8/9 Synthèse protéique_transcription eucaryote Flashcards
contrairement à la transcription procaryote, pr la eucaryote nous avons besoin de plus de 1 ARN pol
on en a besoin de 3
•RNA Polymérase I, II, III
•RNA Polymérase I:
Synthèse de la plupart des rRNAs
•RNA Polymérase II
: Synthèse des mRNAs
•RNA Polymérase III
Synthèse des tRNAs, du rRNA5S, de petits ARNsnucléaires et cytosoliques
à quoi ressemble la structure de l’ARN pol II
Structure RNA Pol II homologue à l’enzyme bactérien,
mais jusqu’à 15 sous-unités (comparé aux 5 sous-unités procaryotes
comment les cellules eucaryotes réalisent elles la transcription
- un ensemble de protéines permettant de recruter la RNA polymérase à l’endroit approprié
- d’autres protéines chargées de réduire (ou augmenter au contraire) l’affinité des histones pour l’ADN, et donc de faciliter ou ralentir le passage de la RNA polymérase. On appelle toutes ces protéines «facteurs de transcription» ou «TF».
quels sont les FT
3 types de facteurs de transcriptions :
•les facteurs constitutifs, qui amènent et orientent la RNA polymérase au début de la région à transcrire
•des facteurs «enhancers» (activateurs, constitutifs ou régulables) qui facilitent le passage de la RNA polymérase
•des facteurs «repressors» (inhibiteurs), qui ralentissent au contraire le passage –déjà très lent –de la RNA polymérase
comment se fait l’assemblage du complexe de pré initiation (PIC)
•La «boîte TATA» se trouve généralement dans une région accessible de l’ADN (-30 pb).
•Elle recrute des facteurs de transcription (TF II) qui recrutent la RNA-Pol II sur l’ADN;
dia 43, 44, 45
description du fragment d’ARN eucaryote
fragment d’ARN d’environ 60 à 70 nucléotides formé, TFIIE
puis TFIIH se dissocient du complexe de préinitiation et la RNA
polymérase II entre dans la phase d’élongation.
résumé global du démarrage de la transcription eucaryote
- Le complexe d’initiation composé de l’ARNpolII et des différents TFII est suffisant pour obtenir une activité transcriptionnellein vitro mais à très faible taux.
- L’augmentation de cette activité basale (ou sa répression) est sous la dépendance de facteurs spécifiques qui vont interagir avec le complexe d’initiation.
- Ces protéines activatrices ou inhibitrices (éléments trans-régulateurs) se lient à des promoteurs distaux spécifiques (séquences cis-régulatrices) de l’ADN, appelées amplificateurs (enhancers) lorsqu’ils recrutent des cofacteurs activateurs, ou silenceurs(silencers) lorsqu’ils recrutent des cofacteurs inhibiteurs.
- Ces promoteurs distaux peuvent être situés à des milliers de nucléotides du promoteur proximal. Malgré la distance qui sépare les promoteurs proximaux des promoteurs distaux, ces derniers agissent sur le promoteur proximal par le jeu de courbures de l’ADN, des facteurs de transcription et du médiateur qui maintient liés tous ces acteurs
régulation de la transcription
gène off
gène on
V/F l’expression des gènes est exclusivement régulée au niveau de la transcription
F: essentiellement au niveau de la transcription mais pas uniquement
modèle de la régulation de la transcription
modèle de l’interaction de plusieurs activateurs avec un complexe médiateur : intégration de siganux
en quoi sont impliqués les mécanismes épigénétiques
épigénétiquesPas de modification de la séquence nucléotidique, mais modifications réversibles qui agissent sur l’expression des gènes
- Méthylation de l’ADN
- Modification post-traductionnelle des histones
Méthylation de l’ADN
Chez les eucaryotes , la méthylation du promoteur d’un gène → en général répression de la transcription
Modification post-traductionnelle des histones
acétylation, méthylation, phosphorylation……
synthèse de la transcription eucaryote
Synthèsede 5’ en3’, commechez les procaryotes… mais
•Modifications co-et post-traductionnellesde l’ARNeucaryote:
•“coiffe” 5’
•Épissage
•Terminaison“polyA”
quelles autres modifications y’a t-il par rapport à la transcription eucaryote
- Modifications co-et post-traductionnellesde l’ARNeucaryote:
- “coiffe” 5’
- Épissage
- Terminaison“polyA”
à quel moment on met en place la coiffe 5’
Dèsque le mRNA a 20-30 ntde long : miseenplace de la “coiffe” 5’: résidu7-méthylguanosine
nom de la coiffe
“coiffe” 5’: résidu7-méthylguanosine
c’est quoi la “coiffe” 5’: résidu7-méthylguanosine
Complexeenzymatiqueresponsable: liéà l’extérmitéphosphoryléede la RNA polyméraseII
epissage de l’ARNm
•Des morceaux entiers d’ARN manquent!
Les introns(éliminés pendant la maturation de l’ARN) représentent typiquement 80 à 99% de la longueur du gène
V/F Les introns(éliminés pendant la maturation de l’ARN) représentent typiquement 80 à 99% de la longueur du gène
V
spliceosome
- complexe ribo-protéique
- retenu au contact du domaine carboxyl-terminal phosphorylé de la RNA polII.
- Reconnait 3 sites précis sur RNA :
spliceosome reconnait 3 sites précis sur RNA ?
le site 5’ d’épissage
le site 3’ d’épissage
un site accepteur au milieu de l’intron
parler des mutations qui peuvent survenir durant la transcription eucaryote
Certaines mutations du pré-mRNA ou des facteurs d’épissage peuvent provoquer l’épissage défectueux d’un ou de plusieurs mRNAs.
Ces mutations sont vraisemblablement responsables de jusqu’à 15% des maladies génétiques! Ces mutations empêchent habituellement l’excision de l’intron
contenu des introns
- un codon STOP en phase avec l’exon précédent….. Interruption précoce de de la séquence protéique
- pas d’une longueur multiple de 3 bases: ils déclenchent un changement de phase de lecture de l’exon suivant. ….une séquence protéique anormale. Le plus souvent, la protéine affectée est inactive
epissage alternatif mécanisme
tous les introns doivent être éliminés mais selon l’organe ou la cell on ne vas pas garder les mêmes exons
calcitonine
est une hormone peptidique (32aa)
participe au métabolisme phosphocalcique.
Produite par les cellules C de la thyroïde
hormone hypocalcémiante et hypophosphorémiante
CGRP
CGRP est produit dans les neurones de SNC et périphériques
un puissant vasodilatateur
intervient dans la transmissionde la douleur
comment se fait la fin de la transcription
Site fin transcription eucaryote= mal défini: les séquences3’ des pré-mRNA sontvariables. Vraisemblablement(?) : séquencesconsensus attirant des facteurs de terminaison la transcription est interrompue, le pré-mRNAest libéré et la RNA Polymérase II est recyclée
polyadénylation
séquence 3’consensus
AAUAAA(N)10-30CA(N)20-40 … (riche enU ouGU)
polyadénylation clivage par ?
Clivagepar uneendonucléase au niveaudu site de clivage
puispolyadénylylationpar unepolyadénylatepolymérase: 80-250 A ajoutésen3’ du mRNA
•Cette «queue poly-A» protège le mRNAcontre la dégradatio
que permet la queue poly A
protège le mRNA contre la dégradation
Ce domaine C-terminal (CTD) de la RNA polII, permet le recrutement sur le pré-mRNAde : expliquez
- Les enzymes de formation de la coiffe immédiatement après le début de la transcription
- Les composants de la machinerie de l’épissage qui initient l’excision des intron au fur et à mesure de la synthèse du pré-mRNA
- Une endonucléase qui clive le transcrit au niveau du site polyAcréant un groupe 3’OH libre qui est la cible de la polyadénylation
- À la fin de la transcription, la RNA polymérase II est déphosphoryléepar des phosphatases
- les différents facteurs de transcription se dissocient, et l’enzyme est recyclé, prêt à initier une nouvelle transcription
qu’est ce qui fait que l’ARNm eucaryote est plus stable
ARNm eucaryote est plus stable grace à coiffe en 5’ et à queue Poly A
