Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biochemistry > מולקולרית פרק 7 - בקרת ביטוי גנים > Flashcards

מולקולרית פרק 7 - בקרת ביטוי גנים Flashcards

1
Q

אילו שתיי דוגמאות הספר נותן להבדלים בביטוי רנא בין תאים שונים?

A

מראה את הגן לביתא אקטין שמבוטא בכל התאים,

לעומת הגן לטירוזין אמינו טרנספראז שמתבטא רק בכבד.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

פקטורי שעתוק

transcription regulators.

A

חלבונים המזהים ונקשרים לרצפים ספציפיים, לרוב 5-10 בסיסים, בדנא הנקראים
cis-regulatory sequences
נקשרים לדנא דרך התעלה הגדולה
כ-10% מהגנים המקודדים לחלבון הם של פקטורי שעתוק
מה שעושה אותם לאחת ממשפחות החלבונים הגדולות ביותרץ

נקשרים כדימרים וזה מגביר את הספציפיות שלהם.
מזהים יותר לוגו מאשר רצף ספציפי מקובע
יכולים להיות הומו או הטרודימרים, מה שמגדיל את הקומבינציות האפשריות.
נקשרים באופן קואופרטיבי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

cis-regulatory sequences

A

רצפים בני 5-10 בסיסים בדנא, הקושרים פקטורי שעתוק
נמצאים בציס, כלומר על אותו כרומוזום כמו הגן אותו הם מבקרים.
לכל גן יש רצפי בקרה משלו, ברוב המקרים יותר מאחד
הקושרים סט של פקטורי שעתוק.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

אינטראקציות דנא פקטור שעתוק

A

דרך התעלה הגדולה
כל פקטור שעתוק מייצר מגע עם הדנא המערב קשרי מימן, קשרים יונים ואינטראקציות הידרופוביות.
למרות שכל אחד חלש בפני עצמו, ביחד הם מייצרים אינטראקציה חזקה וספציפית מאד.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Helix-Turn-Helix

A

נפוצים בחיידקים
מכיל 2 הליקסים, אחד אמיני ואחד קרבוקסילי.
המרחק בין שני ההליקסים הוא 3.4 נ”מ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

חלבוני הומיאודומיין

A

3 הליקסים ארוזים בצפיפות עי אינטראקציה הידרופובית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

רוכסן לאוצין

A

שני מונומריים אלפא הליקליים, מבנה דמוי
Y
שתופס את הדנא כמו אטב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

SHEET DNA RECOGNITION PROTEINS

חלבוני זיהוי מסוג סדין ביתא

A

גדילי ביתא 2

בעל מולקולה אלוסטרית שמשפעלת/מדכאת את הפקטור.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

איזה פקטור שעתוק בעל מולקולה אלוסטרית?

איזה פקטור שעתוק נפוץ בחיידקים?

A

חלבוני זיהוי מסוג סדין ביתא

HELIX TURN HELIX

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

אצבע אבץ

A

מכיל יון אבץ המשמש לאחיזה באלפא הליקס ובסדין הביתא בזכות קשרים קואורדינטיביים.
אינטראקציה חזקה וספציפית מאד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Loop-Helix-Loop

A

מקורבים לרוכסן לאוצין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מיהו

NANOG

A

פקטור שעתוק ממשפחת ההומיאודומיין.

מזהה רצף לוגו עם שני AA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

קישור של פקטורי שעתוק

A

במקרה הפשוט, הקשרים הלא קוולנטיים שמחזיקים את הדימר חזקים ומחייבים. במקרה זה יחידת הקישור היא דימר והגרף אקספוננציאלי.
במקרה שהקשרים חלשים, הם מתקיימים בעיקר כמונומרים בתמיסה. כאן נאמר שהקישור קואופרטיבי והעקומה סיגמואידלית. משמעות הקואופורטיביות היא שמעל ריכוז מסוים, הקישור הוא יותר תופעה של הכל או כלום.

בנוסף, קישור של פקטור אחד מרופפת את הדנא מהנוקלאוזום ומאפשרת לעוד פקטור להיקשר קואופרטיבית.

לעיתים מעורב גם
CRC

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מהם אופרונים

A

גנים המצויים תחת אותה בקרה, ויש להם אותו פרומוטור.

התוצר הוא מולקולות מרנא אחת ארוכה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

אופרון הטריפטופן

מהי הבקרה עליו?

A

מקודד לחמשה אנזימים
ביוסינתזה של טריפטופן

יש לו אופרטור אליו נקשר רפרסור רק כאשר הוא עצמו קשור למס’ מולקולות טריפטופן.
שריכוז הטריפטופן יורד, הרפרסור מתנתק.
הרפרסור מיוצר כל הזמן, הגן שמקודד לרפרסור הוא קונסטיטוטיבי.
דומה ל
helix-loop-helix
הרפרסור הוא חלבון אלוסטרי, טריפטופן הוא האלוסטרנט שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מהו אופרטור

A

רצף שמשמש כאתר קישור לרפרסור.

אקטיבטור לא יכול להיקשר לאופרטור!!!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מהו אופרטור הטריפטופן?

A

רצף
cis-regulatory
המזוהה עי רפרסור הטריפטופן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

אקטיבטור

A

נקשר לרצף הציס רגולטורי
ועושה אינטראקציה עם רנא פולימראז ועוזר לו להתחיל שעתוק.

בחיידקים, קישור של אקטיבטור לרוב נשלט עי מולקולה קטנה או מטבוליט. כמו באופרון הלקטוז.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

מיהו CAP?

A 
אקטיבטור חיידקי, פועל כאשר קשור אליו
cAMP
מניע ייצור של אנזימים שעוזרים לחיידק לעכל סוכרים אחרים
קיים באופרון הלקטוז
קושר את הדנא דרך
helix turn helix

במקרים אחרים הוא חוסם קישור של רנא פולימראז לדנא ומשמש כרפרסור

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

אופרון הלקטוז

מה הבקרה עליו?

A

מקודד לשלושה אנזימים
LacY & LacZ
חשובים לפירוק לקטוז

בקרה שלילית - רפרסור פעיל תמיד, קישור של לקטוז מסיר אותו מהדנא.
בקרה חיובית - כאשר ריכוז הגלוקוז נמול החיידק מתחיל לייצר סאמפ.
זה נקשר לאקטיבטור וגורם לו לייעל את תרגום האופרון.
אקטביטור = CAP

בשורה התחתונה, עמ לתרגם את האופרון צריך רמה נוכחות לקטוז שתסיר את הרפרסור ורמה נמוכה של גלוקוז שתפעיל את האקטיבטור.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

פקטור NtrC

A

פקטור שעתוק חיידקי
פועל במנגנון של לולאת דנא
עי אינטראקציה ישירה עם רנא פולימראז, מבקר שעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

אזור בקרת הגן

A

בגן יוקריוטי, כל החלק בדנא המעורב בבקרה ובאיניציאציה של השעתוק.
כולל פרומוטור אליו נקשר הפולימראז ופקטורי השעתוק הכלליים וכל רצפי בקרה בציס אליהם נקשרים פקטורי השעתוק (הרגולטוריים)
לפעמים החלק הזה מגיע ל-100,000 ז”ב.
חלק ממנו משועתק, אך לא מתורגם.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

גן

A

מקטע בדנא המתורגם למולקולת רנא פונקציונלית, שמקודדת לחלבון או בעלת תפקיד אחר בתא.

ההשקפה הקלאסית כוללת תחת גן גם את רצפי הבקרה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

קו אקטיבטורים/רפרסורים

A

חלובנים שאינם מזהי רצף,
נקשרים לדנא בזכות קישור של פקטורי שעתוק.
לעיתים הקומפלקס שלהם עם פקטורי השעתוק מערב גם רנא.

קואקטיבטורים למשל:
HAT
CRC
Histone kinase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Enhancers

A

רצפי בקרת ציס הקושרים פקטורי שעתוק משפעלים - אקטיבטורים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

מיהו חלבון המדיאטור

A

מדובר בקו אקטביטור של השעתוק
מכיל יותר משלושים תתי יחידות
בערך באותו גודל של הפולימראז
משמש כגשר בין האקבטיטור הקשור לדנא לבין רנא פולימראז ופקטורי השעתוק הכלליים, מקדם את ההתארגנות שלהם בפרומוטור

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

אקטיבטורים

A 
מקדמים את הקישור של רנא פולימראז
הם:
מושכים וממקמים את רנא פולימראז,
וגם עוזרים לו להשתחרר
מקדמים שינויים למבנה הכרומטין

לרוב את כל זה הם עושים עי משיכה של חלבונים אחרים, ולאו דווקא פועלים בעצמם

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

אקטיבטורים יוקריוטיים משתמשים בארבעה מנגנונים לשינוי הכרומטין, מהם?

A

מודיפיקציה קוולנטית על היסטונים - למשל עי HAT
נוקלאוזום רמודלינג - nucleosome sliding
הסרה של נוקלאוזום - דורש צ’אפרונים
החלפה/וריאנטיים של היסטונים - דורש צ’פרונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

מודפיקציות על גבי היסטונים כחלק מבקרת שעתוק

A

הרבה פעמים נעשות תוך כדי השעתוק, באמצעות מנגנון זה אפשר למנוע שעתוק נוסף

רובן נעשות על הזנבות של
H3, H4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

מהו Bromodomain?

A

דומיין מיוחד בחלבון שתפקידו לקרוא את הסימון הספציפי על היסטונים. מופיע כתת יחידה בקומפלקס.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

מנגנונים שונים של אקטיבטורים של שעתוק:

A

גיוס פקטורי שעתוק נוספים
גיוס הפולימראז ופקטורי השעתוק הכלליים
האצת שחרור הפולימראז מקומפלקס האיניציאציה
שחרור הפולימראז ממעצורים בדרך

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

סינרגיסטיות בשעתוק

A

פקטורי השעתוק עובדים יחד ומעצימים אחד את השני.
משמעות הסינרגיות היא שסך כל ההשפעות היא לא סכום של כל פקטור בנפרד אלא מכפלה שלהם.
האפיניות של שניים גדולה מסכום האפיניות כשנמדדת לחוד.

33
Q

מנגנוני פעילות של רפרסורים

יש 6

A

תחרות על אתר קישור עם אקטיבטור
מכסה את האתר הפעיל של האקטיבטור
אינטראקציה ישירה עם פקטורי השעתוק הכלליים שמפריעה לאקטיבטור
גיוס של CRC - למשל ידחוף את הטאטא בוקס פנימה
גיוס של היסטון דה אצטילאזות שמסירות אצטילציות
גיוס של היסטון מתיל טרנספראז, המתיל מגייס חלבונים מדכאים

34
Q

ביוקריוטיים, ברירת המחדל לדיכוי גנים היא לרוב…

A

שימוש בהטרוכרומטין

35
Q

מהם

Insulators?

A

רצפים אשר תפקידם לבודד את השפעת פקטורי השעתוק, ולמנוע מהם להפעיל את הפרומוטור

מייצרים לולאות בדנא, מה שיושעתק הוא מה שבתוך הלולאה

36
Q

הגן Eve

בדרוזופילה, מי האקטיבטורים ומי הרפרסורים

A

Activators:
Hunchback, bicoid
Repressors:
Giant, kruppel

הבקרה נעשית בזכות רגישות של רצפי בקרה לריכוזים שונים שלהם.
הגן הוא בעל אזור רגולטורי רחב
שורה תחתונה, הסטריפים השונים נוצרים בעקבות קומבינציות שונות של פקטורים, הוא קושר מעל 20 פקטורי שעתוק.

כאשר EVE
עצמו מקודד לפקטור שעתוק.

37
Q

מיהו MyoD?.

A

פקטור שעתוק המאפיין תאי שריר.

דוגמה בספר לביטוי שלו בפיברובלסטים הופך אותם לתאי שריר,
זאת נעשה בקלות משום שיש להם מוצא משותף משכבת המזודרם

38
Q

מהם iPSC

A

induced pluripotent stem cells
אפשר להשרות את יצירת עי ביטוי של שלושה
Master genes: Oct4, Sox2, Klf4

39
Q

Master regulator

A

גן שיכול לשעתק את עצמו, פועל במנגנון של פידבק חיובי.

לרוב מדובר בגנים שאחראים להתמיינות של התא לפנוטיפ הספציפי שלו

40
Q

מהו משוב חיובי מסוג

feed-forward

A

א מפעיל את ב וג’
ב מפעיל את ג
ג צריך את א וב כדי לפעול.

41
Q

מהי בקרה מסוג

flip-flop device?

A 
א מעכב את ב
ב מעכב ייצור של א
indirect positive feedback loop
ברגע ש-א נוצר זה מעכב את ב
ואז העיכוב של ב מאפשר שוב לייצר את א
42
Q

Maintenance methyl transferase

A

מייצר מתילציות על ציטוזין בגדיל החדש,
במידה ומזהה מתילציה מורשת על הגדיל ההורי.
ברצפי CG!!!

43
Q

למה תגרום מתילציה על הדנא?

כיצד?

A

ברוב המקרים, דיכוי גנים
המתיל יושב על ציטוזין ישירות על התעלה הגדולה ומפריע לחלבונים קושרי דנא.
מהווה נק עיגון לחלבונים המשפיעים על מבנה הכרומטין וגורמים לו להפוך להטרוכרומטין

44
Q

מהם אזורי

GpC islands?

A 
אזורים עשירים ב-GC
באופן חריג, התקיים לחץ אבולוציוני לשמר אותם.
כך שה-C הממותל
לא הפך ל-T
נמצאים בדרכ באזורי פרומוטור
כל הפרומוטורים המקודדים ל
housekeeping genes
רצפי ה-GC נמשרים לא ממותלים
45
Q

ממה נגרמת תסמונת אנגלמן?

A

מחיקה של גן והחתמה גנטית הסוגרת את הביטוי של העותק התקין.

מתאפיינת בפיגור שכלי עמוק.

46
Q

מהו המנגנון הנפוץ להחתמה גנטית?

A

מתילציה.

ששורדת את גל הדה מתילציה שמתרחש לאחר ההפריה.

47
Q

Igf2 in mice

A

Insulin growth factor 2
העותק האבהי מתבטא.
מתרחשת מתילציה על רצף האינסולטור של הגן האבהי שקושר את חלבון
CTCF
בדרכ החלבון הזה גורם להשתקה של הגן.
המתילציה מונעת ממנו להיקשר וכך בעצם הגן האבהי מתבטא.

48
Q

lncRNA - long non-coding RNA

A 
מעל 200 בסיסים
יותר מ-8000 גנים מקודדים
משועתק עי פולימראז 2 ולכן כולל פולי A ו-CAP
עובר שחבור
משמשים לבקרת גנים
למשל, כפיגום עבור חלבונים אחרים שמצבעים מודיפיקציות
למשל באמצעות החתמה גנומית.
אחראי על אינאקטיבציה של איקס - Xist
רנא של הטלומראז
דוגמה: Kcnq1
גן המקודד לתעלת סידן תלוית מתח.
מולקולת ה
lncRNA
שאמורה לדכא את הגן נוצרת מהאלל האבהי שאינו ממותל
ומשתיקה את הגן האבהי
49
Q

Dosage compensation

A

השתקה או הפחתת הביטוי של כרומוזום איקס בנקבות.

50
Q

Barr-body

A

כינוי לכרומוזום איקס הדחוס שעבר אינאקטיבציה.

51
Q

הגדרה להורשה אפיגנטית

A

היכולת של תאי בת לשמר את דפוס הביטוי הגנטי המורש בעזרת מבנה הכרומטידה.

בעצם, דפוס של מודיפיקציות המורש לצאצאים.

יכול לעבור בציס או בטרנס.
ציס: מתילציה, מודיפיקציות היסטונים
טרנס: פריונים, פידבק חיובי

52
Q

CRISPR

A

מע’ רנא בלתי מקודד להגנה מפני וירוסים
החיידק חותך חלק מהווירוס ומחדיר אותו לגנום ב
CRISPR loci/array
הרצף הכי חדש נמצא בקצה 5’ ולכן ישועתק ראשון
החתיכה שהוחדרה משמשת ליצירת
crRNA
שמשמש כרנא מכווין להרס של הדנא הויראלי עי חלבון
CAS - פועל רק על דנא!!!

53
Q

piRNA

A 
מולקולות אשר עושות אינטראקציה עם חלבוני
piwi
תהליך יצירה שונה מ
miRNA, siRNA
מיוצר כמולקולת רנא ארוכה העוברת ביקוע ליחידות קצרות המשמשות כרנא מכווין
אין מעורבות של Dicer
אין מבנה של רנא דו גדילי
מעט ארוכה יותר
54
Q

חלבוני piwi

A

מתבטאים רק בתאי מין, שם הם חוסמים תנועה של טרנספוזונים.

55
Q

siRNA

A

נחשב עתיק יותר
בצמחים, חרקים ותולעים - עיקר ההתגוננות מפני וירוסים.
במחקר: השתקה זמנית של גנים, ריפוי גני.

56
Q

אטניואציה של שעתוק

מהי הדוגמה בספר

A

אטניואציה מוקדמת של שעתוק מולקולת הרנא היא דרך לדכא ביטוי גנים.
במקרים מסוימים, מולקולת הרנא החדשה מקבלת תצורה שמונעת המשך תרגום.
חלבונים מיוחדים יכולים לבטל את המבנה הזה
ולהמשיך שעתוק

הדוגמה היא וירוס HIV
בדרכ סנתוז הרנא נפסק באמצע, כאשר התנאים אידיאליים לוירוס חלבון אליו הוירוס מקודד
TAT
נקשר למבנה stem and loop
ומונע את האטיונאציה המוקדמת
57
Q

ריבוסוויץ’

A

מולקולות רנא קטנות בעלות מבנה תלת ממדי אשר משתנה כתלות בקישור של מולקולה קטנה, למשל מטבוליט.

לרוב ממוקמים בקצה 5 ומתקפלים תוך כדי שעתוק וכך משפיעים על הפולימראז
ספציפיות גבוהה בין הרנא למטבוליט
מתקיים בעיקר בחיידקים, למשל קישור לגואניןת אדנוזין, פלאבין,גליצין
B12, S-Adenosyl methionine

58
Q

שחבור חליפי

A

כ-90% מהגנים האנושיים עוברים שחבור

סוגים שונים של טרופומיוזין מתבטאים בעזרת שחבור חליפי ברקמות שונות
בקרה שלילית - חלבון חוסם הגעה של מע השחבור
חיובית - חלבון שמגביר את יכולת הזיהוי

59
Q

הגן Dscam בדרוזופילה

A

גן בודד שיכול להניב כ-38,000 חלבונים שונים בעזרת שחבור חליפי.

60
Q

אתרי פולי-אדנילציה

דוגמה

A

כ-50% מהמרנא מכילים אתרי פולי-אדנילציה שונים.

מעבר מנוגדן ממברנלי לנוגדן מסיס בתאי B
הבשלה של נוגנדנים משתמשת במנגנון של ביקוע מרנא כדי לייצר נוגדנים מסיסים במקום ממברנליים
החלבון שמסמן את אתר הביקוע CPSF
החלבון המבקע CstF

בתא בי שאינו מעורר, נוצרת מולקולת רנא ארוכה, והאינטרון מוסר עי שחבור. מתקבלת מולקולת מרנא שמקודדת לנוגדן ממברנלי.
אחרי גירוי של אנטיגן, תוצר הרנא עובר ביקוע ופולי אדנילציה במעלה הזרם מהאינטרון. כתוצאה חלק מהאינטרון נותר כרצף מקודד.

61
Q

RNA editing

A

Deamination of A to I

Deamination of C to U

62
Q

Apolipoprotein B gene

A 
הגן עובר עריכה מסוג דה אמינציה של
C
ל- U
וכך נוצר קודון סטופ חדש וחלבון קצר יותק במעי,
לעמות החלבון הארוך והשלם בכבד.
63
Q

מה התפקיד של עריכת רנא?

A

תיקון שגיאות
הגדלת כמות החלבונים
אמצעי הגנה מפני וירוסים וטרנספוזונים - מכניס שגיאות ברנא שלהם.

64
Q

ADAR enzyme

A 
Adenosine deamination acting on-RNA
עושה דאמינציה של A
ליצירת I
בעזרת הידרוליזה ושימוש במולקולת מים,
משתחרר NH3
ובמקום יש קרבוניל
65
Q

טרנספורט של מרנא

איזה דוגמה הספר נותן?

A

אחת מתוך עשרים מולקולות עוזבת את הגרעין
יציאה של רנא החוצה מהגרעין מבוקרת מאד.

הדוגמה היא וירוס ה HIV
בעייתי למולקולה לצאת מהגרעין כי היא לא עברה שחבור
הוירוס מקודד לחלבון Rev
המזהה רצף בגנום הויראלי
RRE Rev response element
המצוי בתוך אינטרון.
החלבון רב יוצר אינטראקציית חלבון-חלבון עם אקספורטין בשם
Crm1
שמכווין אותו החוצה מהגרעין.
החלבון רב מצביע גם על שלב ההדבקה
66
Q

לוקליזציית מרנא בציטוזול

A

באמצעות סיגנל המצוי במרנא עצמו, לרוב ב
UTR3
באמצעות חלבוני המנוע הנעים על שלד התא
חלבונים המחזיקים אותו במקום

67
Q

רצפי UTR

A

נחשבים חלק מאקסונים משום שמצויים על מולקולת המרנא הבוגרת,

רצפי בקרה המשפיעים על זמן מחצית החיים של המולקולה ועל מיקומה בתא.

68
Q

רצף

Shine Degrano

A

מצוי ב-UTR
חיוני לאיניציאציית תרגום מאחר ומבצע אינטראקצייה עם יחידה
16S של היחידה הקטנה

69
Q

כאשר חיידק הליסטריה מצוי בטמפ של 37 מעלות הוא מתחיל לבטא גנים מסוימים, איזה מנגנון עומד מאחור?

A

הריסת המבנה השניוני של המרנא עקב חום חושפת רצפי

שין דלגרנו ומאפשרת תרגום לחלבון.

70
Q

פקטור השעתוק eIF2

A 
פקטור יוקריוטי, חלבון ג'י
נקשר לקצה 5 של מרנא וסורק את המולקולה עד שמוצא קודון התחלה
AUG
הידרוליזה של ה
GTP
גורמת לשינוי מרחבי והוא עוזב תוך כדי שמשאיר את
tRNAi-Met
באתר P
פקטור השחלוף שלו הוא eIF2B
71
Q

למה גורם זרחון של הפקטור eIF2?

A

eIF2B קישור חזק מדי שלו עם

שעושה לו בעצם סיקווסטרינג.

72
Q

uORF

A

upstream URF
מסגרת קריאה אלטרנטיבית במעלה הזרם
זה לא הכל ולא הבנתי, צריך לקרוא בספר

73
Q

מערכת הIRES

A

רצפים בני כמה מאות נוקלאוטידים המתאגנים למבנים שניונים ומגייסים את פקטורי האיניציאציה.
לא יהיה שימוש ב eIF4E!!!
שנקשר ל-CAP
וירוסים מבטאים אנזים מסוג פרוטאז שמבקע את
eIF4E
וכך סוגרים את כל התרגום התאי פרט לזה

74
Q

בקרה על זמן מחצית החיים של מרנא

A

ככמה דקות, בגלל נוקלאזות שמפרקות
רצף הפולי A מגן מפני נולקאזות

דוגמאות:
פקטורי שעתוק - זמן מחצית חיים קצר
בטא-גלובין - מגיע לעשר שעות!
שתי דרכים כלליות לבקרה:
הבקרה נעשית באמצעות קיצור הפוליA,
שמשמש מעין טיימר, תהליך שמתחיל עם ההגעה לציטוזול
ברגע שזנב הפולי איי מגיע לנק’ קריטית של 25 נוקל’, מתפצל לשני מסלולים:
באחד ה-5 קאפ מוסר והמרנא מפורק במהירות מקצה 5
בשני המרנא ממשיך להתפרק מקצה 3

75
Q

איזה מנגנון חשוב שולט בבקרה על זמן מחצית החיים של מולקולות מרנא בציטוזול?

A

poly-A shortening

76
Q

זנב הפולי A

משמש…

A

גם לאיניציאציה של תרגום

וגם לפירוק מולקולת המרנא.

77
Q

מנגנון נוסף לשליטה בפירוק של מרנא

A

אינו תלוי בפולי איי
מאפשר פירוק מהיר של המולקולה משני הקצוות
באמצעות אתרי קישור לאנדונוקלאזות
אפשר לבקר על התהליך עי חשיפה/הטמנה של אתרי הקישור.

למשל, טרנספרין - מרנא שלו רגיש לברזל, זה חושף אתר לפירוק.
אקוניטאז יכול להיקשר ל
3UTR של רצפטור טרנספרין
ולהגביר את ייצור הרצפטור עי חסימת אתר הקישור לאנדונוקלאז.
כשהבזרל עולה אקוניטאז מתנתק והנוקלאז פועל שוב.

78
Q

גופיפי P

P-bodies

A

אגרגטים של חומצות גרעין וחלבונים המצויים בציטוזול ותפקידם לאחסן ולפרק רנא.
לרוב מדובר בפירוק.

79
Q

Stress granule

A

אגרגט נוסף, שמאחסנות רנא ומכינות אותו לתרגום.

לכן ימצאו שם: פקטורי איניציאציה, תת יחידות קטנות של ריבוזום, PAB

Biochemistry (41 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions