifie structure niche du côté N-terminal du peptide pour fragiliser le lien: permet de s’assurer que le peptide dans la niche est de haute affinité
permet éjecter les peptides instables
que fait HLA-DO
- DO toujours trouvé associé à DM
- compétitionne avec DR pour lier DM (empêche DM de faire son action)
- si on a bcp de DO, on a bcp de CLIP
- permet élargir le répertoire des peptides: comme inhibe DM: permet de présenter des peptides avec moins d’affinité
- sans DO: meilleure présentation
caractéristiques des lysosomes
- contient enzymes hydrolytique qui dégradent
- pH acide (pompe protons): optimal pour enzymes
que se passe-t-il dans le processus de maturation des compartiments lysosomaux
- acquiert des molécules différentes, composition en protéine change
- processus mène a acidification: pour dénaturer protéine et activer protéase
comment les Ag sont apportés aux compartiments vaculoaires
- phagocytose
- macropinocytose
- endocytose (besoin récepteur spécifique)
que permettent les récepteurs de surface pour l’endocytose d’Ag
- concentrer Ag
- diriger vers compartiments fonctionnels
- signalisation intracellulaire
(à vérifier)
que permet la macropinocytose pour amener Ag au compartiments vacuolaires
- non-sélective
- capture de grande quantité matériel
- efficace chez macrophages et DC immatures
comment ecq épitopes sont captés sur CMH II
2 méthodes (puisque niche peptidique CMH II ne restreint pas la taille du peptide)
- Ag dégradé par protéase et après lie CMH II
- CMH II lie immédiatement le épitope et après protéase coupe
