8/9 synthèse protéique_ribosomes_traduction procaryote

Question 1

ribosomes procaryotes et mitochondries

Answer 1

• Diamètre200 Ǻ, 65% RNA et 35% protéine
• Grande sous-unité (50 S): RNA 23 S et 5S (3200 et 120 nt) et 34 protéines ;
• Petite sous-unité (30S) : ARN 16 S (1540 nt) et 21 protéines.
• Masse environ 2.7 106

Question 2

ribosomes eucaryote

Answer 2

• 250 Ǻ diamètre, 50% protéines / 50% RNA
• Grande sous-unité (60S) : RNA 5 S, 28 S et 5.8 S (120, 4700 et 160 nt) et 49 protéines;
• Petite sous-unité (40 S) : RNA 18S (1900 nt) et 33 protéines
• Masse environ 4.2 106

Question 3

V/F ribosomes pro et euc

Similaires, mais différents antibiotiques

Answer 3

V

Question 4

taille des ribosomes euc et leurs sous unités

Answer 4

Les ribosomes eucaryotes mesurent 80S et leurs sous-unités, 60 et 40S

Question 5

S

Answer 5

S=coefficient de sédimentation (dépend du diamètre de la particule repliée)

Question 6

ribosomes proca avec ss

Answer 6

Les ribosomes procaryotes, de 70S, deux sous-unités, de 50 et 30S

Question 7

origine des ARNr

Answer 7

Les rRNAproviennent de la transcription par la RNApol1sous forme d’une Pré-rRNAqui doit être modifié groupement méthyl et pseudouridine… puis clivé et empaqueté pour former les ribosomes.
Mécanisme hautement régulé , nécessite + de 200 protéines.

Question 8

comment sont les protéines ribosomiales

Answer 8

les protéines ribosomales sont :
peu compactes
très largement déroulées pour s’insinuer à l’intérieur du ribosome, en soutenant la structure de l’ARN ribosomal

Question 9

parler du code génétique

Answer 9

Le code génétique est «dégénéré»: chaque acide aminé est encodé par plusieurs codons
Un seul codon «START» : AUG encode également les autres Met
Trois codons «STOP» :
UAA, UAG et UGA

• Code génétique : 3 nucléotides par acide aminé = codon. Lus consécutivement, sans chevauchement et sans intercalaire, plusieurs codons possibles / acide aminé ;
• 1 codon (AUG) signale le début de la traduction, 3 codons (UAA, UGA ou UAG) signalent la fin de la traduction;
• Acides aminés transportés par tRNA;
• Ribosome positionne tRNAs sur mRNA, et catalyse synthèse liaisons peptidiques.

Question 10

parler des aminoacyl ARNt synthase

Answer 10

-sont des ligases
-Spécifique de la nature de l’acide aminé : alanyl-ARNtsynthétase,
-méthionyl–ARNt-synthétase
dia 80

Question 11

quelles sont les 3 étapes de la traduc

Answer 11

initiation
élongation
terminaison

Question 12

initiation

Answer 12

• chargement du mRNApar la petite sous-unité du ribosome,

* recrutement du premier tRNAet de la grande sous-unité du ribosome

Question 13

élongation

Answer 13

reconnaissance du tRNAsuivant
•formation de la liaison peptidique,
•avance du mRNAet des tRNAs

Question 14

terminaison

Answer 14

• lecture du codon stop
• recyclage du ribosome: hydrolyse de la liaison tRNA-peptide, séparation du complexe en deux sous-unités du ribosome + mRNA+ tRNAs+

Question 15

3 sites pr les ARNt enterrés ds le ribosome

Answer 15

site E, P , A

E comme EXIT, P comme PEPTIDE et A comme Accepteur

Question 16

départ synthèse procaryote

Answer 16

La synthèse démarre à un codon «AUG» qui suit une séquence riche en purines (A, G) située en «-10» (séquence de ShineDalgarno)
Toutes les protéines procaryotescommencent par une formyl-méthionine, apportée par un tRNAparticulier appelé tRNAf

Question 17

positionnent de RNA m

Answer 17

sur les différents sites

Question 18

site A

Answer 18

Site A: «accepteur» retient le RNAtchargé de l’aaà incorporer

Question 19

site P

Answer 19

Site P: «peptide» retient le tRNAlié au peptide en cours de synthèse

Question 20

site E

Answer 20

Site E: Exit retient le RNAtqui a déjà cédé son aa

Question 21

V/F Le peptide est synthétisé au coeur du ribosome, puis injecté au fur et à mesure vers l’extérieur à travers un long tunnel, qui traverse la grande sous unité du ribosom

Answer 21

V

Question 22

les différents facteurs procaryotes

Answer 22

IF1

IF3

Question 23

role de IF1, IF3

Answer 23

IF1 (Facteur d’Initiation 1) et IF3 protègent la petite sous unité :

Question 24

IF1

Answer 24

IF1 empêche la reconnaissance prématurée du site A par un tRNAquelconque

Question 25

IF3

Answer 25

IF3 empêche l’interaction entre petite et grande sous unité du ribosome

Question 26

séquence de Shine-Dalgarno

Answer 26

• La séquence de Shine-Dalgarnoriche en purines (A et G) du mRNAs’apparie sur le rRNA16S riche en (C et U)
• ce qui amène le codon start(AUG) en face du site P de liaison du tRNA

Question 27

IF2

Answer 27

IF2 (une protéine G, occupée par du GTP) «présente» le fMet-tRNAiau ribosome (site P)
•Changement de conformation éjectent IF3 et IF1

Une fois IF3 parti, IF2 facilite la reconnaissance de la grande sous-unité (50 S)

Lorsque la grande sous-unité est en place, IF2 hydrolyse son GTP change de conformation se dissocie du ribosome. Le tRNAfest dans le site P.
La synthèse protéique va pouvoir commencer!

Question 28

élongation

Answer 28

• Le Facteur d’Elongation EF-Tu (protéine G) apporte un tRNAchargé au site A.
• Une fois lié au ribosome, EF-Tu va hydrolyser son GTP, puis se dissocier… en laissant le tRNA-a.a. en place

Question 29

si l’appariement du codon anticodon est correct

Answer 29

le tRNAreste en place assez longtemps pour permettre l’hydrolyse du GTP et le départ de EF-Tu;

Question 30

si l’appariement est incorrect

Answer 30

le complexe tRNA-EF-Tu quitte le ribosome avant l’hydrolyse du GTP

Question 31

recyclage : élongation

Answer 31

Une fois EF-Tu_GDPlibéré dans le cytosol, EF-Tsfacilite le départ du GDP, ce qui permet la remise en place du GTP. EF-Tu, recyclé, va se lier à un autre tRNA.

Question 32

formation du lien peptidique est catalysé par

Answer 32

peptidyl transférase