F3 og F4 - Det endomembrane system Flashcards
Endomembran system
Et system der forbinder et netværk af membranbundne organeller via vesikel-medieret transport herunder endo- og exocytose.
Vesicle-mediated transport
Den transportmetode, hvor materiale transporteres mellem organeller i
det endomembrane system vha. små membranbundende vesikler.
Donor/acceptor compartment
Refererer til de membranbundne rum i cellen, hvor materialer transporteres mellem. Donor compartment er det sted vesikler dannes ved en udposning af en eksisterende membran og indeholder det materiale der skal transporteres. Acceptor compartment er det mål, hvor vesiklerne leverer deres indhold ved fusion mellem vesiklen og acceptor membranen og overfører dermed materialet til dets nye sted.
Cargo selektion
I cargo selektion er det coat proteiner der binder sig til indersiden af membranen af donor compartment og er medansvarlig for indsamling og sortering af materiale. Proteinerne danner en patch, på overfladen af vesiklerne, hvor receptorer og proteiner med signalsekvenser samles.
Budding
I budding er det adaptor proteiner der interagerer med coat proteiner, hvilket tillader dannelsen af en udposning i membranen, som bliver større i takt med at der tilføjes flere adaptor- og coat proteiner. Bindingen mellem adaptor- og coat proteiner organiserer og stabiliserer udposningen, de samarbejder om at sortere og indsamle materialer, hvilket gør dannelsen af vesiklen mere effektiv.
Scission
I scission klippes udposningen af fra donormembranen vha. dynamin, hvilket spontant danner en vesikel.
Uncoating
I uncoating frigives adaptor- og coat proteinerne fra vesiklen når vesiklen er dannet, og de transporteres tilbage til donor compartment, så de kan indgå i en ny cyklus, da de kun er nødvendige til indsamling og sortering af materiale.
Transport
I transport er det ikke obligatorisk at vesikler transporteres af cytoskelettet, men det gør transporten mere effektiv via motorproteiner som kinesin og dynein der interagerer med mikrotubules.
Tethering
I tethering danner Rab-proteinerne, som befinder sig på ydersiden af vesiklen en midlertidig forbindelse med tether-proteiner på acceptor membranen. Den midlertidige forbindelse stabiliserer vesiklen i nærheden af acceptor membranen, hvilket tillader vesiklen at identificere og interagere med de rette mål proteiner. Hvis ikke vesiklen har fundet de rette målproteiner kan komplekset mellem Rab- og tether proteiner dissocierer og vesiklen kan bevæge sig til andre acceptor compartments.
Docking
I docking binder v(vesikel)-SNARE sig til sin komplementære t(target)-SNARE, hvilket stabiliserer den midlertidige forbindelse mellem Rab- og tether proteinerne.
Fusion
I fusion kræver det interaktioner mellem flere forskellige par af v-SNARE og t-SNARE, som udløser fusionen af vesiklerne med acceptor membranen og materialet frigives til acceptor membranen.
Disassembly
I disassembly frigøres v-SNARE og t-SNARE fra hinanden via specielle proteiner. v-SNARE transporteres sammen med receptorer tilbage til donor compartment via vesikler for at deltage i en ny cyklus.
Exocytose
Er en proces hvor syntetiseret og modificeret biomolekyler transporteres via ER og Golgi-apparatet til plasmamembranen, hvor membranbundne proteiner inkorporeres og opløselige proteiner udskilles til det ekstracellulære rum.
Sekretoriske vesikler
Er vesikler, hvis udposninger dannes i Golgi-apparatets membran, der indeholder materiale der skal udskilles. Nogle vesikler udskilles straks, mens andre indeholder fordøjelsesenzymer og kræver derfor et signal for at blive frigivet.
Endocytose
Er en proces hvor molekyler transporteres ind i cellen via endosomer til lysosomer, hvor de nedbrydes i deres grundlæggende byggesten eller uønskede molekyler, celler og vira ødelægges af hydrolytiske enzymer.