F11 - Transkription - prokaryoter Flashcards
Transskription
Den proces hvor tRNA, rRNA og mRNA syntetiseres ud fra en DNA-template i prokaryoter.
RNA polymerase holoenzyme
Et enzym der katalyserer transkriptionen af tRNA, rRNA og mRNA ved at initiere og kopierer en specifik sekvens på DNA-templaten og dermed syntetisere RNA. Hvis core består af to alfa-subunits, en beta-subunits, et beta prime-subunits og en omega-subunit.
Transkriptionsboble
Transkriptionen initieres af at RNA-polymerase åbner et segment, hvor RNA polymerase, DNA og den ny syntetiseret RNA-streng interagerer, som kaldes open promoter kompleks, på ca. 17 basepar i DNA’et for at kunne påbegynde transkriptionen. Før åbningen kaldes det closed promoter kompleks.
Sigma (σ) subunit
Er en subunit der er en del af RNA polymerase-komplekset, som hjælper med at finde startstedet (promoteren) for transkriptionen på DNA. Den mindsker polymerasens bindingsstyrke til DNA, hvilket tillader den at glide langs DNA’et og finde promoterne. Ved initiering af transkriptionen frigøres subunitten og kan derefter hjælpe nye RNA-polymeraser med at finde deres promoter.
Promoter
Et DNA-segment, der angiver startstedet for transkription, hvor RNA polymerasen binder sig og påbegynder syntesen af RNA.
Consensus sequence
En DNA-sekvens, der afspejler de mest almindelige baser på bestemte positioner i promoter-regionerne fx TATAAT. Promoterens styrke afhænger af, hvor tæt den sekvens matcher denne konsensus; stærke promotere ligner konsenssekvensen meget, mens svage har flere variationer.
Rho (ρ)
Er et hexamerisk protein med ATPase-aktivitet, der spiller en central rolle i transkriptionsterminering i prokaryoter. I modsætning til den uafhængig terminering, hvor en stem-loop og en række uraciler (U’er) afslutter transkriptionen er dette protein nødvendigt for at afslutte transkriptionen af visse gener, der mangler U’erne.
