Att hitta sin smitta

Question 1

Vilka tester är bäst för att påvisa virus och vad påvisar de?

Answer 1

Serologi - antikroppar
PCR - DNA/RNA

Question 2

Var kommer den vanligaste kontaminanten ifrån vid blododling? Vad har man oftast missat att göra?

Answer 2

Hudytan
Missat tvätta ytan elller ta slaskrör

Question 3

Bedömning av blododling

• Vanliga patogener
  o E coli/gramnegativer, S aureus, ex endokardit), Streptokocker

Ibland kan man få svar i en enstaka flaska och bortse från det. Men när kan vi inte bortse från svar i en flaska?

Answer 3

Enterokocker (kan ge endokardit)

Question 4

Vanliga bifynd/kontaminanter vid blododling?

Answer 4

o Enstaka flaska, ”lång” larmtid (>24h)
o Koagulasnegativa staphylokocker – KNS (vanligast)
o Corynebakterier/”diftstav”, Bacillus spp
o Ev. alfastreptokocker (INTE enterokocker!)

Question 5

När ska vi blododla och vad ska inte ha startats?

Answer 5

• På vida indikationer
  o Innan start av iv. Antibiotikabehandling

Question 6

Vilka två viktiga saker ska vi göra för att minska risken för kontamination vid blododling? Vad är viktigt tänka på gällande fyllnad? Hur många flaskor?

Answer 6

• Desinficera + slaskrör
  o Fyll flaskorna ordentligt!
• 2 aeroba + 2 anaeroba flaskor

Question 7

Blododling

• Kontinuerlig avläsning i instrument 5 dygn

Hur lång tid brukar det ta innan positivt svar? Vad är kliniskt relevant sett till tid?

Answer 7

o Tar oftast 6-12h till flaska blir ”positiv”
o 90% positiva inom 2 dygn. Efter det sällan relevant!

Question 8

Tar oftast 6-12h till blododlingsflaska blir ”Positiv”

Vad kan vi se efter minuter, 1-2 h, 6-8 h och efter ca 24 h?

Answer 8

o Preliminärt svar 1 (mikroskopi, minuter)
o Preliminärt svar 2 (artbestämning, 1-2 h)
o Preliminärt svar 3 (snabbresistens, 6-8 h)
o Slutsvar (art + resistens, ca 24 h)

Question 9

En patient ligger inlagd på din vårdavdelning pga erysipelas i vänster underben och behandlas med Bensyl-penicillin sedan ett dygn och har
fortsatt hög feber. När du lyfter på täcket ser du att det finns ett sår på höger underben på ca 3x4 cm med omgivande rodnad och värmeökning.
Vilka sorts bakterier kan bidra till den kliniska bilden?

Answer 9

• GAS, streptococcus pyogenes

Question 10

En patient ligger inlagd på din vårdavdelning pga erysipelas i vänster underben och behandlas med Bensyl-penicillin sedan ett dygn och har
fortsatt hög feber. När du lyfter på täcket ser du att det finns ett sår på höger underben på ca 3x4 cm med omgivande rodnad och värmeökning.

Vilka odlingar kan vara lämpliga?

Answer 10

Pinnprov, sterila punktat och/eller vävnadsbitar

o Odlingsplattor/strategi på lab beror på lokal och anamnes!!

Question 11

Vad är viktigt att tänka på vid pinnprov (ytliga infektioner)? Vanliga fynd? Vanliga bifynd?

Answer 11

o Enbart om det förväntas påverka den kliniska handläggningen.
o Normalflora försvårar tolkning. Rengör noga = tvätta bort kolonisatörer först!
o Grupp A-streptokocker och S. aureus vanliga fynd. Bett/rivsår: Pasteurella.
o Oftast bifynd: Koliformer, enterokocker, KNS (=blandflora)

Question 12

Artbestämning - mass-spektrometri - Matrix-assisted laser desorption/ionization – time of flight
Varje art har ett unikt spektrogram

Vad beskrivs?

Answer 12

MALDI-TOF

Question 13

In på akuten med ambulans kommer en högfebril och uttalat andningspåverkad man i 60-årsåldern. Ingen utlandsvistelse. Pigg och uppegående under gårdagen. AF 35/min, BT 85/40, Temp 39.8C.
Vilka agens kan ge denna sjukdomsbild (3)?

Answer 13

• Pneumococker, covid-19, mycoplasma

Question 14

In på akuten med ambulans kommer en högfebril och uttalat andningspåverkad man i 60-årsåldern. Ingen utlandsvistelse. Pigg och uppegående under gårdagen. AF 35/min, BT 85/40, Temp 39.8C.

Vilka odlingar/undersökningar beställer du?

Answer 14

• Sputum/Nasofarynxprov (inte lika bra som nedan)
  o Trakelsekret/Bronksköljvätska
• Urin-antigen (Legionella och Pneumokocker)
• Odling:
  o Bakterier
  o Svamp
  o Resistensbestämning
• PCR:
  o Snabbt svar
  o Bred diagnostik
  o Även svårodlade
  o Agens (virus, ”atypiska” bakterier)

Question 15

En äldre kvinna kommer in med sitt årliga urinprov på en vårdcentral och hävdar med bestämdhet att hon har UVI igen! Sköterskan skickar för odling
och svaret kommer i din inkorg och visar växt av blandflora.

När ska man inte ta urinodling?
När ska urinodling tas ?

Answer 15

Ta inte urinodling vid en okomplicerad UVI hos kvinna

Question 16

Vanliga patogener vid UVI (2)?

Answer 16

o Escherichia coli
o Staphylococcus saprophyticus

Question 17

Gastroenterit
Nämn några vanliga grupper av patogener och någon patogene i varje grupp

Answer 17

• Virus (PCR-paneler finns)
  o Calicivirus (Noro och Sapo), Rotavirus, Adenovirus, Astrovirus mfl
• Bakterier (Odling eller PCR)
  o Selektiva odlingsmedier (normalflora!)
  o Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter
  o EHEC (PCR)
  o C. difficile (PCR/toxinpåvisning)
  o Vibrio cholerae
• Protozoer/mask
  o Entamoeba histolytica, Giardia mfl
  o Blastocystis och Dientamoeba

Question 18

Gällande eventuell infektion, vad tittar du efter vid lumbalpunktion?

Answer 18

• Celler/laktat
• HSV/VZV/enterovirus PCR
• Odling (ev antigentest för pneumokocker)/PCR
• Serologi

Question 19

När kan realtids-PCR vara lämpligt?

Answer 19

Följa förlopp (HIV/hep etc)

Question 20

”Ny” mikrobiologi
Ge exempel på några metoder som är på frammarsch

Answer 20

• NGS – next generation sequencing
  o Olika metoder för omfattande parallell sekvensering (MPS)
  o Klinisk användning- ”universal PCR”
  o 16s rRNA (del av bakteriell ribosom)
• WGS – whole genome sequencing
  o Helgenomsekvensering
  o Art, epidemiologisk typning, resistensmutationer (TB!)
• Metagenomik – NGS-analys av allt genetiskt material i prov
  o Bestämda (”targeted”) målsekvenser – Patogenspecifik anrikning (tex 16s rRNA)
  o Okända (”untargeted”) målsekvenser: smittämne behöver inte vara känt! Känslighet ? Dyrt och komplicerat (bioinformatik)

Question 21

Vad innebär diskdiffusion?

Answer 21

Disk (lapp) som innehåller antibiotikum. Om bakterien är känslig bildas en hämningszon. Man mäter sedan diametern på hämningszonen, t ex 24 mm.

Question 22

Minsta inhiberbara (hämmande) koncentration (?) översätts i ? -svaret (lågt värde ”känslig”, högt värde ”resistent”)

Answer 22

MIC
SIR

Question 23

Vad betyder SIR

Answer 23

S=Susceptible, standard dose (Känslig/Sensitiv)
I=Susceptible, increased exposure
R=Resistant (Resistent)

Question 24

Vad kan vara viktigt gällande serologi och anslagstid för olika antikroppar?

Answer 24

IgM kommer först men försvinner sen