8/9 synthèse protéique_ribosomes_traduction procaryote Flashcards
ribosomes procaryotes et mitochondries
- Diamètre200 Ǻ, 65% RNA et 35% protéine
- Grande sous-unité (50 S): RNA 23 S et 5S (3200 et 120 nt) et 34 protéines ;
- Petite sous-unité (30S) : ARN 16 S (1540 nt) et 21 protéines.
- Masse environ 2.7 106
ribosomes eucaryote
- 250 Ǻ diamètre, 50% protéines / 50% RNA
- Grande sous-unité (60S) : RNA 5 S, 28 S et 5.8 S (120, 4700 et 160 nt) et 49 protéines;
- Petite sous-unité (40 S) : RNA 18S (1900 nt) et 33 protéines
- Masse environ 4.2 106
V/F ribosomes pro et euc
Similaires, mais différents antibiotiques
V
taille des ribosomes euc et leurs sous unités
Les ribosomes eucaryotes mesurent 80S et leurs sous-unités, 60 et 40S
S
S=coefficient de sédimentation (dépend du diamètre de la particule repliée)
ribosomes proca avec ss
Les ribosomes procaryotes, de 70S, deux sous-unités, de 50 et 30S
origine des ARNr
Les rRNAproviennent de la transcription par la RNApol1sous forme d’une Pré-rRNAqui doit être modifié groupement méthyl et pseudouridine… puis clivé et empaqueté pour former les ribosomes.
Mécanisme hautement régulé , nécessite + de 200 protéines.
comment sont les protéines ribosomiales
les protéines ribosomales sont :
peu compactes
très largement déroulées pour s’insinuer à l’intérieur du ribosome, en soutenant la structure de l’ARN ribosomal
parler du code génétique
Le code génétique est «dégénéré»: chaque acide aminé est encodé par plusieurs codons
Un seul codon «START» : AUG encode également les autres Met
Trois codons «STOP» :
UAA, UAG et UGA
- Code génétique : 3 nucléotides par acide aminé = codon. Lus consécutivement, sans chevauchement et sans intercalaire, plusieurs codons possibles / acide aminé ;
- 1 codon (AUG) signale le début de la traduction, 3 codons (UAA, UGA ou UAG) signalent la fin de la traduction;
- Acides aminés transportés par tRNA;
- Ribosome positionne tRNAs sur mRNA, et catalyse synthèse liaisons peptidiques.
parler des aminoacyl ARNt synthase
-sont des ligases
-Spécifique de la nature de l’acide aminé : alanyl-ARNtsynthétase,
-méthionyl–ARNt-synthétase
dia 80
quelles sont les 3 étapes de la traduc
initiation
élongation
terminaison
initiation
- chargement du mRNApar la petite sous-unité du ribosome,
* recrutement du premier tRNAet de la grande sous-unité du ribosome
élongation
reconnaissance du tRNAsuivant
•formation de la liaison peptidique,
•avance du mRNAet des tRNAs
terminaison
- lecture du codon stop
- recyclage du ribosome: hydrolyse de la liaison tRNA-peptide, séparation du complexe en deux sous-unités du ribosome + mRNA+ tRNAs+
3 sites pr les ARNt enterrés ds le ribosome
site E, P , A
E comme EXIT, P comme PEPTIDE et A comme Accepteur
départ synthèse procaryote
La synthèse démarre à un codon «AUG» qui suit une séquence riche en purines (A, G) située en «-10» (séquence de ShineDalgarno)
Toutes les protéines procaryotescommencent par une formyl-méthionine, apportée par un tRNAparticulier appelé tRNAf
positionnent de RNA m
sur les différents sites
site A
Site A: «accepteur» retient le RNAtchargé de l’aaà incorporer
site P
Site P: «peptide» retient le tRNAlié au peptide en cours de synthèse
site E
Site E: Exit retient le RNAtqui a déjà cédé son aa
V/F Le peptide est synthétisé au coeur du ribosome, puis injecté au fur et à mesure vers l’extérieur à travers un long tunnel, qui traverse la grande sous unité du ribosom
V
les différents facteurs procaryotes
IF1
IF3
role de IF1, IF3
IF1 (Facteur d’Initiation 1) et IF3 protègent la petite sous unité :
IF1
IF1 empêche la reconnaissance prématurée du site A par un tRNAquelconque
IF3
IF3 empêche l’interaction entre petite et grande sous unité du ribosome
séquence de Shine-Dalgarno
- La séquence de Shine-Dalgarnoriche en purines (A et G) du mRNAs’apparie sur le rRNA16S riche en (C et U)
- ce qui amène le codon start(AUG) en face du site P de liaison du tRNA
IF2
IF2 (une protéine G, occupée par du GTP) «présente» le fMet-tRNAiau ribosome (site P)
•Changement de conformation éjectent IF3 et IF1
Une fois IF3 parti, IF2 facilite la reconnaissance de la grande sous-unité (50 S)
Lorsque la grande sous-unité est en place, IF2 hydrolyse son GTP change de conformation se dissocie du ribosome. Le tRNAfest dans le site P.
La synthèse protéique va pouvoir commencer!
élongation
- Le Facteur d’Elongation EF-Tu (protéine G) apporte un tRNAchargé au site A.
- Une fois lié au ribosome, EF-Tu va hydrolyser son GTP, puis se dissocier… en laissant le tRNA-a.a. en place
si l’appariement du codon anticodon est correct
le tRNAreste en place assez longtemps pour permettre l’hydrolyse du GTP et le départ de EF-Tu;
si l’appariement est incorrect
le complexe tRNA-EF-Tu quitte le ribosome avant l’hydrolyse du GTP
recyclage : élongation
Une fois EF-Tu_GDPlibéré dans le cytosol, EF-Tsfacilite le départ du GDP, ce qui permet la remise en place du GTP. EF-Tu, recyclé, va se lier à un autre tRNA.
formation du lien peptidique est catalysé par
peptidyl transférase
