AA 3 Flashcards
V - Dérivés des AA (suite) :
Créatine :
Association de 3 AA Gly, Arg et Met
Forme de réserve d’E sous forme de CP
Créatinine :
Dérivé de la créatine. Déchet métabolique éliminé dans les urines
Iodotyrosines :
Précurseurs d’hormones thyroïdiennes
S-Adénosyl Méthionine : SAM
Coenzyme donneur de radical méthyle lors de la plupart des transmethylations
Urée :
Forme d’élimination de NH₃ toxique
Catécholamines et Analogues :
Dérivé de 2 AA : Phe et Tyr
Dopamine - Noradrénaline - Adrénaline
Analogues :
Tyramine - Tryptamine - Sérotonine
VI - Méthodes d’identification et dosage des AA
VI - Méthodes d’identification et dosage des AA
Méthodes générales :
Détection : par des réactions colorées, la ninhydrine (ninhydrine).
Dosage photométrique ou colorimétrique.
Méthodes nécessitant un fractionnement :
Électrophorèse.
Chromatographie sur couche mince (CCM).
Chromatographie par échange d’ions.
PEPTIDES
Molécule formée d’un enchaînement d’AA reliés entre eux par liaisons peptidiques (amides).
Liaison peptidique = réaction entre le COOH du 1ᵉʳ AA et le NH₂ du 2ᵉ avec élimination d’eau. C’est une liaison covalente.
Un peptide commence par l’AA dont le NH₂ est libre (AA Nt), c’est le AA n°1 toujours placé à gauche, et se termine par l’AA dont COOH est libre (AA Ct) tjrs à droite.
Les AA d’un peptide engagés ds 2 liaisons peptidiques perdent leur identité d’AA et sont appelés aminoacyle (-yl), le résidu C terminal garde l’identité AA.
Intérêt biologique :
Certains sont des hormones (insuline, glucagon…).
D’autres sont des antibiotiques ou des neurotransmetteurs.
La liaison peptidique e
La liaison peptidique est hydrolysable en milieu acide concentré et à chaud.
Un peptide possède un pHi.
Réaction de Biuret : donne une coloration violette si le peptide ≥ 4 AA. Caractérise la liaison peptidique.
La chaîne peptidique a une structure spatiale en 3D.
I - Détermination de la séquence du peptide
A - Détermination de la composition en AA :
A - Détermination de la composition en AA :
Hydrolyse acide pour couper les liaisons peptidiques.
Hydrolyse acide détruit le Tryptophane donc pour le détecter on pratique une hydrolyse alcaline.
Identification et dosage des AA par chromatographie échangeuse d’ions et par réaction à la ninhydrine.
B - Détermination de la séquence des AA :
Détermination de l’AA Nt :
Détermination de l’AA Nt :
La dégradation de Sanger : Fixation de DNFB sur NH₂ → hydrolyse acide → Libération du DNP-AA₁ → Identification de AA₁ par chromatographie.
Méthode au Chlorure de DANSYL : Même principe sauf que le composé final est fluorescent.
Méthode récurrente d’Edman : Fixation de PITC sur NH₂ → hydrolyse acide faible → Libération du PTH-AA₁ + peptide raccourci d’un AA.
Méthode enzymatique avec aminopeptidase : Hydrolyse les liaisons depuis le côté Nt → libération AA₁ (fonctionnement récurrent).
Détermination de l’AA Ct :
2. Détermination de l’AA Ct :
Méthodes enzymatiques aux carboxypeptidases : Les carboxypeptidases A et B libèrent l’AA Ct. Leurs actions dépendent de la nature de l’avant dernier résidu et le Ct.
Méthode chimique : L’hydrazinolyse libère facilement le résidu Ct.
Fragmentation des peptides infra-chaîne
Fragmentation des peptides infra-chaîne
Méthode enzymatique aux endopeptidases : Hydrolysent de manière spécifique les liaisons peptidiques à l’intérieur des chaînes.
Méthodes chimiques : Coupent soit après la Met BrCN :côté carboxylique de la Met.soit les ponts disulfures es peptides obtenus sont analysés par méthode d’Edman.
II - Études de quelques peptides d’intérêt biologique :
II - Études de quelques peptides d’intérêt biologique :
Glutathion
Tripeptide formé de : Glu - Cys - Gly
Détoxification et Protection
2 Formes : GSH ou G-S-S-G
Peptides hormonaux
Hormones du SNC : Ocytocine et Vasopressine
Hormones pancréatiques : Insuline et Glucagon
Peptides antibiotiques
Produits par des bactéries ou des champignons, utilisés dans la thérapeutique
Exp : Pénicilline