LM_microbiote intestinal Flashcards
nommer les définitions de microbiote, microbiome, prébiotique et probiotique
- Microbiote intestinal : ensemble des micro-organismes résidant dans le TD
–> Étudier les produits du microbiote à grande échelle nécessite des études métabolomiques - Microbiome : ensemble du matériel génétique contenu dans les micro-organismes (et leur environnement, métabolites), susceptibles d’avoir un impact sur l’hôte (10 millions de gènes par hôte)
–> Étude du microbiome à grande échelle nécessite des études métagénomiques - Prébiotiques : substrats nutritionnels favorisant la croissance de microbes bénéfiques pour la santé de l’hôte
- Probiotique : micro-organismes vivants qui confèrent des bénéfices pour la santé lorsqu’ils sont administrés en quantité adéquate à l’hôte
quels sont les 6 types de phylum dans le microbiote intestinal
- Firmicutes
- Bactériooidete
- proteobactéries
- Actinobactéries
- Verrucomicrobes
- Autres :
- Mycobiote intestinal (fungi) : candida, saccharomyces, malassezia, cladosporidium
quelles sont les fonctions du microbiote
Fermentation des aliments :
- Extraction des nutriments + production énergétique des aliments via des activités enzymatiques et biochimiques
- Biosynthèse des molécules bioactives (ex : vitamines, acides aminés, lipides dépendent du microbiote)
Protection contre les pathogène
- Produit des substances anti-microbienne
- Développement de la muqueuse intestinale et du SI
Stimulation de la réponse immunitaire
Autres
- Métabolisme des acides biliaires
- Dégradation des acides aminés
nommer les différents changements du microbiote selon l’âge
- nourrisson
- 1ère année de vie
- 11 mois
- 3 ans
- personnes + âgées
- Nourrisson : bactéries aérobies prédominantes
- 1ère année de vie : microbiote intestinal ressemble à celui de la mère (Il est aussi variable et susceptible au stress physique et émotif)
- 11 mois : spécifique à l’enfant, distinct et stable
- 3 ans : microbiote de l’enfant comparable à celui d’un adulte avec les 3 principaux phylums (Firmicutes, bactéroidete et actinobactéries en dominance)
- Personnes + âgées : Diminution des bifidobactérium et augmentation des Clostridium et protéobactéries
- La diminution de bifidobactérium vient réduire le SI
Nommer les différences du microbiote entre un accouchement vaginal et césarienne
- vaginal: Contact immédiat avec les potentielles bactéries probiotiques Ex : Lactobacilli, bacteroidetes
- Césarienne: Contact immédiat avec les bactéries similaires au microbiote cutané/oral
- Moins de diversité et potentielle hausse du risque de maladies infectieuses, atopiques, immunes
nommer des facteurs qui peuvent influencer la composition du microbiote
- Génétique de l’hôte
- Géographie
- Diète (végétaux surtout)
- Sommeil
- Activité physique
- États pathologiques autres et antécédents
- Histoire personnelle et sociale (stress important, voyage/migration, interactions sociales)
- Médicaments (ex : enfant qui prend des ATB en jeune âge)
Comment le microbiote peut-il influencer l’activité de l’hôte
- Régulant l’expression de gènes humains
- Produisant des composés actifs (NT, métabolites, hormones, composés pro ou anti-inflammatoires)
- Éliminant des substances de l’hôte
- Autres effets non élucidés
quelles sont les conséquences de l’absence de microbiote
- Métabolisme altéré –> perte de poids
- Susceptibilité diminuée à l’anxiété et la dépression
- Diminution de l’immunité
- Motilité du GI altérée
nommer des thérapies qui permettent de modifier le composition du microbiote
- Diète = élément central pour modifier le microbiote
> Mauvaises habitudes alimentaires peuvent avoir des conséquences importantes et irréversibles
> Microbiotes de diff populations : chasseur, rural, occidentale
> Diversité microbienne diminuée chez les populations occidentales –> perte attribuée à la faible quantité de fibres - ATB
- Prébiotiques (fibres non digestibles)
- Probiotiques
- Transplantation de microbiote
- ATB néfastes (sauf rifaximine)
quel est le mécanisme d’action des probiotiques
- Effet immunomodulatoire : production de cytokines anti-inflammatoires (TGF-beta et IL-10) et inhibition des cytokines pro-inflammatoires (TNF) et lymphocytes
- Modulation de la barrière épithéliale (perméabilité)
- Suppression de la croissance ou invasion par pathogènes
- Modulation de la perception de douleur (expression des R opioïdes et cannabinoïdes)
dans quel cas est-il recommandé de donner des FMT et est-ce sécuritaire?
C difficile
- sécuritaire à court terme, mais inconnu à long terme
quels sont les traitements possibles lors d’une infection à clostridium difficile
ATB (vancomycine, fidaxomicyne)
MAIS : potentiel de récidive à 20-30% –> FMT pour réduire récidives !!!
Note: ne pas utiliser la FMT chez les adultes sévèrement immunodéprimés
comment l’obésité et le microbiote sont liés
les composés bactériens (LPS et AGCC) entraînent la résistance à l’insuline et de l’inflammation
Nommer des indices que le microbiote est impliqué dans les maladies inflammatoires de l’intestin
- Les animaux germ free ne développent pas de MII
→ Les modèles animaux sans microbiote intestinal ne développent pas de MII, donc suggère que bactéries sont nécessaires pour déclencher ou aggraver ces maladies - ATB utilisés dans le tx de Crohn
→ Certains ATB peuvent réduirent l’inflammation chez les patients atteints de Crohn, donc suggère que les bactéries aggravent la maladie - Diminution de le diversité microbienne rapportée
- Ag et marqueurs sérologiques bactériens retrouvés dans Crohn (OmpC, ASCA)
→ OmpC : outer membrane protein C, ASCA : anti-saccharomyces cerevisiae antibody
→ Éléments retrouvés dans la maladie de Crohn indiquent réaction anormale du SI face aux bactéries du microbiote
quels sont les 2 probiotiques efficaces en ECR pour la CU
- Escheria coli Nissle
- VSL#3
quelle est la recommandation de FMT pour les patients avec CU
chez les patients atteints de CU, on suggère de ne pas utiliser la transplantation fécale conventionnelle SAUF dans le cadre d’essais cliniques
nommer les changements au niveau du microbiote chez les patients avec maladie de Crohn
- ↓ diversite microbienne
- ↓ nombre de bacteries (richesse)
- Firmicutes:
→ ↓ Facecalibacterium prausnitzii
→ ↓ clostridiales
→ ↑ Lactobacillus - ↑ Bacteroidetes
- ↓ Actinobacteries (Bifidobacteriaceae)
- ↑ Proteobacteries (Enterobacteriaceae, surtout E. coli)
- ↑ Candida tropicalis
nommer un probiotique qui a un rôle (modeste) dans le maintient de la rémission de Crohn
- Saccharomyces Boulardii
quelles sont les recommandations de probiotiques/FMT pour le syndrome de l’intestin irritable
- Probiotique Bifidobacterium infantis améliore les sx et stimule les cytokines anti-inflammatoires
- Études pilotes FMT : résultats mitigés
certains probiotiques (souches d’Escherichia) pourraient améliorer les sx globaux. Cependant la plupart des autres souches et combinaisons donnent de faibles preuves
* Il n’y a pas d’augmentation significative des effets indésirables avec les probiotiques
nommer les indices d’implication du microbiote a/n du SNC
-
Souris germ-free ont un comportement altéré
suggère que microbiote joue un rôle dans la régulation du comportement - Ces souris ont moins d’anxiété (insouciance) et moins de comportements dépressifs
-
La colonisation de ces souris (ajout microbiote) altère l’expression de plusieurs gènes dans le cerveau
le microbiote peut moduler le fonctionnement du cerveau a/n moléculaire -
Le traitement de souris normales par ATB entraîne une dysbiose et une modification du comportement (semblable aux souris GF)
preuve que microbiote influence comportement
nommer 1 probiotique qui a un effet sur les patients SII avec anxiété et dépression
bifidobacterium longum
nommer les altérations du microbiote chez les gens avec cirrhose et Stéatohépatite associée à un dysfonctionnement métabolique (MASH)
- Stéatohépatite associée à un dysfonctionnement métabolique (MASH) : faible taux de bacteroidete comparé aux personnes saines
- Cirrhose : réduction des bacteroides et majoration des protéobactéries et fusobactérie