8/9. Synthèse protéique_transcription procaryote Flashcards
expliquez la machinerie de synthèse P
dia 2, 4
comment les ARN sont formés
Les ARN sont formés lors de la transcription.
Ils sont copiés à partir de l’ADN puis subissent une maturation les rendant opérationnels.
Mutation conséquences sur la fonctionnalité de la protéine ou sa dégradation
différence entre ribonucléotides et deox
dia 6, 7, 8, 9, 10
différence entre procaryote et eucaryote
dia 11
transcription
Mécanisme de synthèse d’une séquence d’ARN simple brin à partir d’une séquence d’ADN simple brin qui sert de modèle
ARN polymérases
Utilisent un des brins d’ADN comme modèle et assemblent les ribonucléotidescomplémentaires
ARN polymérases synthétisent l’ARN de 5’ en 3’
Réaction très exothermique, rendue irréversible par l’hydrolyse du pyrophosphate en 2 phosphates inorganiques
quelles sont les étapes à la synthèse d’ARN
•Initiation
•Élongation
•Terminaison
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que font les ARN poly
1.Cherchent sur le DNA le site d’initiation = promoteur
2.Déroulent un court segment de DNA de la double hélice → matrice simple brin ( facile à copier)
3.Sélectionnent les ribonucléotidestriphosphate corrects et catalysent la formation du lien phosphodiester( répétition de nombreuses fois)
4.Détectent les signaux de terminaison
5.ARN polymérase va se déplacer le long de la matrice d’ADN et le transcrit est synthétisé du début à la fin par la même ARN pol
6.Interagissent avec des protéines d’activation ou de répression pour moduler la vitesse (↑ou ↓) de transcription.
L’expression des gènes essentiellement régulée au niveau de la transcription mais pas uniquement.
le sens de la transcription
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V/F La RNA polymérase bactérienne déroule 17pb d’ADN pour accéder au brin codant hybrider les ribonucléotides
V
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déroulement relatif
•La RNA polymérase, miseenplace par le facteurσ,déroulelocalementla double héliceet catalysela transcription d’un des brins(“choisi” par le facteurσ).
•L’ADN est sur-enroulédevant, sous-enroulé derrière. Unetopoisoméraserelâcheles tensions.
•Le RNA est polymérisé «de 5’ vers 3’»
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surenroulement relatif
Une courte portion de double hélice hybride ADN-ARN (8pb, environ 1 tour d’hélice) est synthétiséaprès l’appariement de chaque nouveau nucléotide triphosphate sur le brin «codant» de l’ADN.
L’ARN néosynthétiséquitte le site actif par un tunnel à angle droit avec le brin d’ADN transcrit,
L’enzyme synthétise l’ARN à une vitesse d’environ 50 nucléotides par seconde
moins rapidement que la DNA polymérase (environ 700 nucléotides par seconde).
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V/F Pas d’activité proofreading
Erreurs de transcription: 1/10.000 à1/100.000
V
diff entre ARN pol pro et euca
dia 25
dia 26
quel est l’outil de transcription : RNA pol procaryote
Complexe fonctionnel
pentamérique : α2ββ’ω
où démarrer la transcription
site d’initiation avec
•Séquences -10 et -35 asymétriques: permettent la sélection du brin anticodant
V/F Le RNA est polymérisé «de 5’ vers 3’»
V
V/F La RNA polymérase, mise en place par le facteur σ,déroule localement la double hélice et catalyse la transcription d’un des brins (“choisi” par le facteur σ).
V
comment se fait la terminaison de la transcription
- Chez les procaryotes: la transcription s’interrompt à des sites de terminaison précis.
- La terminaison peut être «ρdépendante» ou «ρindépendante» :
V/F Chez les procaryotes: la transcription s’interrompt à des sites de terminaison précis
V
V/F •La terminaison peut être «ρdépendante» ou «ρindépendante
V
arret de la transcription procaryote se fait à l’aide du facteur fi dépendant expliquez
- La protéineρreconnait une séquence particulière d’ARN.
- Elle hydrolyse de l’ATP (c’est une «ATPase») et utilise l’énergie libérée pour avancer le long de l’ARN.
- Elle avance plus vite que la polymérase
- une fois qu’elle a rattrapé la polymérase, elle continue à avancer grâce à l’hydrolyse d’ATP… et arrache le brin d’ARN du site actif la synthèse d’ARN s’arrête.
arret fi dépendant
L’ARN nouvellementsynthétisése replieendouble hélice, cequi gêneet ralentitla RNA polymérase;
•La double hélicemixteARN-ADN riche enA = U qui suit la double héliceARN-ARN estparticulièrementinstable, et se “déshybride” spontanément
V/F La traduction de l’ARN procaryote commence dès la transcription
V
V/F concernant Synthèse d’ARN procaryotes.
•Démarrage: « facteurs σ» lancent la RNA polymérase depuis le site d’initiation, dans la bonne direction
V
V/F concernant Synthèse d’ARN procaryotes.
•Une seule RNA polymérase procaryotesynthétise tous les ARN nécessaires.
V
V/F concernant Synthèse d’ARN procaryotes.
Arrêt de transcription : protéine ρ («rho») ou facteurs protéiques reconnaissant une séquence spécifique
V
V/F concernant Synthèse d’ARN procaryotes.
•L’ARN néosynthétisépeut être «lu» par les ribosomes co-transcriptionnellement
V
résumé de la synthèse d’ARN procaryote
- Démarrage: « facteurs σ» lancent la RNA polymérase depuis le site d’initiation, dans la bonne direction.
- Une seule RNA polymérase procaryotesynthétise tous les ARN nécessaires.
- Arrêt de transcription : protéine ρ («rho») ou facteurs protéiques reconnaissant une séquence spécifique
- L’ARN néosynthétisépeut être «lu» par les ribosomes co-transcriptionnellement
inhibition de la transcription peut se faire par certains AB expliquez
- Rifampicine : inhibe spécifiquement l’initiation de la transcription par liaison à la sous-unité βde l’ARN polymérase.
- L’actinomycine: ( un antibiotique contenant une structure peptidique) se fixe fortement et spécifiquement au DNA double brin et l’empêche de devenir une matrice efficace pour la synthèse de l’ARN
différence de la transcription procaryote à eucaryote
- L’ADN estenrouléautourdes histones. Comment les endétacher?
- Nécessitérégulationdifférenciéecellule par cellule, tissuspar tissus: variation d’expressionnécessairejusqu’à1.000.000.000 fois!
- 3 RNA polymérasesdifférentes, spécialisées
- Nombreuxfacteursde transcriptions, fonctionnenten(hétéro)dimèrescombinaisonsvariées
- Transcription nucléairemaistraductioncytosolique.
- Permetépissage(édition) nucléairede l’ARN