ביותא ב Flashcards

1
Q

פרוקסיזום

A

מקיים תהליכי חמצון
מוקף בממברנה יחידה
משכםל את עצמו
מכיל קטאלז ואוריאה אוקסידאז

מקיים חמצון ביתא - בשמרים וצמחים רק שם

ריאקציה ראשונה לייצור פלזמלוגן - פוספוליפיד חסר מטען, נפוץ במיאלין (90% ממיאלין)

הריאקציה הכללית:
RH2 + O2 -> O2H2 + R

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

האנזים קטלאז

A

מנצל מי חמצן על מנת לחמצן: חומצה פורמית, אלכוהול ופורמאלדהיד - פרוקסידציה.
חשוב במיוחד בכליה
הריאקציה המרכזית:
H2O2 + RH2 -> R + 2H2O
Uses H2O2 already existing to oxidise, also when accumulation:
2H2O2 -> 2H2O + O2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

רצף סיגנל קצר מכוון חלבונים לפרוקסיזום

A

SKL - בקצה הקרבוקסילי!!
חלבונים אחרים מכילים סיגנל בקצה האמיני

רצפטורים מסיסים בציטוזול מזהים את הסיגנל, למשל
Pex5
שמוביל חלבונים עם סיגנל בקצה הקרבוקסילי, וכדי לצאת עוברי יוביקווטינציה.
תהליך הכניסה דרך פרוקסינים, שיוצרים תעלה, מונע עי
ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

תסמונת זלוויגר

A
פגיעה בפרוקסיזומים.
התאים מכילים פרוקסיזומים ריקים
מחלה קלה יותר מתקבלת אם הפגיעה היא ב
Pex7
לרוב מדובר בפגם ב- Pex5
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

יצירת פרוקסיזום

A

הנצה מפרוקסיזום קודם
לעיתים מווזיקולה מה-ER:
Involving Pex15 & Pex3, Pex19

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

כיצד מגיעים חלבונים לפרוקסיזום?

A

מתורגים בציטוזול ונישאים עי פרוקסינים,

או בווזיקולות מה-ER.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

ER
ממברנה
גיוון בתאים

A

כ-50% מהממברנה בתא שייכת ל-ER
מתחלק לחלק וגס, כאשר החלוקה תלויה בפונקציה שממלא בתא
חלק - הנצה של וזיקולות, מטבוליזם ליפידים, כולסטרול, הורמונים סטרואידים; בכבד כמות נכבדת, Cyp450
גס - משובץ בריבוזומים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Leyding cells

A

מצויים באשכים, מכילים כמות גדולה של
ER חלק.
מייצרים הורמונים סטרואידים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

תרגום חלבונים אל חלל ה-ER

Co-translation

A

יכולים להיות ממברנליים או מסיסים ב-ER
SRP חלקי
וגם רצפטור עבורו על ה ER
GTP hydrolysis on SRP will allow interaction with the translocator on the ER membrane

מצריך סהכ 2 GTP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

סיגנל מכווין לER

A

רצף של כ-20 ח.א, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, בקצה אמיני (שמסונתז ראשון)
יעבור ביקוע, כך שהחלבון הסופי קצר ב-20 ח.א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

חלקיק SRP

Signal recognition particle

A
6 subunits and RNA molecule.
בעל מבנה דמוי מתג,
מולקולת הרנא בעלת תפקיד מבני פיגומי
נקשר לתת היחידה הגדולה
מתרכב בגרעינון
גם הוא וגם הרצפטור שלו קיימים בכל התאים,
יכולת הזיהוי הודות לכיס הידרופובי הכולל מתיונין, מקנה לו פלסטיות.
מתתקפל בצורה בעוטפת את הריבוזום וחוסמת את קישור של פקטור אלונגציה, זה עוצר את התרגום עד להגעה לרשתית
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

טרנסלוקטור ל-ER

A

יוצר תעלה מלאה במים דרכה עובר הפפטיד
מכיל ציר - יחידת גאמא, פתח, פקק
הפקק סגור עד שמתחבר ריבוזום, כך שהרשתית אטומה
ליבת הטרנסלוקטור מכונה
Sec61
מכילה 3 תתי יחידות שמורות מאד
הטרנסלוקטור ביחד עם החלבונים המסייעים נקרא טרנסלוקון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Post translation into the ER

A
נפוצה בשמרי ובחלבונים המופרשים החוצה.
מצריך שימוש בצ'פרונים דוגמת
Bip - an ATPase, homologous to Hsp70
מושך את החלבון לתוך הER
לכן מדובר בחלבון מסיס ב-ER
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

העברה לאחר תרגום בחיידקים

A

מדובר בהפרשה מחוץ לתא
יש להם הומולוג ל-SRP ועוד
משתמשים בחלבון
SecA - ATPase into a channel which is called SecY and is homologous to Sec61.

חיידקים דוחפים החוצה ויוקריוטים מושכים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

סיכום העברה לER

כולל חיידקים

A

Co translation - 2 GTP
Post translation - ATP
Bacteria - ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

סוגי חלבונים טרנס ממברנליים

A

טייפ 1 -

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

חלבוני מולטי פס

מה הדוגמה?

A

סורק את הפפטיד החל מהקצה האמיני SRP
ונקשר לרצף ההידרופובי הראשון

לדוגמה, החלבון רודופסין, שגם עובר גליקוזילציה בקצה האמיני טרמינלי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

חלבוני

tail anchored

A
post translation pathway
לנעיצת חלבונים על הממברנה
למשל חלבוני SNARE
התהליך:
חלבון מסיס תופס את הקצה הקרבוקסילי ההדירופובי, וטוען אותו על 
Get3 - ATPase, dimer
ER נוצר קומפלקס שעושה את דרכו ל
שם הוא נקשר לרצפטורים
Get1Get2
שמתפקד כמכונת נעיצת חלבונים בממברנה
גט 3 משתחרר עי שחלוף 
ATP to ADP

הזנב הקרבוקסילי נותר נעוץ בממברנה והאמיני שוחה בציטזול

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

חלבוני הקבע של הER

A

מחצן שייר תיול ליצירת קשרים דיסולפידיים - PDI
צ’פרון - Bip
לחלבוני קבע יש סיגנל מיוחד הכולל 4 ח.א בקצה הקרבוקסילי הנקרא:
ER retention signal

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

PDI - protein disulfide isomerase

A

catalyzes the formation of S-S bonds in cysteine residues, both eukaryotes and bacteria

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

גליקוזילציה של חלבוני הפרשה

A

כמחצית מהחלבונים באי אר עוברים גליקוזילציה
מזורז עי האנזים אוליגוסכריד טרנספראז, היושב ליד הטרנסלוקון
N על שייר אספרגין, גליקוזילציה מסוג
שייר האספרגין חייב להיות:
NH2….N-X-S/T……COOH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

גליקוזילציה על חלבונים ציטוזוליים וגרעיניים

A

N-acetyl glucose amine

על שייר סרין/תריאונין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

גליקוזילציה O

A

מתחיל ב
ER
וממשיך בגול’י

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

בקרת קיפול חלבוני

ER

A

N glycolisation is important for correct folding of a protein.
קלנקסין וקלרטיקולין
חלבוני קושרי לקטינים הנקשרים לאוליגוסכרידים על פני חלבונים לא מקופלים ומחזירים אותם ב-ER
מונעים בכך אגרגציה של החלבונים.
מזהים סוכרים עם
גליקוזילציה N
וגלוקוז חופשי בקצה - משמע כאלו ששניים מתוך 3 הוסרו עי
ER glucosidase

תיאור מלא של התהליך אצל רשף.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

ERp57

A

מזהה קבוצות סולפדריל חופשיות, שהן סימן לקיפול לא נכון,

צ’פרון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

חלבון ER

המיועד לפירוק

A

האוליגוסכרידים משמשים מעין טיימר,
הכנת החלבון ליציאה לציטוזול עי קישור ללקיטינים, צ’פרונים ודיסולפיד איזומראז
סימון ביוביקווטין עי הטרנסלוקטור עם היציאה לציטוזול
פירוק בפרוטאוזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

עיגון חלבונים דרך

GPI

A

אלו חלבונים שעתידים להיות על הממברנה
Glycosylphosphatidylinositol (GPI) Anchors
הקצה הקרבוקסילי הידרופובי ומשמש כסטופ טרנספר שנחתך החוצה.
הקישור: הקצה האמיני של הפוספוליפיד עושה התקפה נוקלאופוילית על הקצה האמיני
התוצאה היא ביקוע החלק ההידרופובי שנשאר נעוץ בממברנה.
נמצאים בשכיחות גבוהה בליפיד ראפט

מנוצל עי הפרזיט טריפונוזומה עמ להתחמק ממע’ החיסון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q
phospholipid
exchange proteins (or phospholipid transfer proteins
A

Water soluble protein carriers, p.691

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

אנדוציטוזה

A

תהליך שבו התא מסיר קומפוננטים ממברנליים ומעביר אותם למדורים פנימיים הנקראים אנדוזומים. משם הם ימוחזרו או יועברו לפירוק בליזוזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

COP

A

משפחה של חלבוני מעטפת השייכת למע’ ההפרשה המוקדמת
COPI - Golgi to ER
COPII - ER to Golgi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Clathrin

A

מהגולג’י ומהממברנה הפלזמטית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Clathrin

A

מהממברנה הפלזמטית, ובין הגולג’י לאנדוזום
מורכב משלושה פפטידים גדולים ושלושה קטנים שמייצרים מבנה המכונה טריסקליו - triskelion.
קלות - עוברות זרחון רגולטורי, בעלות תפקיד רגולטורי של הרכבה ופירוק, מתחברות לשלד האקטין
כבדות - מייצבות את המבנה
מתרכבים יחדיו למעין כלוב קלתרין, גם במבחנה ללא ממברנה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Adaptor protein

A

רכיב בוזיקולת קלתרין
מייצר שכבת מעטפת משלו מתחת לקלתרין ומעל הממברנה
ישנם סוגים שונים, כל אחד מתאים למטען אחר - different cargo receptor
ההתאגדות של חלבון האדפטור מבוקרת מאד.

דוגמה מוכרת היא AP2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

רשימת חלבונים הדרושים להנצה של וזיקולת קלתרין

וגם לשחרור

A
cargo receptor
adaptor protein
clathrin
membrane bending and fission proteins
PIP phosphatase - promotes uncoating
Hsp70 - uncoated ATPase
Auxillin - activates ATP hydrolysis
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

תהליך הנצת וזיקולות קלתרין

A

cargo receptor binds to cargo,
adaptor protein joins
clathrin coat forms
fission proteins help vesicle to detach

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

תהליך קישור של חלבון אדפטור

A

תהליך מבוקר מאד.
AP2 למשל,
נקשר תחילה לפוספואינוזיטיד ספציפי, הקישור משרה שינוי מבני
שחושף אתרי קישור לרצפטורי מטען
תת היחידה ביתא נקשרת ל PIP
תתי היחידות סיגמא ומיו קושרות את הרצפטור עם המטען
האדפטור נקשר לרצפטורים וגם ל PIP
זה מעודד קישור של אדפטורים נוספים וקלתרין - כלומר קואופרטיביות

*כל אדפטור קושר 4 PIPים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

פוספואינוזיטידים

מיהם האנזימים?

A

ER מיוצרים ב
עוברים זרחון ודה זרחון בפחמנים 3,4,5 של טבעת האינוזיטול
לאיברונים שונים בתא יש סט שונה של קינאזות ופוספטאזות שעושות זרחון ודה זרחון.

האנזימים:
PI kinase
PIP kinase
PIP phosphatase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

BAR חלבונים בעלי דומיין

A

נקשרים באמצעות אינטראקציות אלקטרוסטטיות עם קבוצות הראש של הפוספוליפידים.
בנויים כ-coiled-coil
שעושה דימריזציה
לדומיין עם משטח פנימי עם מטען חיובי.

קשירה של אחד מעודדת קשירה של עוד - פידבק חיובי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

צביטה עי דינאמין וחלבונים ציטופלזמטיים נוספים

A
מתכנסים בצוואר הוזיקולה,
דינאמין מכיל דומיין קושר
PI(4,5)P2
ודומיין
GTPase
המבקר את קצב ניתוק הווזיקולות
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

כיצד מוסר הציפוי של וזיקולות קלתרין?

A

שנארז לתוך הוזיקולה PIP פוספטאז
פועל על PI(4,5)P2
ומדלל את כמותו, כך שהאדפטור משתחרר

בנוסף,
Hsp70 functions as uncoating ATPase assisted by Auxilin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

מה קושר דינאמין?

A

PI(4,5)P2

GTP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Sar1 החלבון
(Coat-recruitment GTPases)

COPII at the ER

A

חלבון ג’י מונומרי
הוא חלבון ממברנלי על הרשתית האנדו Sar1-GEF
הוא משחלף ל-GTP
זה חושף הליקס אמפיפילי שננעץ בממרנה ומגייס את
Sec23
שנקשר לרצפטור עם המטען Sec24
COPII עכשיו מגויסים - Sec13/31

ברגע שהוזיקולה משתחררת סאר1 משתחרר בהידרוליזה של
GTP
כל זה כמובן מתרחש בציטוזול!!!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

ARF-GAP

COP1 וזיקולה מצופה

A

כמו קלתרין, המעטפת מוסרת מיד עם הנצת הווזיקולה
עקמומיות הממברנה משמשת טריגר להתחלת ה
uncoating
ARF-GAP מגויס
הוא חש את עקמומיות הממברנה לפי צפיפות הליפידים ומופעל ברגע שזו מגיעה לרמה של הנצת וזיקולה, ואז עושה אינאקטיבציה ל ARF
והמעטפת מתפרקת.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

מה יחס הריכוז בין GTP

לGDP בציטוזול?

A

יש הרבה יותר GTP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

לא כל הווזיקולות הן ספריות

A

הרבה פעמים ישנה עדיפות להנצת וזיקולות באזורים בהם כבר קיימת עקמומיות לממברנה, למשל שולי ציסטרנות הגולג’י.
חלקן לא בעלת מבנה כדורי
למשל וזיקולת פרוקולגן - הפרוקולגן שמורכב באי אר נקשר לחלבוני אריזה טרנסממברנליים שמבקרים את ההתאספות של
COP2 רכיבי מעטפת ה
בנוסף מעורבים:
Sec24, Sar1, Sec31+monoubiquitin
וכל השאר, אלו בעצם אותם חלבונים בתופסת היוביקוויטין

מוטציה בחלבוני האריזה תוביל לפגמים בקולגן.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Rab חלבוני

מכווינים את תנועת הוזיקולות לממברנת המטרה

A

Rab1 - ER and Golgi
Rab2 - cis Golgi network
Rab5 - early endosome, plasma membrane, clathrin

אלו חלבוני ג’י מונומרים המצויים על ממברנות ומגדירים את הזהות שלהן.
המשפחה הגדולה ביותר, מכילה למעלה מ-60 חלבונים שונים
GDI מעכבים אותם חלבוני
שמרתקים אותם לציטוזול ומונעים התחברות לממברנה.

47
Q

Rab חלבוני

מכווינים את תנועת הוזיקולות לממברנת המטרה

A

Rab1 - ER and Golgi
Rab2 - cis Golgi network
Rab5 - early endosome, plasma membrane, clathrin

אלו חלבוני ג’י מונומרים המצויים על ממברנות ומגדירים את הזהות שלהן.
המשפחה הגדולה ביותר, מכילה למעלה מ-60 חלבונים שונים
GDI מעכבים אותם חלבוני
שמרתקים אותם לציטוזול ומונעים התחברות לממברנה.

בחלק מהמקרים דרוש חלבון ראב גם על ממברנת המטרה וגם על הוזיקולה

48
Q

חלבון GDI

A

GDT dissociation inhibitor

שומרים את חלבוני ראב בציטוזול

49
Q

Rab effectors חלבוני

A
מאד וריאביליים ולא שמורים
יכולים להיות בעלי פעילות של 
GEF, GAP
בעלי פעילות:
חכה שדגה וזיקולות בהתאם לראב
קינאז - זרחון מסייע להסרת המעטפת
חלבוני מנוע - motor
אינטראקציה עם SNARE

ההתאספות של חלבוני ראב והאפקטורים היא קואופרטיבית, והם מייצרים מעין פאץ’ ממברנלי

50
Q

Rab5 דוגמה של

A

מתאסף על האנדוזום, מכווין אליו וזיקולות שהגיעו מהמבברנה

מוטציית מחיקה של הגן שלו מובילה להעלמות מוחלטת של האנדוזום, מה שמראה שיש לחלבוני ראב תפקיד בביוגנזה של האיברונים.

51
Q

קסקדת הראב משנה זהות של ממברנות

A

דומיין ראב יכול להיות מפורק ומוחלף עי דומיין אחר, וכך לשנות את הזהות של האיברון.
למשל עם הזמן ראב5 מוחלף ב-7 על האנדוזום - זה ממיר מאנדוזום מוקדם למאוחר.
זה משנה את חלבוני האפקטור שיופעלו

52
Q

SNARE איחוי וזיקולות מתווך עי

A

ישנם לפחות 35 חלבוני סנייר שונים
כדי לאחות את הוזיקולה עלינו לקרב אותה לממברנה ולהרחיק את שכבת המים - זה מהווה מחסום אנרגטי לאיחוי
V-SNARE - vesicule
t-SNARE - target

המאפיין העיקרי הוא מוטיב הליקאלי שמאפשר להם להתלפף ליצירת קומפלקס 4-הליקאלי
ריאקציית ההתלפפות היא מועדפת אנרגטית
שכבה נוספת של ספציפיות באיחוי

53
Q

מחזור של חלבוני SNARE

A

האנזים NSF
שהוא
AAA ATPase
משתמש בהדירוליזת ATP
עמ להפריד, נחשוב עליו כמעין הליקאז שמפריד את ההליקסים הכרוכים אחד בשני
ישנם חלבונים נוספים שמסייעים לו - accessory proteins

בעל תפקיד רגולטורי, משתתף בבקרה על תהליך איחוי וזיקולות.

54
Q

איחוי של וירוסים

A

HIV - bind to surface receptors and enter cytosol

Influenza - receptor mediated endocytosis

55
Q

הגולג’י מייצר?

A
פקטין
המיצלולוז
קליקוסאמינגליקן
ספינגומיאלין
גליקוליפידים
ספינגומיאלין
56
Q

ER exist sites

A

אזורים מיוחדים באי אר, מהם מניצות וזיקולות.

איזורים אלו הם חסרי ריבוזומים.

57
Q

ליזוזום

A

איברון עטוף ממברנה,
מכיל אנזימים הידרוליטיים מסיסים, כ-40 סוגים, כולם
acid hydrolase - work best at acidic pH.
צריכים להיות מופעלים עי ביקוע פרוטאוליטי, שדורש גם כן סביבה חומצית.
pH of about 4.5-5.0
רוב החלבונים הממברנליים מסוכררים מאד, וכך מוגנים מפני האנזימים בלומן

58
Q

כיצה הליזוזום שומר על סביבה חומצית?

A

A vacuolar H+ ATPase in the lysosome membrane uses the energy of ATP
hydrolysis to pump H+ into the lysosome, thereby maintaining the lumen at its
acidic pH

שייכת למשפחת ה
V-type ATPase
שואבת פרוטונים לתוך הליזוזום ולא החוצנ
זרם הפרוטונים משמש גם להעברת מולקולות דרך טרנספורטרים בממברנה.

59
Q

ליזוזום קלאסי

A

הליזוזום לאחר שעיכל את רוב האוכל ונשארו רק אנזימי הקבע או מעט שאריות, הופך לליזוזום קלאסי.

60
Q

וקאולה בצמחים

A

רוב הצמחים מכילים וקואלות - וזיקולות גדולה ומליאה בנוזל
קשורות לליזוזומים, תפקידיהן:
ויסות לחץ טורגור
מכילות אנזימים הידרוליטיים
אחסון
הגענה - רעל
שליטה בגודל התא של הצמח, למשל עי התנפחות והעלאת הנפח

בשימוש בני אדם:
גומי, אופיום, תבלין השום

anthocyanin pigments - הצובעים עלי כותרת של פרחים

61
Q

אוטופגיה

פירוק חלבונים ואיברונים לא רצויים

A

לאוטופגוזום יש ממברנה כפולה
התא אוכל את עצמו,
מתחיל מהתאספות ממברנה כפולה ליצירת אוטופאגוזום:
אקטיבציה עי סיגנל - פרוטאין קינאז שמעביר מידע על המצב האנרגטי בתא, כולל mTOR
נוקלאציה והתארכות של ממברנה, מאופיין בנוכחות של
ATG9 - החלבון הטרנסממברנלי היחיד שמעורב בתהליך
אבל לא נשאר חלק מהאוטופגוזום, הוא יוצא
סגירה של מעטפת ממברנה, עם יוביקווטין
איחוי עם ליזוזום, מערב חלבוני SNARE
עיכול הממברנה הפנימית והתוכן

62
Q

ארבע דרכים להאכל בליזוזום

A

אוטופגיה
מאקרו פינוציטוזה
אנדוציטוזה
פאגוציטוזה

63
Q

אוטופגיה יכולה להיות סלקטיבית או לא סלקטיבית

A

לא סלקטיבית - למשל במצב רעב

סלקטיבית - מכילה מעט ציטוזול, משקפת את המבנה שנבלע. משמשת להיפטר מאיברונים, או פולשים.

64
Q

מיטופגיה

A
אוטופגיה של מיטוגכונדריה
כזו של מצליחה לשמור על גרדיאנט הפרוטונים
פרוטאין קינאז Pink1
מגיע לפני השטח ומגייס יוביקווטין ליגאז בשם
Parkin
שעושה יוביקווטינציה שמסמלת לאוטופוגיה

מוטציה בפינק1 או בפרקין - פרקיסנון מוקדם

65
Q

A Mannose 6-Phosphate Receptor Sorts Lysosomal Hydrolases in the Trans Golgi Network

ואיך מגיעים חלבוני הבית לליזוזום? עמ 728

A

כדי שחלבון יגיע לליזוזום עליו להכיל סימן M6P
שמוסף עו ב-CGN
ב-TGN
יש רצפטורים ל M6P

66
Q

signal patch

A

רצף חומצות אמינו בפפטיד של חלבון ליזוזומלי, המסמן שיש להוסיף מאנוז.

67
Q

Hurler’s disease

A

מחלת אגירה ליזוזמלית,

מחסור באנזים לפירוק גליקוזאמינגליקן

68
Q

inclusion-cell disease (I-cell disease).

A
הצורה החמורה ביותר של מחלת אגירה ליזוזומלית,
אין כמעט אף אנזים הידרוליטי.
משפיע על כל מע' הגוף
גנטית רציסיבית.
ההידרולזות מצוייות בדם.
מוטציה בגלונק פוספוטרנספראז, כך שהאנזימים לא מזורחנים
והרצפטורים לM6P
לא מזהים אותם.
69
Q

ליזוזום לא תמיד שווה השמדה

A

למשל מלנוציטים מאחסנים שם פיגמנטים ומשוחררים עי אקסוציטוזה.

ליזוזומים מיוחדים אלו רכשו את היכולת לשלוח וזיקולות לממברנה הפלזמטית

70
Q

ליזוזום לא תמיד שווה השמדה

A

למשל מלנוציטים מאחסנים שם פיגמנטים ומשוחררים עי אקסוציטוזה.
ליזוזומים מיוחדים אלו רכשו את היכולת לשלוח וזיקולות לממברנה הפלזמטית
פגמים יכולים לגרום למשל ללבקנות
אקסוזומים - אותרו בזרם הדם, יתכן ומשמשים להעברה בין תאים

71
Q

איזו מעטפת לוזיקולות מהגולג’י לליזוזום?

A

קלתרין!

72
Q

פינוציטוזה

A

שתייה תאית למחזור ממברנה לשמירה על הומיאוסטזיס ממברנות
מעטפת קלתרין לרוב, לפעמים קבאולי
Clathrin coated pits - כ-2% משטח הממברנה
כ-2500 וזיקולות קלתרין נצבטות כל רגע

73
Q

קבאולי

A

סוג אחר של וזיקולה פונוציטית
עם חלבוני מעטפת מסוג קבאולינים
משמשת את וירוס SV40
ואת רעלן הכולרה!

74
Q

מאקרופינוציטוזה

A

תהליך אנדוציטי שלא תלוי בקלתרין
נוצר מעין ראפל (גל) שבולע את התוכן
מונע עי שינויים באקטין
מופעל לזמן מוגבל כתגובה להפעלת רצפטור על פני התא
נוצרים macropinisomes
מגידילים באופן זמני את ספיגת הנוזלים פי 10
לוזיקולות האלו מסלול מיועד פירוק הן מחמיצות ומתאחות עם אנדוזום מאוחר או אנדוליזוזום,
המטען לא מתמחזר לממברנה
אין מחזור!

75
Q

אנדציטוזה מתווכת רצפטורים

איזו מעטפת?

A

קלתרין

76
Q

אנדציטוזה מתווכת רצפטורים

דוגמה LDL

A

התהליך
אנשים שנושאים גן פגום לרצפטור ל
LDL
חולים יותר בטרשת עורקים

77
Q

טרנספרין

A

דוגמה נוספת לאנדוציטוזה מתווכת רצפטור
החלבון טנרספרין לא מתנתק מהרצפטור, רק הברזל משתחרר
נשאר אפו-טרנספרין שעובר מחזור ביחד עם הרצפטור שלו דרך tubular extension
Kממברנה
כך שהוא עושה הולך וחוזר לאנדוזום המוקדם ולממברנה, ונמנע מהליזוזום.

78
Q

דאון רגולציה של רצפטורים עי אנדוציטוזה

דוגמה - EGF

A

הווזיקולה מתגבשת רק לאחר קישור הליגנד לרצפטור
משמש להורדת ריכוז הרצפטורים,
לרצפטור מתחבר מונויוביקווטין
חלבונים מזהי יוביקווטין לוקחים אותם לאנדוזום.
ליד האנדוזום, חלבונים ציטוזוליים קושרי יוביקווטין נקשרים
ESCRT - endosome sorting complex…
הם מייצרים וזיקולה אינטרה לומינלית שממשיכה לאנדוזום המאוחר והליזוזום

79
Q

כיצד נחסם מחזור של רצפטורים לממברנה לאחר אנדוציטוזה תלויית רצפטורים?

A

באמצעות סימונם ביוביקווטין

מונויוביקווטינציה בדרכ.

80
Q

מהם חמשת מדורי הגולג’י?

A

CGN - מיון, זרחון של אוליגוסכרידים על חלבונים ליזוזומליים
cis - הסרה של מנוז
medial - הסרה של מנוז, הוספקה של גלונק
trans - הוספה של גלקטוז, הוספה של נאנא
TGN - מיון, סולפיטציה של טירוזין ופחמימות

81
Q

סיגנל יציאה מה-ER

A

כניסה לווזיקולה שעוזבת את הרשתית יכולה להיות רנדומלית או מתווכת רצפטור.
יציאה מתוכננת מתרחשת עי אינטראקציה בין סיגנל יציאה על החלבון לבין רצפטור לסיגנל

82
Q

מיהם ה

Cargo receptors?

A
אלו חלבונים טרנסממברנליים מסוג לקטינים,
הם קושרים את האוליגוסכרידים על החלבונים המופרשים.
דוגמה:
לקטין הקושר מנוז על פקטורי קרישה 5,8
מוטציה בחלבון זה גורמת לדימום מוגבר
83
Q

מה מצריך איחוי הומטיפי של שתי ממברנות?

A

NSF
SNARE
Rab
Rab effectors

84
Q

מה ההבדל בין איחוי הומטיפי להטרוטיפי?

A

הומוטיפי - איחוי ממברנות מאותו מדור

הטרוטיפי - ממדורים שונים

85
Q

תארי את תהליך איחוי הומטיפי

A
תחילה מפריד חלבוני NSF
SNARE
על אותה ממברנה כדי לאפשר איחוי שלהם עם חברי זהים אבל על וזיקולה
אז פועלים
Rab and Rab effector
86
Q

vesicular tubular clusters מהם?

A

וזיקולות שיוצאות מה
ER
מסירות את המעטפת שלהן ומתאחות אחת עם השנייה ליצירת קלסטרים צינוריים ליצירת ה CGN
מתאחות אחת עם השנייה ויוצרות קלסטרים צינוריים שנעים במהירות על המיקרוטובולי לעבר הגולג’י ומתאחות עם ה
CGN.
בנוסף, הן מיד מתחילות להנץ וזיקולות שחוזרות לרשתית
אלו יהיו מצופות COPI
ורכיבי הציפוי שלהם מגוייסים כמעטפת מוכנה מראש המכונה
coatomer

87
Q

החזרת חלבונים מהגולג’י לרשתית

A

עי שני סיגנלים
KXXX - membrane proteins
KDEL - מסיסים, בקצה אמינית נקשרים לרצפטור מיוחד

88
Q

רצפטור KDEL

A

טרנסממברנלי מסוג מולטיפס הקושר רצף
KDEL
ונארז לוזיקולה COPI
האפיניות שלו לרצף משתנה כתלות במיקום, כך שהוא משחרר את המטען ב ER
ככל הנראה השינוי מסמתך על הבדלים בחומציות

TGN נשים לב שמה
כבר אין דרך חזרה והחלבון שיתקע שם יעבור אקסוציטוזה ככל הנראה

89
Q

חלבונים נשמרים במדורים בהם הם מתפקדים
מה יקרה למשל אם נוריד לחלבון את סיגנל ה
KDEL?

A

הוא עדיין ישאר ברובו ב ER

ככל הנראה חלבונים במדורים הבית שלהם מתאגדים במגה קומפלקסים ששומרים אותם באותו מדור.

90
Q

כיצד מוחזק הגולג’י?

A
עי מיקרוטובולי וחלבוני מנוע
בלעדיו, הוא יתארגן לערמת ציסטרנות ליד נקו' היציאה מה
ER
לכן יש השקעת אנרגיה בשמירה על מיקומו
וגם עי חלבוני מטריקס הגולג'י - הגולגי'נים
Rab קושרים 
ועוזרים לנתב וזיקולות
מזורחנים בזמן המיטוזה
מבוקעים עי קספאזות באפופטוזיס
91
Q

עיבוד שרשראות סוכרים בגולג’י

A

שני סוגים:
Complex
High manose - לא עובר גליקוזילציות נוספות בגולג’י

לשניהם אזור ליבה משותף
N-linked
שהוסף ברשתית וכולל שני גלונק ושלושה מנוז

92
Q

סולפטציה בגולג’י

A

מאפשרת הוספת מטען שלילי, שיכול למשל לספוח מולקולות מים
על שייר טירוזין
תלוי בתורם הפוספט שמועבר לגולג’י מהציטוזול:
PAPS3

93
Q

האם יכולה להתרחש
גליקוזילציה N
בגולג’י?

A

כן! לגלוקנק בלבד!

94
Q

על אילו ח.א יכולה להתרחש

גליקוזילציה O?

A

סרין
תריאונין
הידרוקסיליזין
הידרוקסיפרולין

בעיקרון צריך הידרוקסיל!

95
Q

אנדוציטוזה מתווכת רצפטור, להכנסת

LDL

A

התהליך:
כאשר לתא יש צורך בכולסטרול הוא מייצר ושולח רצפטורים ל
LDL
הם מתחילים להתאגד לווזיקולה עוד בטרם קשירת ליגנד
מעטפת קלתרין
הרצפטורים מזהים רכיב בליפופרוטאין בשם:
100ApoB
הוזיקולה תתאחה לאנדוזום המוקדם
בזכות החומציות הרצפטור ישחרר את הליגנד ויעבור מחזור
האפוליפופרוטאין מפורק והכולסטרול מנוצל

*גן פגוע לרצפטור יוביל לנטייה מוגברת לטרשת עורקים.

96
Q

איזה סימון צריכים חלבוני
ESCRT
כדי לייצר וזיקולה אינטרלומינלית?
מה קורה אם יש בהם מוטציה?

A

גם PI3P
וגם יובקווטינציה

מוטציה תוביל לחוסר יכולת של התא לווסת רצפטורים, יכול למשל לגרום לסרטן

97
Q

טרנסציטוזה

A

הגעה לדומיין אחר של הממברנה
דוגמה של נוגדנים בתינוק, שעוברים מהצד האפיקלי לבזולטרלי
ממברנה -> אנדוזום מוקדם -> אנדוזום ממחזר -> ממברנה בצד השני

98
Q

אנדוזום ממחזר

A

יכול למשל לשמור על וזיקולות
GLUT4
או בכלייה דברים אחרים
כלומר אנדוזום ממחזר לא עובר בהכרח דרך הליזוזום

99
Q

פאגוציטוזה

A

יצירת פאגוזום לבליעת חלקיקים גדולים
תאים םגוציטים: נויטרופילים, מאקרופאגים
מאקרופאגים - בולעים תאים מתים, ומלא אריתרוציטים
תהליך המופעל עי מטען, למשל נוגדן שיפעיל את הרצפטור
התהליך:
הצטברות של פוספואינוזיטידים ספציפיים בממברנה, עי
PI 3 kinase
גורמת לפלמור ורה-ארגון של אקטין שיוצרת פסאודופוד
נסגר לוזיקולה
צריך:
Actin
PI(4,5)P2
PI kinase
Rho

מתאחה עם ליזוזומים

100
Q

החיידק לגיונלה והליזוזום

A

פיתח מנגנון התחמקות
Rab מזריק לתא אנזים המשנה את חלבוני
ומכווין למקום אחר.
החיידק נשאר בפגוזום ובעצם מוגן לחלוטין בתוך התא

101
Q

כיצד תאים חיים מתחמקים מפאגוציטוזה?

A

עי איתות אל תאכל אותי

קושרים את הרצפטורים על פני המאקרופאגים ומפעילים מנגנון איתות פנימי של טירוזין פוספטאזות שמעכבות את התהליך

102
Q

אקסוציטוזה
טרנספורט מה TGN
לחוץ התא

A

איחוי וזיקולות עם הממברנה הפלזמטית
יכולה להיות מושרית או קונסיטוטיבית
קונסיטוטיבי לא סלקטיבי - מעביר את רוב החלבונים לממברנה, ברירת מחדל, מחדש ממברנה

103
Q

ריכוז חלבוני הפרשה בווזיקולה

A

ה- secretory proteins
TGN נארזים ב
הוזיקולה מתחילה רופפת ותוכנה הולך ומתרכז תוך כדי שהיא מאבדת ממברנה

104
Q

electron dense material

A

איזורים צפופים ודחוסים שניתן להבחין בהם במיקרוסקופ אלקטרונים

105
Q

חומציות הגולג’י

A

הוא חומצי יותר מה ER
מכיל משאבות פרוטונים מסוג
V type ATPase

106
Q

ביקוע פרוטאוליטי בהיווצרות וזיקולה

A

פפטידים להפרשה המיוצרים בפרקורסרים עוברים ביקוע בווזיקולה, ולעיתים בנוזל החוץ תאי.
דוגמה:
enkephalins - נוירופפטיד, 5 ח.א, פעילות דמויית מורפין, קטנים מדי בכדי להיות מועברים ל ER

107
Q

pro-hormones polyprotein

A

פרקורסר אחד שנחלק לכמה הורמונים פפטידים

108
Q

התבגרות של הליזוזום, אם נקח מולקולה מסומנת פלוריסנטית..

A

נתחיל בליזוזום המוקדם, ממש מתחת לממברנה

תוך כמה דקות נעבור למאוחר, קרוב לגלוג’י וליד הגרעין

109
Q

אנדוזום מתבגר

וגופים מולטי וזיקולריים

A
אנדוזום בוגר מכיל וזיקולות אינטרלומינליות רבות,
אלו נצבטו פנימה עי חלבוני 
ESCRT
לכן אנדוזום בוגר מכונה גם 
multivesicular body

נזכיר שלצורך יצירת וזיקולה אינטרלומינלית דרוש יוביקווטין שמוסף על הצד הציטוזולי. זה משמש עוד כדי להנץ אותם מהבממברנה, ושוב באנדוזום עי חלבונים ESCRT

110
Q

NSF החלבון

הוא…

A

ATPase

שמבצע הידרוליזה כדי לקדם את התהליך הלא מועדף אנרגטית של ניתוק חלבוני SNARE

111
Q

AP2 הרכב החלבון

A

מורכב מארבע תתי יחידות: אלפא, ביתא, מיו וסיגמה.
כאשר יחידות מיו וסיגמה קושרות את הרצפורים עם המטען,
ויחידה ביתא קושרת את ה]פוספואינוזיטיד

בגלל שדרוש קומבינציה של תנאים להיקשרותו, הוא מכונה
coincidence detector
הקומפלקס מתרכב רק כשכל התנאים מתקיימים

תחילה נקשרים הפוספואינוזיטידים, 4 במספר.

112
Q

יציאת חלבון שלא התקפל כהלכה מה

ER

A

תחילה, בלומן האי אר הם נקשרים ל:
PDI, צ’פרונים, לקטינים
לאחר מכן הם יוצאים דרך קומפלקס טרנסלוקטור.
בציטוזול: עוברים יוביקווטינציה ודה-גליקוזילציה

113
Q

מיקרוזומים

A

כאשר עושים הומוגנציה לתא ואי אר מתפרק לחלקיקים קטננם בשם מיקרוזומים.
שעדיין מסוגלים לעשות טרנסלוקציה, סינתזה בסיפ 450, סכרור חלבונים, שחרור ואפטייק של סידן וייצור ליפידים.
ומהווים דגם אותנטי לפעילות האיאר.

בגרדיאנט סוכרוז המיקרוזומים יופרדו לשתי אוכלוסיות, חלק ומחוספס. כאשר המחוספס יתמקם בריכוז סוכרוז גבוה יותר.

114
Q

מחלת הליגיונרים

A

מצליח להתחמק מאיחוד הפאגוזום שבלע אותו עם הליזוזום,
עי הזרקת חלבון שמשנה את
Rab
וכך ממשיך לחיות לו בתוך הפאגוזום, שמח ומוגן.