13November Flashcards
CGH-array
Comparativ Genome Hybridisation
God metode til at undersøge deletion og mikrodeletioner
Man kigger på hele genomet og ser forskel på ploid antallet (CNV, copy number variations)
Man sætter en række glas op og propper farvestof i, der vil dermed vises neutral, positiv, negativ
Haploinsufficiens
Vi har to gener i kromosom 22
Det ene er sygt
Det andet er raskt
Men det raske kan ikke opretholde et funktionelt protein alene
Hvad kan mutationer i et gen som koder for transkriptionsfaktorer forårsage af symptomer?
Hvad kalder man effekten?
Transkriptionsfaktorer spiller en vigtig faktor under fosterudvikling
- Der kan forårsages forkert regulering af genekspression i de forskellige celler under udvikling hvilket skaber fejludvikling
Effekten kaldes:
- Pleotropi
Hjertet og ganen stammer fra samme lag under fosterudvikling og hvis TF ikke virker skaber det mutationer
En populationsmekanisme der kan forklare en høj allelhyppighed i en befolkning
- Founder effect
- Genetisk drift
To muligheder:
- Mindre gruppe mennesker som er taget til Finland
- Sygdommen er overrepræsenteret i den lille gruppe mennesker
Genetisk drift
Genetisk variation i en population
Founder effect
Tab af genetisk variation, når en ny population er dannet
Multifaktoriel sygdom
- Polygenetisk
- Flere miljøfaktorer
OR, Odds ratio
Hvad tallet betyder
Odds for at udvikle sygdom ved en eller anden betingelse
Hvis den er på 1, er der ikke association
Hvis den er på 10 er risikoen 10 gange så høj for at en genetisk sygdom indtræffer
Forskel mellem RR og OR
Hvis det er en sjælden sygdom er RR og OR tæt på hinanden
Hvad er mikroRNA
miRNA kan blokere for translationen af mRNA i cytoplasmaet ved at sætte sig på ribosomerne
Det er en del af RISC forsvaret
Posttranskriptionel modifikationsfaktor
Hvad er en polymorf DNA markør?
DNA markør med flere forskellige alleler tilknyttet
Mange forskellige alleler der muliggør informativ koblingsanalyse
En sekvens variation betegnes en polymorfi hvis den sjældneste allel har en hyppighed i befolkningen på mindst 1 % = SNP
Imprinting
Epigenetisk genregulering:
Et gen som er transkriptionelt inaktivt siges at være ‘‘imprinted’’
Genet kan blive nedlukket /silenced
Omkring 200 autosomale gener anslås at være ‘‘imprinted’’
Kan medføre monoallel ekspression. - Ved deletion på det monoallel ekspressive gen kan sygdomme opnåes, fx - Angelman (deletion fra mor) - Prader-Willi (deletion fra far) Willi)
Hvor de aktive gen nedlukket
Obligat bærere
Personer som er nødt til at have et sygdomsgen for at et stamtræ kan gå op
Proband
En person man undersøger i et stamtræ
Hvad er:
- Reciprok translokation
- Robertsonsk translokation
Der forekommer IKKE et tab af genetisk materiale mellem dem
Recibrok translokation:
- Bytning af DNA mellem to ikke-homologe kromosomer –> derivate kromosomer
Robertsonsk translokation:
- Fusion af 2 akrocentriske kromosomer –> 1 metacentrisk kromosom udfra to arme og tab af de resterende q-arme (ofte kromosom 14 el. 21)