Pharmacologie moléculaire (PHR501) Flashcards
Quelle est la structure des récepteurs tyrosine kinase?
1) Domaine extracellulaire : large et glycosylé + liaison avec ligand
2) Domaine transmembranaire
3) Domaine intracellulaire : domaine tyrosine kinase, site liaison pour l’ATP, site liaison pour substrat, tyrosine pouvant être phosphorylées
Quel est le mécanisme d’activation des récepteurs tyrosine kinase?
1) Dimérisation au niveau ligand, moléculaire intermédiaire, récepteur
2) Liaison de l’ATP sur son site et phosphorylation de la boucle d’activation
3) Phosphorylation de boucle activation, domaine juxtamembranaire et queue c-terminale
Quelles sont les protéines recrutées par les RTK?
Protéines avec domaines SH2 ou PTB
Quels sont les deux sites de liaisons de SH2?
Site pour liaison avec tyrosine phosphorylé et site de liaison avec les aa situés en aval (C-terminal) de la tyrosine phosphorylée
Comment se fait la liaison de PTB avec les RTK?
Une proche de liaison se lie à la tyrosine phosphorylée et les aa en amont (n-terminal) font contact avec le PTB
Avec quoi se lie le module d’interaction SH3?
Avec des domaines riches en proline dans SOS
Avec quoi se lie le module d’interaction PH?
Avec des phospholipides
Quel est le cycle d’activation de la protéine Ras?
Le facteur GEF dissocie le GTP et active Ras. Par la suite, GAP hydrolyse le GTP en GDP ce qui inactive Ras.
Quelle est la voie de signalisation Ras/MAPK?
1) Association de Ras avec Raf
2) Modification de la conformation de Raf (forme active)
3) Phosphorylation de MEK1/2
4) Phosphorylation de ERK1/2
5) Translocation de ERK1/2 dans le noyau
6) ERK1/2 induit la phosphorylation de facteurs de transcription
Comment se fait l’activation de PI3K?
1) Composée de sous-unité p85 et p110
2) PI3K recruté aux RTK par domaine SH2
3) Liaison PI3k aux pTyr induit activation p110
4) Lipides PIP2 phosphorylé et transformé en PIP3
Quelle est la voie de signalisation de PI3K?
1) Lipides PIP3 sont des points d’ancrage pour domaine PH
2) Recrutement PH + Akt à la membrane
3) Interaction Akt + PIP3 induit changement conformation
4) Akt peut être phosphorylé et activé par PDK1 (recruté à membrane par PIP3 et PH)
Quel est le rôle d’Akt?
Permet la survie cellulaire puisqu’il bloque la voie d’apoptose
Comment se fait la régulation négative des RTK?
Par internalisation du récepteur. Une ubiquitine ligase, le Cbl se lie au récepteur et ajoute des groupements ubiquitine. Une fois dans l’endosome précoce, les récepteurs ubiquitinés sont dirigés vers les lysosomes et les récepteurs non ubiquitinés sont recyclés
Comment se fait la diversification des voies de tyrosine kinase?
Si le récepteur Met est dans l’endosome, il va activer la voie STAT. Si le récepteur Met est sur la membrane, il active la voie ERK1/2
Quelles sont les caractéristiques physiopathologiques de la fibrose kystique?
- défaut transport du RE vers MP
- Sueur des patients riche en sel
- CFTR : gène responsable : mutations sur chromosome 7 entraîne altération protéine CFTR
- CFTR = canal chlore
Quelles sont les caractéristiques physiopathologiques de la maladie de surchage lysosolmale (POMPE)?
- Défaut transport vers lysosomes
- Accumulation substrats dans lysosomes (glycogène)
- Lysosomes prennent de l’expansion
- Affection muscles squelettiques, cardiaques, respiratoires
Quelles sont les caractéristiques physiopathologiques de l’hypercholestérolémie et maladies cardiovasculaires?
- Mutation récepteur LDL et de son ligand apoB qui empêche capture et internalisation LDL
Quels sont les mécanismes physiopathologiques de la fibrose kystique?
- Canal inactif : accumulation chlorure dans milieu intracellulaire et plus grande entrée de sodium, mucose plus visqueux
- CFTR a un effet négatif sur canal sodique
- Mutation F508 : Mauvais repliement, incapable de lier COPII
Quels sont les mécanismes physiopathologiques de la maladie de surcharge lysosomale (POMPE)?
- Enzyme alpha-1,4-glucosidase acide (GAA) incapacité à hydrolyser le glycogène
Quels sont les mécanismes physiopathologiques de l’hypercholestérolémie et maladies cardiovasculaires?
- Statines : inhibition HMG-CoA réductase et de la synthèse cholestérol
Quelles sont les approches thérapeutiques applicables pour la fibrose kystique?
- Chaperonnes pharmacologiques : lipophiles qui lient spécifiquement une protéine
- Aide au bon repliement CFTR (VX-809)
- Potentiateur : Effet sur activité canal CFTR
- Augmente la probabilité d’ouverture du canal (VX-770)
Quelles sont les approches thérapeutiques applicables pour la maladie de surcharge lysosomale?
- TES : Enzymes recombinantes. GAA couplée au M6P et va pouvoir être incorporée dans lysosomes
- TCP : design mime substrat naturel de l’enzyme, stabilise l’enzyme, améliore le routage aux lysosomes, augmente l’activité enzymatique
- TRS : diminuer la quantité de substrat
Quelles sont les approches thérapeutiques applicables pour l’hypercholestérolémie et maladies cardiovasculaires?
- TRS
- Inhibition PCSK9
De quelle famille et clan font parti les caspases?
FAmille C14 et clan CD
Quels sont les deux domaines qui composent les caspases?
Domaine N- et C-terminal
Quelle est la forme active obligatoire des caspases?
Dimères
Quelles sont les 3 catégories de caspases?
1) Apoptotiques
2) Inflammatoires
3) Caspase 14 dans différenciation épithéliale
Quelle est la fonction des caspases initiatrices?
Activer les caspases exécutrices, leur substrat principal
Quelles sont les étapes de la voie extrinsèque des caspases apoptotiques initiatrices?
1) Assemblage trimérique DRs
2) Liaison du ligand avec DRs
3) Ouverture de la région cytoplasmique des DRs et exposition DDs
4) Recrutement de FADD au régions DDs
5) Formation du complexe DISC
4) Recrutement des DEDs des caspases 8/10/FLIP sur FADD
5) Liaison de RIPK1 sur DRs et FADD
6) Clivage de Bid par caspase 8 et 10 en tBid qui va aller activer la voie intrinsèque dans les mitochodrion par Bcl-2
Quels sont les substrats des caspases 8 et 10?
Elles-mêmes sur le DISC, pro-caspase 3, 7 et Bid.
Quelles sont les étapes de la voie intrinsèque des caspases apoptotiques initiatrices?
1) Sécrétion de cyt c et Smac par les cellules du mictochondrion Bcl-2
2) Liaison de cyt c et Apaf-1
3) Recrutement de la caspase 9 vie CARD par l’apoptosome
Par quoi est inhibée la caspase 9 clivée?
Par XIAP via BIR3
Quels sont les substrats de caspase 9?
Elle-même, pro-caspase 3 et 7
Quelles sont les caspases apoptotiques exécutrices?
Caspases 3, 6, 7
Comment se fait l’activation des caspases apoptotiques exécutrices?
Clivage du linker qui sépare la grande et le petite sous-unité du domaine catalytique
Par quelles molécules se fait le clivages des caspases apoptotiques exécutrices?
Par GrB ou caspase 3
Par quelle molécule sont inhibée les caspases exécutrices 3 et 7 et la caspase initiatrice 9?
Par XIAP via domaine BIR2
Quel est le rôle de la protéine Smac?
Inhiber XIAP
Quel est le rôle du clivage de caspase 9 par caspase 3?
Retirer l’inhibition par XIAP
Par quelle caspase peut être clivée la caspase 8?
Par la caspase 6
