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Biochimie > 8/9 Synthèse protéique_transcription eucaryote > Flashcards

8/9 Synthèse protéique_transcription eucaryote Flashcards

1
Q

contrairement à la transcription procaryote, pr la eucaryote nous avons besoin de plus de 1 ARN pol

A

on en a besoin de 3

•RNA Polymérase I, II, III

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2
Q

•RNA Polymérase I:

A

Synthèse de la plupart des rRNAs

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3
Q

•RNA Polymérase II

A

: Synthèse des mRNAs

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4
Q

•RNA Polymérase III

A

Synthèse des tRNAs, du rRNA5S, de petits ARNsnucléaires et cytosoliques

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5
Q

à quoi ressemble la structure de l’ARN pol II

A

Structure RNA Pol II homologue à l’enzyme bactérien,

mais jusqu’à 15 sous-unités (comparé aux 5 sous-unités procaryotes

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6
Q

comment les cellules eucaryotes réalisent elles la transcription

A
  • un ensemble de protéines permettant de recruter la RNA polymérase à l’endroit approprié
  • d’autres protéines chargées de réduire (ou augmenter au contraire) l’affinité des histones pour l’ADN, et donc de faciliter ou ralentir le passage de la RNA polymérase. On appelle toutes ces protéines «facteurs de transcription» ou «TF».
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7
Q

quels sont les FT

A

3 types de facteurs de transcriptions :
•les facteurs constitutifs, qui amènent et orientent la RNA polymérase au début de la région à transcrire
•des facteurs «enhancers» (activateurs, constitutifs ou régulables) qui facilitent le passage de la RNA polymérase
•des facteurs «repressors» (inhibiteurs), qui ralentissent au contraire le passage –déjà très lent –de la RNA polymérase

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8
Q

comment se fait l’assemblage du complexe de pré initiation (PIC)

A

•La «boîte TATA» se trouve généralement dans une région accessible de l’ADN (-30 pb).
•Elle recrute des facteurs de transcription (TF II) qui recrutent la RNA-Pol II sur l’ADN;
dia 43, 44, 45

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9
Q

description du fragment d’ARN eucaryote

A

fragment d’ARN d’environ 60 à 70 nucléotides formé, TFIIE
puis TFIIH se dissocient du complexe de préinitiation et la RNA
polymérase II entre dans la phase d’élongation.

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10
Q

résumé global du démarrage de la transcription eucaryote

A
  • Le complexe d’initiation composé de l’ARNpolII et des différents TFII est suffisant pour obtenir une activité transcriptionnellein vitro mais à très faible taux.
  • L’augmentation de cette activité basale (ou sa répression) est sous la dépendance de facteurs spécifiques qui vont interagir avec le complexe d’initiation.
  • Ces protéines activatrices ou inhibitrices (éléments trans-régulateurs) se lient à des promoteurs distaux spécifiques (séquences cis-régulatrices) de l’ADN, appelées amplificateurs (enhancers) lorsqu’ils recrutent des cofacteurs activateurs, ou silenceurs(silencers) lorsqu’ils recrutent des cofacteurs inhibiteurs.
  • Ces promoteurs distaux peuvent être situés à des milliers de nucléotides du promoteur proximal. Malgré la distance qui sépare les promoteurs proximaux des promoteurs distaux, ces derniers agissent sur le promoteur proximal par le jeu de courbures de l’ADN, des facteurs de transcription et du médiateur qui maintient liés tous ces acteurs
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11
Q

régulation de la transcription

A

gène off

gène on

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12
Q

V/F l’expression des gènes est exclusivement régulée au niveau de la transcription

A

F: essentiellement au niveau de la transcription mais pas uniquement

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13
Q

modèle de la régulation de la transcription

A

modèle de l’interaction de plusieurs activateurs avec un complexe médiateur : intégration de siganux

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14
Q

en quoi sont impliqués les mécanismes épigénétiques

A

épigénétiquesPas de modification de la séquence nucléotidique, mais modifications réversibles qui agissent sur l’expression des gènes

  • Méthylation de l’ADN
  • Modification post-traductionnelle des histones
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15
Q

Méthylation de l’ADN

A

Chez les eucaryotes , la méthylation du promoteur d’un gène → en général répression de la transcription

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16
Q

Modification post-traductionnelle des histones

A

acétylation, méthylation, phosphorylation……

17
Q

synthèse de la transcription eucaryote

A

Synthèsede 5’ en3’, commechez les procaryotes… mais
•Modifications co-et post-traductionnellesde l’ARNeucaryote:
•“coiffe” 5’
•Épissage
•Terminaison“polyA”

18
Q

quelles autres modifications y’a t-il par rapport à la transcription eucaryote

A
  • Modifications co-et post-traductionnellesde l’ARNeucaryote:
  • “coiffe” 5’
  • Épissage
  • Terminaison“polyA”
19
Q

à quel moment on met en place la coiffe 5’

A

Dèsque le mRNA a 20-30 ntde long : miseenplace de la “coiffe” 5’: résidu7-méthylguanosine

20
Q

nom de la coiffe

A

“coiffe” 5’: résidu7-méthylguanosine

21
Q

c’est quoi la “coiffe” 5’: résidu7-méthylguanosine

A

Complexeenzymatiqueresponsable: liéà l’extérmitéphosphoryléede la RNA polyméraseII

22
Q

epissage de l’ARNm

A

•Des morceaux entiers d’ARN manquent!

Les introns(éliminés pendant la maturation de l’ARN) représentent typiquement 80 à 99% de la longueur du gène

23
Q

V/F Les introns(éliminés pendant la maturation de l’ARN) représentent typiquement 80 à 99% de la longueur du gène

A

V

24
Q

spliceosome

A
  • complexe ribo-protéique
  • retenu au contact du domaine carboxyl-terminal phosphorylé de la RNA polII.
  • Reconnait 3 sites précis sur RNA :
25
Q

spliceosome reconnait 3 sites précis sur RNA ?

A

le site 5’ d’épissage
le site 3’ d’épissage
un site accepteur au milieu de l’intron

26
Q

parler des mutations qui peuvent survenir durant la transcription eucaryote

A

Certaines mutations du pré-mRNA ou des facteurs d’épissage peuvent provoquer l’épissage défectueux d’un ou de plusieurs mRNAs.
Ces mutations sont vraisemblablement responsables de jusqu’à 15% des maladies génétiques! Ces mutations empêchent habituellement l’excision de l’intron

27
Q

contenu des introns

A
  • un codon STOP en phase avec l’exon précédent….. Interruption précoce de de la séquence protéique
  • pas d’une longueur multiple de 3 bases: ils déclenchent un changement de phase de lecture de l’exon suivant. ….une séquence protéique anormale. Le plus souvent, la protéine affectée est inactive
28
Q

epissage alternatif mécanisme

A

tous les introns doivent être éliminés mais selon l’organe ou la cell on ne vas pas garder les mêmes exons

29
Q

calcitonine

A

est une hormone peptidique (32aa)
participe au métabolisme phosphocalcique.
Produite par les cellules C de la thyroïde
hormone hypocalcémiante et hypophosphorémiante

30
Q

CGRP

A

CGRP est produit dans les neurones de SNC et périphériques
un puissant vasodilatateur
intervient dans la transmissionde la douleur

31
Q

comment se fait la fin de la transcription

A

Site fin transcription eucaryote= mal défini: les séquences3’ des pré-mRNA sontvariables. Vraisemblablement(?) : séquencesconsensus attirant des facteurs de terminaison la transcription est interrompue, le pré-mRNAest libéré et la RNA Polymérase II est recyclée

32
Q

polyadénylation

A

séquence 3’consensus

AAUAAA(N)10-30CA(N)20-40 … (riche enU ouGU)

33
Q

polyadénylation clivage par ?

A

Clivagepar uneendonucléase au niveaudu site de clivage
puispolyadénylylationpar unepolyadénylatepolymérase: 80-250 A ajoutésen3’ du mRNA
•Cette «queue poly-A» protège le mRNAcontre la dégradatio

34
Q

que permet la queue poly A

A

protège le mRNA contre la dégradation

35
Q

Ce domaine C-terminal (CTD) de la RNA polII, permet le recrutement sur le pré-mRNAde : expliquez

A
  • Les enzymes de formation de la coiffe immédiatement après le début de la transcription
  • Les composants de la machinerie de l’épissage qui initient l’excision des intron au fur et à mesure de la synthèse du pré-mRNA
  • Une endonucléase qui clive le transcrit au niveau du site polyAcréant un groupe 3’OH libre qui est la cible de la polyadénylation
  • À la fin de la transcription, la RNA polymérase II est déphosphoryléepar des phosphatases
  • les différents facteurs de transcription se dissocient, et l’enzyme est recyclé, prêt à initier une nouvelle transcription
36
Q

qu’est ce qui fait que l’ARNm eucaryote est plus stable

A

ARNm eucaryote est plus stable grace à coiffe en 5’ et à queue Poly A

Biochimie (25 decks)

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