mol 8 Flashcards
Le taux de base de transcription procaryote dépend de quoi?
dépend de la facilité à débuter la transcription (lien avec force du promoteur):
+ la séquence se rapproche du consensus, + elle est facile à ouvrir (+ facile à initier la transcription)
Qu’est-ce qui permet de moduler le taux de base de transcription procaryote?
Protéines régulatrices
comment sont organisés (généralement) les gènes procaryotes?
en opérons qui donnent des transcrits polycystroniques (info pour plusieurs protéines en un seul transcrit)
les opérons sont généralement transcrits suite à un signal activateur, comment ce signal est il interprété?
l’opérateur est un segment d’ADN sur lequel le signal (molecule ou proteine) peut aller se lier et réprimer la transcription de tout l’opéron
un site distinct de l’opérateur va lier un autre type de signal et permettre de transcrire les opérons
Quel est le principe d’un opéron?
Plusieurs gènes ayant une même fonction
leurs expression est régulée par un seul promoteur
il existe deux classes générales de protéines régulatrices de la transcription, quel est leur méchanisme général?
Ils se lient à des sites spécifiques près des gènes qu’ils contrôlent
Activateurs: augmente le taux d’expression
Répresseurs: diminue ou bloque la transcription
plus précisément, que font les répresseurs de transcription et que font les activateurs?
-répresseurs se lient à l’ADN sur le site opérateur (à l’intérieur du promoteur) et empêchent la laison de l’ARNpol
-activateurs se lient à l’ADN ET à l’ARNpol pour augmenter l’affinité de cette dernière pour le promoteur
=recrutement par liaison coopérative
VRAI OU FAUX: les répresseurs et les activateurs se lient sur l’opérateur
FAUX, seulement les répresseurs se lient sur l’opérateur
les activateurs se lient à l’extérieur du promoteur
À quel moment de la transcription interviennent les répresseurs et activateurs?
Lors de l’initiation de la transcription
vrai ou faux, l’isomérisation de l’ARN pol en complexe ouvert se fait toujours spontanément (lors de la liaison de l’holoenzyme au promoteur)
faux, parfois l’ARN pol se positionne sur le promoteur mais n’arrive pas à induire la transition vers le complexe ouvert, il s’agit d’un complexe fermé stable,
ll a donc besoin d’un activateur actif qui induire un changement de conformation dans la polymérase pour passer en complexe ouvert
*certains de ces activateurs fonctionnent par allostérie et répondent à des contextes environnementaux précis
Pas d’isomérisation = ??
Pas de transcription
pourquoi les complexes fermés stables peuvent-ils être utiles lors de l’expression de gènes qui ne sont pas toujours nécéssaires
comme la transcription ne peut commencer sans la présence d’un activateur, certains gènes qui doivent être exprimés seulement lors de certaines situations peuvent être régulés de telle façon à ce que leur transcription ne débute que lors d’un signal précis qui concorde avec le moment où les gènes sont utiles.
Que fait la glutamine synthase GlnA?
Par quoi est reconnu son promoteur?
Quel est son objectif?
Elle catalyse la dernière étape de la fixation de l’ammonium et est impliquée dans le métabolisme de l’azote
Son promoteur est reconnu par l’ARNpol-σ54. Il s’agit d’un complexe fermé stable.
Tant que la cellule a assez d’azote, l’ARN polymérase ne bouge pas.
La glutamine synthase est produite que lorsqu’il y a un besoin et assure une meilleure efficacité de l’utilisation de l’ATP
-elle permet donc d’augmenter le niveau cytosoilique d’azote
explique la régulation de la glutamine synthase GlnA selon la régulation allostérique
si on manque d’azote dans la cellule:
-kinase NtrB s’active
-phosphorylation de NtrC = rend active
-libération du transporteur de NH4
NtrC-P (activateur) se lie devant le promoteur du gène GlnA et interragit directement avec sigma54, ce qui induit un changement allostérique
Ce changement de conformation permet à l’ARN polymérase de passer en complexe ouvert
Cela permet alors la transcription des gènes qui permettent l’importation de l’azote dans la cellule
qu’est-ce que le facteur sigma54
une sous-unité de l’ARNpol54 qui constitue un complexe fermé stable sur le promoteur du gène de la glutamine synthase
si un site activateur se trouve très loin du gène en question, comment rémédier au problème de distance (2 façons)
Donnez un exemple
Mécanisme à distance:
-une protéine architecte se lie entre le site activateur et le site promoteur pour plier l’ADN en boucle
-les protéines régulatrices interagissent avec d’autres protéines du complexe d’initiation encore dans le but de former une boucle d’ADN
Exemple: L’activateur NtrC agit à distance : son site de liaison est 150 pb en amont du promoteur basal.
tous les répresseurs empêchent la liaison de l’ARN pol à la séquence du promoteur, vrai ou faux
faux, certains répresseurs maintiennent l’ARN pol sur le site du promoteur, aka l’empêche de s’éloigner plutôt que d’empêcher sa liaison
L’opéron gal fait parti de quel mécanisme?
explique comment l’opéron gal est exprimé ou réprimé
Rétention de la polymérase
En absence du galactose: lopron gal est inutile et le répresseur se lie à un site adjacent au promoteur. Lorsque l’ARN pol arrive, le répresseur interagit avec elle et l’empêche de faire la transition vers le complexe ouvert, inhibant la transcription.
En présence du galactose: le répresseur se dissocie de l’ADN et l’ARN pol peut échapper au promoteur. Le galactose est un inducteur.
Qu’est-ce que l’opéron gal?
Il encode les protéines nécessaires pour métaboliser le galactose
quel est le répresseur de l’opéron gal? quel est l’inducteur?
répresseur : cAMP-CAP
inducteur : galactose
Donne un exemple d’antiactivation?
explique comment cet opérion est exprimé et réprimé
En présence d’arabinose : araC se lie sous la forme de dimère aux sites I1 et I2 (prom. basal). La transcription est activée via recrutement de l’ARN polymérase
En absence d’arabinose: changement de conformation du dimère. Liaison d’une sous-unité du dimère à un site distant (araO2). Bloque la transcription via formation d’une boucle de répression de l’opéron.
qu’est-ce que l’opéron lac?
Qui est son répresseur?
activateur?
un opéron contenant 3 gènes nécessaire à la dégradation du lactose soit :
lacZ = B-galactosidose
LacY = la lactose perméase
LacA = la thiogalactoside transacétylase
son répresseur est la protéine lacI (via opérateur)
son activateur est la protéine CAP
qu’est ce les gènes Lac Z Y et A codent respectivement?
lacZ :la β galactosidase qui hydrolyse le lactose en glucose et galactose
lacY :la lactose perméase qui permet l’entrée du lactose (et des thiogalactosides) dans la cellule
lac A: la thiogalactoside transacétylase qui dégrade les thiogalatosides toxiques pour la cellule
