השלמות לקראת מועד ב Flashcards
הפרוטאוזום
קומפלקס חלבוני בלבד!!
קיים בהעתקים רבים, 1% ממסת החלבון בתא
ATP עושה שימוש ב
נמצא בגרעין ובציטוזול
מבנה:
20S core proteasome - 4 טבעות הפטמריות,
אנזימים פרוטאוליטים פונים כלפי פנים.
19S regulatory particle:
Unfoldase - AAA ATPase, קרוב משפחה של הליקאז
יוביקווטין רצפטור
יוביקווטין הידרולז - נמצא יותר פנימה, חותך את היובקוויטין.
נק’ נוספות:
לפרוטאוזום יש פרוססיביות
חותך לפפטידים קצרים ולא לח.א
הרחבה על יחידה של הפרוטאוזום
AAA ATPase
ATP חלבון הקסמרי, כל יחידה בהקסמר עושה הידרוליזה של ATP חלבון המטרה נקשר כשהיחידות במצב קושר הידרוליזה מאפשרת למשוך את החלבון פנימה. ATP קשירה מחדש של תאפשר משיכת החלבון יותר פנימה.
זה לא מצליח עם על החלבונים*
קשירה של יוביקווטין לחלבון
שלב 1: E1 שייר ציסטאין על גבי קושר קצה קרבוקסילי של יוביקווטין, זה מצריך הידרוליזה של ATP. AMP נוצר תוצר ביניים של יוביקווטין שלב 2: שמכיל גם הוא שייר ציסטאין נקשר ל E2 E1 ולוקח ממנו את היוביקווטין E2 = conjugated hormone. שלב 3: שהוא יוביקוויטין ליגאז E3 E2 קושר את חלבון המטרה ואת DEGRON הקשירו בחלבון הוא לאתר בשם
שלבים מקדימים להתליך היוביקווטינציה
יוביקווטין ליגאז
שלוש דרכים לשפעל:
זרחון
אלוסטרית עי ליגנד
אלוסטרית עי תת יחידה חלבונית
דוגמה:
APC/C התווספות של תת יחידה ל
שלבים מקדימים להתליך היוביקווטינציה
חלבון המטרה
שלוש דרכים לסימון חלבון המטרה:
זרחון חושף אתר סיגנל לפירוק
ניתוק של יחידה חלבונית חושף את הסיגנל
ביקוע של הקצה האמיני
פירוק מעטפת הגרעין במיטוזה
וגם הלמינה הגרעינית מזורחנים עי NPC
M-CDK.
נקשר לרצפטורים אימפורטינים NPC
שיעזרו בהמך להרכיבה מחדש.
חלבונים ממברנליים בגרעין כבר לא קשורים לשום דבר ומתפזרים על גבי ממברנת האי אר.
החלבון דינאין מסייע אקטיבית בקריעת מעטפת הגרעין.
הרכבה מחדש של מעטפת הגרעין
Ran-GTP תפקיד חשוב ל
שלו מצוי קשור לכרומטידה, כך שזו מוקפת במולקולות של GEF
Ran-GTP and not GDP.
NPC שמשחרר את האימפורטין וה
ויכולה להיווצר מחדש מעטפת גרעין.
בגלל שזו נוצרת קטנה, סביב כרומוזום בלבד, נמנעת כניסה של דברים אחרים, למשל ריבוזומים לגרעין.
pre-replicating complex חלבונים ושלבים ב Cdc6 - Cdt1 - Mcm - ORC - S-Cdk - DDK -
G1 באיור היותר מפורט נראה שזה מתרכב ב Cdc6 - ORC בתחילת ג'י1 נקשר ל וביחד קושרים את ההליקאזות Cdt1 - קושר את ההליקאזות Mcm - ההליקאזה ORC - קושר את מוצא השכפול לאורך מחזור התא S-Cdk - מעורר את חלבוני אינציאציית השכפול DDK - מזרחן תתי יחידות בהליקאזות
Dscam
זהו גן בודד בדרוזופילה שיכול להניב מעל 38,000 חלבונים שונים בעזרת שחבור חליפי.
ACC משפעלים ומעכבים של
או, מה ישפעל סינתזת ח.ש בכבד?
בקרה אלוסטרית: משפעל: ציטרט מעכב: פלמטואיל - התוצר של הריאקציה הראשונה הורמונלית: אדרנלין/גלוקגון דיכוי עי זרחון של ACC אינסולין - שפעול עי הסרת הזרחן
מהן הבקרות על חמצון ח.ש?
NADH/NAD יחס גבוה מעכב Aמעכב: אצטיל קו AMPK משפעל את AMP שמעכב תהליכי סינתזת ח.ש A מעכב - מאלוניל קו שנוצר בשלב הראשון של סינתזת ח.ש עי ACC
סיבי ביניים מבנה
פולרי - מונומר ודימר חסר פולריות - טטרמר. שמונה טטרמרים יוצרים פרוטופילמנטים שמסתדרים לסיב עם חתך של 32 מונומרים. אינטראקציות הידרופוביות, בעל כוח מתיחה גדול
Met-tRNAi
P נכנס לאתר
A ולא לאתר
עובד עם פקטורי איניציאציה ולא אלונגציה
nonsense מוטציית
מוטציה הגורמת לקודון סטופ מוקדם
Missense mutation
מוטציה הגורמת להחלפה של ח.א אחת באחרת
בעקבות שינוי בקודון
point mutation
שינוי באות אחת שלא גורמת לשינוי בח.א וכך בחלבון
FGF מיהם
Fibroblast growth factor
פקטורי גדילה המקדמים התחלקות תאים,
נקשרים לרצפטורי טירוזין קינאז.
אוליגומריזציה שלהם עי פרוטאוגליקאנים מאפשרת יצירת קשרי צילוב והעברת סיגנל יעילה יותר ברצפטור
EGF קישור ליגנד לרצפטור
קישור הליגנד גורם לדימריזציה שמשרה שינוי מבני שגורם לזרחון עצמי של אחת היחידות, ואז מזרחנת גם את האחרת.
כלומר, אוטופוספורילציה מתקיים רק באחד המונומרים.
מה תפקידו של החלבון 14-3-3?
Bad אינאקטיבציה של
ephrin סיגנל מסוג
הכוונה של מיגרציה של אקסון!!
מפעיל רצפטור טירוזין קינאז שבתורו מייצר אתר עיגון לטירוזין קינאז ציטוזולי שמזרחן את
Ephexin - Rho GEF
ephexin החלבון
GEF הוא בעצם ה
Rho של
Rho
חלבון ג’י שנעוץ בממברנה.
גורם לרה-ארגון של הציטוסקלטון וכך משפיע על תנועת התא.
הדוגמה בספר היא של מיגרציה של אקסונים.
הוא..? PDGF
אילו עוד קיימים?;
מיטוגן!
EGF, אריתרופויטין
transforming growth factor-β (TGFβ)
סיגנל חוץ תאי שעושה אינהיביציה על גדילה ומגביל אותה
G1 בעיקר עי חסימת מעבר ל
ATM/ATR מה הפעילות הבסיסית של
קינאזות, מזרחנים את
Chk1, Chk2
P53 שגם הם קינאזות שיזרחנו את
שיפעיל תגובה לעצירת מחזור התא
כיצד הוא עוצר את מחזור התא P53
CKI עי הפעלה של P21 למשל שעושה חיבוק דב לקומפלקס CDK-ציקלין: G1/S-Cdk and S-Cdk
P53
מה ההבדל בין מצב מזורחן ללא?
במצב מזורחן המדאם לא מזהה אותו.
מנגנון אפוטוזיס בעקבות גירוי יתר של מסלול מיטוגני
פעילות יתר של מיק תגרום לאקטיבציה של
Arf שנקשר ל-
Mdm2 ומונע ממנה לעקב את p53/
אריזת וזיקולות קולגן
מצופות COP II נארז כפרו-קולגן מצריך חלבוני אריזה מיוחדים וכן יוביקווטינציה Sec31 מונויוביקווטינציה שמוספת ל
חמצון ח.ש בפרוקסיזום אל מול מיטו
ההבדל העיקרי הוא בריאקציה הראשונה בה עודפי חמצן מסולקים עי ייצור
H2O2
שיפורק עי קטלאז ולא יתרום אלקטרונים ל ATP.
הפרוקסיזום מומחה בחמצון של ח.ש ארוכות ומסועפות.
מהן שתי מחלות השומנים של הפרוקסיזום
רפסום - ח.ש ארוכות לא מפורקות
מחסור של טרנספורטר בפרוקסי’ - XLAD
אין יכולת לחמצן ח.ש ארוכות 26:0
Orai/Stim1 מה התפקיד של
שמירה על מתח טטני.
מה מאפשר את ההתנגדות הגבוהה של סיבי בינייים לכוחות מתיחה?
מגע לטרלי בין יחידות סיב
החלבון החיידקי FtsZ
הומולוג למיקרוטובולי, מייצר את הטבעת המתכווצת שמפרידה את שני תאי הבת.
החלבון MreB
למה תגרום מוטציה?
הומולוג לאקטין, עשוי פילמנטים הליקאליים לינארים שנעים בחיידק ומקושרים לסינתזת דופן התא וקביעת צורת החיידק
מוטציה תגרום לצורה לא מאורגנת ופגמים בהפרדת כרומוזומים.
ParM & ParR
שניהם מקודדים בפלסמיד.
ParM:
הומולוג של אקטין, מקודד על פלסמיד שנושא גם עמידות ל-אנטיביוטיקה. מתארגן לסיבים שנקשרים בקצה לפלסמיד, אז גדילה שלו דוחפת את ההעתקים לתאים שונים. מעין כישור חלוקה.
ParR - mediated ParM and the plasmid.
נקשר לדנא מסוים בפלסמיד.
כל כמה חזרות יש טוויסט בסיב אקטין?
כל 37 ננומטר.
למה משמש Pyrene?
פרוב פלוריסנטי שנקשר לאקטין.
נוקלאציה של אקטין
שני מונומרים נקשרים יחסית חלש אחד לשני,
אבל הוספה של שלישי מייצרת קישור חזק יותר.
הטרימר יפעל כגרעין נוקלאציה.
ARP2/3
איזה צד של האקטין הוא קושר?
זה בעצם קומפלקס של
ARP2 ARP3
שמסייע לנוקלאציה של אקטין.
הם זקוקים לחלבון אקטיבטור כדי לייצר נוקלאציה.
נקשר מצד מינוס, ומאפשר הארכה מפלוס.
פורמין
דימרי,
עוזר לנוקלאציה
נקשר לקצה פלוס של אקטין.
מחובר לעיתים לממברנה ומאפשר יצירה של אקטין בסמיכות אליה.
חוקר מעוניין להפריד איברונים מהתא, אילו מהשיטות הבאות תשמר את האיברונים? הומוגנציה סוניפיקציה שימוש בדטרגנט אף אחת מהנ"ל
תשובה: הומוגנציה - פירוק של ממברנת התא באמצעות בוכנה המשמרת את האיברונים.
סונפיקציה - פירוק באמצעות גלי קול, לא משמר איברונים.
NOTCH רצפטורי
גאמא סקרטאז - חותך מבפנים, מכיל את תת היחידה פרה-סנילין שמוטציה בה מקושרת לאצהיימר מוקדם.
חיתוך ראשון בגולג’י, חיתוך שני מבחוץ, חיתוך שלישי מהצד הציטוזולי.
גם נוטץ’ וגם דלתא הם גליקופרוטאינים, שעוברים גליקוזילציה עי פרינג’ - מסוג O glycosylation
השארית של נוטץ’ נודדת לגרעין ושם ממירה מרפרסור לאקטיבטור את
Rbpsuh - החלבון בעל השם הקליט
Wnt-Frizzled בהפעלה של מסלול
מי עובר זרחון?
עובר זרחון LRP
מה שמאפשר אינאקטיבציה של אקסין ומניעת פירוק של בתא קטנין.
כאשר המסלול לא מופעל, נראה זרחון של ביתא קטנין עי
GSK & CK1
שיעודד יוביקווטינציה ופירוק לפפטידים קטנים.
איזה חלבון מוטנטי באדנומות - גידולים שפירים במעי הגס?
APC
שהוא חלבון פיגום במסלול ה Wnt-Frizzled.
סטריאוסיליה ניתן למצוא ב…?
ממה מורכבת?
באוזן הפנימית ובתאי אשכים.
מורכבת מאקטין ומחלבוני עזר דוגמת
ezrin, fimbrin
מה מערבת אקומודציה?
מעבר של מתח הסף ללא יצירת פוט’ פעולה.
עי גירוי איטי הולך ועולה של הממברנה נוצר מצב בו תעלות הנתרן נכנסות למצב אינאקטיבי ולא מתאפשרת יצירת פפ.
מנגד, תעלות אשלגן נפתחות ומתנגדות “להתצטברות” המתח.
Synaptic delay
מוגדר עי פרק הזמן שעובר מההגעה לשיא הזרם הפרה-סינפטי לשיא הזרם הפוסט סינפטי.
סינפסות חשמליות למשל חסרות עיכוב סינפטי.
ואילו בסינפסות כימיות הנל נובע ממנגנון הנ”ט.
SANP25
בהוכלת וזיקולות נמצא על ממברנת המטרה ביחד עם סינטקסין.
עם ההיקשרות של סינפטוברבין אליהם מגוייסים חלבוני קומפלקסין.
שלאחר מכן עם איחוי הווזיקולות מתנתקים ביחד עם הסידן.
PRIMING מה מתרחש ב
ישנו איחוי של סינפטוטקסין, ברבין וסנאפ.
וגיוס של קומפלקסין.
עדיין אין קישור של סידן!! סידן יגיע רק כאשר יהיה שחרור למרווח הסינפטי.
כיצד נארז קולגן בווזיקולה?
COPII בוזיקולות עם מעטפת
יחד עם
Sec 23/24, Sec 13/31
בנוסף דרושי חלבוני אריזה מיוחדים.
Replacement of Rab5 by Rab7?
מכבר מאנדוזום מוקדם שמבטא את ראב5, למאוחר שמבטא את ראב7.
כיצד וירוסי השפעת וה HIV
נכנסים לתא?
שפעת באנדוציטוזה תלויית רצפטור.
איידס בהתאחות עם הממברנה באמצעות חלבונים דומים לחלבוני
SNARE
