13Maj Flashcards
Primer
En primer skal være antiparallel og komplementær til den kodende (ikke-transkriberende) sekvens af exon
Redegør for to måder på hvordan mutationer i den transkriberende del (ikke kodende del region) kan medføre exon skipping
Mutationer i 3’-UTR eller 5’-UTR:
- Mutationer i splice-site (ændrer splice-site)
- Mutationer i polyA-addition-sites –> inhiberer poly-adenylering
Et polygen
Arvegang hvor sygdommen skyldes en kombination af mutationer i forskellige gener
SNP
Variant fremfor en mutation
Single nucleotide polymorfs
Minder om en punktmutation, hvor vi har en nukleotid som er blevet udskiftet med en anden
Er så hyppig at mindst 1% har den, man taler derfor om en variant fremfor en mutation
Relativ fordeling
En hyppigere forekomst hos syge end hos folk der ikke er syge
OR
Odds ratio på 1,20 betyder at man har 20% større risiko for at udvikle en sygdom, hvis man er bærer af genet.
I forhold til, hvis man er ikke-bærer
Koblingsuligevægt
Loci, hvorimellem der er koblingsuligevægt, er tæt koblede
Når en specifik haplotype (kombination af alleler på to eller flere loci) forekommer i en befolkning hyppigere end man ville forvente hvis allelerne på de involverede loci kombinerede frit.
Recibrok translokation
Bytning af DNA mellem to ikke-homologe kromosomer –> derivate kromosomer
En balanceret recibrok translokation har ingen fænotypisk effekt.
Man kan få:
- Raske bærere med balancerede translokation
- Raske børn med balanceret karyotype
- Syge børn med ubalanceret karyotype
Nævn tre forhold for modermærkekræft der kan forklare et resultat af en koblingsanalyse
- Locus heterogenitet
- Fænokopi
- Sporadisk tilfælde
- Nedsat penetrans
Locus heterogenitet
Mutationer i forskellige loci kan give samme fænotype
Uregelmæssigheder
Mutationer i gener i forskellige loci = giver samme sygdom
Fænokopi
Mutation forårsaget af miljøfaktorer
Som genetisk ligner en genetisk mutation
Penetrans
Gennemslagskraft
Den sandsynlighed for sygdommens forekomst ifht. fænotypen
Inkomplet:
- Forskellighed fra 100%
Aldersbetinget:
- Fremtræder med alderen
Kønsbetinget:
- Kun ét køn får sygdommen
Vil sekventering af cDNA være tilstrækkelig for at påvise mutationen, eller skal man bruge gDNA for at påvise mutationen
Promoter regionen er ikke en del af mRNA
cDNA = mRNA
Vi har derfor brug for gDNA idet promotersekvensen ikke indgår i mRNA
- Hvordan opstår kræft?
Uhindret celledeling
- Hvorfor har kræft evigt liv?
Opretholder telomerase så det ikke går i stykker
Normale celler:
- Telomer DNA forkortes under hver replikation