LM microorganismes pathogènes : mesures diagnostiques et antibiothérapie Flashcards
Nomme les 3 étape du traitement des échantillons.
- Pré analytique
- Analytique
- Post analytique
Que comprend l’étape pré analytique?
- Test demandé par le professionnel de la santé.
- Échantillon prélevé et acheminé au laboratoire.
- Réception de l’échantillon au laboratoire de microbiologie.
Que comprends l’étape analytique?
- Étalement de l’échantillon sur une lame microscopique : coloration de
Gram - Étalement de l’échantillon sur des «géloses»
Géloses sont mises dans des incubateurs à __oC
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Nomme les 3 principales géloses.
- Sang de mouton
- Chocolat
- MacConkey
Nomme une gélose sélective et différentielle.
MacConkey
Nomme les 3 atmosphères d’incubation.
- Dans une étuve à l’air ambiant (21% d’O2)
- Dans une étuve à CO2
- Dans une tente anaérobie
Nomme 3 tests qui se font en analytique.
- Hémolyse
- Coagulase
- Catalase
Qu’est-ce que le post analytique?
Le résultat des tests
Quand le médecin doit-il prescrire des hémocultures?
- Patient qui présente de la fièvre avec signes d’atteinte
systémique sévères - Dx possible de méningite ou endocardite
Symptômes qui requièrent une hémoculture?
- Atteinte de l’état général
- Frissons solennels
- Tension artérielle basse
Quel nombre d’hémoculture est généralement prescrit?
- le médecin prescrit 2 hémocultures
- L’infirmière prélève 4 bouteilles
Vrai ou faux? On prélève généralement deux bouteilles aérobies lors d’une hémoculture.
FAUX
une bouteille aérobie et une anaérobie
Pourquoi prélève-t-on une bouteille aérobie et une anaérobie lors d’une hémoculture?
- À cause des anaérobies (augmentation légère)
- Meilleure croissance de certaines bactéries aérobies dans les bouteilles anaérobies
Quel est le volume de sang idéal par hémoculture?
20 mL
De quoi dépend la probabilité de trouver la bactérie dans le sang?
Du volume de sang cultivé
Pourquoi prélever 2 hémocultures (40 ml de sang)?
- Plus le volume est grand, plus la probabilité est haute de trouver des bactéries
- Risque « coût-bénéfice » devient moins intéressant après 40 mL
Quand prescrire plus que 2 hémocultures?
- Endocardite aiguë
- Endocardite subaiguë
Décrit le prélèvement des hémocultures dans le cas d’une endocardite aigue.
Obtenir 3 hémocultures1 < 2h, avant de débuter le traitement
Décrit le prélèvement des hémocultures dans le cas d’une endocardite subaigue.
- Obtenir 3 hémocultures1 < 24h, avant de débuter le traitement.
- Prélever 2 autres hémocultures si la première série est négative après 24 heures.
Pourquoi prélever en « 2 temps » une hémoculture?
Évaluer la contamination cutanée
Évaluer le caractère continu de la bactériémie
Décrit le traitement des hémocultures au laboratoire.
- Dès la réception au laboratoire, les bouteilles d’hémoculture sont déposées dans un appareil qui maintient la température à 37°C et qui brasse les bouteilles de façon continue.
- L’appareil détecte la présence de croissance bactérienne grâce aux métabolites générés par les bactéries dans la bouteille.
- La technicienne effectue une coloration de Gram sur le liquide de la bouteille d’hémoculture «positive» et ensemence des milieux de
culture (géloses) ce qui permettra d’identifier la bactérie impliquée et
de procéder à un antibiogramme.
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Cocci Gram + amas?
Staphylococcus
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Cocci Gram + en chaînettes?
Streptococcus,
Enterococcus
Pneumocoque
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Cocci Gram + en paires?
Pneumocoque
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Cocci Gram – en paires?
Neisseria,
Moraxella
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Bâtonnets Gram -?
E. coli,
K. pneumoniae,
Pseudomonas,
Bacteroides fragilis
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Coccobacille Gram négatif?
Haemophilus influenzae
Quel est l’agent possible sur cette hémoculture si…
Bâtonnets Gram +?
Listeria monocytogenes,
Clostridium spp.
Corynebacterium spp.,
Bacillus spp.
Quelles bactéries ne sont jamais des contaminants?
S.aureus
S.pneumoniae
Streptococcus pyogenes (Gr. A)
Listeria monocytogenes
E.coli
Candida albicans
Quelles bactéries sont peut-être des contaminants?
- Staphylocoque à coagulase négative
- Streptocoque du groupe viridans
Quelles bactéries sont probablement des contaminants?
Bacillus spp.
Est-ce que cette situation présente un lien plausible?
Présence de Neisseria meningitidis dans l’hémoculture d’un patient hospitalisé pour une méningite.
Oui
Est-ce que cette situation présente un lien plausible?
Présence de Streptococcus viridans dans l’hémoculture d’un enfant hospitalisé pour une méningite.
Non
Les Streptococcus viridans ne cause pas de méningite.
Nomme les deux types d’examen de laboratoire sur un échantillon urinaire.
- Analyse d’urine (laboratoire de biochimie)
- Culture d’urine (laboratoire de microbiologie)
Que permet d’obtenir une analyse d’urine?
- Présence de globules blancs
- Présence de globules rouges
- Présence de nitrites
- Etc…
Que permet d’obtenir une culture d’urine?
Croissance de bactéries
Vrai ou faux? La présence de bactérie dans les urines sans symptômes associés nécessite très rarement un traitement.
Vrai
Est-ce que l’urine est stérile?
Oui, normalement
Est-ce que l’urètre distale est stérile?
Non
Comment faire la différence entre la croissance de bactéries qui proviennent de l’urètre et celles qui proviennent de la vessie?
- Technique de prélèvement par mi-jet.
- Culture quantitative de bactéries (>10^8 UFC/L).
Explique la technique de prélèvement d’urine par mi-jet chez la femme.
- Écarter le plus possible les genoux, lorsqu’assis sur la toilette.
- Avec les mains préalablement nettoyées, dégager le méat urinaire.
- Nettoyer la région vulvaire en commençant au-dessus du méat urinaire.
- Débuter la miction dans la toilette.
- Par la suite, transférer le pot stérile sous le jet urinaire.
- Terminer la miction dans la toilette.
Explique la technique de prélèvement d’urine par mi-jet chez l’homme.
- Rétracter le prépuce (si non circoncis).
- Avec les mains préalablement nettoyer, nettoyer la région du méat
urinaire. - Débuter la miction dans la toilette.
- Par la suite, transférer le pot stérile sous le jet urinaire.
- Terminer la miction dans la toilette.
Quelle est la technique de prélèvement d’urine pour un TAAN de Neisseria gonorrhoeae et Chlamydia trachomatis?
Début de jet
Quelle quantité de bactériurie est significative?
Sur une culture d’urine
- Un décompte bactérien de > 10^8 UFC/L (> 10^5 UFC/mL ) est traditionnellement jugé significatif.
- Des infections des voies urinaires sont parfois associées à un décompte plus faible (jusqu’à 10^5 UFC/L)
Est-ce qu’une culture d’urine positive est nécessairement un épisode d’infection urinaire?
NON
Comment expliquer l’inflammation à l’analyse d’urine mais culture d’urine négative?
- Culture faite après le début des antibiotiques
- L’inflammation vient d’ailleurs que l’urine (urètre? prostate?)
- L’inflammation est causée par un microorganisme non cultivable.
Nomme les principaux agents responsables des infections urinaires?
- E. coli
- Proteus mirabilis
- Klebsiella pneumoniae
- Enterocococcus spp.
- Staphylococcus saprophyticus
Quels tests si on suspecte une pharyngite à strep pyogenes?
- Culture de gorge
- Dépistage de SGA par test rapide
- Test Amplification des Acides Nucléiques (TAAN)
Quelle bactérie recherche-t-on dans une culture de gorge pour pharyngite?
Streptocoque β-hémolytique A,C,G
Signes physique d’une pharyngite?
- Rechercher une inflammation des amygdales
- Rechercher des pétéchies
- Rechercher des sécrétions purulentes / exsudat
Décrit le protocole de prélèvement d’une culture de gorge.
- À l’aide d’un bâtonnet, abaisser la langue.
- Frotter les amygdales avec une culturette
- Identifier l’échantillon
- Compléter la requête de laboratoire
Quel est le rôle du laboratoire avec une culture de gorge?
- Enregistrement de la demande d’analyse
- Ensemencement de la gélose au sang (GS) de mouton
- Incubation 24 heures
- Examen de la GS
Que fait le labo si la culture de gorge présente des colonies β-hémolytiques?
Typage de Lancefield : groupe A? C? G?
Lorsqu’un médecin prescrit une culture de gorge sans autre précision, les agents infectieux recherchés sont :
- Streptococcus β hémolytique du groupe A
- Streptococcus β hémolytique du groupe C
- Streptococcus β hémolytique du groupe G
Pourquoi indiquer si le patient est allergique à la pénicilline sur la requête?
- Pas de résistance à cet antibiotique = pas d’antibiogramme d’emblée
- Possibilité de cephalexine/cefadroxil si allergie non sévère
- Besoin d’un antibiogramme pour l’azithromycine/clindamycine s c’est le cas
Décrit le dépistage de SGA par test rapide.
Comme un test covid
Mettre l’échantillon dans la bouteille de réactif puis déposer sur la bandelette de test
Décrit la TAAN.
Détection du pathogène via son ADN
Quel strepto est détectable par culture?
A C et G
Quel strepto est détectable par test rapide?
SGA
Quel strepto est détectable par TAAN?
SGA
Temps des résultats pour la culture de gorge?
24h-48h
Temps des résultats pour le test rapide?
1h
Temps des résultats pour le TAAN?
Rapide
Classe en ordre de coût (du plus cheap au plus cher) les techniques suivantes:
Culture de gorge vs test rapide vs TAAN
- Culture
- TAAN ($-$$$)
- Test rapide
Laquelle de ces techniques permet de faire un antibiogramme?
Culture de gorge vs test rapide vs TAAN
Culture de gorge
Que sera produit suite à une infection pharyngée par le SGA?
Des anticorps (Ac)
Les Ac sont détectables ____ après le début des symptômes
7-14
À quoi sert la sérologie ASO?
Supporter un diagnostic de rhumatisme articulaire aigu (RAA)
Contre indication de sérologie ASO?
Ne pas faire si suspicion d’infection aigüe à Streptococcus pyogenes.
Nomme les 3 spécimens respiratoires qu’on peut échantillonner en pré analytique.
- Expectorations
- Sécrétions endotrachéales
- Lavage broncho-alévolaire
Comment recueille-t-on les expectorations?
Spécimens produits spontanément par le patient
Comment recueille-t-on les sécrétions endotrachéales?
a) Aspiration chez un patient intubé
b) Pendant la bronchoscopie
Comment recueille-t-on le lavage broncho-alvéolaire?
Pendant la bronchoscopie
Analytique des spécimens respiratoires?
Coloration de Gram
Dans quelle situation rejette-t-on des spécimen respiratoire en analytique?
Rejet de spécimens si contamination salivaire (expectorations)
Que permet de voir la coloration de Gram d’un spécimen respiratoire?
a) Nombre de cellules épithéliales
b) Nombre de globules blancs
c) Présence de bactéries (type et quantification)
Qu’est-ce qu’on peut identifier commpe pathogènes sur spécimens respiratoires?
a) Pathogènes en tout temps (ex: Pseudomonas aeruginosa)
b) Pathogènes si prédominant
c) Flore respiratoire