SS 2009 2. Termin

Question 1

Erläutern sie den Begriff.

1. Plasmadesmos: …
2. Plasmodium:…

Answer 1

1. Plasmaverbindung zwischen Zellen höhere Pflanzen

2. mehrkernige Zellen oder Malariaerreger

Question 2

Nenne sie zwei Parameter, von denen die Schmelztemp. eines Membranlipides abhängt.

Answer 2

-Länge der Fettsäure-Seitenketten
-Art der Seitenketten
((un-)gesättigt)
-Größe der Kopfgruppen

Question 3

Ja / Nein Frage

1. Bei der co-translationalen Acetylierung von Proteinen wird in der Regel die alpha-Aminogruppe der ersten AS modifiziert
2. Interne Histidine können durch Phosphorylierung modifiziert werden.
3. Proteine des Zytoplasmas liegen immer in einer definierten Raumstruktur vor und besitzen keine ungeordneten Domänen.
4. Im ATP Zyklus des HSP70 aus E.Coli wird der geschwindigkeitsbestimmende Schritt durch die GrpE katalytische gefördert.

Answer 3

1. ja
2. Ja
3. Nein
4. Ja
   (Nukleotidaustauschfaktor)

Question 4

Ja / Nein Frage

1. GroEL Chaperonine bestehen aus zwei heptameren GroEL Ringen, die mit heptameren GroES Kappen interagieren können
2. GroES ist eine ATPase
3. HSP90 unterstütz die Faltung kleiner Proteine unter 20 kDa
4. Alle Chaperone der HSP70 Gruppe ein Euk. werden bei Faltungsprozessen z.B. durch Wärme in ihrer Expression hoch reguliert

Answer 4

1. Ja
2. Nein
3. Nein
4. Nein

Question 5

Ja / Nein Frage

1. Das 26S Proteasom hydrolasiert ATP
2. Seine 19S Cap-Subunit besteht aus 5 Polypeptidketten
3. die direkte Bindung der lid-Region an das 20S core-Partikel ermöglicht den Zutritt des abzubauenden Polypetids zu den katalytischen Zentren.
4. Die 11S cap Subunit enthält ATPasen des AAATyps

Answer 5

1. Ja
2. Nein
3. Nein
4. Nein (19S hat ATPase Aktivität)

Question 6

1. In welcher Zell-Zell-Kontaktstruktur sind Connexine zu finden?
2. Sind sie auch in der Zell-Matrix-Kontakstruktur zu finden?
3. Welche zytoskeletalen Strukturen werden durch Connexine miteinander verbunden?

Answer 6

1. Gap junctions ( 6 Connexine = 1 Connexon ; 2 Connexone = 1 gap junction)
2. nein
3. keine

Question 7

Nennen sie die drei wichtigsten Wege, über die Proteine zum Abbau in das Lysosom gelangen können.

Answer 7

Mikroautophagie
Makroautophaige
Chaperon-vermittelte Autophagie

Question 8

Was ist ein Aggregosome?

Wo in der Zelle ist ein Aggregosome überlichweise positioniert?

Answer 8

• Aggregate falsch gefalteter Proteine

- in der Nähe des MTOC(microtubule-organizing center)

Question 9

Unterstreichen sie die richtige Antwort
Mikrotubulie entstehen durch Zusammenlagerung von ( Monomeren / Dimeren / Trimeren) aus ( alpha / beta / gamma) Tubulin. Sie liegen oft (einzeln / in Bündeln / in Netzwerken ) vor.
Ihre Verankerung im Centrosom (erfolgt / erfolgt nicht) durch direktem Kontakt mit dem gamma-Tubulin der Centriolen. Die Centriolen (anstehen in der Regel nach jeder Zellteilung neu / teilen sich während der Interphase und werden später auf die Tochterzelleb verteilt).

Answer 9

• Dimeren
• alpha / beta
• einzeln / in Bündeln ?
• erfolgt nicht (siehe Hartmann VL III Folie 51)
• teilen sich während der Interphase und werden später auf die Tochterzellen verteilt

Question 10

1. Nennen sie zwei der wichtigsten Modifikationen, die an Kollagen zu finden sind.
2. Welche dieser Modifikationen finden sich auch im Elastin?
3. Welche Modifikation ist typisch für Proteoglykane?

Answer 10

1. Hydroxy-Pro
   Hydroxy-Lys
2. Hydroxy-Lys auch im Elastin (Spektrum sagt aber Hydroxy Prolin…)
3. Sulfatzucker;( Modifikation mit Sulfamat- und Sulfatester-Gruppen )

Question 11

Unterstreichen
Bei der Bewegung mittels Pseudopodien werden (Filopodien am Führungsende der Zelle ausgebildet / die Filopodien mittels Desmosomen am Untergrund fixiert / stress fibers in der Zelle ausgebildet).
Kerntransportrezeptoren, die den Import von Molekülen in den Zellkern dienen, binden ihr Cargo in (Gegenwart / Abwesenheit ) von RanGTP.
Der Transport von RandGDP über die Kernpore erfolgt (ausschließlich durch Diffusion des monomeren Moleküls / ausschließlich mit NTF2 / auf beiden Wegen).
Der Transport von mRNP durch die Kernpore erfolgt (unter Beteiligung von ATP / mittels Motorproteinen / durch Diffusion).

Answer 11

• Filopodien am Führungsende der Zelle ausgebildet / stress fibers in der Zelle ausgebildet
• Abwesenheit
• auf beiden Wegen
• unter Beteiligung von ATP / durch Diffusion

Question 12

Unterstreichen:
Ein wichtiges Merkmal einer Signalsequenz sekretorischer Proteine ist ( die Bindung einer amphipatischen Helix / ein mindestens 7 AS langer hydrophober Abschnitt / eine Schnittstelle für die Signalpeptidase am C-Terminus der Signalsequenz).
Der SRP-Rezeptor der Eu. ist ein ( Riboproteinkomplex / ein Komplex aus zwei Proteinen / ein monomeres Protein).
der SRP-Rezeptor besitzt ( eine / zwei ) GTPase-Domänen und bindet SRP mit hoher Affinität in Gegenwart von (GTP / GDP / GDP +P).
Typ IV Membranproteine besitzen eine tail-anchor Sequenz und benötigen für ihre Membraninsertion in der Regel / SRP / ein Sec61 haltiges Translokon / luminöses Kar2p / ATP).

Answer 12

• ein mindestens 7 AS langer hydrophober Abschnitt / eine Schnittstelle für die Signalpeptidase am C-Terminus der Signalsequenz
• ein Komplex aus zwei Proteinen
• zwei
• GTP
• ATP

Question 13

Unterstreichen:
Prenylierte Proteine können ( ein / zwei) Prenylreste besitzen.
Palmitoylierung treten (nur alleine / auch in Kombination mit Myristoylierung/ auch in Kombination mit Farnesylierung) auf.
Die Bindung myristoylierter Proteine an Membranen wird reversibel über (ionische Wechselwirkungen / Disulfidbrückenbildung / zusätzliche Modifikation mit GPI-Ankern) stabilisiert.
GPI-Anker besitzen ( Sulfatzucker / Mannosen / keine Zuckerstrukturen ). Ihr Lipidanteil enthält ( Fettsäuren / Prenylreste / beides).

Answer 13

• ein, zwei
• auch in Kombination mit Myristoylierung/ auch in Kombination mit Farnesylierung
• ionische Wechselwirkungen
• Mannosen
• Fettsäuren

Question 14

Beschreiben sie die Grundschritte der Signaltransduktion über Ire1 in der Hefe und über ATF6 während der UPR(unfolded Protein Response)

Answer 14

Ire1:
-Ablösen des Kar2p von Ire1p durch dessen Bindung an ungefilterte Proteine
-Dimerisierung des ire1p führt zur Autophosphorylierung und Aktivierung
-aktives Ire1p spliced Hat-mRNA, so dass ein funktionelles Transkript entsteht
-Hac1-mRNA wird transplantiert, das entsprechende Protein wirkt als Transkriptionsfaktor für UPR-Gene
ATF6:
-Ablösen des BiP von ATF6 erlaubt dessen Transport in den Golgi
-Proteasen im Golgi setzten die zytoplasmatischen Domänen frei
-diese geht in den Kern und wirkt als TRanskriptionsfaktor für UPR-Gene

Question 15

Unterstreichen:
Bei der Bildung eines COPII Coats können als Cargo ( neu synthetisierte Membranproteine / KDEL-Rezeptoren / das Translokon des ER) mit verpackt werden.
Die Krümmung der Lipidmembran bei der Visikelbildung wird vermutlich durch (halbmondförmige periphere Membranproteine / Änderung in der Lipidzusammensetzung / extensive Zuckermodifikationen von Lipiden ) unterstützt.
Die Auflösung des SNARE-Komplexes (benötigt ATP / erfolgt unmittelbar vor der Fusion des Vehikels mit der Membran / wird durch Arf-Proteine gesteuert).

Answer 15

• neu synthetisierte Membranproteine / KDEL-Rezeptoren
• halbmondförmige periphere Membranproteine / Änderung in der Lipidzusammensetzung
• benötigt ATP

Question 16

Ja / Nein frage:

1. Der APC ist eine Protease.
2. Der APC ist eine Ubiquitin-Ligase.
3. Der APC ist eine Proteinkinase.
4. Durch die APC-Aktivität kommt es zum Abbau des Proteins Seperase.
5. Der APC markiert Zielproteine für die Protolyse durch das Proteasom.

Answer 16

1. Nein
2. Ja
3. Nein
4. Nein
5. Ja

Question 17

Nennen Sie 4 Regulazionsmechanismen, mit denen die Cdk-Aktivität während des Zellzyklus reguliert werden kann.

Answer 17

• Cyclinbindung
• Proteinabbau
• (De-)phosphorylierung
• CdKIs (cyclin-dependent kinase inhibitor)

Question 18

Ja / Nein Frage:

1. Caspasen werden durch die Phosphorylierung entsprechender Procaspasen aktiviert.
2. Viele Effektor-Caspasen besitzen Domänen, die als CARD bezeichnet werden.
3. Die Umwandlung einer Procaspase in eine Caspasen ist unter physiologischen Bedingungen ein vollständiger reversibler Prozess.
4. Bestimmte Iniator Caspasen besitzen Domänen, die als DED bezeichnet werden.

Answer 18

1. Nein
2. Nein
3. Nein
4. JA

Question 19

Ja / nein Frage:

1. Das Protein p53 wird durch Mdm2 aktiviert
2. Das für das Protein p53 kodierende Gen wird als Onkogen bezeichnet.
3. Das Protein p53 ist ein Transkriptionsfaktor.
4. Das Protein p53 wird durch Phosphorylierung aktiviert / stabilisiert.
5. Protein p53 ist eine Kinase.

Answer 19

1. Nein (Mdm2 ist Inhibitor)
2. nein
3. Ja
4. Ja (durch ATM-Kinase)
5. Nein

Question 20

Die Zellteilung bei Bakterien erfolgt in der Regel durch einen kontraktilen Ring in der Mitte der Bakterienzelle(Z-Ring). Nenne sie zwei Faktoren(Proteine), die verhindern, dass sich der Z-Ring an den Polen bildet bzw. das DNA durchgeschmort wird.

Answer 20

Noc ( DNA)

Min (Pol)

Question 21

Ja Nein Frage:
Der wnt/beta-catenin Signaling pathway spielt eine wichtige Rolle bei der Spezifizierung der dorrst zentralen Achse bei Xenopus. Welche Aussagen sind richtig?
1. Beta-catenin ist der Ligand.
2. Bei Aktivierung des wnt/beta-catenin Signaling pathway wird beta-catenin phoyphoryliert und abgebaut.
3. Das Protein disheveled ist ein Transkriptionsfaktor.
4. Das Protein frizzled ist der Transmembran Rezeptor.

Answer 21

1. Nein
2. Nein ( bewirkt Akkumulation von beta-catenin m Cytoplasma)
3. Nein
4. Ja

Question 22

Das Paarregel-Gen even-skipped spielt eine wichtige Rolle bei der Spezifizierung der anterior-posterior Achse bei Drosophila.
Ja / nein Frage:
1. Produkte der Segmentpolaritäts-Gene regeln die Expression von even-skipped.
2. even-skipped wird in Parasegmenten entlang der anterior-posterior Achse exprimiert.
3. Produkte der homeotischen Gene regeln die Expression von even-skipped.
4. Even-skipped wird nur im posterirr Bereich des Embryos exprimiert.
5. Cis-regulatorische Enhancer-Elemente vermitteln die spezifische even-skipped Expression.
6. Produkte der Lücken-Gene regeln die Expression von even skipped.

Answer 22

1- Nein

2. Ja
3. Nein
4. Nein
5. Ja
6. Ja

Question 23

Die maternalen Proteine bicoid, nano, hunchback und caudal bilden Morphogengradienten im frühen Drosophila-Embryo.
Ja / Nein
1. Sie bilden alle bereits während der Eireifung als Proteine Gradienten.
2. Sie bilden alle bereits während der Eireifung als mRNAs Gradienten.
3. Einige von ihnen werden als mRNAs durch Motorproteine zu den Eipolen transportiert.
4. Einige von ihnen werden als Proteine durch Motorproteine zu den Eipolen transportiert.
5. Sie beeinflussen sich teilweise gegenseitig bei der Translation.
6. Ihre Verteilung wird durch die Lücken-Gen-Produkte reguliert.

Answer 23

1. Nein
2. Nein
3. Ja
4. Nein
5. Ja
6. Nein

Question 24

Zur Generierung eines konditionellen Gen-Knock outs wird dasd sogenannte Cre-lox P System verwendet. Was ist los P?

1. eine spezifische Schnittstelle für eine Cre-Rekombinase
2. ein Antibiotikum zur Selektion von ES Zellen
3. eine Rekombinase
4. eine Polymerase

Answer 24

1. Ja ( ist eine DNA Sequenz)
2. Nein
3. Nein (Cre ist die Rekombinase)
4. Nein

Question 25

Welche Konsequenzen können Mutationen in einem homeotischen Gen für die Bildung der Segmente entlang der anterior-posterior Achse beim Drosophila-Embryo haben?
1- Erhöhung der Segmentzahl.
2. Veränderung komplexer Strukturen der Segmente
3. Änderung der Segmentpolarität
4. Verschmelzen von Segmenten

Answer 25

1. Nein
2. Ja
3. Nein
4. Nein