F7 - Nukleinsyre Flashcards
Double helix
Refererer til DNA’s struktur, som er spiralformet, hvor to komplementære DNA-strenge holdes sammen, den ene streng forløber i 5’-3’-retningen og den anden streng forløber i modsatte retning.
Deoxyribonuklein syre (DNA)
En nukleinsyre, som er dobbeltstrenget og lagere genetisk materiale. Er mere stabil end RNA.
Deoxyribose
Et sukkermolekyle der indgår i DNA’s backbone og har et H-atom bundet på sin 2’-position, og er bundet til hinanden via phosphodiester broer.
Ribose
Et sukkermolekyle der indgår i RNA’s backbone og har en OH-gruppe bundet på sin 2’-position, og er bundet til hinanden via phosphodiester broer.
Purine
Består af en dobbelt ringstruktur. Adenin og guanin er derivater her af.
Pyrimidine
Består af en enkel ringstruktur. Cytosin, thymin og uracil er derivater her af.
Ribonuklein syre (RNA)
En nukleinsyre, som er enkelt strenget og overfører genetisk information fra DNA, som er essentielt for syntesen af proteiner.
Nukleosid
Består af et sukkermolekyle og en nitrogenholdigbase. Kaldes deoxyadenosin, deoxycytidine, deoxyguanin og thymidine
Nukleotid
Består af en phosphatgruppe, nitrogenholdigbase og et sukkermolekyle. Phosphatgrupperne og sukkermolekylerne binder til hinanden via phosphodiester bindinger, og udgør nukleinsyres backbone, hvor sukkermolekyler binder til sin nitrogenholdige base via glykosid bindinger.
Watson-Crick base par
Når de nitrogenholdige baser danner par via hydrogenbindinger i en double helix - AT/AU, GC. Helixen stabiliseres via disse hydrogenbindinger, men også af van der Waals interaktioner mellem stablede base-par.
Semikonservative replikation
Er en proces, hvor DNA’s dobbelt helix adskilles i to enkeltstrenge, der fungerer som templates for dannelsen af to nye dobbelt helixer. Hver ny helix består af én original (forældre-) streng og én nydannet streng, hvilket sikrer præcis overførsel af genetisk information.
B-DNA
Er den mest almindelige form for DNA i levende celler under fysiologiske forhold.
A-DNA
Ved dehydrering optager DNA denne form. Er bredere og mere kompakt end B-DNA.
Z-DNA
Har en zigzag-formation af phosphoryl grupperne i backbone. Illustrerer dynamisk og fleksibel struktur afhængigt af de omgivende betingelser.
Major groove
En bred og dyb rille i DNA. Viser flere sekvensspecifikke træk ved baseparrene, som giver flere muligheder for hydrogenbinding og genkendelse af specifikke DNA-sekvenser af proteiner, hvilket er essentielt for processerne replikation og transkription.
Minor groove
En smal og mindre dyb rille, som viser færre sekvensspecifikke træk, men indeholder stadig i mindre grad hydrogenbindingsdonerer og -acceptorer.
Supercoiling
En strukturel egenskab ved DNA, hvor DNA-strengen kan vikles omkring sig selv for at danne en kompakt form. En tilstand, hvor DNA-strengen er viklet op i en superhelix, kan enten være negativ eller positiv. Den negative tilstand gør DNA lettere at adskille under replikation og transkription.
Histoner
Er små, basiske proteiner, der er afgørende for pakningen af DNA. De har en høj andel af basiske aminosyrer som arginin og lysin, hvilket tillader dem at binde til det negativt ladede DNA (ladningen på phosphorylgrypperne i backbone).
Kromatin
Et kompleks bestående af DNA og proteiner (histoner), som tillader organisering og en kompakt indpakning af DNA så det kan være i cellekernen. Findes i forskellige tilstande: løst pakket (euchromatin) og tætpakket (heterochromatin), det påvirker tilgængeligheden af DNA under replikation og transkription.
Nukleosom
Er den grundlæggende enhed af kromatin, og består af et segment af DNA, der er viklet omkring en histonkerne (8 histoner). De spiller en vigtig rolle i DNA-indpakning og i reguleringen af gen-ekspression
Nukleosom core partikel
Refererer til den del af nukleosomet, der består af 8 histoner og de ca. 145 basepar DNA, der er viklet omkring dette. Denne partikel er stabil og beskytter DNA.
Stem-loop
Er en struktur, hvor et enkeltstrenget RNA- eller DNA-molekyle danner en dobbeltstrenget struktur ved binding af komplementære sekvenser på samme streng. Den består af en baseparret stamme og en ubundet sløjfe, der stikker ud. Denne struktur spiller en rolle i genregulering og proteinsyntese.
