מיטוכונדריה Flashcards
המיטוכונדריה והכלורופלסט חולקים
chemiosmotic coupling
מונח המתאר את הקשר בין יצירת קשרים כימיים שמייצרת
ATP
ותהליך הטרנספורט דרך הממברנה
כלורופלסט מול מיטוכונדריה
כלורופלסט - אנרגיה מאור ומים, מייצר חמצן
מיטו’ - אנרגיה מפחמימות ושומניםף מייצר פדח ומים
כמובן שניהם מייצרים ATP
אבל! יש להם אב קדמון משותף
איזה נפח מהתא תופסות המיטוכונדריה?
כ-20% מהציטופלזמה
המיטו וה-ER
יש נקודות מגע לשתי הממברנות.
שם יש הן מחליפות ליפידים.
כמו גם נקודות אלו מעוררות הנצה של מיטוכונדריה
הממברנה החיצונית של המיטו
חדירה למוקולות עד 5000 דלטון בזכות פורות,
חלבונים חביות ביתא מיוחדים
תהליך ביוכימי לפרקציה של מיטוכונדריה
תחילה שמים במדיום עם אוסמולריות נמוכה,
המיטו’ מתנפחת, הממברנה החיצונית נשברת
מפרידים את חתיכות הממברנה ותוכך התווך הבין ממברנלי
מכינסים לנוזל היפראוסמוטי, המיטו מתכווצת,
אז עושים שוב צנטריפוגה ומקבלים שלוש מבחנות:
ממברנה חיצונית, מטריקס, ממברנה פנימית.
תפקידים נוספים של המיטו
למשל, כאשר יש מספיק אנרגיה עודפי ציטרט יוצאים בחזרה לציטוזול. שם הם משמשים ליצירת אצטיל קו ובניית ח.ש.
לוקחת חלק במעגל האוראה.
ברעב, חלבונים מפורקים לח.א המועברות למיטו להפקת אנרגיה בצורת
NADH, ATP
ייצור חום
ביוסינתזה של קבוצות hem
צברי ברזל גופרית
קרדיוליפין
וגם: פוספטידיל אתנולאמין, פוספטידיל גליצרול.
אחרון - בופר סידן
במיטו’ אנרגיה שנוצרת מחצמון נשמרת
כגרדיאנט אלקטרוכימי
כיצד עוברים האלקטרונים בין הקומפלקסים וחמצן
הם עוברים כל פעם לקומפלקס עם אפיניות גדולה יותר לאלקטרונים.
כאשר לחמצן, המקבל הסופי, יש את האפיניות הגבוהה ביותר
גרדיאנט הפרוטונים
high pH in the matrix
low in the intermembrane space - same as cytosol
הגרדיאנט האלקטרוכימי
שילוב של גרדיאנט כימי של פרוטונים שמחזק את פוט הממברנה.
מייצר
proton motive force
שדוחף פרוטונים בחזרה למטריקס
פוט’ חשמלי על ממברנת המיטו?
שלילי במטריקס, חיובי בתווך הבין ממברנלי - בין השאר בזכות הפרוטונים
proton motive force
מה מניע אותו?
לאיזה כיוון?
הכיוון הוא דחיפת פרוטונים לתוך המטריקס.
מניע אותו הפוט החשמלי וגם הפוט הכימי, שניהם לכיוון המטריקס
המע’ הגנטיות של כלורופלסט ומיטו’
דומות, מעידות על מוצא חיידקי של השתיים.
למשל, ריבוזומים רגישים לאותן אנטיביוטיקות, מתחילים את התרגום עם
פורמיל מתיונין-N
האנזימים האחראיים על התהליכים הגנטיים במיטו?
מקודדים עי גנים בגרעין, כמו מרבית חלבוני המיטו’
למרות הדימיון שלהם לאנזימים חיידקיים, יותר מאשר יוקריוטיים.
המעבר של גנים מיטוכונדריאליים לגנום בגרעין
התרחש ככל הנראה לא מזמן,
בגנומים מיטו’ פשוטים לא נמצא גנים גודמת רנא פולימראז בגנום המיטו’. זה המצב באורגניזמים דוגמת שמרים ותאים אנימליים.
בגנומים מורכבים, הגנים האחראים על שכפול ותרגום דנא נמצאים במיטו’
ככל שהאורגניזם גבוה יותר, כך הגנום המיטו’ שלו פשוט יותר ומכיל פחות גנים.
גנומים מיטו’ מורכבים יותר מכילים למשל את הגן לרנא פולימראז, וחלבוני תתי היחידות של הריבוזום.
ביוגנזה של חלבוני שרשרת הנשימה במיטו אנושית
רנא משועתק בגרעין,
יוצא ומתורגם בציטוזול
נכנס למיטו דרך טום וטים
הדנא המיטו?
מקודד ל-13 מולקולות מרנא,
כולן מקודדות לתתי יחידות של שרשרת הנשימה
ובנוסף 24 מולקולות רנא ריבוזומלי הנחוצות לתרגום המרנא הזה.
סטטוס המיטו’ בתאים הינו דינמי בגלל?
Constant fission and fusion
שיווי המשקל בין שני התהליכים קובע את מצב המיטו’ בתא
החלבון דינאמין 1?
בעל דומיין הידרוליזת GTP
מסתובב בציטוזול כדימר המסתדר
באוליגומר הליקלי, באמצעות חלבון אדפטור מיוחד, זה גורם לכיווץ מקומי.
הידרוליזת
GTP
מספקת את הכוח המכני למעין צביטה שמפרידה לשתי מיטוכונדריות
Fusion of two mitochondria
מדובר בתהליך דו שלבי, השלב הראשון, קודם הממברנה החיצונית מתאחה, תלוי באופן לא ידוע בגרדיאנט הפרוטונים שלב שני ,הפנימית בסיוע של חלבון קרוב של דינאמין מצריך את הרכיב החשמלי של פוט הממברנה הפנימית.
שני השלבים דורשים
GTP
לגנום המיטו’ האנושי יש כמה מאפיינים שמבדילים אותו
אריזה צפופה של גנים - לא מכילי כמעט דנא לא מקודד, כמעט כולו רצף מקודד, כך יש מעט מקום לרצפים רגולטורים.
שימוש נינוח בקודון - רק 22
tRNA
נחוצים, החוקים יותר נינוחים ויש שימוש בוובל נרחב.
קוד גנטי וריאנטי - הקוד הגנטי שונה, באופן מפתיע, ל-4 מתוך 64 הקודונים יש משמעות שונה.
קודון UGA הוא?
סטופ קודון ברוב התאים,
מקודד לטריפטופן במיטוץ
AGG?
קודון סטופ במיטו,
מקודד לארגינין בשאר
וסרין במיטו של דרוזופילה.
כמה ממברנות יש לכלורופלסט?
שלוש!
מכיל ממברנה נוספת פנימית הנקראת טילקואידית,
פנימית לה נמצא החלל הטילקואידי,
חיצונית נמצאת הסטרומה.
המדורים הפנימיים של הכלורופלסט מופרדים.
מע’ האור נמצאות על הממברנה הטילקואידית
היכן מיוצר ה
ATP
במיטו’ ובכלורופלסט?
במיטו - במטריקס
בכלורופלסט - בסטרומה.
מה צורת הגנום המיוכונדריאלי?
לאילו חלבונים הוא מקודד?
עגול, כמו של חיידק
חלבונים הידרופוביים המצויים על גבי הממברנה הפנימית,
ולוקחים חלק בשרשרת מעבר האלקטרונים
הריבוזום במיטו’ ובכלורופלסט
,
מזכיר את החיידקי,
מתחיל את התרגום מפורמיל מתיונין
הנצה של כלורופלסט
שומר על מנגנון חלוקה פרוקריוטי
כולל החלבון FtsZ
החיוני לחלוקה תאית בחיידקים, חלבון ג’י ממשפחת הטובולין
בניגוד למיטו’ חלוקה של כלורופלסט מתחילה מבפנים, ולא מבחוץ
ומערבת חלבוני ג’י
מאפייני הגנום המיטו’
לא מכיל אלמנטים לא מקודדים
אין כמעט רצפים רגולטוריים
שימוש נרחב בוובל
קוד גנטי שונה (לא אוניברסלי), ל-4 קודונים משמעות שונה
הורשה מיטוכונדריאלית
אמהית,
הביצית מכילה כ-100,000 מיטו והזרעית מעט
דנא מיטו’ מעוכב בתאי זרע
מיטו’ בתאי זרע עןברות אוטופגיה - מיטופגיה
בשמרים הורשה בי-פרנטלית, אם זאת אחרי כמה חלוקות תשאר רק גרסה אחת - הורשה ציטופלזמית
כלומר, הורשה מהציטופלזמה ולא מהגרעין
זה נחשב להורשה לא מנדלית.
המיטו’ וזקנה
מייצרת המון רדיקלים ואלו תורמים להזדקנות התא
עם הזמן האורגנזים צובר מוטציות בגנום המיטו’
ככל הנראה התפקיד העיקרי של איחוי מיטו’ הוא לפזר את הדנא הפגום בין כמה מיטו’ ולרכך את הפגיעה
העברת חלבונים מהציטוזול למיטו
מתבצע כלאחר תרגום - post translational
הסיגנל בקצה האמיני - אלפא הליקס אמפיפלי, ח.א חיוביות בצד אחד, הידרופוביות בצד השני.
הרצף פחות חשוב מצורת הארגון.
Mitochondrial precursor proteins
כינוי לחלבונים מיטוכונדריאליים המיוצרים בציטוזול, טרם העברתם למיטו’
Signal sequence
רצף המצוי על חלבונים המייעד אותם למיטו’
כ-20 ח.א, חלקן חיוביות (ארגינין, ליזין) משום שהמטריקס בעל מטען שלילי ביחס לתווך הבינממברנלי. וכך לחלבונים תהיה משיכה טבעית.
מדוע בכלל למיטו גנום משלה?
זה נראה בזבזני ובעל פוט’ למוטציות
אחת ההשערות היא שהמיטו’ מקודדת לחלבונים הידרופוביים,
שאחרת היה בעייתי להעביר אותם מהציטוזול
או שיכול להיות שאנחנו עדיים בעיצומו של תהליך ההעברה
חלבוני העברה במיטו’
ממברנה חיצונית:
חיוני להעברת כל החלבונים - TOM
מעביר לתווך הבין ממברנלי או טוען על ממברנה
מאפשר הטענה וקיפול נכון של חלבונים על הממברנה - SAM
החיצונית
ממברנה פנימית: העברה של חלבונים מסיסים אל המטריקס - TIM23 וחלבונים ממברנליים על הפנימית. עובד בצמוד לצ'פרון שמשתמש ב ATP כדי למשוך חלבונים פנימה
חיוני להטענה של תת משפחה של חלבונים לממברנה - TIM22
פנימית, ביניהם:
ATP/ADP translocase, טרנספורטר פוספט פרוטון
חיוני להטענת חלבונים שמיוצרים במיטו’ על הממברנה - OXA
הפנימית
מהיכן מגיעה האנרגיה לצורך העברת חלבונים למיטו?
הידרוליזה של ATP
וכן פוטנציאל הממברנה.
קישור ושחרור של חלבון לצ’פרון דורש ATP,
לאחר מכן דרוש
ATP נוסף
כדי למשוך את החלבון לתוך המיטו, אם מדובר בחלבון במטריקס
mitochondrial hsp70
אם מוטנטי המיטו לא מצליחה למשוך חלבונים
קשור כחלק מקומפלקס TIM23!!
בעל אפיניות גבוהה לחלבון לא מקופל
לאחר מכן חלבונים רבים יועברו ל
Hsp60!!
כלומר למיטו את שני סוגי הצ’פרונים
הכנסת פורינים עי מיטו’ וחיידקים
עוברים דרך TOM
בתווך הבין ממברנלי שם יפגשו צ’פרונים שמונעים מהם אגרגציה
אינטראקציה עם SAM
מטעינה את הפורין, שם הוא מגיע לקיפול הנכון
דמיון לחיידקים:
SAM = BAM
BAM
טרנסלוקטור חיידקים,
בעל דמיון ל-SAM
יושב על הממברנה החיצונית,
מטעין חלבונים על הממברנה החיצונית
לטרנספורט לממברנה הפנימית ולתווך הבין ממברנלי בשני מסלולים
קלאסי - הסיגנל בקצה האמיני, נכנס וישר עובר ביקוע,
רצף הידרופובי מיד אחרי משמש כסיגנל סטופ - וכחלק הנעוץ בממברנה
רק הסיגנל בצד האמיני נכנס למטריקס
אלטרנטיבי - החלבון עובר כולו למטריקס, הסיגנל פפטיד מבוקע, נחשף קצה אמיני הידרופובי חדש, שמכווין אל קומפלקס
OXA
שטוען על הממברנה הפנימית.
חלבונים מסיסים בתווך הבין ממברנלי משתמשים בדרך זו, ויש חלבון שחותך את החלק הנעוץ שלהם
Mia40
עבור חלבונים שמכילים מוטיב ציסטאין
יוצרים קשר דיסולפידי זמני עם מיה40
הוא הופך למחוזר, ואז מחומצן עי העברת האלקטרונים לשרשרת הנשימה.
שייר הציסטאין בחלבון יהפכו לציסטין S-S
הטענה של חלבוני
Multipass
עוברים דרך TOM ואז דרך TIM22 בתווך הבין ממברנלי נעזרים בצ'פרונים ייחודיים נטענים על הממברנה בתהליך שאינו צורך ATP הכיווניות נקבעת על פי המטען החשמלי.
סיגנל מכווין חלבונים לממברנה הטילקואידית בכלורופלסט
גם כאן לרוב בצד האמיני,
נחתך לאחר השימוש.
משתמש ב-GTP!!
החלבון יכיל שני סיגנלים - אחד לכלורופלסט והשני לטילקואיד
TOC
ואז TIC
חיתוך של הסיגנל הראשון חושף את השני ושולח את החלבון לממברנה הטילקואידית
צריך לחזור וללמוד את התמונה בעמ 665