F12 - Post-transkriptionel proces af RNA Flashcards
Exon
En sekvens i et gen, der indgår i det modne mRNA og som koder for aminosyrer.
Intron
En ikke-kodende sekvens i et gen, der fjernes under RNA-splejsning.
Small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP)
Består af små nukleare RNA’er (snoRNA) og flere proteiner. Komplekserne er involveret i modificeringen af ribosomalt RNA (rRNA) i nukleus. De guider modifikationer af nukleotiderne i præ-rRNA, en vigtig del af rRNA-modenhedsprocessen.
Præ-mRNA
Er det umodne mRNA, som er det oprindelige RNA-transkript, der syntetiseres af RNA polymerase II under transkription. Det indeholder både exons og introns sekvenser og skal gennemgå modifikationer for at blive til det modne mRNA.
mRNA
Det modne resultat af RNA, det fungerer som en opskrift for proteinsyntesen. Det transporteres fra nukleus til enten de frie ribosomer eller ribosomerne på ER, hvor det bruges som template til proteinsyntese.
5’ cap
Er en modificering af det første nukleotid i det voksende præ-mRNA. Den beskytter mRNA’et mod nedbrydning af nukleaser (exonukleaser og endonukleaser), når mRNA skal transporteres fra nukleus til ribosomerne og i translation.
Poly(A) tail
Er en lang sekvens af adenin tilføjet til 3’-enden af præ-mRNA efter transkription. Den beskytter mRNA mod nedbrydning, fremmer dets eksport fra kernen og er med til at regulere mRNA’s stabilitet og effektivitet i translation.
Splicing
Den proces som foregår i nukleus og danner det modne mRNA, hvor introns fjernes fra præ-mRNA, og exons sammenkædes. Finder sted ved specifikke sekvenser, der markerer begyndelsen (GU) og slutningen (AG) på introns, et branch site findes mellem disse markeringer (A bundet til OH), OH-gruppen angriber GU og AG.
Spliceosome
Et stort molekylært kompleks med enzymatiskaktivitet, der er ansvarlig for præcist at fjerne introns og sammenkoble exons i præ-mRNA. Det katalyserer de to transesterifikationer, der resulterer i det splittede produkt.
Small nuclear RNA (snRNA)
En klasse små RNA-molekyler, der spiller en rolle i splejsning af præ-mRNA. De er vigtige komponenter i spliceosomet og deltager i genkendelsen af splejsningssteder, dannelsen af det katalytiske center og katalysen af splejsningsreaktionerne.
Small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) particles
Er komplekser af snRNA og tilknyttede proteiner. De er integrerede komponenter af spliceosomet. ATP er nødvendig for reorganisering af komplekset og samle spliceosomet korrekt og ved frigivelsen af komplekset fra spliceosomet.
Transesterification
Refererer til en kemisk reaktion, hvor en ester reagerer med en alkohol for at danne en ny alkohol og en ny ester. Denne kemiske reaktion katalyseres i splejsning.
Alternative splicing
En proces til at skabe proteinmangfoldighed. Hvor et enkelt præ-mRNA spaltes på forskellige måder for at danne forskellige mRNA og dermed proteiner.
RNA editing
En post-transkriptionel proces, som ændrer nukleotidsekvensen i det modne mRNA. Dette kan ændre aminosyresekvensen af det protein, som RNA’et koder for. Fx er den nye sekvens UAA, UAG eller UGA, som er stopcodons og vil resulterer i et kortere protein, med en anden funktion.
Catalytic RNA
Ribozymer der er RNA-molekyler, som fungerer som enzymer og katalyserer biokemiske reaktioner uden behov for proteiner.
