8/9 synthèse protéique_traduction pro et euc Flashcards
explication schéma dia 100-101
Lors de la formation du lien peptidique, le peptide en cours de synthèse (lié au deuxième tRNA), s’engage dans le tunnel de sortie. «tire» le tRNA2vers le site P
Immédiatement après la formation du lien peptidique,
le tRNA1 (bleu) se retrouve à cheval sur les sites P -E,
le tRNA2 (vert)à cheval sur les sites A -P.
Pour continuer la synthèse protéique, il va falloir avancer le mRNAd’un cran le long de la petite sous unité du ribosome, glisser le peptidyl-tRNA(vert)entièrement dans le site P,
et avancer le tRNAdéchargé (bleu) entièrement dans le site E
dia 102
- Nécessité de «pousser» le complexe mRNA_tRNA_peptidyl-tRNAde l’équivalent d’un codon le long du ribosome
- Le Facteur d’Elongation EF-G (une protéine G) vient occuper le demi-site A libéré (en jaune).
- La liaison de EF-G_GTP au ribosome déclenche l’hydrolyse de GTP en GDP+Pichangement de conformation de la protéine EF-G.
- EF-G repousse le complexe mRNA_tRNA_peptidyl-tRNAde l’équivalent d’un codon le long du ribosome.
- Le complexe EF-G_GDP se dissocie, libérant la place pour un nouveau complexe aminoacyl-tRNA_EF-Tu.
terminaison pro
signalée par la présence d’un codon STOP dans l’ARNm
Les codons «stop» (UAA, UGA et UAG)
•ne sont pas reconnus par un tRNA
•Reconnus par facteurs de relargage
autre explication terminaison pro
Les codons «stop» (UAA, UGA et UAG) ne sont pas reconnu par un tRNA, mais par un complexe protéique : soit RF1-RF3, soit RF2-RF3 (RF = Releasing Factor).
•RF3 prend la place de EF-Tu et apporte RF1 (ou bien RF2) qui prend la place du tRNA-a.a.
•RF1 (ou RF2) favorise l’hydrolyse de la liaison peptide-tRNAet libère la protéine
•Un facteurde recyclage, RRF, interagitavec EF-G et le ribosome. Il déclenchela dissociation du mRNA et des deuxsous-unitésdu ribosome.
IF1 et IF3 (ré)occupentla petite sous-unité(30S) et empêchentla réassociationprématuréedu ribosome enl’absencede mRNA
initiation pro en résumé
- Ribosome reconnaitséquencede Shine-Dalgarno: initiation au premier AUG qui suit uneséquence(-10) riche enpurines;
- IF1 et IF3 protègentla petite sous-unitéet IF2 amènele tRNA(fMet), puisla grandesous-unité
élongation pro en résumé
- EF-Tu amènel’aminoacyl-tRNAsuivantet vérifiel’appariement, EF-Ts recycle EF-Tu
- EF-G fait progresserle complexemRNA-tRNAsaprès la formation de chaqueliaison peptidique
terminaison pro en résumé
•Des “releasing factors” reconnaissentles codons STOP et libèrent(hydrolysent) la protéinenéosynthétisée…
recyclage procaryote
•RFF reconnaîtEF-G sur 1 ribosome “enarrêt” favorisela dissociation du complexerecyclagedu mRNA, de la sous-unité30S et de la sous-unité70S
euca Beaucoup plus grand nombre de facteurs d’initiation
V
comment sont les mRNA eucaryotes cytosoliques
une structure circulaire:
la coiffe et la queue poly-A de chaque molécule sont reliées entre elles par un complexe protéique appelé eIF-4F (eucaryoticInitiation Factor 4F)
composition de eIF-4
- eIF-4Ese lie à eIF-4G,
- eIF-4G, qui reconnaît la PAB («polyABinding Protein»): une protéine associée à la queue polyAde l’ARNm
- eIF-4A possède une activité hélicase: il hydrolyse de l’ATP pour fournir l’énergie nécessaire pour dérouler l’ARN messager pendant la traduction.)
identification du codon START chez les euca
•Pas de séquence de ShineDalgarno! La petite sous-unité du ribosome (40S), eIF2 et le tRNAi-Met scannent ensemble le mRNApour trouver lepremier codon AUG (Met). L’énergie est fournie par l’hydrolyse de plusieurs ATPspar un des eIF.
•Lorsque le premier «AUG» est en place en face du tRNAi-Met, eIF2 hydrolyse le GTP en GDP+Pi, ce qui déclenche la dissociation d’autres eIF. eIF5 favorise l’hydrolyse du GTP, la dissociation des autres facteurs d’initiation, et enfin la reconnaissance de la grande sous-unité du ribosome.
(contrepartie de IF2 = eIF2 + eIF5 ! ).
chez les euca comment ça se passe
Le complexe eIF-4F-mRNA recrute eIF-3 et la petite sous unité 40S du ribosome
Le facteur eIF-2 apporte au ribosome 40S un tRNAinitiateur spécialisé (Met-tRNAi),
Quand mRNAet le tRNAisont tous les deux en place:
eIF-5 facilite la dissociation de plusieurs des facteurs d’initiation, reconnaissance de la «grande sous unité » du ribosome (60S) pour former le complexe d’initiation, «80S».
élongation eucar
•EF1α(l’équivalent de EF-Tu)apporte le tRNAsuivant au site A du ribosome. Il hydrolyse le GTP, puis se dissocie du ribosome. La liaison peptidique peut alors se former. (Si le aa-tRNAn’est pas parfaitement apparié au niveau des 2 premiers nt du codon, le tRNAse dissocie avant hydrolyse du GTP, et l’aan’est pas incorporé.)
•EF1βγ, (l’équivalent de EF-Ts)facilite la dissociation du GDP lié au facteur EF1α, donc son recyclage
EF2 (l’équivalent de EF-G)facilite la translocation des tRNAsd’un site à l’autre en utilisant l’énergie produite par l’hydrolyse de GTP.
terminaison eucar
Terminaison RF
•eRF1 (eucaryotic releasing factor) reconnaît les trois codons «STOP» et favorise l’hydrolyse de la liaison peptidyl-tRNA. (Remplace à lui seul RF1, RF2 et RF3)
•eIF6 facilite la dissociation des deux sous unités du ribosome inactif et leur recyclage (–donc l’initiationde la lecture de l’ARNm suivant…) (Remplace EF-G + RRF)
