השלמות ממחברות Flashcards
מה קורה בשבץ איסכמי?
אספקת החמצן נפגעת ולכן גם ייצור ה
ATP.
התאים לא יכולים לשמור על נפח ולכן ייכנסו לשיווי משקל גיבס-דונאן ויתפוצצו.
טרנספורטרים מסוג
ABC CASETTE
קיימים מעל 100 סוגים שונים כל סוג ייחודי למשפחה/חומר מסוים קושרים ATP לא עוברים זרחון אלא עושים הידרוליזה דומה - משאבת כלור ב CF CFTR
פיקוסימונס של דברים
10^9 פורות
10^6-10^8 תעלות
10^2-10^4 נשא, תלוי ATP
למה שווה קבוע האורך?
שור של Rm/Ra
למה שווה קבוע הזמן טאו
Rm*C
קיבול הממברנה
מיאלין מוריד את יכולת הקיבול
קיבול מוגבר מקטין את מהירות ההולכה משום שמתנגד לשינויים במתח הממברנה
AFM
מאפשר איסוף מידע לגבי כוחות אלקטרוסטיים, ואן דר ואלס
פתיחת קיפול של חלבון ומדידת אנרגיית הקיפול
מוקרן לייזר בזוית, מוחזר בזווית ישרה
מדידה מתבצעת באמצעות גלאי להסטה של קרן לייזר.
מיוטוניה קונג’ניטה
מוטציה בתעלת כלור תלוית מתח
*הכלור חשוב לדה פולריזציה… ולא הבנתי
ממברנת התא הופכת היפר-אקסיטבילית.
מוחמר עם אדרנלין.
רנא פולימראזות
pol I: 5.8, 18, 28 - בגרעינון, מפרקורסר ארוך
pol ll:
pol III: 5s, tRNA
Cre-Lox שיטת
שיטת רקומבינציה באתר ספציפי
יצירת מוטצציה מושרית
Cre - רקומבינאז המזהה רצפי לוקס ספציפיים
מאפשרת מחיקה של גן ספציפי מתא ברקמה מסוימת, למשל רק בכבד. עי הצמדת ביטוי חלבון הרקומבינציה לגן שמתבטא רק בכבד או שניתן להשרות את הביטוי שלו.
בקרות על רקומבינציה הומולוגית
האנזימים מיוצרים כפרקורסרים לא פעילים
BRCA2 שומר על
Rad 51 לא פעיל
הפעלה עי זרחון
העובדה שדרושים חלבונים אחרים לטעינה, למשל
Rad52
למה יכולה לגרום טעות ברקומבינציה הומולוגית?
אובדן של הטרוזיגוטיות, למשל אם נעשית רקומבינציה עם הומולוג ולא עם אחות
Mre11 מיהו החלבון?
אחראי לעיבוד הקצוות ברקומבינציה מיוטית.
מי עוד נמצא שם?
על כל גדיל Spo11
PLN
זהו פפטיד אנדוגני - פוספולמבן
מבקר פעילות של SERCA
בעיקרון מפחית את האפיניות שלה לסידן באפטייק
זרחון עי PKA
מעכב אותו ומאפשר החזרה מהירה של הסידן, והרפייה יעילה.
לסיכום, הוא גורם לכיווץ ארוך והרפיה איטית
ADAR מה עושה האנזים?
Adenosine deamination acting on RNA.
A דה אמינציה של I ל A-->I זה מנגנון של ערכית רנא לאחר שעתוק, הוא מזהה רנא דו גדילי.
העריכה הזו חשובה ליצירת תעלת מתח במוח ומוטציה בו גורמת לאפילפסיה.
Fractal globule
בזמן האינטרפאזה רוב הכרומטין דחוס למבנה זה, שמאפשר גם דחיסה מקסימלית ובה בעת יכולת
to unfold and foldץ
מה ישפעל טלומר קצר?
מנגנון עצירת חלוקה או אפופטוזיס דרך
ATM/ATR –> Ckh1 –>p53
gene conversion מה קורה ב
סטייה מהתוצרים הצפויים במיוזה
מה תפקיד שלטרין וכיצד הוא מבצע אותו?
הגנה על קצות הטלומרים,
עי יצירת לולאה - t-loop
פילאגרין
חלבון אקססורי לסיבי ביניים
מטציה = אקזמה
SR חלבוני
מצמדים בין שעתוק לשחבור
מתיישבים ומסמנים רצפים שמורים באקסון
ESE - exon splicing enhancer מזהים
ספטינים
GTP חלבונים קושרי
מייצרים איזורים מובחנים, למשל הפרדה בפריימרי סיליה
חיוניים גם לציטוקינזה.
ש:
EMF בממברנה של חיידק, למה משמש?
תנועה של הפלאג’לה
ש: מה מודדים פוטנציאלי רידוקס?
אפיניות לאלקטרונים!!
איזה צורה של טבעת הניקוטינאמיד בולעת אור?
מה מסמל הפלוס ליד המולקולה?
הצורה המחוזרת
הפלוס מסמן צורה מחומצנת, לא מטען!!!
מהו קיפול רזומן?
דומיין מיוחד בהידרוגנזות לקשירת NAD/NADP
ממה נגרמת מחלת הלשון השחורה בכלבים?
דיאטה דלה בטריפטופן
בעצם מדובר במחסור בניאצין.
בבני אדם גורם לפלגרה.
גולג’ינים
חלבוני המטריקס של הגולג'י coiled-coil מבנה של Rab נקשרים ל עוברים זרחון במיטוזה מצויים בציטוזול ומחזיקים הכל במקום
אילו ח.א בעלות שני מרכזים כיראליים?
איזולאוצין ותריאונין
תראו איזו כיראליות
היכן בתא יש רצפטורים ל
M6P?
מחוץ לתא
בגולג’י
באנדוזום המוקדם
מה יש באתר הפעיל של תרופות ממשפ מעכבי פרוטאזות לטיפול ב
HIV
הידרוקסיל וטבעת ארומטית
כיצד נקשרים
ATPת ADP
להקסוקינאז?
תמיד עם יון מגנזיום.
שתפקידו
אנזים - ליזוזים
הסוב’ הוא פפטידוגליקןת מבקע קשר גליקוזידי בין
NAM, NAG
ח.א פעילות: גלוטמט ואספרטט
הריאקציה היא החלפת הקשר הגליקוזידי/הסוכר בהידרוקסיל שמקורו במים
למה משמשת חומצה קלבונית המוספת לאנטיביוטיקות מסוג פניצילין?
מעכב מתאבד
האנזים אספרטט טרנסקרבומואילז במצב קושר
CTP
אינו פעיל!!
T יימצא במצב
לפיכך הוא מודולטור אלוסטרי CTP
מה המבנה של ספינגוליפיד?
ח.ש יחידה מחוברת לספינגוזין - ספינגוזין שהוא אמין שומני
מהו ה
platelet activating factor?
מולקולת סיגנל מסוג אתר ליפיד
ether lipid
ממה נגרמת מחלת ניימן פיק?
פגם באנזים ספינגומיאלינז שגורם להצטברות של ספינגומיאלין במוח.
מה קובע את זוג הדם?
השרשרת הסוכרית על גליקוספינגוליפידים
גנגליוזידים
נמצאים בשכבה החיצונית של הממברנה
הרכבם משתנה עם הזמן, למשל עם ההתפחות העוברית
תאים סרטניים מציגים סט חדש שלהם
מחלת פברי
פגם באנזים אלפא גלקטוזידאז
איפה ניתן למצוא קרדיוליפין?
בממברנה החיצונית והפנימית של המיטו’
ER ב
ובליזוזום
איזה פוספוליפיד לא נמצא בכלל הממברנה החיצונית?
פוספוטידיל אינוזיטול
FAK - focal adhesion kinase
מעורב בתהליכי סיגנל של אינטגרין
טירוזין קינאז, מזרחן את עצמו יוצר אתר עגינה ל
Src
Actin-linked cell–matrix junction נמצא ב
מה נמצא על כילומיקרונים?
Apo C II
Apo C III
Apo B 48
מה ההבדל בין ספקטרומטר מסות סטנדרטי לבין טאנדם?
תא גז שחותך לפפטידים קצרים
שני אנלייזרים בטנדם לעומת אחד
ראשון - בחירת היון הספציפי, פרקורסר
שני - מדידת המסה של הח.א
שיטת אנאיזוטרופיה פלוריסנטית,
מה בודקת, כיצד
על מה מתבססת
בודקת אינטראציה בין חלבונים באמצעות , או בין חלבון ומולקולה קטנה.
מולקולה קטנה שלא קשורה לכלום תסתובב במהירות ונוכל למדוד את השינוי בפלוריסנציה לעמות מולקולה מקובעת
מתבססת:
מולקולה שאינה קשורה תסתובב מהר יותר, ותתן פליטה לא מקוטבת
Depolarized emission vs polarized emission
מה ימצא בדם ב
Refsum disease?
רמות גבוהות של חומצה פיטנית.
להעשרה: ח.ש מסועפת שמקורה בצריכת מוצרי חלב.
Nucleoside diphosphate kinase
ATP + NDP <=> ADP + NTP הריאקציה הזו קרובה לשיווי משקל ונסמכת על יחס גבוה ATP/ADP משהו עם פינג פונג ויש לו היסטידין באתר פעיל דוגמה לטרנספוספורילציה בין נוקלאוטידים
תכונה קולגטיבית
תכונה התלויה בריכוז המומס בתמיסה
EGF קישור של
קישור לרצפטורים מונומרים גורם להם לדימריזציה,
זו בתורה משרה שינוי מבני שגורם שמפעיל את דומיין הקינאז ב
RTK
ומאפשר לאחד לזרחן את עצמו ואת האחר.
אחד נקשר לכל מונומר EGF
Contractile ring Vs parallel bundle
טבעת מתכווצת - עם אלפא-אקטינין, יש מקום למיוזין להיכנס
צרור מקבילי - פימברין, צפוף אין מקום למיוזין
אילו חלבונים קושרים אקטין לממברנה?
ERM ספקטרין ו
פילאמין
יוצר מבנים תלת ממדייים של אקטין, חשוב לנדידת נוירונים, מוטציה גורם להם לא לנדוד, מוח לא חלק, אין פגיעה קוגניטיבית רק אפילפסיה.
GTP חלבון ג’י במצב קושר
למה יגרום חיתוך של פוספט אלפא - משמע הידרוליזה ל
GDP
GTP במצב
יש שני קשרי מימן בין ח.א בחלבון לבין הטריפוספט בנוקלאוטיד.
ההידרוליזה מנתקת את קשרי המימן וכך גם את הנולקאוטיד במצב ה GDP
ממה בנוי סיב משי?
שכבות של סדיני ביתא אנטי מקבילים עשירים באלנין וגליצין.
מתאפשרת גמישות כי הסדינים קשורים עי ריבוי אינט’ חלשות ולא קוולנטית.
ביוסינתזה של כולסטרול
מה חומר המוצא?
כמה פחמנים ומה המבנה?
מהם השלבים המרכזיים?
חומר המוצא - אצטט
הרכב: 27 פחמנים, 4 טבעות לא ארומטיות! והידרוקסיל
יצירת מבלונט
יצירת איזופרן
יצירת סקוואלן - הריאקציה השלישית היא הצעד המחייב
יצירת כולסטרול
בקרה על ביוסינתזת כולסטרול דרך
SCREBP, SCAP, INSIG
סקאפ יושב באמצע על ממברנת ה ER
בין השניים האחרים ומחזיק אותם. הוא חלבון קושר כולסטרול
כשאין כולסטרול העיכוב שלו מוסר,
SCAP ו-SPERB
עוברים לגולג’י, שם ספרב עובר חיתוך,
החלק שנחתך נודד לגרעין ומשמש פקטור שעתוק לחלבונים בביוסינתזה של כולסטרול
בקרה עי LXR
פקטור שעתוק גרעיני שמופעל עי קישור של אוקסיסטרול
(משקף ריכוז כולסטרול גבוה)
עושה אינטגרציה למטבוליזם של ח.ש, סטרולים וגלוקוז.
אלפא - מתבטא בכבד, רקמות שומן ומאקרופאגים
ביתא - שאר הרקמות.
במצב קושר אוקסיסרול מייצר הטרודימרים עם רצפטור גרעיני - RXR
LXR-RXR דימר של
משפעיל שעתוק של גנים, כולל ACC
HMG-CoA reductase,
אנזים אינטגרלי ממברנלי באי אר החלק.
רמות גבוהות של כולסטרול בתא
LDL מפחיתות ביטוי של רצפטור ל
ACAT מפעילות את
שתפקידו להגדיל אסתריפיקציה של כולסטרול לאחסון
איך מבצעים שיטת
Tandem affinity purification
זו שיטה מאד מדויקת להפרדת חלבון.
לחלבון מצמידים טאג אפיטופי וכן אתר חיתוך לפרוטאז אחרי הטאג.
תחילה מפרידים את החלבון באמצעות הטאג בקולונת אפיניות
בשלב השני חותכים את הטאג באמצעות רצף החיתוך.
זה מאפשר לקבל חלבון מטוהר מאד.
על מה מתבססת שיטת
Salting in/out
על כך שלכל חלבון יש ריכוז מלח אידיאלי בו הוא מסיס
מי יותר צפוף, אגרוז או פוליאקרילאמיד?
פוליאקרילאמיד!
באגרוז אפשר להכניס ארגז.
