Básicos Flashcards

1
Q

¿Cuáles son los hallmarks del cáncer?

A

Incluyen:
el mantenimiento de la señalización proliferativa;
la evasión de las señales supresoras del crecimiento;
la resistencia a la muerte celular;
la capacidad de adquirir inmortalidad en la replicación;
la inducción de la angiogénesis, y
la activación de la invasión y la formación de metástasis.

Subyacentes a estos hallmarks se encuentran:
la inestabilidad genómica,
la inflamación.

De manera posterior se añadieron dos características emergentes:
la alteración del metabolismo energético,
la evasión del sistema inmunológico.

Se han agregado nuevas características «habilitantes» o «distintivas», como son:
el desbloqueo de la plasticidad fenotípica de las células;
la reprogramación epigenética;
la microbiota;
la senescencia celular.

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2
Q

¿Qué es el TMB?

A

Tumor mutational burden. Se correlaciona con la respuesta a inmunoterapia. El keynote 158 era positivo para tumores sólidos irresecable/metastásica con TMB >10 mut/Mb

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3
Q

Tipos de cáncer según células de origen y definiciones

A

Carcinoma: células epiteliales
Sarcoma: tejido conectivo
Melanoma: melanocitos
Linfoma: tejido linfático
Leucemia: médula ósea
Mieloma: células plasmáticas
Tumores SNC

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4
Q

Criterios RECIST 1.1

A

RC: no evidencia de tumor
RP: reducción de más del 30%
SD: el tamaño tumoral se mantiene entre -30% y 20%
PD: crecimiento de más del 20% (y que sea al menos 5mm) o que haya lesiones nuevas

Ojo! Se compara con el nadir

Inmunorecist igual, pero hay que confirmar con otro TC al mes

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5
Q

Qué características tienen que cumplir las metástasis para ser Target en el RECIST 1.1

A

Lesiones Target: lesiones medibles>1 cm, no valen óseas ni cerebrales. Máximo 5 lesiones en total, 2 por órgano

Nota: los ganglios se miden por su eje corto y son Target si miden más de 15mm, entre 10-15mm non target pero sí patoloógicos y menos de 10mm no patológicos.

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6
Q

Definición proto oncogen

A

Gen normal que estimula el crecimiento celular.

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7
Q

Oncogen

A

Protooncogen alterado de forma que estimula el crecimiento tumoral

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8
Q

Genes supresores de tumores

A

Genes normales que frenan el crecimiento tumoral. Se requiere la perdida de ambos para que el crecimiento celular se descontrole

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9
Q

Genes reparadores

A

Genes normales que corrigen los fallos del DNA. La perdida de los dos hacen que se acumulen mutaciones

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10
Q

¿Qué son los biomarcadores?

A

biomarcadores son aquellas características clínicas o moleculares que pueden medirse de una manera objetiva y reproducible para indicar una condición biológica, bien sea un proceso normal, bien uno patológico, así como la respuesta a una intervención terapéutica concreta

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11
Q

¿Qué son los biomarcadores pronósticos?

A

Para un biomarcador pronóstico, la probabilidad de supervivencia está relacionada con la expresión o no del biomarcador, independientemente del tratamiento administrado.

Identifican características moleculares o histopatológicas específicas del tumor que se asocian con el curso clínico de la enfermedad. Como ejemplo se puede citar la plataforma genómica Oncotype Dx® para establecer el riesgo de recidiva en el cáncer de mama.

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12
Q

¿Qué son biomarcadores predictivos?

A

Para un biomarcador predictivo, la probabilidad de supervivencia está condicionada por el tratamiento recibido en aquellos pacientes que expresan el biomarcador de interés.

Proporcionan información acerca de la probabilidad de respuesta a una terapia particular. Un ejemplo de biomarcador predictivo en el cáncer de mama es la sobreexpresión de la proteína HER2 (receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano)/neu, de la familia de receptores transmembrana EGFR (receptor del factor de crecimiento epidérmico), asociada a la respuesta a los diferentes agentes dirigidos contra esta proteína, como trastuzumab, pertuzumab, lapatinib o trastuzumab-emtansina, entre otros. Cabe destacar que, en algunos supuestos, un biomarcador puede ser pronóstico y predictivo al mismo tiempo, como es el caso de la ya mencionada proteína HER2/neu en el cáncer de mama.

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13
Q

Tres mecanismos por los que un protooncogen se puede transformar en un oncogen:

A

1- Supresión o mutación puntual en la secuencia de decodificación
2- Sobre expresión del gen
3- Reordenamiento cromosómico

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14
Q

¿Qué son las mutaciones silentes?

A

Existe un cambio en una de las bases del ADN, de forma que el triplete de nucleótidos se modifica, pero sigue codificando para el mismo aminoácido.

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15
Q

¿Qué son los polimorfismos?

A

Hay un cambio en una de las bases del ADN, lo que da lugar a un aminoácido diferente, pero este resulta tener poco o ningún impacto en la función de la proteína. Aunque la mayor parte de los polimorfismos son silenciosos, en algunos casos la proteína alterada puede causar alteraciones en el metabolismo de fármacos o alterar la actividad enzimática de procesos metabólicos.

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16
Q

¿Qué son las missense mutations o mutaciones con cambio de sentido o de sentido erróneo?

A

ay un cambio en una de las bases del ADN, de forma que el aminoácido que codifica es diferente y altera la función de la proteína en mayor o menor medida, dependiendo de la localización. Pueden subclasificarse a su vez en:

Conservadoras. El aminoácido es sustituido por otro similar, por lo que el efecto sobre la estructura y función de la proteína puede ser mínimo.
No conservadoras. El aminoácido es sustituido por otro no similar, cuyo efecto es más problemático.

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17
Q

¿Qué son las nonsense mutations o mutaciones sin sentido?

A

Cambio en una de las bases del ADN, de forma que el nuevo triplete de nucleótidos determina un codón de terminación prematuro (o codón sin sentido), lo cual conduce a una proteína truncada o incompleta, y por tanto, no funcional.

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18
Q

¿Qué son las frameshift mutations o las mutaciones de cambio de marco de lectura?

A

Este tipo de mutación está causada por la inserción o deleción de un número de nucleótidos que no es múltiplo de tres, con un cambio en el marco de lectura de los nucleótidos, lo que da lugar a aminoácidos erróneos o incluso a la posibilidad de un codón de terminación prematura.

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19
Q

¿Qué son las mutaciones drivers?

A

Son las responsables de aportar una ventaja de crecimiento a las células. En muchas ocasiones, estas mutaciones son seleccionadas por el microambiente tumoral, para dar esa ventaja evolutiva a los tumores. Dentro de estas podemos hablar también de mutaciones accionables o diana, que son aquellas que además tienen un abordaje de tratamiento específico.

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20
Q

¿Qué son las mutaciones passenger?

A

No producen una ventaja evolutiva en las células que las presentan. No suelen ser objetivo de tratamiento.

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21
Q

M1 mama

A

Ganglios linfáticos axilares, pulmón, pleura, hígado, hueso, cerebro, glándula suprarrenal

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22
Q

M1 colon

A

Ganglios linfáticos regionales, hígado, pulmón, invasión por contigüidad a vejiga o estómago

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23
Q

M1 riñón

A

Pulmón, hígado, hueso

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24
Q

M1 pulmón

A

Ganglios linfáticos regionales, pleura, hígado, hueso, cerebro, glándula suprarrenal, bazo

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25
Q

M1 ovario

A

Peritoneo, ganglios linfáticos regionales, pulmón, hígado

26
Q

M1 páncreas

A

Hígado, invasión por continuidad a estómago, colon, peritoneo

27
Q

M1 próstata

A

Hueso, ganglios linfáticos regionales

28
Q

M1 gástrico

A

Ganglios linfáticos regionales, hígado, pulmón, hueso

29
Q

M1 testículo

A

Ganglios linfáticos regionales, pulmón, hueso

30
Q

M1 vejiga

A

Invasión por continuidad a recto, colon, próstata, uréter, vagina, hueso, ganglios linfáticos regionales, pulmón, peritoneo, hígado, cerebro

31
Q

M1 endometrio

A

Ganglios linfáticos regionales, pulmón, hígado, ovario

32
Q

¿Cuál es la principal molécula que regula la angiogénesis?

A

La principal es la familia de factores de crecimiento del endotelio vascular (VEGF [vascular endothelial growth factor]), siendo el principal VEGF-A. VEGF se une a sus receptores análogos, el receptor 1 y el receptor 2 del factor de crecimiento del endotelio vascular (VEGFR-1 y VEGFR-2, respectivamente). El más potente es el receptor VEGFR-2.

Además, muchas otras proteínas relacionadas con la oncogénesis, como KRAS, HER2 (receptor 2 del factor de crecimiento epidérmico humano) o p53, regulan la angiogénesis mediante la inducción de expresión del VEGF.

33
Q

¿Qué son los DDR?

A

Los genes implicados en la reparación y respuesta al daño del ADN (DDR por sus siglas en inglés [DNA damage repair genes]) son particularmente importantes por la susceptibilidad al cáncer hereditario. Las personas que heredan una mutación en la línea germinal en determinados genes que participan en esta vía suelen tener un mayor riesgo de desarrollar cáncer debido a la mayor frecuencia de acumular mutaciones (ya que no disponen de todos los mecanismos para reparar daños), y con ello, se promueve la inestabilidad genómica.

34
Q

¿Cómo funciona la reparación por escisión de nucleótidos o NER?

A

Se extrae la parte dañada o incorrecta de una de las cadenas del ADN, y el hueco resultante se completa mediante la replicación con el uso de la cadena complementaria como plantilla. Sirve en aquellos casos en los que el daño se produce solamente en una de las cadenas del ADN.

35
Q

¿Cómo funciona la reparación por escisión de bases o BER?

A

Una fuente importante de daño al ADN surge del metabolismo normal que puede causar la oxidación y alquilación del ADN. El sistema de reparación que interviene principalmente en la identificación y eliminación de estas lesiones es la vía de reparación por escisión de bases (BER [base excision repair]). Esta vía es iniciada por un conjunto de glicosilasas específicas que reconocen la base alterada o inapropiada, y la separan del ADN, tras lo cual se produce una ruptura de una sola cadena del ADN. Posteriormente, se añade un nucleótido normal y se completa la ligación del mismo. Uno de los elementos fundamentales en esta vía es la familia de polimerasas PARP (poli[ADP-ribosa) polimerasas), que une y recluta mediadores esenciales para reparar el daño.

36
Q

¿Cómo funciona la reparición por aparamiento erróneo o MMR?

A

Corrige los nucleótidos emparejados de manera incorrecta, así como las deleciones e inserciones que ocasionan la distorsión de la doble hélice del ADN. Es fundamental para mantener la estabilidad genómica en regiones de secuencias cortas y repetitivas del ADN, conocidas como regiones microsatélites. Los defectos en esta vía se han vinculado al síndrome de Lynch.
Algunos de los genes más importantes involucrados en esta vía son: MSH2, MSH3, MSH6, MLH1 y PMS2.

37
Q

¿Cómo funciona la recombinación homóloga o HHR?

A

Restaura el código original del ADN sin introducir errores, pero para ello requiere de una cromátida hermana como guía. Por ello, su actuación está restringida a las fases S y G2 del ciclo celular. Algunos componentes de esta vía incluyen las proteínas BRCA1, BRCA2, PALB2 y RADS1. Interviene también en la reparación de entrecruzamientos intercatenarios, que unen las cadenas de ADN con enlaces covalentes e impiden su posterior separación.

38
Q

¿Cómo funciona la recombinación por extremos no homólogos o NEHJ [non-homologous end-joining]?

A

Repara las roturas de doble cadena mediante la religación de los extremos del ADN, pero sin utilizar una secuencia homóloga como guía. Esto hace que se puedan acumular errores, con la posibilidad de introducir nuevas mutaciones. Al contrario que el proceso de la HRR, puede actuar durante todo el ciclo celular.

39
Q

Hipótesis de la letalidad sintética

A

En una célula normal (BRCA wild-type), tanto PARP como BRCA1/2 participan en las vías de reparación del ADN. Si en este contexto se administra un inhibidor de PARP, la célula sobrevive, ya que tiene el sistema de reparación de BRCA intacto. En un paciente portador de mutación en uno de los alelos de BRCA1/2, dado que el otro alelo es funcional, aunque se administre un inhibidor de PARP, la célula sobrevive. Sin embargo, en un paciente portador de mutación bialélica en BRCA1/2, si se administra un inhibidor de PARP se produce la letalidad sintética por acúmulo de fallos en las vías de reparación del ADN.

40
Q

Tipos de reparación del DNA

A

Las vías más importantes para reparar los daños en una sola cadena del ADN son la reparación por escisión de bases (BER), la reparación por escisión de nucleótidos (NER) y la reparación por mal apareamiento de las bases (MMR); mientras que la reparación por unión de extremos no homólogos (NHEJ) y la reparación por recombinación homóloga (HR) son más comunes para los daños en ambas cadenas.

41
Q

¿Qué porcentaje de los casos totales de cáncer se asocian a etiología infecciosa?

A

En torno al 15% de todos los tumores malignos se asocian a una etiología viral.

De manera reciente, un estudio ha evaluado cuál es la carga de mortalidad por cáncer atribuible a agentes infecciosos en España. La proporción estimada de muertes debidas a infecciones en 2017 fue del 8,3%. Cuatro agentes infecciosos cancerígenos representaron la gran mayoría de esta mortalidad (H. pylori, VHB, VHC y VPH).

42
Q

Vía MAPK

A

vías de proteínas-quinasas activadas por mitógenos (MAPK):
EGFR/HER - RAS - RAF - MEK - ERK

43
Q

Vía PIKK

A

familia de proteínas quinasas relacionada con la fosfoinositol quinasa (PIKK)
PI3K - AKT - mTOR

Los factores de crecimiento y las citoquinas estimulan a mTORC1 principalmente a través de la ruta de la fosfoinositol 3-quinasa (PI3K)/Akt, pero también pueden ser una señal a través de la ruta MAPK.

44
Q

Quinasas dependientes de ciclina

A

Las CDK son una familia de serina/treonina quinasas que desempeñan un papel central en el ciclo celular. El CDK4 y CDK6 fosforilan secuencialmente la proteína retinoblastoma y facilitan la transición G1/S. CDK1 y CDK2 regulan la progresión de la fase S, y el complejo ciclina B-CDK1 controla la transición G2/M y la progresión a la fase M

45
Q

¿Qué es la secuenciación en genética?

A

La secuenciación es un conjunto de métodos y técnicas bioquímicas cuya finalidad es la determinación del orden de los nucleótidos (A, C, G y T) que componen la cadena de ADN o ARN.

46
Q

Secuenciación por Sanger (secuenciación enzimática)

A

La muestra de ADN se divide en cuatro reacciones de secuenciación que contienen de forma separada (en 4 tubos) una mezcla que contiene: la misma cadena molde, la ADN polimerasa, el cebador, los 4 nucleótidos normales (dNTP) y cada uno de cada dideoxinucleótidos (ddATP, ddGTP, ddCTP y ddTTP) (que son de parada). El cebador, por complementariedad, se une a la hebra molde favoreciendo su reconocimiento por la ADN polimerasa y el inicio de la síntesis de la nueva hebra. La ADN polimerasa va añadiendo dNTPs hasta que de forma aleatoria, incorpora un nucleótido de parada y se interrumpe la síntesis.

De esta forma, en cada uno de los 4 tubos van a aparecer fragmentos secuenciados de diferentes tamaños e interrumpidos por el ddNTP del mismo tipo.
Los fragmentos de ADN sintetizados son separados por tamaño mediante electroforesis en gel donde las secuencias más cortas migrarán mientras que las secuencias más largas permanecerán en el inicio del gel y de esta forma se obtendrá la secuencia original

47
Q

Secuenciación masiva: Next Generation Sequencing

A

Varias técnicas. La más usada: Secuenciación por síntesis (Illumina)

Para amplificar la muestra utilizan una PCR en puente. en la que los fragmentos de ADN se amplifican a partir de los cebadores unidos a una placa sólida. Esta metodología se caracteriza por el uso de nucleótidos marcados con fluoróforos que bloquean de forma reversible la elongación de la cadena.

De este modo, tras la detección de la incorporación del fluoróforo, y la eliminación del mismo, es posible continuar con un nuevo ciclo de adición de un nuevo nucleótido. Una cámara recoge la fluorescencia etiquetada de los nucleótidos, y determinará qué nucleótido es el que se ha unido en cada posición

48
Q

Interpretación de NGS

A

Los laboratorios clasifican habitualmente las variantes obtenidas en 5 categorías principales de acuerdo con su potencial patogenicidad, pudiendo existir diferencias de interpretación incluso entre diferentes centros:

  1. Patogénicas

    Se ha descrito esa variante previamente como deletérea en pacientes con enfermedad o presentan un fuerte racional patogénico basado en estudios preclínicos.
  2. Probablemente patogénicas

    Sus características apuntan aque muy probablemente esté implicada en la enfermedad (mutaciones con cambio de marco de lectura, deleciones, inserciones que conllevan una proteína truncada), pero no existe evidencia concluyente de patogenicidad.
  3. Variante de significado incierto

    Alteraciones con ciertas características que apuntan a una posible repercusión funcional del gen, pero con insuficiente evidencia para confirmar su papel benigno/patogénico.
  4. Probablemente benigna

    La mayoría de la evidencia apunta un origen benigno.
  5. Benigna

    Alteraciones benignas conocidas que no condicionan la expresión del gen o su función.
49
Q

¿Qué son los microsatélites?

A

Los microsatélites son cortas secuencias de nucleótidos constituidas por 1 a 7 pares de bases que se repiten en tándem un número variable de veces. Aunque la longitud de los MS es muy variable de persona a persona, cada individuo tiene en todas sus células MS de una longitud determinada. La aparición de MS anormalmente más largos o más cortos en el ADN del individuo respecto al tejido tumoral es lo que se denomina Inestabilidad de MS.

50
Q

Estudio de inestabilidad de microsatélites

A

El estudio de la inestabilidad de microsatélites de basa en la detección de cambios en la longitud de secuencias repetitivas de ADN tumoral comparado con la longitud del mismo microsatélite en tejido normal. Este fenómeno es un subrogado del defecto de función de las proteínas reparadoras. La forma más común de estudiar la inestabilidad de microsatélites es mediante PCR de 5 loci(Panel Bethesda o Panel Promega). Si al menos el 2 de estos microsatélites son inestables, el tumor es considerado MSI-H (alta inestabilidad de microsatélites). Si este porcentaje es menor del 40%: MSI-Low (baja inestabilidad de microsatélites) y si no existe inestabilidad en ningún microsatélite estudiado: MSS (estabilidad de microsatélites).

51
Q

Determinación PDL1

A

La determinación de PDL1 se realiza mediante técnicas de IHQ. Se determina la expresión de PDL1 en células tumorales y no tumorales. El CPS (Combinad Positive Score) es el número de células (células tumorales, linfocitos, macrófagos) que expresan PDL1 dividido por el total de células tumorales viables, multiplicado por 100.

Mediante este estudio cuantitativo, se considera que un tumor expresa PDL1 si CPS es mayor o igual a 1.

52
Q

IHQ (Inmunohistoquímica):

A

Principio: Utiliza anticuerpos marcados con colorantes para detectar la presencia y distribución de proteínas específicas en tejidos.
Aplicaciones: Identificación de proteínas en muestras de tejido para diagnóstico y clasificación de enfermedades, como el cáncer.
Ventajas: Permite visualizar la ubicación de las proteínas en el contexto del tejido.

53
Q

FISH (Hibridación in situ con fluorescencia):

A

Principio: Utiliza sondas de ADN fluorescente para detectar la presencia o ausencia de secuencias específicas de ADN en células.
Aplicaciones: Identificación de alteraciones cromosómicas, como amplificaciones, deleciones y traslocaciones.
Ventajas: Alta sensibilidad y especificidad en la detección de anomalías cromosómicas.

54
Q

PCR (Reacción en cadena de la polimerasa):

A

Principio: Amplificación selectiva y rápida de regiones específicas de ADN utilizando enzimas y cebadores.
Aplicaciones: Detección y cuantificación de material genético, identificación de genes específicos, diagnóstico molecular.
Ventajas: Alta sensibilidad, especificidad y rapidez.
NGS (Secuenciación de nueva generación):

Principio: Secuenciación masiva de fragmentos de ADN o ARN para obtener información detallada sobre la composición genética de una muestra.
Aplicaciones: Identificación de mutaciones, variaciones genéticas, análisis genómico completo.
Ventajas: Capacidad para secuenciar grandes cantidades de ADN en paralelo, proporcionando una visión detallada del genoma

55
Q

NGS (Secuenciación de nueva generación):

A

Principio: Secuenciación masiva de fragmentos de ADN o ARN para obtener información detallada sobre la composición genética de una muestra.
Aplicaciones: Identificación de mutaciones, variaciones genéticas, análisis genómico completo.
Ventajas: Capacidad para secuenciar grandes cantidades de ADN en paralelo, proporcionando una visión detallada del genoma.

56
Q

Tipos de respuesta patológica a la neoadyuvancia

A

pCR

pCR (respuesta patológica completa): 0% tumor viable

near-pCR

near-pCR (casi respuesta completa): < 10% tumor viable

pPR

pPR (respuesta parcial): >=50% y < 10% tumor viable

pNR

pNR (sin respuesta): >50% tumor viable

Otra clasificación
Definición de MPR

Definición de MPR (gran respuesta completa): <=10% de tumor viable en el lecho tumoral

Definición pCR

Definición pCR (respuesta completa): sin células viables en el lecho tumoral

57
Q

Edad media de diagnóstico de cáncer de vejiga, pulmón y páncreas

A

73, 71, 70

58
Q

Riesgo de cáncer en toda la vida de hombres y mujeres

A

Entre los 0-80 años, los hombres tienen un riesgo de desarrollar cáncer de 40,9% y las mujeres 27’6%
A partir de los 80 años los hombres 48’6 y las mujeres 32’2%

59
Q

Fármacos oncológicos que se deben tomar en ayunas porque la comida incrementa la absorción

A

Lapatinib
Abiraterona
Nilotinib
Olaparib
Pazopanib
Pexidartinib
Erlotinib

60
Q

Los carcinógenos derivados del tabacoson:

A

aminas aromáticas, nitrosaminas, hidrocarbonos policíclicos aromáticos, aldehídos y fenoles