ביותא א

Question 1

מהו הרכיב הנפוץ ביותר בממברנה של:
חיידקים
שכבת המיאלין
מיטוכונדריה ו-ER
כדוריות דם אדומות

Answer 1

חיידקים - פוספוטידיל אתנולאמין
שכבת המיאלין - גליקוליפידים
מיטוכונדריה ו-ER - פוספוטידיל כולין
כדוריות דם אדומות - כולסטרול

Question 2

מה עובי הממברנה?

Answer 2

5 ננומטר

*ממברנה של יוקריוטים וריאבילית מאד, מכילה 500-2000 ליפידים שונים

Question 3

פוספוגליצרידים

Answer 3

בעלי שלד גליצרול

Question 4

לציטין

Answer 4

מונח גנרי הבא לציין חומר שומני חום צהבהב

באמת??

Question 5

ספינגוליפידים

מה השלד ומה הרכבו?

Answer 5

בעלי שלד ספינגוזין

יש לו שני הידרוקסילים וקבוצת אמין

Question 6

פוספוטידיל סרין

Answer 6

בעל מטען שלילי

Question 7

כולסטרול

Answer 7

מולקולה אמפיפטית בעלת קבוצת הידרוקסיל וארבע טבעות קשיחות.
אינה מישורית אלא מסתדרת בקונפיגורציות
בממברנה, מצויה בתוך המונולייר ולא חוצה את שתי השכבות

בופריזציה של הממברנה
יוצר אינטראקציה עם שני פוספוליפידים
מפחית את חדירות הממברנה
מוריד את נק’ הקיפאון

Question 8

מה קובע האם יווצר ליפוזום או מיצלה?

Answer 8

הצורה הגיאומטרית של הדטרגנט.
חרוט - מיצלה
גליל - ליפוזום

Question 9

2 שיטות מרכזיות

ששימשו למחקר תנועת ליפידים בממברנה

Answer 9

הצמדה של ראש פלוריסנטי או חלקיק זהב לראש הפולרי

spin labled -
NO מוסיפים לקבוצת הליפידים
וזה ייתן לו ספין שניתן יהיה לזהות ב-
ESR - electron spin resonance

Question 10

מהם סוגי התנועה של ליפידים בממברנה?

Answer 10

לטרלית - דיפוזיה פשוטה בעלעל
רוטציה - סיבוב פשוט סביב הציר
פלקסיה - פיסוק של הפוספוליפיד
פליפ-פלופ - מעבר מעלעל אחד לאחר,נדיר יחסית.
*כולסטרול דווקא עושה פליפ-פלופ מהיר.

Question 11

מיהם ה

phospholipid translocators?

Answer 11

אנזימים שמסייעים לתנועה של פוספוליפידים בין העלעלים.
פליפאז - מהחיצוני לפנימי - ATP, to inner
פלופאז - מהפנימי לחיצוני - ATP, to outer

Question 12

כיצד נמנע איחוי לא מבוקר של ממברנות,

למשל שני איברונים בתא?

Answer 12

בזכות מעטפת מיימית דקה שעושה אינטראקציה עם הראש הפולרי.

Question 13

במה תלויה פלואידיות הממברנה?

Answer 13

בהרכב ובטמפרטורה

Question 14

כולסטרול בממברנה

Answer 14

מפחית את הפרמיביליות

לא מפחית את הפלואידיות

Question 15

LIPID RAFTS

Answer 15

החלבונים מתארגנים בזכות אינטראקציות חלבון-חלבון
אזור פונקציונלי בממברנה בעל פעילות מסויימת
עשירים ב:
גליקופרוטאינים
גליקוליפידים
GPI חלבוני
כולסטרול

ממברנה עבה באזורים אלו
סוג של ליפיד ראפט, חיוני לאנדוציטוזה - Caveolae

Question 16

טיפת שומן

Answer 16

איברון עטוף בחד שכבה של פוספוליפידים

Question 17

הרחבה: כולסטרול אסטר

Answer 17

הצורה הלא פעילה של כולסטרול
אחרי שהוא למשל קשור לח.ש
מולקולה הידרופובית לחלוטין
אין לו כבר הידרוקסיל!

Question 18

הרכב עלעלי הממברנה

Answer 18

חיצוני:
ספינגומיאלין - ראש פולרי של פוספוכולין
פוספוטידיל כולין
LCAT - lecithin cholesterol acyl transferase

פנימי: עשיר בקבוצות אמינו טרמינליות
פוספוטידיל סרין - (פנימי באפופוטוזיס)
פוספוטידיל אתנולאמין
פוספוטידיל אינוזיטול - משמש להולכת אותות בתור
PIP2
המפורק עי פוספוליפאזות ל:
IP3, DAG

Question 19

גליקוליפידים

Answer 19

על העלעל החיצוני בלבד
כ-5% מהליפידים
אינם מכיליפ פוספט ולכן אינם פוספוליפידים
מורכבים על שלד ספינגוזין
מתאגדים בממברנה הודות לקשרי מימן בין קבוצות הסוכר וקשרי ואן דר ואלס
תורמים להיווצרות ליפיד ראפט
אינטראקציה וזיהוי בין תאים (מערב לקטינים)
משמשים נק’ עגינה לחיידקים, למשל טוקסין הכולירה

בתאי אפיתל נמצאים רק בצד האפיקלי - הגנה מפני פרוטאזות
ומשיכה של יונים חיוביים (סידן)

Question 20

גנגליוזידים

Answer 20

סוג מורכב של גליקוליפידים
מכילים קבוצה סיאלית מסוג NANA
המקנה להם מטען שלילי
בתאי עצב מהווים 5-10%

Question 21

לקטינים

Answer 21

חלבונים קושרי סוכר בעלי ספציפיות גבוהה

לסובסטרט שלהם. לפיכך בעלי תפקיד מכריע בזיהוי ביולוגי.

Question 22

טאי זקס

Answer 22

מחלת אגירה,
מחסור באנזים המפרק גנגליוזיד GM2
חוסר באנזים ביתא הקסואמינידאז בלילזוזום

Question 23

גושה

Answer 23

חוסר באנזים גלוקוצרברוזידאז,

האחראי על פירוק הגליקוליפיד גליקוזיל-צרמיד

Question 24

כיצד החלבונים הבאים מחוברים לממברנה
פריפריאליים
מעוגנים

Answer 24

פריפריאליים - באמצעות אינטראקציית חלבון-חלבון

מעוגנים - ליפידיזציה עי ליפיד

Question 25

קישור באמצעות ח.ש

Answer 25

חומצה מיריסטית - 14 פחמנים, נקשרת לקצה האמיני, נוצר קשר אמידי.
חומצה פלמיטית - 16 פחמנים, נקשרת לקבוצת תיול של ציסטאין בחלבון, קשר תיואסטרי
קבוצה פרנילית - נקשרת לקבוצת תיול של ציסטאין, נוצר קשר תיואתרי

Question 26

SRC חלבוני

Answer 26

משפחה של חלבונים ציטוזוליים בעלי פעילות טירוזין קינאז,
נקשרים לממברנה עי קבוצת מיריסתיול
להגברת יציבות לעיתים גם עי חומצה פלמיטית - קישור התלוי בסיגנל חוץ תאי.

Question 27

RAS משפחת

Answer 27

GTPase בעלי פעילות - Small GTPase

מעוגנים לממברנה עי קבוצת פרנילית וחומצה פלמיטית

Question 28

Rab משפחת

Answer 28

קטנים, GTPase בעלי פעילות
GTP במצב קושר
הם חושפים ליפיד שמעגן אותם לממברנה כ
lipid anchored
כלומר הם חלבונים מסיסים חלק מהזמן ומעוגנים בשאר

Question 29

מקטע חוצה ממברנה של חלבון

Answer 29

לרוב מדובר באלפא הליקס.
הקשר הפפטידי הוא פולרי, בסביבה ההידרופיבית של הממברנה זה מחייב את הקשרים הפפטידים ליצור קשרי מימן אחד עם השני.
אורך סגמנט חוצה ממברנה כ-20-30 ח.א

אך גם חבית ביתא, אורך סגמנט חוצה ממברנה כ-10 ח.א

Question 30

המדד ההידרופתי

Answer 30

מדד המתאר את הנטייה ההידרופובית של ח.א, מאפשר לזהות סגמנטים טרנסממברנליים

מתאים יותר לאלפא הליקס מכיוון שסדין ביתא קצר מדי וקשה לזיהוי

Question 31

החלבון גליקופורין

Answer 31

חוצה ממברנה פעם אחת

Question 32

חביות ביתא

Answer 32

יכולות להיות גם אנזימים לא רק תעלות, רצפטורים ואז התעלה משמשת לתמיכה מבנית
מבנה קשיח יותר מאלפא הליקסת מאפשר קריסטולוגרפיה
8-22 גדילים
נפוצים בחיידקים, מיטו וכלורופלסט
ליבה הידרופילית
קשרי מימן קשיחים בין הגדילים, לא מאפשרים תזוזה (בניגוד לאלפא הליקס)

Question 33

מהו Maltporin?

Answer 33

תעלה מסוג חבית ביתא בחיידקים
סלקטיבית מאד, מאפשרת מעבר רק של מלטוז
פורין

Question 34

החלבון FepA

Answer 34

דוגמה מורכבת של חבית ביתא
22 גדילים
מעביר יוני ברזל
בחיידקים

Question 35

OmpA - outer membrane protein A

OMPLA - outer membrane phospholipase

Answer 35

רצפטור לוירוס חיידקי

אנזים חיידקי מסוג ליפאז

Question 36

Glycocalyx

Answer 36

מעטפת התא העשירה בסוכרים.

אפיניות גבוהה ללקטינים

Question 37

דטגרגנט יוני -

לא יוני -

Answer 37

יוני - SDS

לא יוני - אוקטיגלוקוזיד, טריטון

Question 38

ריכוז CMC

critical micelle concentration

Answer 38

מתחתיו הדטרגנט מתקיים כמונומרים,
מעליו כמיצלות
כאשר בריכוז זה נשמר שיווי משקל, מונומרים מתחברים ויוצאים והריכוז של החופשיים נשאר קבוע.
מושפע מ:
טמפ'
pH
ריכוז מלחים

Question 39

דטרגנט יוני

Answer 39

ממיס חלבונים הידרופוביים

הורסים את המבנה המרחבי של החלבון מאחר ונקשרים לליבה ההידרופובית.

Question 40

דטרגנט לא יוני

Answer 40

שומרים על המצב הנטיבי
נקבל מע’ של חלבוני ממברנה המצויים בתוך ליפוזומים ושומרים על הפעילות שלהם.
ניתן להרחיק את הדטרגנט עי דילול או הוספה של פוספוליפידים
מאפשר לבדוק רק צד אחד של החלבון, באופן אקראי.

Question 41

ננו-דיסקים

Answer 41

חגורה עשויה מ
HDL
ולכן מסיסים בפלזמה
מאפשר לחקור את שני צידי החלבון

Question 42

החלבון בקטריורודופסין

Answer 42

משאבת פרוטונים תלוית אור, מוציא פרוטונים
התגלה בארכאה
שבעה הליקסים שבמרכזם מולקולה קולטת אור - כרומופור מסוג רטינאל, קשור לליזין.
אור משרה שינוי מבני
ממיר אנרגיה סולרית לאנרגיה של מפל ריכוזים
מולקולות ליפידיות קשורות לאתרים בחלבון לייצוב

שימוש בטכניקה של
electron crystallography
שילוב של מיקורסקופ אלקטרונים ודיפרקציית אלקטרונים
בעל צבע סגלגל

Question 43

fluorescence recovery after photobleaching (FRAP).

Answer 43

פוטובליצ’ינג
טכניקה המאפשרת למדוד את קצב הדיפוזיה הלטרלית של חלבונים ממברנליים עי סימון פלוריסנטי
קרן לייזר
מדידת זמן ההתאוששות - כתוצאה מדיפוזיה

שימש למדידת קבוע הדיפוזיה של חלבונים ממברנליים
וכן למדידת צמיגות הממברנה, כמו שמן זית

חסרונות:
לא ניתן לעקוב אחר חלבונים יחידים
אם חלבון מסוים לא נע לאזור ההתאוששות, זה לא בהכרח אומר שהוא לא מובילי. יכול להיות שהוא מוגבל לאזור מסוים.

Question 44

Partition coefficient

Answer 44

קבוע הדיפוזיה של חלבונים ממברנליים

גדול - ההתאוששות מהירה יותר בפוטובליצ’ינג

Question 45

Single partical tracking

Answer 45

מאפשרת לעקוב אחר חלבון יחיד עי הצמדת נוגדן עם סימון.

Question 46

חלבונים וליפידים מוגבלים לעיתים לאיזורים מסוימים בממברנה

Answer 46

זה כך במרבית התאים
למשל לצד אפיקלי או בזולטרטלי
ההפרדה מתבססת למשל על צמתי אטימה

דוגמה קלאסית: תא זרע שמכיל 3 דומיינים ממברנליים מובחנים.
דוגמה נוספת - חלקים מובחנים בנוירון, אקסון, דנדריט…

ארבע דרכים ליצירת מדורים:
יצירת אגרגטיים חלבוניים
קישור לחלבון חוץ תאי
לחלבון תוך תאי
אינטראקציה עם חלבונים על פני תא אחר

Question 47

מחלת HS

Answer 47

מוטציה בחלבון ספקטרין

Question 48

ספקטרין

Answer 48

טטרמר הטרודימר

Question 49

מה מכיל
Junctional complex
בכדוריות אדומות?

Answer 49

ספקטרין
Adducin
Band 4.1
Band 3
גליקופורין
אנקירין
אקטין
טרופומיוזין

Question 50

מהם Corals

Answer 50

דומיינים ממברנליים שנוצרים בגלל שלד התא.

יכולים להיות קבועים או זמניים.

Question 51

מהם Bending proteins?

Answer 51

חלבונים שיוצרים עקמומיות בממברנה.
למשל עי:
ראש הידרופוסבי שנכנס בין הפוספוליפידים
חלבון הקושר את הראשים הפולריים

העקמומיות יכולה להיות חיובית או שלילית

Question 52

מהו גודל הרגעין?

כמה נפח תופס

Answer 52

כ-2 מיקרומטר

כ-10%

Question 53

לגרעין יש ממברנה….

Answer 53

כפולה, כלומר 4 שכבות.

בררנית מאד!!

Question 54

כרומטין הוא?

Answer 54

דנא + חלבונים

Question 55

כמה אחוז מהדנא נמצא כהטרוכרומטין?

Answer 55

כ-10%

Question 56

מה כולל מוטיב ההיסטונים?

Answer 56

שלושה הליקסים, ביניהם 2 לולאות.

Question 57

קישור הדנא להיסטוני הליבה

Answer 57

כ-142 קשרי מימן,

בין הליבה החלבונית לשלד הסוכר פוספט

Question 58

קומפלקס NPC

Answer 58

מורכב מכ-30 סוגי חלבונים הקרויים נוקלאופורינים
קיים קשר אבולוציוני לחלבוני מעטפת דוגמת
COPII, קלתרין
מספרים משתנה בין תא לתא
כ-20,000 בתאי פורקנייה
כמעט ללא בגלייה
מעבר בתוך תווך מיימי
מולקולת קטנות מ-5000 דלטון עוברות בחופשיות
שומר על סימטריה, צד גרעיני וציטוזולי זהים

Question 59

אילו חלבונים נוספים מכיל ה-NPC

Answer 59

Membrane ring proteins - מעגנים לממברנה
Scaffold
Channel nucleoporins

רבים מהחלבונים מכילים זרועות FG
פנילאלנין, גליצין
יוצרות מבנה לא מאורגן דמויי ג’ל
פיברילים הפונים לציטוזול ולגרעין, לא סימטריים

Question 60

סיגנל NLS

Answer 60

בחלבונים הגדולים מ-60 קילודלטון
מורכב מליזין וארגינין
אם מדובר בקומפלקס חלבוני, מספיק חלבון אחד עם הסיגנל

וירוס ה- SV40
מכיל סיגנל שמאפשר לו להיכנס לגרעין

Question 61

Karyopherins

Answer 61

גנים שמקודדים לאימפורטינים ואקספורטינים,

Question 62

אימפורטינים ואקספורטינים

Answer 62

דומים עד כמעט בלתי ניתן להבחין
אימפורטינים - NLS
אקספורטינים - NES
נקשרים מצד אחד לסיגנל ומצד שני לזרועות ה-FG
חלבונים מסיסים

Question 63

מערכת Ran

Ras associated nuclear protein

Answer 63

Monomeric GTPase protein
חיוני לתהליכי אימפורט ואקספורט לגרעין, משקיע את האנרגיה
ומעניק את הכיווניות!!
GAP in cytosol
GEF attached to chromatid
In GDP mode, imported to nucleus via special importine recognizing only GDP mode.
זה אימפורטין שלא קשור למשפחה

Question 64

תהליך האימפורט לגרעין

Answer 64

חלבון האימפורטין קושר את המטען 
נכנס באמצעות זרועות FG
בתוך הגרעין נקשר ל-RanGTP
המטען משתחרר
יוצאים ביחד ובציטוזול פוגש את
GAP
עושה הידרוליזה ל-GDP
האימפורטין משתחרר

Question 65

תהליך האקספורט מהגרעין

Answer 65

אקספורטין קושר מטען בגרעין ויוצא
פוגש RanGDP 
המטען משתחרר
ביחד הם חוזרים לגרעין
פוגש את GEF
קושר GTP
האקספורטין משתחרר

Question 66

shuttling proteins

Answer 66

חלבונים שמכילים גם סיגנל
NES
וגם NLS
לכן נעים פנימה והחוצה מהגרעין.
אם קצב הכניסה גבוה מקצב היציאה החלבון יהיה בעיקר בגרעין

חלקם נעים פנימה והחוצה כל הזמן, אחרים לא.
הבקרה על הטרנספורט עי כיבוי והדלקה של הסיגנלים, למשל עי זרחון.
או חלבונים שמחזיקים אותם בציטוזול, או מכסים את הסיגנל שלהם.

Question 67

דוגמה לבקרה על טרנספורט
כולסטרול
SREBP - sterol response element binding protein

Answer 67

חלבון הבקרה על גן רדום השולט במטבוליזם של כולסטרול.
החלבון נוצר ונשמר כטרנסממברנלי ב-ER
מעוגן לשם עי SCAP
שקושר כולסטרול, כאשר אין לו כולסטרול לקשור, הוא עובר שינוי מבני ונכנס ביחד עם
SREBP
לוזיקולות טרנספורט לגולג’י.
בגולג’י הוא פוגש פרוטאז ספציפי שחותך את הדומיין הציטוזולי המשתחרר לציטוזול.
אז הדומיין החתוך נודד לגרעין ומפעיל את הגנים הנחוצים לאפטייק וביוסינתזה של כולסטרול.

Question 68

כיצד יוצאים

snRNA, miRNA and tRNA

Answer 68

By the same family of export receptors & Ran-GTP

Question 69

כיצד יוצאת?

mRNA

Answer 69

In large assemblies, up to 100 million D
מכיל מאות חלבונים מכתריסר סוגים.
אלו הם
mRNA rubonucleo-protein complex - mRNP’s.
לא מעורב ישירות Ran-GTP
הטרנסלוקציה דרך הגרעין מונעת עי הידרוליזת
ATP

Question 70

NF-AT

Answer 70

nuclear factor activated T cells
חלבון בקרת שעתוק אשר בתאי טי במנוחה
מצוי בציטוזול במצב מזורחן.
כאשר התאים מופעלים ריכוז הסידן התוך תאי עולה וחלבון פוספטאז מסיר את הזרחן.
הצורה הלא מזורחנת חושפת סיגנל כניסה וחוסמת סיגנל יציאה.
הקומפלס
NF-AT cacinurin
נודד לגרעין שםם הוא מפעיל שעתוק.
התגובה מכובת כשריכוז הסידן יורד,
וזרחון מחדש גורם לו לצאת לציטוזול.

תרופות לדיכוי מע החיסון פועלות על מנגנון זה, חוסמות דה זרחון עי
קלצינורין
למשל, ציקלוספורין

Question 71

פירוק מעטפת הגרעין במיטוזה

Answer 71

דינאין מפרק אותה באופן אקטיבי
חלבוני ה-NPC
נקשר לאימפורטינים כדי לאפשר הרכבה מחדש
החלבונים מתפזרים ב-ER

Question 72

מבחינת עיגון, לכרומטין יש אינטראקציה עם?

Answer 72

הלמינה הגרעינית ועם חלבונים טרנסממברנליים של הממברנה הפנימית.

Question 73

הרכבה מחדש של הגרעין

Answer 73

מצריכה את Ran-GTP
שמשחרר את ה-NPC
מהאקספורטינים