22. Úloha chaperonu, proteasomu, lysosomu Flashcards

1
Q

Chaperony - Heat shock proteins

A
  • někdy mohou pomoct se i rozbalit
  • zbraňují předčasnému svinutí
  • zabraňují intermolekulárním interakcím nesbalených bílkovi →precipitaci
  • ATPázy, nespecifické ke svým ligandům
  • při celulárním stresu → měny teploty, pH, detergenty, toxické látky
  • ochrana proti účinku stresvových faktorů
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Glucose regulated proteins

A
  • chaperony v ER
  • cold shock proteins
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Účinky chaperonů

A
  • molekulární → rozpoznávají patologický protein, inhibují agreagaci, při tepelném poškození
  • chemické → upravují podmínky uvnitř buňky, stabilizují proti denaturace
  • farmakologické → váží se na specifickou konformaci a stabilizují ji, prevence před proteasomální degradací
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Ubiquitin a HSP8

A
  • regulují degradaci cytoplasmatických proteinů
  • aktivace molekuly ATP vede k navázání na lysinový zbytek
  • do kavity proteasomu → degradace
  • asi 30% nově vzniklých polypepidů a proteinů → první folding velké množství chybných intermediátů
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

HSP32

A
  • hymoxygenasa
  • oxiduje hemovou část Hb na bilirubin
  • reguluje správnou koncentraci NADPH v nuňkách
  • rozhoduje o antioxidační metabolické ochraně buněk
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

HSP28

A
  • crystallin
  • reguluje apoptosu a reorganizaci filament
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

HSP70

A
  • nejdůležitější velký chaperonový komplex, největší v eukaryotách
  • cytoplasma, ER, mitochonrie
  • oprava špatně uspořádaných nascentních nebo starších polypeptidových řetězců
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Proteasomy

A
  • bílkovinné komplexy s proteasovou aktivitou
  • eu i pro
  • jádro i cytosol
  • podjednotky → katalytické a regulační
  • degradace intracelulárních proteinů → informační, signálni
  • polyubikvitinové proteiny označí → odštěpí se → krátké oligopeptidy → ven
  • některé bez označení → specifický signál nebo zprostředkující protein
  • inhibice → ubistatiny které se váží na polyubikvitiny
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Význam proteasomů

A
  • odklízení starých BK molekul
  • imunitní → rozpoznání antigenních struktur
  • regulace buněčného cyklu
  • význam v apoptose
  • endogenní inhibitory → apoptosa potlačením NF-kB který je proliferativní → jeho inhibitor se přestane degradovat
  • inhibice → vyšší aktivita p53
  • neurologické hromadění proteinů → Parkinson → podpora proteasomů
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Ubiquitinace

A
  • nejdřív vázán za spotřeby ATP → ubiguitin aktivující enzym E1
  • přenos ubiquitin-přenášející/ubiquitin-konjugující enzym E2
  • přesum na protein →ubiquitin ligáza E3 → specificky rozpoznává
  • v buňce málo E1,E2 ale rozmanité E3 pro různé skupiny
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Způsob vazby ubiquitinů

A
  • polyubikquitinový řetězec přes lysin 46 → K48 řetězce → víc degradace
  • lysin 63 → K63 řetězce → signalizace
  • i jiné, vyjímečně rozvětvené
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Deubiquitinace - Deubiquitinasy

A
  • v eukaryotě
  • ubiquitin C-terminální hydrolasy
  • ubiquitin specifické proteasy
  • proteasy s doménou Machadovy-Josephovy nemoci
  • proteasy z vaječníkových tumorů
  • proteasy s JAMM doménou → správné fungování eukariotního proteasomu → Poh1
  • známe pře 75 →interakce se stovkami proteinů
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Proteasom

A
  • K48 řetězec → 26S proteaom → dvě části
  • 20S → hlavní partiule → válec
  • 19S → regulační partikule → PA700
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hlavní partikule

A
  • čtyři prstence →2 vnitřní 7 alfa a 2 vnější 7 beta
  • aktivní míst štěpící proteiny v beta → obrácené dovnitř
  • B1 →aktivita podobná kaspázám
  • B2 → aktivita podobná trypsinu
  • B5 → aktivita podobná chymotrypsinu
  • krom 20S → inducibilní, jiná aktivní místa → imunoproteasomy, směné → odpověď na cizorodé látky
  • thymoproteasomy → beta5t podjednotka, souvisí s CD8+ selekcí
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Regulační partikule

A
  • na vnější prstence 20S
  • báze a víko
  • báze → 6 rozdílných AAA+ ATPáz a dlaší 4 podjednotky
  • regulace vstupu do 20S
  • víko → 9 ne-ATPázových podkednotek → deubikvitinace pomocí Poh1 před vstupem do 26S
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Degradace neubiquitinovaných proteinů

A
  • asi 20% všech proteinů štěpených proteasomy v eukaryotních buňkách
  • špatně uspořádaná místa → nespecifický signál
17
Q

Degradace ubiquitinovaných proteinů

A
  • k rozpoznání nutné podjednotky z baze a proteiny dočasně asociované s proteasomem
  • když na 26S → šepí se, resyntezuje pomocí deubiquitinas a ubiquitin ligas
  • snížení intenzity degrada ubiquitinů → specifická DUB Ubp6 → není stálá součást
  • ubiquitin Poh1 a štěpí jiné DUBs
  • rozplétání do primární struktury → hydrolýza ATP AAA+ ATPázami
  • rozpletený skladován v alfa prstencích když beta full
  • do 20S z obou stran
  • dokud oligomery nejsou dost malé aby mohly difundovat ven → venku jiné peptidasy až na AMK
18
Q

Regulace aktivity proteinů

A
  • některé proteiny jsou degradovány neúplně nebo degradace inhibitorů které jsou na nich navázány
  • spojení s aktivitou proteinů → TF, signalizační
  • terapeuticky významné procesy → zánět, neurodegenerace, svalové dystrofie, virové infekce, kancerogeneze
19
Q

Lysosom

A
  • sférické membránové organely
  • 50 druhů enzymů → kyselé hydrolasy
  • pH 5-6 udržováno protonovou pumpou
  • oddělení z ER, GA
  • primární → bez materiálu
  • sekundární → větší, splynutí s fagosomem
  • terciální →zbytky které nejdou rozložit →lipofuscin
  • autofagie → recyklace
20
Q

Defekty lysosomů nemoci

A

vrozené
- genetické poruchy enzymů nebo regulačních proteinů → hromadění v CNS, makrofázích
- asi 40 chorob, neléčitelné většinou
- Fabry → pdání alfa galaktosidasy, Niemann-Pick, Tay-SAchs, Gaucher, POmpe
získané
-relativní poruchy z nadbytku materiálu → pěnové buňky, hepatocyty, prox. tubuly
- dna narušuje membránu lysosomu krystalky kys. močové →uvolnění enzymů → zánět

21
Q

Stres ER

A
  • soubor všech možných vlivů které vyvádějí ER z homeostázy → hormadění proteinů které neprošly foldingem
  • unfolded protein response
  • zpomalení translace, degradace malformovaných, zvýšení exprese chaperonových genů, udržení oxidativního prostředí v ER
  • při selhání apoptóza
22
Q

Běžná funkce ER

A
  • během translace vznikající polypeptid označen a celý komplex ribosom-polypeptid-mRNA jde na vhodné místo kde se dotvoří
  • N-glykosylace, oxidativní prostředí → disulfidické můstky
  • malfolding → indukuje nabalování dalších → chaperony Grp78 → degradace ERAD
23
Q

Stresové signalizační dráhy

A
  • MERK kinasa (elF2 kinasa)
  • kinasová rodina s Ire1 → dvě formy odpovědi → exprese chaperonů které zaručí že nedojde k malfoldingu nebo translace TF XBP1 NEBO vazba a udržení Ca v ER
  • Transkripční faktor ATF6 → ovlnivňuje expresi mRNA XBP1
24
Q

Spuštění apoptosy

A
  • dvě cesty
  • pomocí TF → Ire1upregulace TF GADD153/CHOP který ovlivňuje rovnováhu mezi Bcl-2 a Bax
  • pomocí kaspáz → casp-12