14November Flashcards
Hvad vil det sige at en fænotype er multifaktorielt betinget?
Forårsaget af gener og miljø
Forklar kort hvad en STRP markør er
Short tandem repeat polymorphism
Er en DNA sekvens som består af multiple korte og gentagne DNA sekvenser. disse sekvenser er polymorfe idet nummeret af antal gentagne sekvenser varierer fra individ til individ.
Den måler mellem 2-5bp
Hvad er den genetiske betegnelse for at en monogen arvelig sygdom i forskellige familier kan skyldes mutationer i forskellige gener
Locus heterogenitet
Giv en mulig forklaring på at to forskellige markr-alleler co-segregerer med en sygdom i to familier
10cM = 10% chance for cross-over
Der er tale om koblingsuligevægt.
Sygdomslocus forekommer hyppigere i befolkningen, da de er tæt koblede (10cM)
Derfor kan de to markør-alleller co-segregere med sygdommen.
De er så tæt koblede at de nedarves sammen, i stedet for hver for sig.
DGiv to mulige forklaringer på resultatet af genotypning hos den pige, som ikke har arvet markør-allel 1
Hun kan have nedarvet rekombinant type gameten.
hvilket betyder at hun ikke bærer markør-allellen for markør allel 1., det er der 10% chance for
EGiv to mulige forklaringer på resultatet af genotypningen hos den raske bror
- Nedsat penetrans
- Variabel ekspressivitet
- Fænokopi: miljø er årsag, men ligner genetik
- Maternel/paternel imprinting
G. mRNA koncentrationen hos syge er 50% lavere end hos de raske
Giv en kort forklaring på hvordan mRNA målingerne kan hhænge sammen med mutationerfundet i familien
RISC overvågningssystem
Habloinsufficiens som følge af loss-of-function pga. frameshift mutation
I. Giv to mulige forklaringer på at forskellige mutationer i samme gen kan give forskellig sygdom/fænotype
En basedeletion vil skabe en frame-shift mutation –> loss-of-function
- Splice-site
B. Forklar hvordan replikationen i S-fasen resulterer både i fordobling af cellens DNA indhold og i dannelsen af identiske søsterkromatider
Under replikation fordobels alt arvemateriale, hvorfor man får dannet to antiparallelle komplementære DNA strenge ud fra en DNA-streng.
Det foregår efter komplementær baseparring i synteseretning 5’–>3’ på leading og lagging strand
man kan tegne DNA dobbelthelix som splittes op og replikeres på hvert bånd
C. hvilken kromosomal struktur er i meiosen afgørende for at den maternelle og den paternelle allel i et locus adskilles og går til hver sin celle?
Centrioler danner tentrådsapparatet.
Deres funktion er at tage fat i centromererne på kromosomerne
D Hvilke forskellige gameter vil A1B1 og A2B2 person kunne danne og hvor mange procent ville hver af dem udgøre?
A1B1 = 25% A2B2 = 25% A1B2 = 25% A2B1 = 25%
E I hvilken situation vil Mendels 2.lov ssvigte?
Mendels lov ophører når locus siges at være koblede, dvs. under 50cM afstand
F. Forklar kort om der i primære spermatocytter skerparring mellem x-kromosom og y-kromosom eller dele deraf
Ja, men kun på de pseudoautosomale dele af X- og Y-kromosomerne, dvs. de dele der findes homologt genetisk materiale på begge kromosomer.
De findes på tippen af den korte p-arm
I Et barn har 47XXY klinefelter med en x-bunden blødersygdom, men begge forældre er fænotypiske raske
Giv en sandsynlig forklaring på at barnet har blødersygdom
Non-disjunction i 2. meiotiske deling danner gamet med 2 identiske X hver
Mor er bærer af recessiv hæmofili-allel på det ene X kromosom
Tumorsuppressor gener er nedarvelige.. hvorfor skidt hvorfor godt?
hvis onkogener nedarves muteret vil fosteret dø.
Knudson’s 1 and 2 hit hypotese
Cellerne har taget første trin i processen (muteret)
C Nævn en anden klinisk forskel der gør at man vil mene at det drejer sig om en arvelig snarere sporadisk cancer
Sygdommen optræder bilateralt, multifokalt og med flere uafhængige primærtumorer
D Hvilken genetisk forandring er afgørende at en celle med muteret ‘‘tumorsuppressorgen’’ kan udvikle sig til en malign cancercelle?
- Loss-of-function
E Nævn og beskriv en metode der kan bruges til at visualisere balancerede translokationer i cancerceller
E.
beskriv kort en probe-baseret, cytogenetisk metode til bestemmelse af kromosomal lokalisation af sygdomslocus
Først SKY derefter FISH
FISH har cytogenetisk metode, ved komplementær baseparring kan identificere gDNA
DCFDDH
- Dyrkning af celler
- Tilsætte Colchicin –> tentråde sprænger
- Fiksere cellerne
- Dråbeteknik i små glas
- Denaturering med 96’C
- Hybridisering og tilsætning af farvestof
F Nævn og beskriv en metode der i en og samme undersøgelse kan afsløre numeriske fejl i arvemassen og samtidig bestemme lokalisationen af disse afvigelser
FISH og SKY, måske CGH
G Nævn 3 forskellige typer af genetiske forandringer som kan ændre et proto-onkogen til et onkogen
- Mutation i proto-onkogenets regulatoriske region (promoterregionen) kan ændre proteinet til et onkogen
- Mutationer i miRNA
- Translokation
H Hvordan kan man forvente at Metyleringsændringer af DNA vil påvirke hhv. tumorsuppressorgener og protoonkogener sådan at det bidrager til udvikling af maligne celler?
Hypermethylering
Giver ukontrolleret celle proliferation
- Hypomethylering
Frmmer ureguleret cellevækst
I Hvilke 3 celleulære reaktioner på genskaber er de vigtigste for at undgå permanent genskade skal opstå som cancer
- DNA-repair gener
- Apoptose
- G0 hvilestadie
J Beskriv 2 principielle mekanismer som kan være involveret i virus-medieret induktion af cancer
Onkogner: Virus kommer med et onkogen og speeder celledeling op
Tumorsuppre. gener: Virus nedlukker menneskecellens tumorsuppressorgen
Tab af funktionelt genprodukt kan ske følge af:
- Loss of heterozygosity
- En punktmutation i kodende sekvens
- promoter mutation
- enhancer mutation
- hypermetylering
- overproduktion af miRNA
D.
PJD nedarves Xbunden DogR Hvis man sætter hyppigheden af sygdomsallellen til 0,001, hvad er da sygdomshyppigheden af PJD i befolkningen
q = 0,001
2pq -‘‘bølge’’ 2q = 0,002
G.
Nedarvede sygdomme kan skyldes mutation i mitokondrie-DNA
1. Hvad er karakteristisk ved sådan en arvegang?
2. Hvordan vil du forkalre variable ekspressivitet ved mitokondriesygdom?
- Mitokondriel arvegang nedarves fra mødre til børn
- Homoplasmi dvs alle mitokondrier har samme DNA-sekvens.
Alle børn bliver syge. - Heteroplasmi, vil det sige at ikke alle mitokondrier indeholder mutationen..
Ikke alle børn bliver syge, dem som bliver syge i mildere eller sværere grad
B. Hvilken type kromosomabnormitet vil du se efter ved båndfarvning
Aneuploidi
F Et barn emd karyotypen XXY Hvad er sandsynligheden for at barnet får hæmofili A hvis non-disjunction var sket i 1. Første mtiotiske deling hos far 2. anden meiotiske deling hos mor
Skæv in-aktivering kan give sygdommen.
Ved at faderen har non-disjunction i første meiose er ca. 0%
- Moderens bærersandsynlighed er 50%.
nondisjunction i 2. meiotiske stadie skaber identiske kromosomer.
Derfor er sandsynligheden for at hun har givet den videre 1/2 * 1/2 = 1/4 = 25%
Hvad er VNTR-locus?
Et sted i arvemassens DNA hvor en sekvens forekmmer i et antal kopier ved siden af hinanden.
Antallet kan vareiere fra invidiv ti lindivid VNTR (variable numer tandem repeats)
Man kan derfor bruge VNTR locus som markør til undersøgning af nedarvning Og DNA finger print
D.
nævn en specifik somatisk non-disjunction der sker hos et voksens menneske, der kan føre til alvorlig sygdom
hvis et kromosom har muteret tumorsuppressorgen, vi ltab af det homologe kromosom ved non-disjunction i en somatisk celle kunne føre til at cellen udvikler sig forkert og danner en tumor
F.
reciprok translokation mellem 5 og 11:
Beskriv de forskellige partielle monosomier respektive trisomier som de giver anledning til i zygoten
Reciprok:
Ombygning af dele mellem tO ikke-homologe kromosomer uden ændret mængde
Monosomi for chr5 og trisomi for chr11
monosomi for kromosom 11 og trisomi for chr5
A.
Hvilken arvegang følger Rh+ ?
Autosomalt dominant
A.
Kan man bruge en blodprøve til genetisk at bestemme brystcancer chancerne for en kvinde med brystcancer if amilien?
Ja det kan man. det er en arvelig sygdom og en genetisk ændring (mutation) vil ses i alle kroppens celler.
Man kan skelne mellem sygdomsalleller og raske alleler ved DNA- markøranalyse hvis man har en kontrolgruppe
B.
Hvorfor bruger man mikrosatellitmarkører for hvert gen?
Selvom man vælger meget polymorf mikrosatllitmarkører kan man risikere at markører ikke er informative sådan at man ikke kan skelne mellem syg/rask allel i familien.
Derfor er det godt at bruge flere
F.
Både Brystkræft 1 og 2 koder for proteiner der involveret i DNA reparation.
Giv et forslag til hvorfor ved arvelig brystkræft man ser dominant og ikke recessive arvegange
Man arver sygdomsfremkaldende allel og der kan ske somatisk tab af den anden allel (loss of heterozygosity)
C.
Forklar kort principperne i DNA-sekvensering
Beskriver den proces hvor man aflæser sekvensen af DNa mlekyle med udgangspunkt i en blodprøve.
Man skal bruge dNTP, ddNTP, DNA polymerase
Man separerer DNA molekylerne efter størrelse og markerer med farve
I.
X bunden recessiv sygdom
Hyppigheden af Nefrogen Di er 1/114.000 drenge
hvad er hyppigheden af sygdomsallellen i befolkningen?
Ved x-bunden recessiv sygdom er hyppigheden af sygdomsallellen lig med hyppigheden af syge drenge i befolkningen. altså 1 ud af 114.000
C1.
hvad vil det sige at koden er degenereret
Der er 20 aminosyrer som skal specificeres af codons.
Med 3 nukleotider kommer flere forskellige codons til at kode for samme aminosyre. den konsekvens ligger bag betegnelsen degeneret kode.
