Prokaryoten Flashcards
Wat zijn de acht gemeenschappelijke fundamentele eigenschappen van alle levende organismen?
- Cellulaire organisatie
- Gevoeligheid voor stimuli
- Groei
- Ontwikkeling
- Reproductie
- Regulatie
- Homeostase
- Erfelijkheid
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘cellulaire organisatie’ over?
Elk organismen bestaat uit 1 of meer cellen - complexe georganiseerde assemblages van moleculen ingesloten in een membraan
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘groei’ over?
Alle levende organismen bouwen energie op en gebruiken deze om orde te onderhouden en te groeien -> metabolisme
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘ontwikkeling’ over?
Zowel eencellige als meercellige organismen ondergaan systematische gen-gestuurde veranderingen voor hun groei en maturatie
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘reproductie’ over?
organismen vermenigvuldigen, geven genen door van de ene op de andere generatie
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘regulatie’ over?
alle organismen zetten regulatorische mechanismen in om interne processen te coördineren
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘homeostase’ over?
onderhoud van relatief constante interne condities, verschillend van de omgeving
Waar gaat de fundamenteel gemeenschappelijke eigenschap ‘erfelijkheid’ over?
Genetisch systeem gebaseerd op de replicatie van DNA -> laat adaptaties en evolutie toe
Hoe heten de 3-domeinen in de 3-domein fylogenie, gebaseerd op rRNA studies?
Domein Archaea
Domein Bacteria
Domein Eukarya
Eerste twee zijn prokaryoten, de laatste zijn eukaryoten
Welke domeinen (van de 3-domein fylogenie) zijn het meest met elkaar verbonden? en hoe kan dat?
Archaea en Eukarya, NIET Archaea en bacteria, ondanks dat dit beide prokaryoten zijn.
Dit omdat Archaea en eukarya later in de evolutie zijn ontwikkeld
Wat zijn de vier kenmerken van Archaea en Bacteria?
- Oudste vorm van leven
- Meest voorkomende vorm van leven
- Structureel simpele vorm van leven
- Overleven waar eukaryoten niet kunnen overleven
Archaea zijn extremofielen, wat houdt dit in?
Dat ze kunnen (over)leven in extreme omstandigheden, zoals poolijs of bij erg hoge druk
Wat zijn de zeven fundamentele verschillen tussen Prokaryoten en Eukaryoten? (in kernwoorden!)
- Unicellulair
- Celgrootte
- Chromosomen
- Celverdeling en genetische recombinatie
- interne compartimentalisatie
- Flagella
- Metabole diversiteit
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘unicellulair’ over
Prokaryoten kunnen wel groeperen tot matrix of filament (eiwitdraad) maar blijven individuen. Geen directe interconnecties tussen cytoplasma (dit heeft enkele uitzonderingen)
(Eukaryoten kunnen juist samenwerken/leven/zijn zoals in het menselijk lichaam)
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘Celgrootte’ over?
Prokaryoten zijn vele malen kleiner dan Eukaryoten (Mitochondria heeft ongeveer de grootte van een prokaryoot, ter vergelijking)
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘chromosomen’ over?
Prokaryoten hebben een nucleoid regio met 1 circulair DNA + histone-achtige eiwitten en ze hebben plasmiden
Eukaryoten hebben een aparte celkern
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘celdeling en genetische recombinatie’ over?
Prokaryoten doen celdeling door binaire splijting (vorm van aseksuele reproductie). Gentransfer is mogelijk door horizontale gentransfer (geen vorm van reproductie)
Eukaryoten doen celdeling en genetische recombinatie door mitose, seksuele voortplanting wat betreft vorming van haploïde gameten en diploïde zygoten
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘interne compartimentalisatie’ over?
Prokaryoten hebben geen membraan omgeven organellen dus geen kern, mitochondriën, ER Golgi apparaat en lysosomen
wél hebben prokaryoten ribosomen (maar structureel verschillend)
Eukaryoten hebben wel membraan omgeven organellen
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘flagella’ over?
Prokaryoten hebben een simpele flagella, die bestaat uit 1 vezel opgebouwd uit flagelline. Ziet er propeller-achtig uit voor voortbeweging en hebben pili voor het binden/plakken aan een oppervlakte en aan elkaar.
Eukaryoten hebben een 9 + 2 structuur microtubuli
Waar gaat het fundamentele verschil tussen Prokaryoten en Eukaryoten ‘metabole diversiteit’ over?
Prokaryoten hebben twee types fotosynthese: zuurstof producerend en niet-zuurstof producerend. Daarnaast zijn ze ook chemolithotroof.
Eukaryoten hebben mitochondria voor metabolisme (toch?)
Wat is biofilm?
De meeste bacteriën kunnen onder normale omstandigheden complexe gemeenschappen bouwen, bestaande uit verschillende species
Wat is plasmide?
Cirkelvormige streng DNA, buiten het chromosomale DNA. Dit genetische element kan worden overgedragen tussen Prokaryoten cellen
Wat zijn de vier sleuteldomeinen voor de verschillen tussen bacteria en Archaea?
- Plasmamembraan
- Celwand
- DNA replicatie
- Genexpressie
Op welke manier zijn lipiden gelinkt op het glycerol skelet bij Archaea?
Met een etherbindingen
Op welke manier zijn lipiden gelinkt op het glycerol skelet bij Bacteria?
Met een esterbinding
Wat is het verschil tussen een etherbinding (Archaea) en een esterbinding (Bacteria)?
De esterbinding heeft buiten de glycerolbinding een extra C = O (koolstofbinding)
Hoe ziet de glycerolbinding eruit?
CH2 - CH - CH2
| | |
OH O O.
(tussen CH - O is de ether verbinding, bij de esterverbinding komt onder de O nog C = O )
Wat kunnen lipiden bij Archaea wat ze niet bij Bacteriën kunnen?
Lipiden kunnen bij Archaea vertakken, dat komt niet voor bij Bacteriën
Wat is een tetraether?
Elke verbinding die vier functionele ethergroepen bevat
Wat kan een tetraether maken?
Een monolayer (mono = 1, layer = laag, dus 1 laag fosfolipiden. Wel een bolletje aan beide kanten)
O~O
O~O
Waar kan een monolayer bij helpen?
Een voorbeeld is dat een monolayer weerstand biedt tegen hoge temperaturen (dit is bij hypterthermofielen)
Zowel Bacteria als Archaea hebben een celwand over de plasmamembraan, maar wat is het verschil?
Bacteria: celwand bestaand uit peptidogylcan
Archaea: celwand zonder peptidoglycaan, soms wel pseudopeptidoglycan
Wat is het verschil in DNA replicatie wat betreft Archaea en Bacteriën?
Bij Archaea is de initiatie van DNA replicatie meer gelijkend op die van Eukaryoten (ze staan dichter bij elkaar in de levensboom)
(Celdeling voor Prokaryoten door binaire splijting, en gentransfer mogelijk door horizontale gentransfer)
Wat is het verschil in genexpressie? (eukaryoten en prokaryoten)
Transcriptie en translatie bij Archaea lijkt meer op die van Eukaryoten. Meer dan 1 RNA polymerase zoals en gelijkend op die van Eukaryota.
(Er staat niet bij hoe Bacteria doen aan genexpressie)
O.b.v. welke eigenschappen kan een eerste classificatie van Prokaryoten worden gemaakt? (5x ‘vs.’)
- Fotosynthese vs geen fotosynthese
- Bewegend vs sessiel
- Unicellulaire vs filamenteus
- vorming sporen vs divisie via binaire splijting
- pathogeen voor de mens vs niet pathogeen voor de mens
Wat is de moleculaire aanpak voor de classificatie van prokaryoten? (not sure of we dit ook helemaal moeten kennen)
- Analyse van AA sequenties van sleutelproteïnen
- Analyse van de nucleïnezuur sequentie o.b.v. G - C inhoud
- Nucleïnezuur hybridisatie - bepaling an de graad van bassparing tussen enkelstrengig DNA van twee species
- Gen/RNA sequencing met speciale aandacht voor rRNA
- Genoom sequencing
Welke drie soorten celvorm kan een prokaryoot hebben?
- Staafvormig
- Rond/ovaal
- Helicaal (spiraalvormig)
Waardoor wordt de celvorm bepaald bij een Prokaryoot?
Vorm wordt bepaald door de celwand
Wat gebeurt er met de vorm als een Prokaryoot geen celwand heeft?
Dan heeft het geen vaste vorm (zoals bv bij mycoplasma)
Waaruit bestaat de celwand van prokaryoten?
Het is meestal complex opgebouwd uit vele lagen.
Bij Bacteria bestaat het uit minimum van peptidoglycan
Wat is Peptidoglycan?
Polysaccharide ketens verbonden via peptide zijketens
Waar dient peptidoglycaan voor in de celwand van Bacteria?
Het behoudt vorm, beschermt tegen zwellen en scheuren in een hypotone omgeving (Bacteriën overleven niet gemakkelijk in een hypertone omgeving)
Wat is een hypertone omgeving?
Een omgeving met hoge suiker of zout concentraties (Bacteriën overleven hier niet gemakkelijk in)
Wat is een hypotone omgeving?
Een omgeving met een relatief lage osmotische waarde